MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_021200	CGC	2	6	543322	543327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074883
15502	NC_021200	CGA	2	6	543337	543342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074883
15503	NC_021200	ACC	2	6	543344	543349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074883
15504	NC_021200	GTC	4	12	543359	543370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074883
15505	NC_021200	GCA	2	6	543381	543386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074883
15506	NC_021200	CCA	2	6	543435	543440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074883
15507	NC_021200	TGC	2	6	543450	543455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074883
15508	NC_021200	CAT	2	6	543484	543489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074883
15509	NC_021200	CCA	2	6	543495	543500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074883
15510	NC_021200	CGA	2	6	543505	543510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074883
15511	NC_021200	CCG	2	6	543513	543518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074883
15512	NC_021200	CG	4	8	543535	543542	0 %	0 %	50 %	50 %	499074883
15513	NC_021200	TCG	2	6	543564	543569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074883
15514	NC_021200	CTG	2	6	543599	543604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074883
15515	NC_021200	CAG	2	6	543605	543610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074883
15516	NC_021200	GGT	3	9	543625	543633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074883
15517	NC_021200	GTC	2	6	543634	543639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074883
15518	NC_021200	CGG	2	6	543645	543650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074883
15519	NC_021200	GCT	2	6	543655	543660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074883
15520	NC_021200	CCA	3	9	543669	543677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074883
15521	NC_021200	GTG	2	6	543686	543691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074883
15522	NC_021200	GAT	2	6	543694	543699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074883
15523	NC_021200	CTG	2	6	543707	543712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074883
15524	NC_021200	CGG	2	6	543766	543771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074883
15525	NC_021200	GTG	2	6	543806	543811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074883
15526	NC_021200	CGGC	2	8	543815	543822	0 %	0 %	50 %	50 %	499074883
15527	NC_021200	TGC	2	6	543823	543828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074883
15528	NC_021200	GCT	2	6	543937	543942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074883
15529	NC_021200	GCC	2	6	543992	543997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074883
15530	NC_021200	GCG	2	6	543998	544003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074883
15531	NC_021200	GCT	2	6	544021	544026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074883
15532	NC_021200	TCG	2	6	544053	544058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074883
15533	NC_021200	GTG	2	6	544070	544075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074883
15534	NC_021200	GCC	3	9	544082	544090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074883
15535	NC_021200	CCG	2	6	544109	544114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074883
15536	NC_021200	CGGC	2	8	544144	544151	0 %	0 %	50 %	50 %	499074883
15537	NC_021200	GC	3	6	544170	544175	0 %	0 %	50 %	50 %	499074883
15538	NC_021200	GAT	2	6	544187	544192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074883
15539	NC_021200	GC	3	6	544201	544206	0 %	0 %	50 %	50 %	499074883
15540	NC_021200	GGT	2	6	544210	544215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074883
15541	NC_021200	CGA	2	6	544243	544248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074883
15542	NC_021200	CAG	2	6	544252	544257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074883
15543	NC_021200	GCT	2	6	544282	544287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074883
15544	NC_021200	GGCC	2	8	544338	544345	0 %	0 %	50 %	50 %	499074883
15545	NC_021200	CGGG	2	8	544346	544353	0 %	0 %	75 %	25 %	499074883
15546	NC_021200	GAG	2	6	544385	544390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074883
15547	NC_021200	CGG	2	6	544407	544412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074883
15548	NC_021200	ACG	2	6	544428	544433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074883
15549	NC_021200	GCG	2	6	544434	544439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074883
15550	NC_021200	CG	3	6	544442	544447	0 %	0 %	50 %	50 %	499074883
15551	NC_021200	GCT	2	6	544489	544494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074883
15552	NC_021200	TCG	2	6	544503	544508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074883
15553	NC_021200	GT	4	8	544529	544536	0 %	50 %	50 %	0 %	499074883
15554	NC_021200	GAG	2	6	544553	544558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074883
15555	NC_021200	CAGC	2	8	544594	544601	25 %	0 %	25 %	50 %	499074883
15556	NC_021200	CGCT	2	8	544616	544623	0 %	25 %	25 %	50 %	499074883
