MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_021200	ACA	2	6	508876	508881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499074849
14502	NC_021200	CAGGGC	2	12	508922	508933	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	499074849
14503	NC_021200	GGCG	2	8	508963	508970	0 %	0 %	75 %	25 %	499074849
14504	NC_021200	GCA	2	6	509002	509007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074849
14505	NC_021200	CCG	2	6	509016	509021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074849
14506	NC_021200	CGG	3	9	509035	509043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074849
14507	NC_021200	GTG	3	9	509061	509069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074849
14508	NC_021200	GAT	2	6	509072	509077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074849
14509	NC_021200	CAG	2	6	509120	509125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074849
14510	NC_021200	GC	3	6	509127	509132	0 %	0 %	50 %	50 %	499074849
14511	NC_021200	GGCC	2	8	509134	509141	0 %	0 %	50 %	50 %	499074849
14512	NC_021200	AGC	2	6	509142	509147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074849
14513	NC_021200	GCC	2	6	509166	509171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074849
14514	NC_021200	CACG	2	8	509216	509223	25 %	0 %	25 %	50 %	499074849
14515	NC_021200	GCG	2	6	509256	509261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074849
14516	NC_021200	GC	3	6	509289	509294	0 %	0 %	50 %	50 %	499074849
14517	NC_021200	AGT	2	6	509307	509312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074849
14518	NC_021200	GTTG	2	8	509341	509348	0 %	50 %	50 %	0 %	499074849
14519	NC_021200	GCG	3	9	509363	509371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074849
14520	NC_021200	TCG	2	6	509382	509387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074849
14521	NC_021200	GC	3	6	509490	509495	0 %	0 %	50 %	50 %	499074849
14522	NC_021200	GATC	2	8	509509	509516	25 %	25 %	25 %	25 %	499074849
14523	NC_021200	TGG	2	6	509529	509534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074849
14524	NC_021200	GCG	3	9	509589	509597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074849
14525	NC_021200	GCC	2	6	509601	509606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074849
14526	NC_021200	GCG	2	6	509658	509663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074849
14527	NC_021200	CCG	2	6	509672	509677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074849
14528	NC_021200	GGC	2	6	509678	509683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074849
14529	NC_021200	C	6	6	509733	509738	0 %	0 %	0 %	100 %	499074849
14530	NC_021200	CCG	2	6	509743	509748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074849
14531	NC_021200	GCC	2	6	509800	509805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074849
14532	NC_021200	GGC	2	6	509891	509896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074849
14533	NC_021200	CGC	2	6	509912	509917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074849
14534	NC_021200	A	6	6	509973	509978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14535	NC_021200	GAC	2	6	509990	509995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14536	NC_021200	GGC	3	9	510023	510031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14537	NC_021200	CCGG	2	8	510052	510059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14538	NC_021200	CCA	2	6	510095	510100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14539	NC_021200	TCCGG	2	10	510151	510160	0 %	20 %	40 %	40 %	499074850
14540	NC_021200	GTT	2	6	510173	510178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499074850
14541	NC_021200	CGG	2	6	510268	510273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074850
14542	NC_021200	CCGGCA	2	12	510321	510332	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	499074850
14543	NC_021200	TCC	2	6	510366	510371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14544	NC_021200	GC	3	6	510377	510382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14545	NC_021200	CGC	2	6	510431	510436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14546	NC_021200	CAG	2	6	510486	510491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074851
14547	NC_021200	GCC	2	6	510532	510537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074851
14548	NC_021200	CGT	2	6	510564	510569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074851
14549	NC_021200	CGG	2	6	510572	510577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074851
14550	NC_021200	CCGG	2	8	510657	510664	0 %	0 %	50 %	50 %	499074851
14551	NC_021200	GGC	2	6	510702	510707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074851
14552	NC_021200	CAG	3	9	510711	510719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074851
14553	NC_021200	GC	3	6	510726	510731	0 %	0 %	50 %	50 %	499074851
14554	NC_021200	CAT	2	6	510765	510770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074851
14555	NC_021200	TCG	2	6	510817	510822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074851
14556	NC_021200	GCA	2	6	510878	510883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074851
14557	NC_021200	GTA	3	9	510900	510908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074851
14558	NC_021200	GTG	2	6	510913	510918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074851
14559	NC_021200	CG	3	6	510965	510970	0 %	0 %	50 %	50 %	499074851
14560	NC_021200	CA	3	6	511004	511009	50 %	0 %	0 %	50 %	499074851
14561	NC_021200	GGC	3	9	511013	511021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074851
14562	NC_021200	TCG	2	6	511024	511029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074851
14563	NC_021200	GCC	2	6	511083	511088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074852
14564	NC_021200	TGA	2	6	511097	511102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074852
14565	NC_021200	CGG	2	6	511127	511132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074852
14566	NC_021200	CG	3	6	511178	511183	0 %	0 %	50 %	50 %	499074852
14567	NC_021200	GCG	2	6	511204	511209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074852
14568	NC_021200	ACCG	2	8	511234	511241	25 %	0 %	25 %	50 %	499074852
14569	NC_021200	TGT	2	6	511289	511294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499074852
14570	NC_021200	CGCGA	2	10	511306	511315	20 %	0 %	40 %	40 %	499074852
14571	NC_021200	GGCC	2	8	511359	511366	0 %	0 %	50 %	50 %	499074852
14572	NC_021200	GGGC	2	8	511367	511374	0 %	0 %	75 %	25 %	499074852
14573	NC_021200	CGC	2	6	511386	511391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074852
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14579	NC_021200	GCC	2	6	511668	511673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074852
14580	NC_021200	GGC	3	9	511674	511682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074852
14581	NC_021200	CG	3	6	511702	511707	0 %	0 %	50 %	50 %	499074852
14582	NC_021200	GGC	2	6	511761	511766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074852
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14586	NC_021200	CGC	2	6	511864	511869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14587	NC_021200	CGC	2	6	511874	511879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14588	NC_021200	GGC	2	6	511964	511969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074853
14589	NC_021200	CGC	2	6	511990	511995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074853
