MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
133001	NC_021200	GCC	2	6	4689006	4689011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078612
133002	NC_021200	CGC	2	6	4689029	4689034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078612
133003	NC_021200	GCG	2	6	4689037	4689042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078612
133004	NC_021200	CGC	2	6	4689073	4689078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078612
133005	NC_021200	CGG	3	9	4689079	4689087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078612
133006	NC_021200	GTC	2	6	4689102	4689107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078612
133007	NC_021200	TTCGCG	2	12	4689117	4689128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078612
133008	NC_021200	CAC	2	6	4689155	4689160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078612
133009	NC_021200	CGA	2	6	4689179	4689184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078612
133010	NC_021200	CCG	2	6	4689268	4689273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078612
133011	NC_021200	GAT	2	6	4689308	4689313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078612
133012	NC_021200	GGT	3	9	4689323	4689331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078612
133013	NC_021200	GCC	2	6	4689354	4689359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078613
133014	NC_021200	GCG	2	6	4689392	4689397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078613
133015	NC_021200	GCCG	2	8	4689440	4689447	0 %	0 %	50 %	50 %	499078613
133016	NC_021200	GGC	2	6	4689448	4689453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078613
133017	NC_021200	GCACA	2	10	4689455	4689464	40 %	0 %	20 %	40 %	499078613
133018	NC_021200	GCCCA	2	10	4689470	4689479	20 %	0 %	20 %	60 %	499078613
133019	NC_021200	CAA	2	6	4689577	4689582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499078613
133020	NC_021200	CACC	2	8	4689625	4689632	25 %	0 %	0 %	75 %	499078613
133021	NC_021200	GAT	2	6	4689667	4689672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078613
133022	NC_021200	GC	3	6	4689675	4689680	0 %	0 %	50 %	50 %	499078613
133023	NC_021200	CGA	2	6	4689727	4689732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078613
133024	NC_021200	CAT	2	6	4689922	4689927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078613
133025	NC_021200	GTT	2	6	4689946	4689951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499078613
133026	NC_021200	CGA	2	6	4689982	4689987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078613
133027	NC_021200	CGC	2	6	4689988	4689993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078613
133028	NC_021200	CAC	3	9	4690099	4690107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078613
133029	NC_021200	CCG	2	6	4690164	4690169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078613
133030	NC_021200	GAC	2	6	4690263	4690268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133031	NC_021200	CTCGG	2	10	4690277	4690286	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
133032	NC_021200	CGC	2	6	4690290	4690295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133033	NC_021200	GC	3	6	4690310	4690315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133034	NC_021200	GCT	2	6	4690410	4690415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133035	NC_021200	CGG	2	6	4690425	4690430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133036	NC_021200	GCTG	2	8	4690436	4690443	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133037	NC_021200	CGG	2	6	4690467	4690472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133038	NC_021200	GCC	2	6	4690567	4690572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133039	NC_021200	TGC	2	6	4690586	4690591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078614
133040	NC_021200	CGG	2	6	4690615	4690620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078614
133041	NC_021200	TGG	2	6	4690621	4690626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078614
133042	NC_021200	ACC	2	6	4690684	4690689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078614
133043	NC_021200	GGC	2	6	4690715	4690720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078614
133044	NC_021200	GAA	2	6	4690733	4690738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499078614
133045	NC_021200	CAG	2	6	4690775	4690780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078614
133046	NC_021200	CTG	2	6	4690781	4690786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078614
133047	NC_021200	CAGCCG	2	12	4690832	4690843	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	499078614
133048	NC_021200	GCA	2	6	4690852	4690857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078614
133049	NC_021200	GAT	2	6	4690871	4690876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078614
133050	NC_021200	CCA	2	6	4690900	4690905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078614
133051	NC_021200	GCC	3	9	4690929	4690937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078614
133052	NC_021200	ACG	4	12	4690938	4690949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078614
133053	NC_021200	CGA	2	6	4690957	4690962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078614
133054	NC_021200	ACC	2	6	4690966	4690971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078614
133055	NC_021200	CGG	2	6	4691011	4691016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078614
