MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_021200	GCACC	2	10	527641	527650	20 %	0 %	20 %	60 %	499074870
15003	NC_021200	TCG	2	6	527676	527681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074870
15004	NC_021200	ATC	2	6	527718	527723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074870
15005	NC_021200	GCA	2	6	527746	527751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074870
15006	NC_021200	GTG	2	6	527808	527813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074870
15007	NC_021200	GTGG	2	8	527816	527823	0 %	25 %	75 %	0 %	499074870
15008	NC_021200	CCG	2	6	527824	527829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074870
15009	NC_021200	GCG	2	6	527833	527838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074870
15010	NC_021200	TGGG	2	8	527853	527860	0 %	25 %	75 %	0 %	499074870
15011	NC_021200	TGA	2	6	527887	527892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074870
15012	NC_021200	GTC	2	6	527933	527938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074870
15013	NC_021200	TCG	2	6	527994	527999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074870
15014	NC_021200	TCG	2	6	528003	528008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074870
15015	NC_021200	GCCC	2	8	528025	528032	0 %	0 %	25 %	75 %	499074870
15016	NC_021200	CTG	2	6	528047	528052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074870
15017	NC_021200	AGC	2	6	528063	528068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074870
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15019	NC_021200	CGGCGC	2	12	528094	528105	0 %	0 %	50 %	50 %	499074870
15020	NC_021200	GCC	2	6	528137	528142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074870
15021	NC_021200	ACC	2	6	528153	528158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074870
15022	NC_021200	CCG	2	6	528171	528176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074870
15023	NC_021200	CGG	2	6	528178	528183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074870
15024	NC_021200	GCC	2	6	528195	528200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074870
15025	NC_021200	CAC	2	6	528245	528250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074870
15026	NC_021200	GC	4	8	528256	528263	0 %	0 %	50 %	50 %	499074870
15027	NC_021200	GCCG	2	8	528293	528300	0 %	0 %	50 %	50 %	499074870
15028	NC_021200	GCA	2	6	528310	528315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074870
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15030	NC_021200	GTC	2	6	528371	528376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074870
15031	NC_021200	GCCAGC	2	12	528381	528392	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	499074870
15032	NC_021200	TCG	2	6	528438	528443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074870
15033	NC_021200	GC	3	6	528445	528450	0 %	0 %	50 %	50 %	499074870
15034	NC_021200	TCG	2	6	528459	528464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074870
15035	NC_021200	TGG	2	6	528502	528507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074870
15036	NC_021200	GTAG	2	8	528524	528531	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15037	NC_021200	CG	3	6	528580	528585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15038	NC_021200	CCGGCT	2	12	528620	528631	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15039	NC_021200	CGGG	2	8	528652	528659	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15040	NC_021200	GCAC	2	8	528668	528675	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15041	NC_021200	TGG	2	6	528686	528691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15042	NC_021200	AGA	2	6	528696	528701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15043	NC_021200	CTAC	2	8	528718	528725	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15044	NC_021200	TCC	2	6	528808	528813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499074871
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15047	NC_021200	C	6	6	528854	528859	0 %	0 %	0 %	100 %	499074871
15048	NC_021200	ACC	2	6	528872	528877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074871
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15050	NC_021200	CGA	2	6	528942	528947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074871
15051	NC_021200	CGGA	2	8	528972	528979	25 %	0 %	50 %	25 %	499074871
15052	NC_021200	GCC	3	9	528997	529005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074871
15053	NC_021200	GCA	2	6	529011	529016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074871
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15055	NC_021200	GTG	2	6	529060	529065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074871
15056	NC_021200	ACC	2	6	529103	529108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074871
15057	NC_021200	CTGG	2	8	529128	529135	0 %	25 %	50 %	25 %	499074871
15058	NC_021200	GCC	2	6	529171	529176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074871
15059	NC_021200	CGA	2	6	529209	529214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074871
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15061	NC_021200	CGCGC	2	10	529231	529240	0 %	0 %	40 %	60 %	499074871
15062	NC_021200	TCG	3	9	529265	529273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074871
15063	NC_021200	GC	3	6	529281	529286	0 %	0 %	50 %	50 %	499074871
15064	NC_021200	CAG	2	6	529299	529304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074871
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15067	NC_021200	GGCGA	2	10	529348	529357	20 %	0 %	60 %	20 %	499074871
15068	NC_021200	CTG	2	6	529375	529380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074871
