MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
130001	NC_021200	GC	3	6	4584608	4584613	0 %	0 %	50 %	50 %	499078507
130002	NC_021200	CCT	2	6	4584675	4584680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499078507
130003	NC_021200	CCA	2	6	4584744	4584749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078507
130004	NC_021200	GCG	2	6	4584842	4584847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078507
130005	NC_021200	CGG	2	6	4584923	4584928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078507
130006	NC_021200	CTC	2	6	4584949	4584954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499078507
130007	NC_021200	CGGCAC	2	12	4584958	4584969	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	499078507
130008	NC_021200	GC	3	6	4584992	4584997	0 %	0 %	50 %	50 %	499078507
130009	NC_021200	GCA	3	9	4585008	4585016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078507
130010	NC_021200	TCG	2	6	4585046	4585051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078507
130011	NC_021200	GCA	2	6	4585053	4585058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078507
130012	NC_021200	GC	3	6	4585059	4585064	0 %	0 %	50 %	50 %	499078507
130013	NC_021200	TCG	2	6	4585091	4585096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078507
130014	NC_021200	GTC	2	6	4585102	4585107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078507
130015	NC_021200	AC	3	6	4585161	4585166	50 %	0 %	0 %	50 %	499078507
130016	NC_021200	CAG	2	6	4585195	4585200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078507
130017	NC_021200	CGG	2	6	4585203	4585208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078507
130018	NC_021200	TGGCG	2	10	4585230	4585239	0 %	20 %	60 %	20 %	499078507
130019	NC_021200	GGC	2	6	4585276	4585281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078507
130020	NC_021200	GCA	2	6	4585290	4585295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078507
130021	NC_021200	GC	3	6	4585380	4585385	0 %	0 %	50 %	50 %	499078507
130022	NC_021200	CAT	2	6	4585393	4585398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078507
130023	NC_021200	TCG	3	9	4585406	4585414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078507
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130025	NC_021200	GC	3	6	4585444	4585449	0 %	0 %	50 %	50 %	499078507
130026	NC_021200	GTC	2	6	4585456	4585461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078507
130027	NC_021200	CGG	2	6	4585467	4585472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078507
130028	NC_021200	CG	3	6	4585490	4585495	0 %	0 %	50 %	50 %	499078507
130029	NC_021200	TGCG	2	8	4585527	4585534	0 %	25 %	50 %	25 %	499078507
130030	NC_021200	CCAG	2	8	4585542	4585549	25 %	0 %	25 %	50 %	499078507
130031	NC_021200	CCT	2	6	4585608	4585613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499078507
130032	NC_021200	ACC	2	6	4585647	4585652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078507
130033	NC_021200	GCG	2	6	4585661	4585666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078507
130034	NC_021200	CGG	2	6	4585668	4585673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078507
130035	NC_021200	CGG	2	6	4585685	4585690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078507
130036	NC_021200	TCG	2	6	4585794	4585799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078508
130037	NC_021200	CGG	2	6	4585804	4585809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078508
130038	NC_021200	CAG	2	6	4585814	4585819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078508
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130041	NC_021200	GCG	2	6	4585926	4585931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078508
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130044	NC_021200	CGG	2	6	4585951	4585956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078508
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130050	NC_021200	CCAGCG	2	12	4586146	4586157	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	499078508
130051	NC_021200	TCG	2	6	4586160	4586165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078508
130052	NC_021200	GTA	2	6	4586186	4586191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078508
130053	NC_021200	CAC	2	6	4586234	4586239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078508
130054	NC_021200	GCC	2	6	4586252	4586257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078508
130055	NC_021200	TGA	2	6	4586260	4586265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078508
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130059	NC_021200	CGT	2	6	4586362	4586367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078508
130060	NC_021200	GCTCCC	2	12	4586377	4586388	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	499078508
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130062	NC_021200	GGT	2	6	4586430	4586435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130063	NC_021200	GT	3	6	4586446	4586451	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130064	NC_021200	CT	3	6	4586456	4586461	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130065	NC_021200	CGA	2	6	4586469	4586474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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130067	NC_021200	GGC	2	6	4586513	4586518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078509
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130072	NC_021200	TGA	2	6	4586812	4586817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078509
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130086	NC_021200	GTC	2	6	4587263	4587268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078509
130087	NC_021200	GC	3	6	4587269	4587274	0 %	0 %	50 %	50 %	499078509
130088	NC_021200	CGGGT	2	10	4587297	4587306	0 %	20 %	60 %	20 %	499078509
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130098	NC_021200	CCG	2	6	4587747	4587752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078510
130099	NC_021200	GAA	2	6	4587779	4587784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499078510
130100	NC_021200	TTCC	2	8	4587818	4587825	0 %	50 %	0 %	50 %	499078510
130101	NC_021200	ACTGCG	2	12	4587826	4587837	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	499078510
130102	NC_021200	TGA	2	6	4587952	4587957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078510
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130105	NC_021200	GC	3	6	4588049	4588054	0 %	0 %	50 %	50 %	499078510
130106	NC_021200	CGT	2	6	4588093	4588098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078510
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130108	NC_021200	CCCCA	2	10	4588123	4588132	20 %	0 %	0 %	80 %	499078510
130109	NC_021200	AGC	2	6	4588149	4588154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078510
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130112	NC_021200	GAA	2	6	4588286	4588291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499078510
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130114	NC_021200	TTGC	2	8	4588312	4588319	0 %	50 %	25 %	25 %	499078510
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130342	NC_021200	GCGCG	3	15	4596089	4596103	0 %	0 %	60 %	40 %	499078515
130343	NC_021200	GCG	3	9	4596101	4596109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078515
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130444	NC_021200	TGCC	2	8	4598949	4598956	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130445	NC_021200	CGAGC	2	10	4599068	4599077	20 %	0 %	40 %	40 %	499078520
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130454	NC_021200	GCCCG	2	10	4599214	4599223	0 %	0 %	40 %	60 %	499078520
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