MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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128502	NC_021200	GAC	2	6	4532971	4532976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128503	NC_021200	CGG	2	6	4533018	4533023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128504	NC_021200	CGC	2	6	4533024	4533029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128505	NC_021200	GCG	2	6	4533124	4533129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128506	NC_021200	CGT	2	6	4533163	4533168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078465
128507	NC_021200	CGA	2	6	4533186	4533191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078465
128508	NC_021200	ACG	2	6	4533252	4533257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078465
128509	NC_021200	ATCC	2	8	4533259	4533266	25 %	25 %	0 %	50 %	499078465
128510	NC_021200	CGT	2	6	4533309	4533314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078465
128511	NC_021200	GC	3	6	4533336	4533341	0 %	0 %	50 %	50 %	499078465
128512	NC_021200	CAG	2	6	4533346	4533351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078465
128513	NC_021200	CGGGT	2	10	4533370	4533379	0 %	20 %	60 %	20 %	499078465
128514	NC_021200	GCC	2	6	4533392	4533397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078465
128515	NC_021200	CGGC	2	8	4533435	4533442	0 %	0 %	50 %	50 %	499078465
128516	NC_021200	CGT	2	6	4533480	4533485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078465
128517	NC_021200	TCG	2	6	4533497	4533502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078465
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128519	NC_021200	CGA	2	6	4533612	4533617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078465
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128528	NC_021200	GGGT	2	8	4534043	4534050	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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128552	NC_021200	TGC	2	6	4534813	4534818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078466
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128961	NC_021200	GCC	2	6	4548223	4548228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128962	NC_021200	GCA	3	9	4548262	4548270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128963	NC_021200	TTC	2	6	4548317	4548322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128964	NC_021200	GGC	2	6	4548364	4548369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128965	NC_021200	CG	3	6	4548379	4548384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128966	NC_021200	GGC	2	6	4548390	4548395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128967	NC_021200	GGCC	2	8	4548402	4548409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128968	NC_021200	CGG	2	6	4548615	4548620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128969	NC_021200	GATC	2	8	4548772	4548779	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128970	NC_021200	CGA	2	6	4548802	4548807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128971	NC_021200	CGGC	2	8	4548850	4548857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128972	NC_021200	CGGG	2	8	4548907	4548914	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
128973	NC_021200	GCCGGC	2	12	4548915	4548926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128974	NC_021200	TCG	2	6	4548959	4548964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128975	NC_021200	GCG	2	6	4548972	4548977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128976	NC_021200	GC	3	6	4549019	4549024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128977	NC_021200	CCG	2	6	4549102	4549107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128978	NC_021200	ACC	2	6	4549119	4549124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128979	NC_021200	CGA	2	6	4549147	4549152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128980	NC_021200	CGG	2	6	4549170	4549175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128981	NC_021200	GTC	2	6	4549208	4549213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128982	NC_021200	ACGC	2	8	4549224	4549231	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128983	NC_021200	ACC	2	6	4549311	4549316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128984	NC_021200	ACG	2	6	4549317	4549322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128985	NC_021200	CG	3	6	4549327	4549332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128986	NC_021200	CGGG	2	8	4549341	4549348	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
128987	NC_021200	GCA	2	6	4549372	4549377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128988	NC_021200	TCG	2	6	4549380	4549385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128989	NC_021200	CTTG	2	8	4549437	4549444	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128990	NC_021200	CGC	2	6	4549459	4549464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128991	NC_021200	GC	3	6	4549488	4549493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128992	NC_021200	CCA	2	6	4549661	4549666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128993	NC_021200	CG	4	8	4549749	4549756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128994	NC_021200	GC	3	6	4549802	4549807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128995	NC_021200	GCCG	2	8	4549885	4549892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128996	NC_021200	CAACG	2	10	4549915	4549924	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
128997	NC_021200	CGCC	2	8	4549925	4549932	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
128998	NC_021200	GCC	2	6	4549941	4549946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128999	NC_021200	CTC	2	6	4550043	4550048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129000	NC_021200	GAC	2	6	4550049	4550054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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