MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
129001	NC_021200	CGC	2	6	4550071	4550076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129002	NC_021200	CCG	2	6	4550087	4550092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129003	NC_021200	CGC	2	6	4550156	4550161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129004	NC_021200	AGA	2	6	4550193	4550198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129005	NC_021200	TG	3	6	4550202	4550207	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129006	NC_021200	CGG	2	6	4550211	4550216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129007	NC_021200	GA	3	6	4550218	4550223	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129008	NC_021200	GCT	2	6	4550232	4550237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078475
129009	NC_021200	GTCGAA	2	12	4550282	4550293	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	499078475
129010	NC_021200	AGC	2	6	4550370	4550375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078475
129011	NC_021200	ACG	2	6	4550391	4550396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078475
129012	NC_021200	TCG	2	6	4550457	4550462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078475
129013	NC_021200	AAT	2	6	4550504	4550509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129014	NC_021200	CG	3	6	4550516	4550521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129015	NC_021200	CGG	2	6	4550527	4550532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129016	NC_021200	GGT	2	6	4550567	4550572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129017	NC_021200	ACC	2	6	4550576	4550581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129018	NC_021200	AGCG	2	8	4550718	4550725	25 %	0 %	50 %	25 %	499078476
129019	NC_021200	CCG	2	6	4550758	4550763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078476
129020	NC_021200	CAGC	2	8	4550791	4550798	25 %	0 %	25 %	50 %	499078476
129021	NC_021200	TCG	2	6	4550800	4550805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078476
129022	NC_021200	GCG	2	6	4550818	4550823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078476
129023	NC_021200	ACG	2	6	4550826	4550831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078476
129024	NC_021200	CGG	2	6	4550844	4550849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078476
129025	NC_021200	GCA	2	6	4550917	4550922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078476
129026	NC_021200	GCC	2	6	4550967	4550972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078476
129027	NC_021200	GCTGC	2	10	4550994	4551003	0 %	20 %	40 %	40 %	499078476
129028	NC_021200	CGA	2	6	4551005	4551010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078476
129029	NC_021200	CG	3	6	4551135	4551140	0 %	0 %	50 %	50 %	499078476
129030	NC_021200	GAGC	2	8	4551147	4551154	25 %	0 %	50 %	25 %	499078476
129031	NC_021200	GCC	2	6	4551168	4551173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078476
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129033	NC_021200	CCA	2	6	4551292	4551297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078476
129034	NC_021200	GC	3	6	4551304	4551309	0 %	0 %	50 %	50 %	499078476
129035	NC_021200	GCG	2	6	4551314	4551319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078476
129036	NC_021200	AGC	2	6	4551323	4551328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078476
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129038	NC_021200	CTT	2	6	4551391	4551396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499078477
129039	NC_021200	CGTG	2	8	4551402	4551409	0 %	25 %	50 %	25 %	499078477
129040	NC_021200	GTT	2	6	4551424	4551429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499078477
129041	NC_021200	CGG	2	6	4551431	4551436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078477
129042	NC_021200	TCA	2	6	4551474	4551479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078477
129043	NC_021200	GCT	2	6	4551490	4551495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078477
129044	NC_021200	ATC	2	6	4551533	4551538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078477
129045	NC_021200	CTG	2	6	4551554	4551559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078477
129046	NC_021200	GCC	2	6	4551572	4551577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078477
129047	NC_021200	GCG	2	6	4551596	4551601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078477
129048	NC_021200	CGCCGG	2	12	4551649	4551660	0 %	0 %	50 %	50 %	499078477
129049	NC_021200	GC	3	6	4551689	4551694	0 %	0 %	50 %	50 %	499078477
129050	NC_021200	GAG	2	6	4551704	4551709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499078477
129051	NC_021200	TGG	2	6	4551753	4551758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078477
129052	NC_021200	CGC	2	6	4551772	4551777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078477
129053	NC_021200	TCG	2	6	4551783	4551788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078477
129054	NC_021200	CGGTG	2	10	4551802	4551811	0 %	20 %	60 %	20 %	499078477
129055	NC_021200	CGG	2	6	4551829	4551834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078477
129056	NC_021200	CGG	2	6	4551867	4551872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078477
129057	NC_021200	CACCCT	2	12	4551886	4551897	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	499078477
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129059	NC_021200	GGT	2	6	4551928	4551933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078477
129060	NC_021200	GCT	2	6	4551972	4551977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078477
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129069	NC_021200	CGG	3	9	4552190	4552198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078478
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129082	NC_021200	ACT	2	6	4552753	4552758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078478
129083	NC_021200	GTC	2	6	4552806	4552811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078478
129084	NC_021200	ATC	2	6	4552812	4552817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078478
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129087	NC_021200	CTA	2	6	4552844	4552849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078478
