MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_021200	CGT	3	9	491557	491565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074832
14002	NC_021200	CG	4	8	491569	491576	0 %	0 %	50 %	50 %	499074832
14003	NC_021200	CGA	2	6	491584	491589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074832
14004	NC_021200	TGC	2	6	491601	491606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074832
14005	NC_021200	GAG	2	6	491618	491623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074832
14006	NC_021200	GC	3	6	491649	491654	0 %	0 %	50 %	50 %	499074832
14007	NC_021200	TCG	2	6	491742	491747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074832
14008	NC_021200	ACC	2	6	491748	491753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074832
14009	NC_021200	CCCGCA	2	12	491772	491783	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	499074832
14010	NC_021200	TCG	2	6	491796	491801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074832
14011	NC_021200	CGA	3	9	491812	491820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074832
14012	NC_021200	TGATCG	2	12	491871	491882	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	499074832
14013	NC_021200	ATC	2	6	491915	491920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074832
14014	NC_021200	GCT	2	6	491954	491959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074833
14015	NC_021200	CCT	2	6	491975	491980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499074833
14016	NC_021200	GCC	2	6	492003	492008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074833
14017	NC_021200	GC	3	6	492009	492014	0 %	0 %	50 %	50 %	499074833
14018	NC_021200	CTG	2	6	492045	492050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074833
14019	NC_021200	GGGC	2	8	492071	492078	0 %	0 %	75 %	25 %	499074833
14020	NC_021200	TGC	2	6	492079	492084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074833
14021	NC_021200	CGG	2	6	492095	492100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074833
14022	NC_021200	TCA	2	6	492106	492111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074833
14023	NC_021200	CCA	2	6	492112	492117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074833
14024	NC_021200	GC	3	6	492118	492123	0 %	0 %	50 %	50 %	499074833
14025	NC_021200	GTG	2	6	492132	492137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074833
14026	NC_021200	TGC	3	9	492139	492147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074833
14027	NC_021200	CAG	2	6	492185	492190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074833
14028	NC_021200	CAC	2	6	492198	492203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074833
14029	NC_021200	CGG	2	6	492214	492219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074833
14030	NC_021200	CGT	2	6	492224	492229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074833
14031	NC_021200	CGC	2	6	492236	492241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074833
14032	NC_021200	GGCT	2	8	492258	492265	0 %	25 %	50 %	25 %	499074833
14033	NC_021200	TCG	2	6	492321	492326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074833
14034	NC_021200	CGT	2	6	492329	492334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074833
14035	NC_021200	GCT	2	6	492341	492346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074833
14036	NC_021200	GGA	2	6	492347	492352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074833
14037	NC_021200	CGG	2	6	492382	492387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074833
14038	NC_021200	GGTGCT	2	12	492395	492406	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	499074833
14039	NC_021200	GCC	2	6	492423	492428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074833
14040	NC_021200	CGG	3	9	492458	492466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074833
14041	NC_021200	CGT	2	6	492479	492484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074833
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14043	NC_021200	GC	3	6	492505	492510	0 %	0 %	50 %	50 %	499074833
14044	NC_021200	TGG	2	6	492511	492516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074833
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14048	NC_021200	GGC	2	6	492623	492628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074833
14049	NC_021200	GGTG	2	8	492659	492666	0 %	25 %	75 %	0 %	499074833
14050	NC_021200	TGG	2	6	492673	492678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074833
14051	NC_021200	GACCCG	2	12	492704	492715	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	499074833
14052	NC_021200	CGC	2	6	492746	492751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074833
14053	NC_021200	TCT	2	6	492754	492759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499074833
14054	NC_021200	TGC	2	6	492805	492810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074833
14055	NC_021200	GCC	2	6	492828	492833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074833
14056	NC_021200	CGC	2	6	492869	492874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074833
14057	NC_021200	ACG	2	6	492880	492885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074833
14058	NC_021200	GGCGC	2	10	492890	492899	0 %	0 %	60 %	40 %	499074833
14059	NC_021200	GCGG	2	8	492908	492915	0 %	0 %	75 %	25 %	499074833
14060	NC_021200	ATC	3	9	492951	492959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074833
14061	NC_021200	TCA	2	6	493015	493020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074833
14062	NC_021200	CGGC	2	8	493062	493069	0 %	0 %	50 %	50 %	499074833
14063	NC_021200	GC	3	6	493088	493093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14064	NC_021200	CCA	3	9	493116	493124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074834
14065	NC_021200	CGCCGG	2	12	493137	493148	0 %	0 %	50 %	50 %	499074834
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14070	NC_021200	CCA	2	6	493326	493331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074834
14071	NC_021200	CAG	2	6	493342	493347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074834
