MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
131001	NC_021200	CG	3	6	4619941	4619946	0 %	0 %	50 %	50 %	499078535
131002	NC_021200	GTCG	2	8	4619957	4619964	0 %	25 %	50 %	25 %	499078535
131003	NC_021200	GC	3	6	4619971	4619976	0 %	0 %	50 %	50 %	499078535
131004	NC_021200	TCG	2	6	4620066	4620071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078535
131005	NC_021200	GCG	2	6	4620117	4620122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078535
131006	NC_021200	CAC	2	6	4620167	4620172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078535
131007	NC_021200	CCG	2	6	4620215	4620220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078535
131008	NC_021200	GGA	2	6	4620239	4620244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499078535
131009	NC_021200	GCG	2	6	4620250	4620255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078535
131010	NC_021200	ACT	2	6	4620340	4620345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078535
131011	NC_021200	ATC	2	6	4620396	4620401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078535
131012	NC_021200	AGTG	2	8	4620418	4620425	25 %	25 %	50 %	0 %	499078535
131013	NC_021200	AGG	2	6	4620579	4620584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131014	NC_021200	GGCGAA	2	12	4620595	4620606	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	499078536
131015	NC_021200	CG	3	6	4620731	4620736	0 %	0 %	50 %	50 %	499078536
131016	NC_021200	GAG	2	6	4620761	4620766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499078536
131017	NC_021200	GCC	2	6	4620884	4620889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078536
131018	NC_021200	TGG	2	6	4620909	4620914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078536
131019	NC_021200	CGC	2	6	4620916	4620921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078536
131020	NC_021200	TGC	2	6	4620957	4620962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078536
131021	NC_021200	CGA	3	9	4621021	4621029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078536
131022	NC_021200	GCT	2	6	4621033	4621038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078536
131023	NC_021200	TCG	2	6	4621044	4621049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078536
131024	NC_021200	GCT	2	6	4621066	4621071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078536
131025	NC_021200	GCC	2	6	4621073	4621078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078536
131026	NC_021200	CGA	2	6	4621087	4621092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078536
131027	NC_021200	GGT	2	6	4621102	4621107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078536
131028	NC_021200	GTGG	2	8	4621147	4621154	0 %	25 %	75 %	0 %	499078536
131029	NC_021200	AGC	2	6	4621164	4621169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078536
131030	NC_021200	CGA	2	6	4621183	4621188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078536
131031	NC_021200	GGA	2	6	4621240	4621245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499078536
131032	NC_021200	GGT	2	6	4621273	4621278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078536
131033	NC_021200	GCG	2	6	4621296	4621301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078536
131034	NC_021200	TCG	2	6	4621329	4621334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078536
131035	NC_021200	GCT	2	6	4621390	4621395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078536
131036	NC_021200	CTG	3	9	4621427	4621435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078536
131037	NC_021200	GTC	2	6	4621472	4621477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078536
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131042	NC_021200	CCGC	2	8	4621579	4621586	0 %	0 %	25 %	75 %	499078536
131043	NC_021200	CAC	2	6	4621600	4621605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078536
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131047	NC_021200	GCCG	2	8	4621754	4621761	0 %	0 %	50 %	50 %	499078536
131048	NC_021200	GTC	2	6	4621763	4621768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078536
131049	NC_021200	ATC	2	6	4621772	4621777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078536
131050	NC_021200	AGT	2	6	4621779	4621784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078536
131051	NC_021200	CTG	2	6	4621838	4621843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131052	NC_021200	AAT	2	6	4621876	4621881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131053	NC_021200	CGG	2	6	4621886	4621891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131054	NC_021200	GTG	2	6	4621951	4621956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131055	NC_021200	TCGT	2	8	4621963	4621970	0 %	50 %	25 %	25 %	499078537
131056	NC_021200	TCG	2	6	4621988	4621993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078537
131057	NC_021200	CGA	2	6	4622027	4622032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078537
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131079	NC_021200	GGCCC	2	10	4622638	4622647	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
131080	NC_021200	GCCG	2	8	4622670	4622677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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131083	NC_021200	GCGCCG	2	12	4622713	4622724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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131086	NC_021200	CGGC	2	8	4622774	4622781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131087	NC_021200	GC	3	6	4622800	4622805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131088	NC_021200	CGC	2	6	4622810	4622815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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131091	NC_021200	GAG	2	6	4622960	4622965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131092	NC_021200	GC	3	6	4622978	4622983	0 %	0 %	50 %	50 %	499078538
131093	NC_021200	TGG	2	6	4623000	4623005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078538
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131101	NC_021200	GCTGGC	2	12	4623199	4623210	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	499078538
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131104	NC_021200	GTC	2	6	4623260	4623265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078538
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131110	NC_021200	GC	3	6	4623589	4623594	0 %	0 %	50 %	50 %	499078538
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131117	NC_021200	ACA	2	6	4623783	4623788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499078538
131118	NC_021200	CGG	2	6	4623791	4623796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078538
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131216	NC_021200	GTG	2	6	4626827	4626832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131217	NC_021200	GCGT	2	8	4626833	4626840	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131218	NC_021200	GTT	2	6	4626846	4626851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131219	NC_021200	CGT	2	6	4626894	4626899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131220	NC_021200	TCG	2	6	4626981	4626986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131221	NC_021200	CGC	2	6	4626999	4627004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131222	NC_021200	CGA	2	6	4627079	4627084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131223	NC_021200	CTG	2	6	4627147	4627152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131224	NC_021200	GGCA	2	8	4627229	4627236	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
131225	NC_021200	CAGTGA	2	12	4627247	4627258	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	499078542
131226	NC_021200	TGA	2	6	4627260	4627265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078542
131227	NC_021200	GAA	2	6	4627317	4627322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499078542
131228	NC_021200	GAG	2	6	4627360	4627365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499078542
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131459	NC_021200	CCA	2	6	4635262	4635267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078551
131460	NC_021200	CGG	2	6	4635269	4635274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078551
131461	NC_021200	CGG	2	6	4635290	4635295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078551
131462	NC_021200	GACC	2	8	4635389	4635396	25 %	0 %	25 %	50 %	499078551
131463	NC_021200	CCG	2	6	4635443	4635448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078551
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131483	NC_021200	CGG	2	6	4636225	4636230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078551
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131492	NC_021200	GCT	2	6	4636613	4636618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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131494	NC_021200	CTG	2	6	4636719	4636724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078552
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