MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_021200	CGGTC	2	10	626181	626190	0 %	20 %	40 %	40 %	499074952
18003	NC_021200	CGGTC	2	10	626197	626206	0 %	20 %	40 %	40 %	499074952
18004	NC_021200	CCGG	2	8	626242	626249	0 %	0 %	50 %	50 %	499074952
18005	NC_021200	GC	3	6	626294	626299	0 %	0 %	50 %	50 %	499074952
18006	NC_021200	TTC	2	6	626303	626308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499074952
18007	NC_021200	ACCA	2	8	626348	626355	50 %	0 %	0 %	50 %	499074952
18008	NC_021200	CGT	2	6	626359	626364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074952
18009	NC_021200	CGA	2	6	626401	626406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074952
18010	NC_021200	CGG	2	6	626442	626447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074952
18011	NC_021200	CGT	3	9	626455	626463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074952
18012	NC_021200	CGG	2	6	626497	626502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074952
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18014	NC_021200	ATTGC	2	10	626557	626566	20 %	40 %	20 %	20 %	499074952
18015	NC_021200	CGG	2	6	626598	626603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074952
18016	NC_021200	TGC	2	6	626607	626612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074952
18017	NC_021200	CGC	2	6	626620	626625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074952
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18019	NC_021200	CG	3	6	626708	626713	0 %	0 %	50 %	50 %	499074952
18020	NC_021200	CTCGC	2	10	626735	626744	0 %	20 %	20 %	60 %	499074952
18021	NC_021200	CGC	2	6	626770	626775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074952
18022	NC_021200	GGCC	2	8	626782	626789	0 %	0 %	50 %	50 %	499074952
18023	NC_021200	GC	3	6	626799	626804	0 %	0 %	50 %	50 %	499074952
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18030	NC_021200	CG	3	6	627035	627040	0 %	0 %	50 %	50 %	499074952
18031	NC_021200	TGG	2	6	627051	627056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074952
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18036	NC_021200	GA	3	6	627206	627211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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18039	NC_021200	G	6	6	627303	627308	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18040	NC_021200	GCG	2	6	627310	627315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18041	NC_021200	GCC	2	6	627351	627356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074953
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18065	NC_021200	TCG	2	6	628334	628339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074954
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18093	NC_021200	CAGC	2	8	629149	629156	25 %	0 %	25 %	50 %	499074954
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18121	NC_021200	CGGTG	2	10	629977	629986	0 %	20 %	60 %	20 %	499074955
18122	NC_021200	TGG	2	6	630030	630035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074955
18123	NC_021200	GCT	2	6	630040	630045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074955
18124	NC_021200	CAC	2	6	630061	630066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074955
18125	NC_021200	GGC	2	6	630106	630111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074955
18126	NC_021200	CTG	2	6	630119	630124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074955
18127	NC_021200	GTG	2	6	630137	630142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074955
18128	NC_021200	TGGGG	2	10	630167	630176	0 %	20 %	80 %	0 %	499074955
18129	NC_021200	GCC	2	6	630202	630207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074955
18130	NC_021200	CGGC	2	8	630252	630259	0 %	0 %	50 %	50 %	499074955
18131	NC_021200	TGC	2	6	630261	630266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074955
18132	NC_021200	TTC	2	6	630281	630286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499074955
18133	NC_021200	CGC	2	6	630310	630315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074955
18134	NC_021200	TGG	2	6	630363	630368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074955
18135	NC_021200	CGGT	2	8	630369	630376	0 %	25 %	50 %	25 %	499074955
18136	NC_021200	TGCGGC	2	12	630384	630395	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	499074955
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18138	NC_021200	TGC	2	6	630465	630470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074955
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18140	NC_021200	CGT	2	6	630487	630492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074955
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18143	NC_021200	TCG	2	6	630617	630622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074955
18144	NC_021200	GCT	2	6	630655	630660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074955
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18148	NC_021200	GTCG	2	8	630709	630716	0 %	25 %	50 %	25 %	499074955
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18153	NC_021200	TGG	2	6	630765	630770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074955
18154	NC_021200	CGT	2	6	630796	630801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074955
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18183	NC_021200	CGC	2	6	631770	631775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074956
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18196	NC_021200	CGA	2	6	632214	632219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074956
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18212	NC_021200	GCT	2	6	632871	632876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074957
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18224	NC_021200	TGA	2	6	633393	633398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074957
18225	NC_021200	GAG	2	6	633461	633466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074957
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18230	NC_021200	ACGC	2	8	633643	633650	25 %	0 %	25 %	50 %	499074958
18231	NC_021200	GC	3	6	633724	633729	0 %	0 %	50 %	50 %	499074958
18232	NC_021200	CGT	2	6	633731	633736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074958
18233	NC_021200	ATC	2	6	633811	633816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074958
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18235	NC_021200	ACA	2	6	633893	633898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499074958
18236	NC_021200	CAG	2	6	633924	633929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074958
18237	NC_021200	CGG	2	6	633938	633943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074958
18238	NC_021200	CCG	2	6	633947	633952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074958
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18362	NC_021200	GCG	2	6	638227	638232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074961
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18481	NC_021200	CGT	2	6	642332	642337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18482	NC_021200	GCGT	2	8	642356	642363	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18483	NC_021200	CCG	2	6	642453	642458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18484	NC_021200	TGG	2	6	642489	642494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18485	NC_021200	CGT	2	6	642498	642503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18486	NC_021200	GCT	2	6	642529	642534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18487	NC_021200	CTG	2	6	642563	642568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18488	NC_021200	CCG	2	6	642593	642598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18489	NC_021200	GCCG	2	8	642601	642608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18490	NC_021200	ACG	2	6	642610	642615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18491	NC_021200	CG	3	6	642637	642642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18492	NC_021200	GC	3	6	642671	642676	0 %	0 %	50 %	50 %	499074966
18493	NC_021200	CGA	2	6	642778	642783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074966
18494	NC_021200	CTT	2	6	642857	642862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499074966
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18500	NC_021200	GGCGG	2	10	643028	643037	0 %	0 %	80 %	20 %	499074966

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