MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021200	GTCCG	2	10	61121	61130	0 %	20 %	40 %	40 %	499074452
1502	NC_021200	CGGT	2	8	61152	61159	0 %	25 %	50 %	25 %	499074452
1503	NC_021200	CTG	2	6	61178	61183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074452
1504	NC_021200	CG	3	6	61221	61226	0 %	0 %	50 %	50 %	499074452
1505	NC_021200	GCC	2	6	61230	61235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074452
1506	NC_021200	CCG	2	6	61236	61241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074452
1507	NC_021200	CCA	2	6	61252	61257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074452
1508	NC_021200	GCA	2	6	61330	61335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074452
1509	NC_021200	GCA	2	6	61339	61344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074452
1510	NC_021200	GGTC	2	8	61357	61364	0 %	25 %	50 %	25 %	499074452
1511	NC_021200	AGC	2	6	61392	61397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074452
1512	NC_021200	TGG	2	6	61456	61461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074452
1513	NC_021200	GCC	2	6	61488	61493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074452
1514	NC_021200	ACG	2	6	61497	61502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074452
1515	NC_021200	CAG	2	6	61517	61522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074452
1516	NC_021200	TGG	2	6	61528	61533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074452
1517	NC_021200	TGG	2	6	61552	61557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074452
1518	NC_021200	CCA	2	6	61606	61611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074452
1519	NC_021200	CCG	2	6	61627	61632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074452
1520	NC_021200	GCG	2	6	61644	61649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074452
1521	NC_021200	GCCG	2	8	61655	61662	0 %	0 %	50 %	50 %	499074452
1522	NC_021200	CGG	2	6	61681	61686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074452
1523	NC_021200	ATC	2	6	61701	61706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074452
1524	NC_021200	GC	3	6	61728	61733	0 %	0 %	50 %	50 %	499074453
1525	NC_021200	CGT	2	6	61758	61763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074453
1526	NC_021200	GGC	2	6	61810	61815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074453
1527	NC_021200	GAC	2	6	61822	61827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074453
1528	NC_021200	GGC	2	6	61854	61859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074453
1529	NC_021200	CGC	2	6	61884	61889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074453
1530	NC_021200	TGA	2	6	61910	61915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074453
1531	NC_021200	TCA	2	6	61920	61925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074453
1532	NC_021200	CGGC	2	8	61934	61941	0 %	0 %	50 %	50 %	499074453
1533	NC_021200	GGC	3	9	61939	61947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074453
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1535	NC_021200	TGC	2	6	61996	62001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074453
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1537	NC_021200	CG	4	8	62044	62051	0 %	0 %	50 %	50 %	499074453
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1539	NC_021200	CCG	2	6	62075	62080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074453
1540	NC_021200	GC	3	6	62109	62114	0 %	0 %	50 %	50 %	499074453
1541	NC_021200	CGG	2	6	62139	62144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074453
1542	NC_021200	CGG	2	6	62150	62155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074453
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1544	NC_021200	TGC	2	6	62244	62249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074453
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1550	NC_021200	GCAGC	2	10	62359	62368	20 %	0 %	40 %	40 %	499074453
1551	NC_021200	CGG	2	6	62487	62492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074453
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1556	NC_021200	GCC	2	6	62602	62607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074454
1557	NC_021200	CGT	2	6	62618	62623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074454
1558	NC_021200	GCC	2	6	62653	62658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074454
1559	NC_021200	CAG	3	9	62664	62672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074454
1560	NC_021200	CCGA	2	8	62673	62680	25 %	0 %	25 %	50 %	499074454
1561	NC_021200	GCCCA	2	10	62728	62737	20 %	0 %	20 %	60 %	499074454
1562	NC_021200	ACC	2	6	62788	62793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074454
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1564	NC_021200	ACC	3	9	62851	62859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074454
1565	NC_021200	CGG	2	6	62897	62902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074454
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1570	NC_021200	GAT	2	6	63102	63107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074454
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1583	NC_021200	GCC	2	6	63597	63602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074455
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1588	NC_021200	AT	3	6	63742	63747	50 %	50 %	0 %	0 %	499074455
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1596	NC_021200	GCC	2	6	63927	63932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074455
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1599	NC_021200	CGG	2	6	63974	63979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074455
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1604	NC_021200	CAC	2	6	64224	64229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074455
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1611	NC_021200	TGG	2	6	64511	64516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074455
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1785	NC_021200	CGA	2	6	70966	70971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1861	NC_021200	AACC	2	8	74117	74124	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1862	NC_021200	GTT	2	6	74130	74135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1870	NC_021200	GGCAG	2	10	74577	74586	20 %	0 %	60 %	20 %	499074464
1871	NC_021200	CG	3	6	74612	74617	0 %	0 %	50 %	50 %	499074464
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