129088	NC_021200	GCG	2	6	4552864	4552869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078478
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129230	NC_021200	CGC	2	6	4558134	4558139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078482
129231	NC_021200	CGC	2	6	4558158	4558163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078482
129232	NC_021200	GCCGG	2	10	4558168	4558177	0 %	0 %	60 %	40 %	499078482
129233	NC_021200	GCG	2	6	4558203	4558208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078483
129234	NC_021200	CG	3	6	4558207	4558212	0 %	0 %	50 %	50 %	499078483
129235	NC_021200	TGG	2	6	4558214	4558219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078483
129236	NC_021200	GGC	2	6	4558227	4558232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078483
129237	NC_021200	CGT	2	6	4558241	4558246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078483
129238	NC_021200	CGG	2	6	4558296	4558301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078483
129239	NC_021200	CCGGGT	2	12	4558359	4558370	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	499078483
129240	NC_021200	CTG	2	6	4558498	4558503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078483
129241	NC_021200	GCG	2	6	4558562	4558567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078483
129242	NC_021200	CTG	2	6	4558576	4558581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078483
129243	NC_021200	TCG	2	6	4558588	4558593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078483
129244	NC_021200	CGG	3	9	4558644	4558652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078483
129245	NC_021200	GCC	2	6	4558733	4558738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078483
129246	NC_021200	TCA	2	6	4558748	4558753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078483
129247	NC_021200	AGC	2	6	4558762	4558767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078483
129248	NC_021200	CGA	2	6	4558773	4558778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078483
129249	NC_021200	CGAT	2	8	4558790	4558797	25 %	25 %	25 %	25 %	499078483
129250	NC_021200	CTG	2	6	4558810	4558815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078483
129251	NC_021200	GCC	2	6	4558866	4558871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078483
129252	NC_021200	CTG	2	6	4558993	4558998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078483
129253	NC_021200	GCC	2	6	4559032	4559037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078483
129254	NC_021200	CGA	2	6	4559088	4559093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078483
129255	NC_021200	GCC	2	6	4559134	4559139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078483
129256	NC_021200	CCA	2	6	4559156	4559161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078483
129257	NC_021200	ACA	2	6	4559165	4559170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499078483
129258	NC_021200	CACCGG	2	12	4559178	4559189	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	499078483
129259	NC_021200	GC	3	6	4559198	4559203	0 %	0 %	50 %	50 %	499078483
129260	NC_021200	GC	4	8	4559205	4559212	0 %	0 %	50 %	50 %	499078483
129261	NC_021200	GAT	2	6	4559244	4559249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078483
129262	NC_021200	CCCAAC	2	12	4559269	4559280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078483
129263	NC_021200	TGG	2	6	4559300	4559305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078483
129264	NC_021200	TGC	2	6	4559354	4559359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078484
129265	NC_021200	CGG	2	6	4559363	4559368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078484
129266	NC_021200	GGT	2	6	4559382	4559387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078484
129267	NC_021200	TAC	2	6	4559401	4559406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078484
129268	NC_021200	CGG	2	6	4559469	4559474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078484
129269	NC_021200	CCGA	2	8	4559539	4559546	25 %	0 %	25 %	50 %	499078484
129270	NC_021200	GCGCG	2	10	4559547	4559556	0 %	0 %	60 %	40 %	499078484
129271	NC_021200	CGA	2	6	4559561	4559566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078484
129272	NC_021200	GCC	2	6	4559605	4559610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078484
129273	NC_021200	CGG	2	6	4559627	4559632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078484
129274	NC_021200	CCG	2	6	4559663	4559668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078484
129275	NC_021200	CCAG	2	8	4559720	4559727	25 %	0 %	25 %	50 %	499078484
129276	NC_021200	CGC	2	6	4559745	4559750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078484
129277	NC_021200	TGC	2	6	4559768	4559773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078484
129278	NC_021200	GCT	2	6	4559793	4559798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078484
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129280	NC_021200	GCG	2	6	4559841	4559846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078484
129281	NC_021200	TGG	2	6	4559849	4559854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078484
129282	NC_021200	GCA	2	6	4559888	4559893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078484
129283	NC_021200	CGA	2	6	4559895	4559900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078484
129284	NC_021200	CGA	2	6	4559904	4559909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078484
129285	NC_021200	TCG	2	6	4559912	4559917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078484
129286	NC_021200	ATC	2	6	4559932	4559937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078484
129287	NC_021200	GCC	2	6	4559977	4559982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078484
129288	NC_021200	GCC	2	6	4559998	4560003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078484
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129290	NC_021200	GCA	2	6	4560032	4560037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078484
129291	NC_021200	CGG	2	6	4560084	4560089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078484
129292	NC_021200	GCC	3	9	4560276	4560284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078484
129293	NC_021200	GC	3	6	4560318	4560323	0 %	0 %	50 %	50 %	499078484
129294	NC_021200	CGG	2	6	4560326	4560331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078484
