MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19503	NC_021200	TGA	2	6	677156	677161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499075000
19504	NC_021200	GC	3	6	677167	677172	0 %	0 %	50 %	50 %	499075000
19505	NC_021200	CGTTCG	2	12	677173	677184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075000
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19507	NC_021200	GAT	2	6	677289	677294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499075000
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19545	NC_021200	CCGGA	2	10	678441	678450	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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19555	NC_021200	GCCC	2	8	678872	678879	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19556	NC_021200	AAG	2	6	678882	678887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19626	NC_021200	TGC	2	6	681417	681422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075002
19627	NC_021200	GAG	2	6	681434	681439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499075002
19628	NC_021200	GGGGT	2	10	681452	681461	0 %	20 %	80 %	0 %	499075002
19629	NC_021200	CGG	2	6	681552	681557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075002
19630	NC_021200	CGG	2	6	681565	681570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075002
19631	NC_021200	AGC	2	6	681576	681581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075002
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19652	NC_021200	GTC	2	6	682330	682335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075004
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19655	NC_021200	ACG	2	6	682421	682426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075004
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19658	NC_021200	CGG	2	6	682604	682609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19659	NC_021200	CGA	2	6	682610	682615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19660	NC_021200	GCA	2	6	682640	682645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075005
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19662	NC_021200	GCCG	2	8	682692	682699	0 %	0 %	50 %	50 %	499075005
19663	NC_021200	GGT	2	6	682734	682739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075005
19664	NC_021200	TGACG	2	10	682753	682762	20 %	20 %	40 %	20 %	499075005
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19666	NC_021200	GTC	2	6	682791	682796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075005
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19704	NC_021200	CG	3	6	684017	684022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19705	NC_021200	GGCG	2	8	684041	684048	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19706	NC_021200	GACTC	2	10	684073	684082	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
19707	NC_021200	CGC	2	6	684189	684194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075006
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19731	NC_021200	G	6	6	685335	685340	0 %	0 %	100 %	0 %	499075007
19732	NC_021200	ATC	2	6	685355	685360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499075007
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19737	NC_021200	GTCG	2	8	685540	685547	0 %	25 %	50 %	25 %	499075007
19738	NC_021200	ATC	2	6	685550	685555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499075007
19739	NC_021200	TGC	2	6	685569	685574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075007
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19741	NC_021200	CAG	2	6	685658	685663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075007
19742	NC_021200	CTG	2	6	685676	685681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075007
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19858	NC_021200	GCCG	2	8	689504	689511	0 %	0 %	50 %	50 %	499075012
19859	NC_021200	TGGCGG	2	12	689519	689530	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	499075012
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19981	NC_021200	CGGC	2	8	694296	694303	0 %	0 %	50 %	50 %	499075017
19982	NC_021200	CCAG	2	8	694305	694312	25 %	0 %	25 %	50 %	499075017
19983	NC_021200	CG	3	6	694318	694323	0 %	0 %	50 %	50 %	499075017
19984	NC_021200	CCG	2	6	694337	694342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075017
19985	NC_021200	CCGTC	2	10	694382	694391	0 %	20 %	20 %	60 %	499075017
19986	NC_021200	CGAA	2	8	694427	694434	50 %	0 %	25 %	25 %	499075017
19987	NC_021200	CAA	2	6	694453	694458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499075017
19988	NC_021200	GAC	2	6	694461	694466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075017
19989	NC_021200	CACCGT	2	12	694486	694497	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	499075017
19990	NC_021200	GCCGTC	2	12	694498	694509	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	499075017
19991	NC_021200	ACC	2	6	694511	694516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499075017
19992	NC_021200	GTG	3	9	694529	694537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499075017
19993	NC_021200	GCG	2	6	694538	694543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499075017
19994	NC_021200	GCCA	2	8	694556	694563	25 %	0 %	25 %	50 %	499075017
19995	NC_021200	CGC	2	6	694582	694587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499075017
19996	NC_021200	GGCG	2	8	694606	694613	0 %	0 %	75 %	25 %	499075017
19997	NC_021200	GCT	2	6	694665	694670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075018
19998	NC_021200	GC	3	6	694747	694752	0 %	0 %	50 %	50 %	499075018
19999	NC_021200	CGT	2	6	694766	694771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499075018
20000	NC_021200	GCA	2	6	694772	694777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499075018

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