MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
128001	NC_021200	CCCGGG	2	12	4513597	4513608	0 %	0 %	50 %	50 %	499078447
128002	NC_021200	TCG	2	6	4513639	4513644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078447
128003	NC_021200	CGC	2	6	4513659	4513664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078447
128004	NC_021200	GGC	2	6	4513671	4513676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078447
128005	NC_021200	TGC	2	6	4513702	4513707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078448
128006	NC_021200	CCG	2	6	4513734	4513739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078448
128007	NC_021200	TGC	2	6	4513822	4513827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078448
128008	NC_021200	CCA	2	6	4513918	4513923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078448
128009	NC_021200	ACA	2	6	4514020	4514025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499078448
128010	NC_021200	ATC	2	6	4514076	4514081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078448
128011	NC_021200	CCGG	2	8	4514082	4514089	0 %	0 %	50 %	50 %	499078448
128012	NC_021200	GGT	2	6	4514099	4514104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078448
128013	NC_021200	GCTG	2	8	4514107	4514114	0 %	25 %	50 %	25 %	499078448
128014	NC_021200	GCG	2	6	4514118	4514123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078448
128015	NC_021200	TGC	2	6	4514125	4514130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078448
128016	NC_021200	GCT	2	6	4514135	4514140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078448
128017	NC_021200	GCG	2	6	4514234	4514239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128018	NC_021200	TCG	2	6	4514269	4514274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078449
128019	NC_021200	TCCT	2	8	4514280	4514287	0 %	50 %	0 %	50 %	499078449
128020	NC_021200	CCCG	2	8	4514381	4514388	0 %	0 %	25 %	75 %	499078449
128021	NC_021200	ACG	2	6	4514413	4514418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078449
128022	NC_021200	TGC	2	6	4514506	4514511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078449
128023	NC_021200	GTG	2	6	4514529	4514534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078449
128024	NC_021200	GCT	2	6	4514552	4514557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078449
128025	NC_021200	CGG	2	6	4514564	4514569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078449
128026	NC_021200	CG	3	6	4514579	4514584	0 %	0 %	50 %	50 %	499078449
128027	NC_021200	CTGG	2	8	4514585	4514592	0 %	25 %	50 %	25 %	499078449
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128030	NC_021200	TGC	2	6	4514800	4514805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078449
128031	NC_021200	CG	3	6	4514819	4514824	0 %	0 %	50 %	50 %	499078449
128032	NC_021200	CGG	2	6	4514841	4514846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078449
128033	NC_021200	CGC	2	6	4514851	4514856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078449
128034	NC_021200	TCG	2	6	4514869	4514874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078449
128035	NC_021200	TCG	2	6	4514878	4514883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078449
128036	NC_021200	TCG	3	9	4514950	4514958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078449
128037	NC_021200	GC	3	6	4515019	4515024	0 %	0 %	50 %	50 %	499078449
128038	NC_021200	CGA	2	6	4515032	4515037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078449
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128041	NC_021200	CGG	2	6	4515155	4515160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078449
128042	NC_021200	CTG	2	6	4515195	4515200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078449
128043	NC_021200	CGA	2	6	4515209	4515214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078449
128044	NC_021200	GCCG	2	8	4515230	4515237	0 %	0 %	50 %	50 %	499078449
128045	NC_021200	GCCG	2	8	4515275	4515282	0 %	0 %	50 %	50 %	499078449
128046	NC_021200	CGA	2	6	4515323	4515328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078449
128047	NC_021200	CCGGC	2	10	4515412	4515421	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
128048	NC_021200	TCC	2	6	4515461	4515466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128049	NC_021200	GCG	2	6	4515537	4515542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128050	NC_021200	ACC	2	6	4515557	4515562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128051	NC_021200	TCA	2	6	4515564	4515569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128052	NC_021200	CGC	2	6	4515583	4515588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128053	NC_021200	CGC	2	6	4515659	4515664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078450
128054	NC_021200	CG	3	6	4515701	4515706	0 %	0 %	50 %	50 %	499078450
128055	NC_021200	CGTCG	2	10	4515730	4515739	0 %	20 %	40 %	40 %	499078450
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128057	NC_021200	GTG	2	6	4515916	4515921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078450
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128095	NC_021200	CG	4	8	4517050	4517057	0 %	0 %	50 %	50 %	499078452
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128099	NC_021200	CA	3	6	4517174	4517179	50 %	0 %	0 %	50 %	499078452
128100	NC_021200	GCC	2	6	4517181	4517186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078452
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128102	NC_021200	GCA	2	6	4517245	4517250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078452
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128105	NC_021200	TCACC	2	10	4517386	4517395	20 %	20 %	0 %	60 %	499078452
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128110	NC_021200	CGA	2	6	4517579	4517584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078452
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128113	NC_021200	GTC	2	6	4517744	4517749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078452