14072	NC_021200	GGC	2	6	493360	493365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074834
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14077	NC_021200	CGGC	2	8	493549	493556	0 %	0 %	50 %	50 %	499074834
14078	NC_021200	GC	4	8	493566	493573	0 %	0 %	50 %	50 %	499074834
14079	NC_021200	CGA	2	6	493602	493607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074834
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14083	NC_021200	GGT	2	6	493728	493733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14084	NC_021200	TCA	2	6	493744	493749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14085	NC_021200	GC	3	6	493787	493792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14086	NC_021200	GC	3	6	493831	493836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14087	NC_021200	GAC	2	6	493840	493845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14099	NC_021200	TGG	2	6	494433	494438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074835
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14101	NC_021200	GTCGG	2	10	494462	494471	0 %	20 %	60 %	20 %	499074835
14102	NC_021200	CGG	2	6	494476	494481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074835
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14104	NC_021200	CAG	2	6	494566	494571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074835
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14108	NC_021200	GCTG	2	8	494712	494719	0 %	25 %	50 %	25 %	499074835
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14111	NC_021200	CGCCC	2	10	494974	494983	0 %	0 %	20 %	80 %	499074835
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14120	NC_021200	AAG	2	6	495386	495391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074836
14121	NC_021200	ATT	2	6	495442	495447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499074836
14122	NC_021200	TGG	3	9	495507	495515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074836
14123	NC_021200	CGGC	2	8	495534	495541	0 %	0 %	50 %	50 %	499074836
14124	NC_021200	CGC	2	6	495598	495603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074836
14125	NC_021200	CGC	2	6	495747	495752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074836
14126	NC_021200	CGA	2	6	495805	495810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074836
14127	NC_021200	TGC	2	6	495819	495824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074836
14128	NC_021200	CGAT	2	8	495915	495922	25 %	25 %	25 %	25 %	499074836
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14130	NC_021200	CG	3	6	495956	495961	0 %	0 %	50 %	50 %	499074836
14131	NC_021200	GAT	2	6	495970	495975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074836
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14133	NC_021200	AAG	2	6	496028	496033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074836
14134	NC_021200	CG	3	6	496036	496041	0 %	0 %	50 %	50 %	499074836
14135	NC_021200	ATG	2	6	496049	496054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074836
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14147	NC_021200	GGC	2	6	496452	496457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074837
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14149	NC_021200	GAC	2	6	496492	496497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074837
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14151	NC_021200	CGC	2	6	496542	496547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074837
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14153	NC_021200	CGG	2	6	496574	496579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074837
14154	NC_021200	CGC	2	6	496605	496610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074837
14155	NC_021200	TCG	2	6	496640	496645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074837
14156	NC_021200	CCTGG	2	10	496665	496674	0 %	20 %	40 %	40 %	499074837
14157	NC_021200	GCCA	2	8	496678	496685	25 %	0 %	25 %	50 %	499074837
14158	NC_021200	CTG	2	6	496699	496704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074837
14159	NC_021200	TGT	2	6	496709	496714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499074837
14160	NC_021200	GGTAC	2	10	496742	496751	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14161	NC_021200	CGC	2	6	496796	496801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14162	NC_021200	GAC	2	6	496846	496851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074838
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14165	NC_021200	CAC	2	6	496954	496959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074838
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14168	NC_021200	CATCGG	2	12	497122	497133	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	499074838
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14184	NC_021200	GCC	2	6	497807	497812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074838
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14186	NC_021200	CGT	2	6	498005	498010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14187	NC_021200	GAC	2	6	498073	498078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14191	NC_021200	CCG	2	6	498208	498213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074839
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14194	NC_021200	CTG	3	9	498254	498262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074839
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14200	NC_021200	GTC	2	6	498427	498432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074839
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14218	NC_021200	CGC	2	6	499397	499402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14219	NC_021200	GTT	2	6	499485	499490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14220	NC_021200	CCG	2	6	499499	499504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14221	NC_021200	CGA	2	6	499528	499533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074840
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14223	NC_021200	GC	3	6	499596	499601	0 %	0 %	50 %	50 %	499074840