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133057	NC_021200	CGC	2	6	4691090	4691095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078614
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133059	NC_021200	CGGCGA	2	12	4691167	4691178	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	499078614
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133064	NC_021200	CAG	2	6	4691327	4691332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078614
133065	NC_021200	C	6	6	4691346	4691351	0 %	0 %	0 %	100 %	499078614
133066	NC_021200	GTA	2	6	4691405	4691410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078614
133067	NC_021200	TCG	2	6	4691463	4691468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078614
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133069	NC_021200	GAGAA	2	10	4691526	4691535	60 %	0 %	40 %	0 %	499078614
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133071	NC_021200	CGG	2	6	4691552	4691557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078614
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133075	NC_021200	C	6	6	4691707	4691712	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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133082	NC_021200	CGAGG	2	10	4691951	4691960	20 %	0 %	60 %	20 %	499078615
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133089	NC_021200	GCGACC	2	12	4692180	4692191	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	499078615
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133100	NC_021200	ACCC	2	8	4692574	4692581	25 %	0 %	0 %	75 %	499078615
133101	NC_021200	CAC	2	6	4692587	4692592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078615
133102	NC_021200	GCGG	2	8	4692662	4692669	0 %	0 %	75 %	25 %	499078615
133103	NC_021200	GAA	2	6	4692734	4692739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499078615
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133110	NC_021200	GGC	2	6	4692953	4692958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133111	NC_021200	GTG	2	6	4692982	4692987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133112	NC_021200	GCCGC	2	10	4692992	4693001	0 %	0 %	40 %	60 %	499078616
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133345	NC_021200	CGT	2	6	4701971	4701976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078628
133346	NC_021200	CG	3	6	4701987	4701992	0 %	0 %	50 %	50 %	499078628
133347	NC_021200	GCG	2	6	4702025	4702030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078628
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133349	NC_021200	GCA	2	6	4702076	4702081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078628
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133363	NC_021200	CGA	2	6	4702510	4702515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078629
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133401	NC_021200	TCG	2	6	4703934	4703939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078630
133402	NC_021200	CGG	3	9	4703980	4703988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078630
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133404	NC_021200	CGG	2	6	4704104	4704109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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133406	NC_021200	CGG	2	6	4704117	4704122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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133410	NC_021200	TGC	2	6	4704349	4704354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078631
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133445	NC_021200	CGG	3	9	4705629	4705637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078632
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133447	NC_021200	GC	3	6	4705679	4705684	0 %	0 %	50 %	50 %	499078632
133448	NC_021200	GTGCC	2	10	4705720	4705729	0 %	20 %	40 %	40 %	499078632
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133451	NC_021200	GC	3	6	4705794	4705799	0 %	0 %	50 %	50 %	499078632
133452	NC_021200	CAC	2	6	4705845	4705850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078632
133453	NC_021200	GGC	2	6	4705854	4705859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078632
133454	NC_021200	CCAC	2	8	4705925	4705932	25 %	0 %	0 %	75 %	499078632
133455	NC_021200	GGCC	2	8	4705934	4705941	0 %	0 %	50 %	50 %	499078632
133456	NC_021200	ACCGA	2	10	4705975	4705984	40 %	0 %	20 %	40 %	499078632
133457	NC_021200	GTC	2	6	4705998	4706003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078632
133458	NC_021200	GCT	2	6	4706054	4706059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078632
133459	NC_021200	GCG	2	6	4706060	4706065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078632
133460	NC_021200	GCCCC	2	10	4706072	4706081	0 %	0 %	20 %	80 %	499078632
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133464	NC_021200	GTC	2	6	4706160	4706165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078632
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133470	NC_021200	GCG	3	9	4706386	4706394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078632
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133481	NC_021200	CGGC	2	8	4706696	4706703	0 %	0 %	50 %	50 %	499078632
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133485	NC_021200	CAG	2	6	4706870	4706875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078633
133486	NC_021200	GCC	2	6	4706880	4706885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078633
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