128114	NC_021200	ACG	2	6	4517788	4517793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078452
128115	NC_021200	CCAG	2	8	4517866	4517873	25 %	0 %	25 %	50 %	499078452
128116	NC_021200	GCCCAG	2	12	4517876	4517887	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	499078452
128117	NC_021200	GC	3	6	4517907	4517912	0 %	0 %	50 %	50 %	499078452
128118	NC_021200	CGC	2	6	4517926	4517931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078452
128119	NC_021200	GC	3	6	4517951	4517956	0 %	0 %	50 %	50 %	499078452
128120	NC_021200	CGA	2	6	4517962	4517967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078452
128121	NC_021200	CG	5	10	4517984	4517993	0 %	0 %	50 %	50 %	499078452
128122	NC_021200	GCC	2	6	4518000	4518005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078452
128123	NC_021200	GCG	2	6	4518006	4518011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078452
128124	NC_021200	CGG	2	6	4518016	4518021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078452
128125	NC_021200	CAC	3	9	4518032	4518040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078452
128126	NC_021200	CGT	2	6	4518062	4518067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078452
128127	NC_021200	GGT	2	6	4518110	4518115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078453
128128	NC_021200	GGCG	2	8	4518116	4518123	0 %	0 %	75 %	25 %	499078453
128129	NC_021200	AGC	2	6	4518181	4518186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078453
128130	NC_021200	CGA	2	6	4518212	4518217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078453
128131	NC_021200	CAT	2	6	4518218	4518223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078453
128132	NC_021200	CGG	2	6	4518254	4518259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078453
128133	NC_021200	CCGC	2	8	4518269	4518276	0 %	0 %	25 %	75 %	499078453
128134	NC_021200	CCCCGA	2	12	4518305	4518316	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	499078453
128135	NC_021200	CGC	2	6	4518317	4518322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078453
128136	NC_021200	ACG	3	9	4518379	4518387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078453
128137	NC_021200	CAA	2	6	4518443	4518448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499078453
128138	NC_021200	GGT	2	6	4518623	4518628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078453
128139	NC_021200	CGC	2	6	4518653	4518658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078453
128140	NC_021200	GCCGAC	2	12	4518690	4518701	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	499078453
128141	NC_021200	GGC	2	6	4518726	4518731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078453
128142	NC_021200	CGA	2	6	4518758	4518763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078453
128143	NC_021200	CAT	2	6	4518764	4518769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078453
128144	NC_021200	CGCGG	2	10	4518878	4518887	0 %	0 %	60 %	40 %	499078453
128145	NC_021200	CGA	4	12	4518914	4518925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078453
128146	NC_021200	GGT	2	6	4518926	4518931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078453
128147	NC_021200	GCT	2	6	4518947	4518952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078453
128148	NC_021200	GGCCAA	2	12	4518971	4518982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078453
128149	NC_021200	GGCGCA	2	12	4519004	4519015	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	499078453
128150	NC_021200	GC	4	8	4519052	4519059	0 %	0 %	50 %	50 %	499078453
128151	NC_021200	AACC	2	8	4519111	4519118	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128152	NC_021200	GT	3	6	4519162	4519167	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128153	NC_021200	GAG	2	6	4519181	4519186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128154	NC_021200	GTT	2	6	4519277	4519282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499078454
128155	NC_021200	TTC	2	6	4519299	4519304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499078454
128156	NC_021200	CTA	2	6	4519340	4519345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078454
128157	NC_021200	GC	3	6	4519367	4519372	0 %	0 %	50 %	50 %	499078454
128158	NC_021200	CCG	2	6	4519441	4519446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078454
128159	NC_021200	CGC	2	6	4519526	4519531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078454
128160	NC_021200	CTG	2	6	4519535	4519540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078454
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128162	NC_021200	GC	3	6	4519580	4519585	0 %	0 %	50 %	50 %	499078454
128163	NC_021200	CGG	2	6	4519706	4519711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078454
128164	NC_021200	GCT	3	9	4519742	4519750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078454
128165	NC_021200	GCT	2	6	4519757	4519762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078454
128166	NC_021200	GTG	2	6	4519782	4519787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078454
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128168	NC_021200	CGA	2	6	4519823	4519828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078454
128169	NC_021200	CGG	2	6	4519889	4519894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078454
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128173	NC_021200	TGA	2	6	4519948	4519953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078454
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128175	NC_021200	CCG	2	6	4520027	4520032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078454
128176	NC_021200	CG	3	6	4520065	4520070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128177	NC_021200	CGC	2	6	4520104	4520109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128178	NC_021200	CAC	2	6	4520110	4520115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128179	NC_021200	CGC	2	6	4520318	4520323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078455