15557	NC_021200	ACG	2	6	544674	544679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074883
15558	NC_021200	GGC	2	6	544693	544698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074883
15559	NC_021200	CGA	2	6	544711	544716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074883
15560	NC_021200	GC	3	6	544720	544725	0 %	0 %	50 %	50 %	499074883
15561	NC_021200	GGC	2	6	544732	544737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074883
15562	NC_021200	GTC	2	6	544747	544752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074883
15563	NC_021200	CG	3	6	544795	544800	0 %	0 %	50 %	50 %	499074883
15564	NC_021200	ATC	2	6	544805	544810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074883
15565	NC_021200	GGT	2	6	544838	544843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074884
15566	NC_021200	GCG	2	6	544880	544885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074884
15567	NC_021200	TTG	2	6	544937	544942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499074884
15568	NC_021200	CCG	2	6	544943	544948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074884
15569	NC_021200	CGG	4	12	544968	544979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074884
15570	NC_021200	TCA	2	6	545034	545039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074884
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15574	NC_021200	CGA	2	6	545176	545181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15575	NC_021200	CGA	2	6	545234	545239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15576	NC_021200	CCG	2	6	545368	545373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074885
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15578	NC_021200	CG	3	6	545410	545415	0 %	0 %	50 %	50 %	499074885
15579	NC_021200	GCCGGC	2	12	545433	545444	0 %	0 %	50 %	50 %	499074885
15580	NC_021200	CACC	2	8	545465	545472	25 %	0 %	0 %	75 %	499074885
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15584	NC_021200	CGG	2	6	545602	545607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074885
15585	NC_021200	CGC	3	9	545636	545644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074885
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15587	NC_021200	GCT	2	6	545699	545704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074885
15588	NC_021200	GGT	2	6	545720	545725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074885
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15590	NC_021200	CGA	2	6	545765	545770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074885
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15600	NC_021200	ACCGCT	2	12	546022	546033	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	499074885
15601	NC_021200	CGA	2	6	546044	546049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074885
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15738	NC_021200	TCG	2	6	550693	550698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074889
15739	NC_021200	CGC	2	6	550712	550717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074889
15740	NC_021200	CGC	2	6	550737	550742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074889
15741	NC_021200	GTC	2	6	550746	550751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074889
15742	NC_021200	GTC	2	6	550755	550760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074889
15743	NC_021200	GCA	2	6	550769	550774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074889
15744	NC_021200	CGG	2	6	550814	550819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074889
15745	NC_021200	CGG	2	6	550844	550849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074889
15746	NC_021200	GGCCG	2	10	550908	550917	0 %	0 %	60 %	40 %	499074889
15747	NC_021200	CGGCGC	2	12	550927	550938	0 %	0 %	50 %	50 %	499074889
15748	NC_021200	GCG	2	6	550984	550989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074889
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15754	NC_021200	CTGG	2	8	551220	551227	0 %	25 %	50 %	25 %	499074889
15755	NC_021200	CCAG	2	8	551228	551235	25 %	0 %	25 %	50 %	499074889
15756	NC_021200	CG	3	6	551272	551277	0 %	0 %	50 %	50 %	499074889
15757	NC_021200	CCCA	2	8	551457	551464	25 %	0 %	0 %	75 %	499074889
15758	NC_021200	CAT	2	6	551472	551477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074889
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15761	NC_021200	GGC	2	6	551523	551528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074889
15762	NC_021200	CGGC	2	8	551603	551610	0 %	0 %	50 %	50 %	499074889
15763	NC_021200	CCG	2	6	551636	551641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074889
15764	NC_021200	CCAG	2	8	551660	551667	25 %	0 %	25 %	50 %	499074889
15765	NC_021200	TGG	3	9	551705	551713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074889
15766	NC_021200	GC	3	6	551757	551762	0 %	0 %	50 %	50 %	499074889
15767	NC_021200	CCG	2	6	551794	551799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074889
15768	NC_021200	CGC	2	6	551876	551881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074889
15769	NC_021200	TCTT	2	8	551932	551939	0 %	75 %	0 %	25 %	499074889
15770	NC_021200	TCC	2	6	551956	551961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499074889