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14592	NC_021200	CGGG	2	8	512057	512064	0 %	0 %	75 %	25 %	499074853
14593	NC_021200	CAT	2	6	512144	512149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074853
14594	NC_021200	CGA	2	6	512207	512212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074853
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14601	NC_021200	GC	3	6	512453	512458	0 %	0 %	50 %	50 %	499074853
14602	NC_021200	CGGG	2	8	512479	512486	0 %	0 %	75 %	25 %	499074853
14603	NC_021200	ACC	2	6	512490	512495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074853
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14607	NC_021200	ACCGC	2	10	512758	512767	20 %	0 %	20 %	60 %	499074853
14608	NC_021200	TGA	2	6	512773	512778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074853
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14620	NC_021200	CGG	2	6	513457	513462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074854
14621	NC_021200	CGA	2	6	513478	513483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074854
14622	NC_021200	GCC	2	6	513581	513586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074854
14623	NC_021200	GGC	2	6	513587	513592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074854
14624	NC_021200	CGT	2	6	513607	513612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074854
14625	NC_021200	CGG	2	6	513633	513638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074854
14626	NC_021200	CGT	2	6	513657	513662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074854
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14630	NC_021200	GGC	2	6	513886	513891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074854
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14636	NC_021200	CGACTC	2	12	514028	514039	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	499074855
14637	NC_021200	TCG	2	6	514063	514068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074855
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14640	NC_021200	ACC	2	6	514177	514182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074855
14641	NC_021200	CAC	2	6	514244	514249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074855
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14644	NC_021200	GCT	2	6	514292	514297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074855
14645	NC_021200	GTGC	2	8	514307	514314	0 %	25 %	50 %	25 %	499074855
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14647	NC_021200	CTG	2	6	514371	514376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074855
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14649	NC_021200	CCGA	2	8	514452	514459	25 %	0 %	25 %	50 %	499074855
14650	NC_021200	TTCC	2	8	514505	514512	0 %	50 %	0 %	50 %	499074855
14651	NC_021200	CG	3	6	514529	514534	0 %	0 %	50 %	50 %	499074855
14652	NC_021200	CGA	2	6	514544	514549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074855
14653	NC_021200	AGC	2	6	514560	514565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074855
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14655	NC_021200	GCT	2	6	514664	514669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074855
14656	NC_021200	GGC	2	6	514747	514752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074855
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14660	NC_021200	TAC	2	6	514893	514898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074855
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14671	NC_021200	CGG	2	6	515269	515274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074856
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14674	NC_021200	CCGG	2	8	515315	515322	0 %	0 %	50 %	50 %	499074856
14675	NC_021200	GTC	2	6	515327	515332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074856
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14691	NC_021200	CGT	2	6	515848	515853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074856
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14707	NC_021200	CAT	2	6	516521	516526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074857
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14713	NC_021200	CGG	2	6	516775	516780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074857
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14715	NC_021200	GCC	2	6	516855	516860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074857
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14718	NC_021200	CGG	2	6	517096	517101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14719	NC_021200	CG	3	6	517115	517120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14720	NC_021200	GAG	2	6	517221	517226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14722	NC_021200	CGA	2	6	517244	517249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074858
14723	NC_021200	GAG	2	6	517261	517266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074858
14724	NC_021200	TGGC	2	8	517271	517278	0 %	25 %	50 %	25 %	499074858
14725	NC_021200	GCA	2	6	517324	517329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074858
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14728	NC_021200	CGG	2	6	517509	517514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074858
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14732	NC_021200	GAA	2	6	517834	517839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074858
14733	NC_021200	CTG	2	6	517966	517971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074858
14734	NC_021200	GCA	2	6	518007	518012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074858
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14736	NC_021200	GTC	2	6	518028	518033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074858
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14860	NC_021200	CGCA	2	8	522699	522706	25 %	0 %	25 %	50 %	499074865
14861	NC_021200	CGG	2	6	522709	522714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074865
14862	NC_021200	CAGC	2	8	522721	522728	25 %	0 %	25 %	50 %	499074865
14863	NC_021200	CGG	2	6	522747	522752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074865
14864	NC_021200	GCG	2	6	522906	522911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074865
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14878	NC_021200	CCG	2	6	523296	523301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074866
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14907	NC_021200	CCAG	2	8	524381	524388	25 %	0 %	25 %	50 %	499074867
14908	NC_021200	GCT	2	6	524456	524461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074867
14909	NC_021200	TCG	2	6	524470	524475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074867
14910	NC_021200	AGCG	2	8	524506	524513	25 %	0 %	50 %	25 %	499074867
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14914	NC_021200	GC	3	6	524575	524580	0 %	0 %	50 %	50 %	499074867
14915	NC_021200	CCGG	2	8	524592	524599	0 %	0 %	50 %	50 %	499074867
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14948	NC_021200	AC	3	6	525693	525698	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14949	NC_021200	CCGAA	2	10	525727	525736	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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14965	NC_021200	CGCGGC	2	12	526156	526167	0 %	0 %	50 %	50 %	499074869
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