MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16503	NC_021200	GCC	2	6	576681	576686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074908
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16505	NC_021200	TGG	2	6	576716	576721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074908
16506	NC_021200	CGT	2	6	576738	576743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074908
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16508	NC_021200	CGA	2	6	576782	576787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074908
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16512	NC_021200	ACCCA	2	10	576916	576925	40 %	0 %	0 %	60 %	499074908
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16523	NC_021200	CCCG	2	8	577339	577346	0 %	0 %	25 %	75 %	499074909
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16619	NC_021200	GGC	2	6	580205	580210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074912
16620	NC_021200	CGC	2	6	580223	580228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074912
16621	NC_021200	CCA	2	6	580264	580269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074912
16622	NC_021200	GCG	2	6	580270	580275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074912
16623	NC_021200	CGA	2	6	580307	580312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074912
16624	NC_021200	GCG	2	6	580349	580354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074912
16625	NC_021200	GC	3	6	580376	580381	0 %	0 %	50 %	50 %	499074912
16626	NC_021200	CGA	2	6	580385	580390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074912
16627	NC_021200	GATCGC	2	12	580403	580414	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	499074912
16628	NC_021200	AGC	2	6	580426	580431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074912
16629	NC_021200	CGA	2	6	580439	580444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074912
16630	NC_021200	CCAC	2	8	580474	580481	25 %	0 %	0 %	75 %	499074912
16631	NC_021200	GCC	2	6	580482	580487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074912
16632	NC_021200	CGC	2	6	580502	580507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074912
16633	NC_021200	GC	3	6	580509	580514	0 %	0 %	50 %	50 %	499074912
16634	NC_021200	CG	3	6	580520	580525	0 %	0 %	50 %	50 %	499074912
16635	NC_021200	CGC	2	6	580598	580603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074912
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16640	NC_021200	CGG	2	6	580735	580740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074912
16641	NC_021200	CAC	2	6	580811	580816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074912
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16643	NC_021200	CCG	2	6	580882	580887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074912
16644	NC_021200	CGG	2	6	581037	581042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074912
16645	NC_021200	CGG	2	6	581054	581059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074912
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16648	NC_021200	GCG	2	6	581086	581091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074912
16649	NC_021200	GCT	2	6	581117	581122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074912
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16653	NC_021200	ATCAGC	2	12	581359	581370	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	499074913
16654	NC_021200	TCA	2	6	581429	581434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074913
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16656	NC_021200	TCG	2	6	581509	581514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074913
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16662	NC_021200	ATCG	2	8	581613	581620	25 %	25 %	25 %	25 %	499074913
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16671	NC_021200	GGCG	2	8	581909	581916	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16672	NC_021200	GC	3	6	581921	581926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16673	NC_021200	GCC	3	9	581947	581955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16674	NC_021200	GAC	2	6	581978	581983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074914
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16679	NC_021200	GC	3	6	582216	582221	0 %	0 %	50 %	50 %	499074914
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16683	NC_021200	GTCG	2	8	582373	582380	0 %	25 %	50 %	25 %	499074914
16684	NC_021200	ATG	2	6	582411	582416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074914
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16686	NC_021200	CCG	2	6	582572	582577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074915
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16712	NC_021200	CGT	2	6	583598	583603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074917
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16739	NC_021200	CGA	2	6	584432	584437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074917
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16742	NC_021200	CGA	2	6	584678	584683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074917
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16750	NC_021200	GCCG	3	12	584872	584883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16751	NC_021200	CGG	2	6	584956	584961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16752	NC_021200	CG	3	6	584991	584996	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16753	NC_021200	CGT	2	6	585019	585024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16755	NC_021200	GCC	2	6	585042	585047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16757	NC_021200	GCC	2	6	585160	585165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16758	NC_021200	GTGAT	2	10	585180	585189	20 %	40 %	40 %	0 %	499074918
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16778	NC_021200	GTC	3	9	585952	585960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16858	NC_021200	CTG	2	6	589297	589302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074920
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16978	NC_021200	GCG	2	6	593257	593262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074924
16979	NC_021200	CGC	3	9	593279	593287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074924
16980	NC_021200	CCA	2	6	593335	593340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074924
16981	NC_021200	GC	3	6	593410	593415	0 %	0 %	50 %	50 %	499074924
16982	NC_021200	CGC	2	6	593423	593428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074924
16983	NC_021200	GC	3	6	593461	593466	0 %	0 %	50 %	50 %	499074924
16984	NC_021200	GC	3	6	593494	593499	0 %	0 %	50 %	50 %	499074924
16985	NC_021200	CGC	3	9	593497	593505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074924
16986	NC_021200	GCA	2	6	593506	593511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074924
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16988	NC_021200	GC	3	6	593635	593640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16989	NC_021200	GC	3	6	593650	593655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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