15771	NC_021200	GGA	2	6	551964	551969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074889
15772	NC_021200	CG	3	6	552025	552030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15773	NC_021200	CGG	2	6	552088	552093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15774	NC_021200	GTG	2	6	552160	552165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074890
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15777	NC_021200	GGT	2	6	552258	552263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074890
15778	NC_021200	ACC	2	6	552292	552297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074890
15779	NC_021200	GAC	2	6	552312	552317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074890
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15782	NC_021200	CG	3	6	552392	552397	0 %	0 %	50 %	50 %	499074890
15783	NC_021200	CCCG	2	8	552408	552415	0 %	0 %	25 %	75 %	499074890
15784	NC_021200	CG	3	6	552422	552427	0 %	0 %	50 %	50 %	499074890
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15800	NC_021200	TCG	2	6	552896	552901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074890
15801	NC_021200	CGGGA	2	10	552903	552912	20 %	0 %	60 %	20 %	499074890
15802	NC_021200	CCG	2	6	552920	552925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074890
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15804	NC_021200	CGC	2	6	552969	552974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074890
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15807	NC_021200	CGGG	2	8	553112	553119	0 %	0 %	75 %	25 %	499074890
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15817	NC_021200	CGGCTG	2	12	553533	553544	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	499074891
15818	NC_021200	CTG	2	6	553575	553580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074891
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15825	NC_021200	TGC	2	6	553864	553869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074891
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15832	NC_021200	TCG	2	6	554122	554127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074891
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15839	NC_021200	CAG	2	6	554355	554360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074891
15840	NC_021200	CTA	2	6	554372	554377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074891
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15846	NC_021200	CTACAC	2	12	554783	554794	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	499074891
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15849	NC_021200	CTT	2	6	554867	554872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499074891
15850	NC_021200	CGGCG	2	10	554923	554932	0 %	0 %	60 %	40 %	499074891
15851	NC_021200	ACC	2	6	554958	554963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074891
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15854	NC_021200	CAA	2	6	555101	555106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499074891
15855	NC_021200	ACG	2	6	555169	555174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074891
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15978	NC_021200	GCT	2	6	559207	559212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074894
15979	NC_021200	CCG	2	6	559215	559220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074894
15980	NC_021200	GCCCAC	2	12	559272	559283	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	499074894
15981	NC_021200	CCCG	2	8	559285	559292	0 %	0 %	25 %	75 %	499074894
15982	NC_021200	CAG	2	6	559337	559342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074894
15983	NC_021200	CAG	2	6	559367	559372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074894
15984	NC_021200	GCAA	2	8	559398	559405	50 %	0 %	25 %	25 %	499074894
15985	NC_021200	CCA	2	6	559439	559444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074894
15986	NC_021200	GCA	2	6	559456	559461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074894
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15989	NC_021200	CGG	2	6	559573	559578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074894
15990	NC_021200	CCT	2	6	559605	559610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15991	NC_021200	C	6	6	559612	559617	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15992	NC_021200	CGGC	2	8	559658	559665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15993	NC_021200	GCG	2	6	559666	559671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15994	NC_021200	CGG	2	6	559673	559678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15995	NC_021200	CGG	2	6	559681	559686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15996	NC_021200	CGC	2	6	559695	559700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15997	NC_021200	GCG	3	9	559759	559767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074895
15998	NC_021200	GGCC	2	8	559782	559789	0 %	0 %	50 %	50 %	499074895
15999	NC_021200	CGA	2	6	559838	559843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074895
16000	NC_021200	GC	3	6	560011	560016	0 %	0 %	50 %	50 %	499074895

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