129295	NC_021200	GCCG	2	8	4560351	4560358	0 %	0 %	50 %	50 %	499078484
129296	NC_021200	CCA	2	6	4560386	4560391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078484
129297	NC_021200	CGTG	2	8	4560419	4560426	0 %	25 %	50 %	25 %	499078484
129298	NC_021200	GCGG	2	8	4560441	4560448	0 %	0 %	75 %	25 %	499078484
129299	NC_021200	GCA	2	6	4560467	4560472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078484
129300	NC_021200	GC	3	6	4560548	4560553	0 %	0 %	50 %	50 %	499078484
129301	NC_021200	CCG	2	6	4560626	4560631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078484
129302	NC_021200	CCG	2	6	4560652	4560657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078484
129303	NC_021200	GTG	2	6	4560694	4560699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078484
129304	NC_021200	GCA	2	6	4560708	4560713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078484
129305	NC_021200	GC	3	6	4560740	4560745	0 %	0 %	50 %	50 %	499078484
129306	NC_021200	ACG	2	6	4560749	4560754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078484
129307	NC_021200	GGT	2	6	4560768	4560773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078484
129308	NC_021200	GTG	2	6	4560787	4560792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078484
129309	NC_021200	CCA	2	6	4560812	4560817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078484
129310	NC_021200	CGA	2	6	4560822	4560827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078484
129311	NC_021200	CGG	2	6	4560865	4560870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129312	NC_021200	GC	3	6	4560878	4560883	0 %	0 %	50 %	50 %	499078485
129313	NC_021200	GCCG	2	8	4560895	4560902	0 %	0 %	50 %	50 %	499078485
129314	NC_021200	GCG	2	6	4560927	4560932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078485
129315	NC_021200	CGA	2	6	4560940	4560945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078485
129316	NC_021200	CAC	2	6	4560957	4560962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078485
129317	NC_021200	ACCGCG	2	12	4560963	4560974	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	499078485
129318	NC_021200	CAG	2	6	4560983	4560988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078485
129319	NC_021200	GC	3	6	4561035	4561040	0 %	0 %	50 %	50 %	499078485
129320	NC_021200	AGG	2	6	4561108	4561113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499078485
129321	NC_021200	CGA	2	6	4561150	4561155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078485
129322	NC_021200	GCC	2	6	4561166	4561171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078485
129323	NC_021200	CAG	2	6	4561214	4561219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078485
129324	NC_021200	CGGC	2	8	4561236	4561243	0 %	0 %	50 %	50 %	499078485
129325	NC_021200	CCG	2	6	4561244	4561249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078485
129326	NC_021200	CGA	2	6	4561252	4561257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078485
129327	NC_021200	GGT	2	6	4561265	4561270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078485
129328	NC_021200	CAG	2	6	4561310	4561315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078485
129329	NC_021200	CAG	2	6	4561325	4561330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078485
129330	NC_021200	CGG	2	6	4561339	4561344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078485
129331	NC_021200	AAC	2	6	4561365	4561370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499078485
129332	NC_021200	CCA	2	6	4561390	4561395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078485
129333	NC_021200	GCG	2	6	4561405	4561410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078485
129334	NC_021200	GGCCG	2	10	4561412	4561421	0 %	0 %	60 %	40 %	499078485
129335	NC_021200	CCA	2	6	4561474	4561479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078485
129336	NC_021200	ACG	2	6	4561488	4561493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078485
129337	NC_021200	CGC	2	6	4561536	4561541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078485
129338	NC_021200	GTC	2	6	4561568	4561573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078485
129339	NC_021200	CCGC	2	8	4561593	4561600	0 %	0 %	25 %	75 %	499078486
129340	NC_021200	CAC	2	6	4561672	4561677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078486
129341	NC_021200	CAG	2	6	4561729	4561734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078486
129342	NC_021200	TCC	2	6	4561742	4561747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499078486
129343	NC_021200	TCG	2	6	4561769	4561774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078486
129344	NC_021200	TGG	2	6	4561839	4561844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078486
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129462	NC_021200	CCG	3	9	4565147	4565155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129463	NC_021200	CG	3	6	4565154	4565159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129464	NC_021200	CAC	2	6	4565160	4565165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129465	NC_021200	GCCGG	2	10	4565166	4565175	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
129466	NC_021200	CAG	2	6	4565196	4565201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129467	NC_021200	GCC	2	6	4565218	4565223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129468	NC_021200	CGG	2	6	4565258	4565263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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129470	NC_021200	CGG	2	6	4565372	4565377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129471	NC_021200	CAG	2	6	4565379	4565384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129472	NC_021200	CGG	2	6	4565396	4565401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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129479	NC_021200	GCA	2	6	4565615	4565620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129480	NC_021200	CGG	2	6	4565675	4565680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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129483	NC_021200	CG	3	6	4565772	4565777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129484	NC_021200	TCG	2	6	4565818	4565823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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