128180	NC_021200	TGC	2	6	4520359	4520364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078455
128181	NC_021200	CGA	2	6	4520422	4520427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128182	NC_021200	GCG	2	6	4520445	4520450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078456
128183	NC_021200	TCG	2	6	4520478	4520483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078456
128184	NC_021200	CGG	2	6	4520484	4520489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078456
128185	NC_021200	CCA	2	6	4520497	4520502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078456
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128189	NC_021200	GCG	2	6	4520574	4520579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078456
128190	NC_021200	CACCGT	2	12	4520606	4520617	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	499078456
128191	NC_021200	CGC	2	6	4520678	4520683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078456
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128193	NC_021200	GCCAGC	2	12	4520769	4520780	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	499078456
128194	NC_021200	ATC	2	6	4520784	4520789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078456
128195	NC_021200	GCA	2	6	4520797	4520802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078456
128196	NC_021200	CAC	2	6	4520831	4520836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078456
128197	NC_021200	AGC	2	6	4520889	4520894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078456
128198	NC_021200	CGATGA	2	12	4520902	4520913	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	499078456
128199	NC_021200	GGC	2	6	4520927	4520932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078456
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128201	NC_021200	CAG	2	6	4520975	4520980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078456
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128204	NC_021200	CGAC	2	8	4521163	4521170	25 %	0 %	25 %	50 %	499078456
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128208	NC_021200	TCACCG	2	12	4521334	4521345	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	499078456
128209	NC_021200	CAG	2	6	4521434	4521439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078456
128210	NC_021200	GC	3	6	4521454	4521459	0 %	0 %	50 %	50 %	499078456
128211	NC_021200	GAT	2	6	4521461	4521466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078456
128212	NC_021200	CAG	2	6	4521521	4521526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078456
128213	NC_021200	CTG	2	6	4521536	4521541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078456
128214	NC_021200	CAC	3	9	4521581	4521589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078456
128215	NC_021200	GCG	2	6	4521606	4521611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078456
128216	NC_021200	CG	3	6	4521610	4521615	0 %	0 %	50 %	50 %	499078456
128217	NC_021200	TGA	2	6	4521664	4521669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078456
128218	NC_021200	ACG	2	6	4521714	4521719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078456
128219	NC_021200	GCC	2	6	4521729	4521734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078456
128220	NC_021200	GCG	2	6	4521751	4521756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078456
128221	NC_021200	CGA	3	9	4521772	4521780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078456
128222	NC_021200	CCG	2	6	4521783	4521788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078456
128223	NC_021200	CGCGAT	2	12	4521830	4521841	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	499078456
128224	NC_021200	CCA	2	6	4521862	4521867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078456
128225	NC_021200	ACC	2	6	4521873	4521878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078456
128226	NC_021200	GAG	2	6	4521882	4521887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499078456
128227	NC_021200	CGC	2	6	4521907	4521912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078456
128228	NC_021200	GC	3	6	4521924	4521929	0 %	0 %	50 %	50 %	499078456
128229	NC_021200	GGGCA	2	10	4521938	4521947	20 %	0 %	60 %	20 %	499078456
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128231	NC_021200	CGT	3	9	4522041	4522049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128232	NC_021200	CG	3	6	4522203	4522208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128233	NC_021200	GAT	2	6	4522401	4522406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078457
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128342	NC_021200	CGACCG	2	12	4526727	4526738	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	499078460
128343	NC_021200	GGCTC	2	10	4526756	4526765	0 %	20 %	40 %	40 %	499078460
128344	NC_021200	CGG	2	6	4526802	4526807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078460
128345	NC_021200	CCAGT	2	10	4526842	4526851	20 %	20 %	20 %	40 %	499078460
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128347	NC_021200	CGC	2	6	4526905	4526910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078460
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128349	NC_021200	TCG	2	6	4526930	4526935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078460
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128356	NC_021200	ATC	2	6	4527482	4527487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078461
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128359	NC_021200	GCTG	2	8	4527615	4527622	0 %	25 %	50 %	25 %	499078461
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128387	NC_021200	GTC	2	6	4529081	4529086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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