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14227	NC_021200	CCGA	2	8	499655	499662	25 %	0 %	25 %	50 %	499074840
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14232	NC_021200	TCG	2	6	499830	499835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074840
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14235	NC_021200	AGCCG	2	10	499879	499888	20 %	0 %	40 %	40 %	499074840
14236	NC_021200	GAA	2	6	499894	499899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074840
14237	NC_021200	CGG	3	9	499934	499942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074840
14238	NC_021200	ACC	2	6	499944	499949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074840
14239	NC_021200	AGGTC	2	10	499954	499963	20 %	20 %	40 %	20 %	499074840
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14242	NC_021200	GGC	2	6	500034	500039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074840
14243	NC_021200	TCG	2	6	500046	500051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074840
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14251	NC_021200	TCG	2	6	500364	500369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14255	NC_021200	GGA	2	6	500470	500475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14256	NC_021200	CCA	2	6	500511	500516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14257	NC_021200	TGC	2	6	500534	500539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14258	NC_021200	TGC	2	6	500635	500640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14260	NC_021200	CCG	2	6	500657	500662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14261	NC_021200	GCC	2	6	500679	500684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14262	NC_021200	GC	3	6	500713	500718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14263	NC_021200	CGA	2	6	500726	500731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14269	NC_021200	CCG	2	6	500877	500882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14270	NC_021200	CCG	2	6	500899	500904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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14353	NC_021200	GCT	2	6	504054	504059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074844
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14356	NC_021200	TCG	2	6	504217	504222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074844
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14359	NC_021200	TGGC	2	8	504295	504302	0 %	25 %	50 %	25 %	499074844
14360	NC_021200	TCG	2	6	504313	504318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074844
14361	NC_021200	TCGCC	2	10	504407	504416	0 %	20 %	20 %	60 %	499074844
14362	NC_021200	TGC	2	6	504425	504430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074844
14363	NC_021200	GCA	2	6	504434	504439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074844
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14373	NC_021200	CGT	2	6	504752	504757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074844
14374	NC_021200	CAC	2	6	504764	504769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074844
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14378	NC_021200	AT	3	6	504856	504861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14467	NC_021200	G	6	6	507663	507668	0 %	0 %	100 %	0 %	499074847
14468	NC_021200	CAT	2	6	507690	507695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14469	NC_021200	CCA	2	6	507765	507770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14470	NC_021200	CAC	2	6	507799	507804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074848
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14475	NC_021200	GCC	2	6	507924	507929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074848
14476	NC_021200	CGACG	2	10	507951	507960	20 %	0 %	40 %	40 %	499074848
14477	NC_021200	GCC	2	6	507988	507993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074848
14478	NC_021200	CCGGA	2	10	508005	508014	20 %	0 %	40 %	40 %	499074848
14479	NC_021200	CTA	2	6	508132	508137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074848
14480	NC_021200	CGC	2	6	508159	508164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074848
14481	NC_021200	TTC	2	6	508193	508198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499074848
14482	NC_021200	GGTC	2	8	508242	508249	0 %	25 %	50 %	25 %	499074848
14483	NC_021200	ATC	2	6	508292	508297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074848
14484	NC_021200	CGA	2	6	508399	508404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074848
14485	NC_021200	GCT	2	6	508408	508413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074848
14486	NC_021200	CCCG	3	12	508416	508427	0 %	0 %	25 %	75 %	499074848
14487	NC_021200	CAA	2	6	508468	508473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499074848
14488	NC_021200	CAA	2	6	508480	508485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499074848
14489	NC_021200	CGC	2	6	508559	508564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074849
14490	NC_021200	TCG	2	6	508566	508571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074849
14491	NC_021200	CGT	3	9	508579	508587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074849
14492	NC_021200	GGA	2	6	508609	508614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074849
14493	NC_021200	GTG	2	6	508625	508630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074849
14494	NC_021200	GGTT	2	8	508647	508654	0 %	50 %	50 %	0 %	499074849
14495	NC_021200	GGTGG	2	10	508663	508672	0 %	20 %	80 %	0 %	499074849
14496	NC_021200	GGT	2	6	508709	508714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074849
14497	NC_021200	GCA	2	6	508729	508734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074849
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14499	NC_021200	GGT	2	6	508778	508783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074849
14500	NC_021200	GTA	2	6	508823	508828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074849

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