MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13504	NC_021200	GGA	2	6	474204	474209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074818
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13619	NC_021200	CG	3	6	478512	478517	0 %	0 %	50 %	50 %	499074823
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13622	NC_021200	TCG	2	6	478639	478644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074823
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13626	NC_021200	CGG	2	6	478748	478753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074823
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13629	NC_021200	GCT	2	6	478787	478792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074823
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13641	NC_021200	GCCG	2	8	479294	479301	0 %	0 %	50 %	50 %	499074823
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13648	NC_021200	CGG	2	6	479531	479536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074823
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13653	NC_021200	CTG	2	6	479816	479821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074824
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13657	NC_021200	TGC	2	6	479952	479957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074824
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13700	NC_021200	CAG	2	6	481487	481492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074824
13701	NC_021200	TGC	2	6	481539	481544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074824
13702	NC_021200	CTG	2	6	481557	481562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13730	NC_021200	ATC	2	6	482533	482538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074825
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13732	NC_021200	CGT	2	6	482586	482591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074825
13733	NC_021200	AC	3	6	482616	482621	50 %	0 %	0 %	50 %	499074825
13734	NC_021200	GCC	2	6	482663	482668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074825
13735	NC_021200	GGC	2	6	482671	482676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074825
13736	NC_021200	ACCGCT	2	12	482710	482721	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	499074825
13737	NC_021200	CGA	2	6	482752	482757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074825
13738	NC_021200	CG	3	6	482892	482897	0 %	0 %	50 %	50 %	499074825
13739	NC_021200	ATT	2	6	482929	482934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499074825
13740	NC_021200	GC	3	6	482935	482940	0 %	0 %	50 %	50 %	499074825
13741	NC_021200	TCGCG	2	10	482944	482953	0 %	20 %	40 %	40 %	499074825
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13752	NC_021200	CGC	2	6	483270	483275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13753	NC_021200	CGCCC	2	10	483290	483299	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
13754	NC_021200	A	6	6	483301	483306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13755	NC_021200	CAG	2	6	483317	483322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13757	NC_021200	GCG	2	6	483343	483348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13758	NC_021200	CGCC	2	8	483363	483370	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13759	NC_021200	GGC	2	6	483376	483381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13760	NC_021200	GCCG	2	8	483399	483406	0 %	0 %	50 %	50 %	499074826
13761	NC_021200	GCG	2	6	483410	483415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074826
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13768	NC_021200	GC	3	6	483558	483563	0 %	0 %	50 %	50 %	499074826
13769	NC_021200	CCT	2	6	483564	483569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499074826
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13858	NC_021200	GCG	3	9	486621	486629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074828
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13861	NC_021200	GGC	2	6	486677	486682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074828
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13976	NC_021200	GTC	2	6	490766	490771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074831
13977	NC_021200	GGT	3	9	490787	490795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074831
13978	NC_021200	GCA	2	6	490826	490831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074831
13979	NC_021200	GGCCC	2	10	490841	490850	0 %	0 %	40 %	60 %	499074831
13980	NC_021200	GTG	2	6	490862	490867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074831
13981	NC_021200	GCA	2	6	490897	490902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074831
13982	NC_021200	GTG	2	6	490908	490913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074831
13983	NC_021200	GTGCTG	2	12	490926	490937	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	499074831
13984	NC_021200	GCCG	2	8	490961	490968	0 %	0 %	50 %	50 %	499074831
13985	NC_021200	GCCG	2	8	490992	490999	0 %	0 %	50 %	50 %	499074831
13986	NC_021200	GTT	2	6	491015	491020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499074831
13987	NC_021200	GCC	2	6	491046	491051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074831
13988	NC_021200	CG	3	6	491141	491146	0 %	0 %	50 %	50 %	499074831
13989	NC_021200	GCG	2	6	491205	491210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074831
13990	NC_021200	CCA	2	6	491212	491217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074831
13991	NC_021200	CCG	2	6	491221	491226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074831
13992	NC_021200	CTG	2	6	491232	491237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074831
13993	NC_021200	CTG	2	6	491265	491270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074831
13994	NC_021200	GGA	2	6	491282	491287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074831
13995	NC_021200	CCG	2	6	491392	491397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074831
13996	NC_021200	AGG	2	6	491460	491465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074832
13997	NC_021200	TGC	3	9	491466	491474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074832
13998	NC_021200	CAT	2	6	491527	491532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074832
13999	NC_021200	CG	3	6	491533	491538	0 %	0 %	50 %	50 %	499074832
14000	NC_021200	GCG	2	6	491544	491549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074832

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