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15071	NC_021200	CCGGCG	2	12	529415	529426	0 %	0 %	50 %	50 %	499074871
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15087	NC_021200	GAC	2	6	529783	529788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074872
15088	NC_021200	GCC	3	9	529817	529825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074872
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15091	NC_021200	GACG	2	8	529972	529979	25 %	0 %	50 %	25 %	499074872
15092	NC_021200	TGG	2	6	529983	529988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074872
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15102	NC_021200	GTC	2	6	530236	530241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074872
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15104	NC_021200	CG	3	6	530305	530310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15105	NC_021200	CTG	3	9	530418	530426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15118	NC_021200	CCCGG	2	10	531232	531241	0 %	0 %	40 %	60 %	499074874
15119	NC_021200	GCCG	2	8	531259	531266	0 %	0 %	50 %	50 %	499074874
15120	NC_021200	CGA	2	6	531282	531287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074874
15121	NC_021200	CGA	3	9	531300	531308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074874
15122	NC_021200	GCCGC	2	10	531316	531325	0 %	0 %	40 %	60 %	499074874
15123	NC_021200	TCG	2	6	531326	531331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074874
15124	NC_021200	CCGT	2	8	531371	531378	0 %	25 %	25 %	50 %	499074874
15125	NC_021200	GCCG	2	8	531477	531484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15126	NC_021200	TAC	2	6	531529	531534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15127	NC_021200	CGT	3	9	531562	531570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15128	NC_021200	CGG	2	6	531590	531595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074875
15129	NC_021200	GC	3	6	531605	531610	0 %	0 %	50 %	50 %	499074875
15130	NC_021200	GGC	2	6	531628	531633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074875
15131	NC_021200	GCA	2	6	531673	531678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074875
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15133	NC_021200	CGA	2	6	531701	531706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074875
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15135	NC_021200	CTGG	2	8	531806	531813	0 %	25 %	50 %	25 %	499074875
15136	NC_021200	GC	3	6	531839	531844	0 %	0 %	50 %	50 %	499074875
15137	NC_021200	TGG	2	6	531862	531867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074875
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15144	NC_021200	GCCG	2	8	532025	532032	0 %	0 %	50 %	50 %	499074875
15145	NC_021200	CGG	2	6	532046	532051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074875
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15162	NC_021200	TGG	2	6	532722	532727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15163	NC_021200	CCGA	2	8	532749	532756	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15164	NC_021200	CGC	2	6	532783	532788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074876
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15361	NC_021200	CGT	2	6	538691	538696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074881
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15478	NC_021200	GCC	2	6	542570	542575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074882
15479	NC_021200	GCCTG	2	10	542595	542604	0 %	20 %	40 %	40 %	499074882
15480	NC_021200	GGC	2	6	542605	542610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074882
15481	NC_021200	GTC	2	6	542629	542634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074882
15482	NC_021200	GC	3	6	542663	542668	0 %	0 %	50 %	50 %	499074882
15483	NC_021200	GGT	2	6	542674	542679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074882
15484	NC_021200	CGA	2	6	542701	542706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074882
15485	NC_021200	ACCG	2	8	542725	542732	25 %	0 %	25 %	50 %	499074882
15486	NC_021200	CGC	2	6	542748	542753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15487	NC_021200	GCA	2	6	542806	542811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15488	NC_021200	CCG	2	6	542829	542834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074883
15489	NC_021200	GCC	2	6	542882	542887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074883
15490	NC_021200	CCA	2	6	542896	542901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074883
15491	NC_021200	GTG	2	6	542912	542917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074883
15492	NC_021200	GAG	2	6	542927	542932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074883
15493	NC_021200	TCA	2	6	542952	542957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074883
15494	NC_021200	TGG	2	6	542979	542984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074883
15495	NC_021200	CGC	3	9	542992	543000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074883
15496	NC_021200	ACC	2	6	543098	543103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074883
15497	NC_021200	CCGC	2	8	543135	543142	0 %	0 %	25 %	75 %	499074883
15498	NC_021200	CAC	2	6	543202	543207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074883
15499	NC_021200	GGA	2	6	543258	543263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074883
15500	NC_021200	CCG	2	6	543315	543320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074883

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