MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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125503	NC_021200	GCT	2	6	4428202	4428207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078362
125504	NC_021200	CCTGGC	2	12	4428229	4428240	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	499078362
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125846	NC_021200	GCT	2	6	4440850	4440855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078376
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125958	NC_021200	TGC	2	6	4445263	4445268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078381
125959	NC_021200	CTGG	2	8	4445273	4445280	0 %	25 %	50 %	25 %	499078381
125960	NC_021200	TCGC	2	8	4445360	4445367	0 %	25 %	25 %	50 %	499078381
125961	NC_021200	GCG	2	6	4445385	4445390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078381
125962	NC_021200	GAC	2	6	4445471	4445476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078381
125963	NC_021200	GGCG	2	8	4445531	4445538	0 %	0 %	75 %	25 %	499078381
125964	NC_021200	TGG	2	6	4445542	4445547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078381
125965	NC_021200	TCGA	2	8	4445571	4445578	25 %	25 %	25 %	25 %	499078381
125966	NC_021200	CCGT	2	8	4445667	4445674	0 %	25 %	25 %	50 %	499078381
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125969	NC_021200	CGG	2	6	4445826	4445831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078382
125970	NC_021200	CGG	2	6	4445837	4445842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078382
125971	NC_021200	CGG	2	6	4445849	4445854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078382
125972	NC_021200	GAC	2	6	4445915	4445920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078382
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125977	NC_021200	GC	3	6	4446079	4446084	0 %	0 %	50 %	50 %	499078382
125978	NC_021200	AGCGC	2	10	4446096	4446105	20 %	0 %	40 %	40 %	499078382
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125983	NC_021200	CGA	2	6	4446322	4446327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078382
125984	NC_021200	CGA	3	9	4446334	4446342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078382
125985	NC_021200	CGA	2	6	4446367	4446372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078382
125986	NC_021200	CGAGGA	2	12	4446394	4446405	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	499078382
125987	NC_021200	GGC	2	6	4446412	4446417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078382
125988	NC_021200	TGC	2	6	4446468	4446473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078382
125989	NC_021200	TGG	2	6	4446585	4446590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078382
125990	NC_021200	GTG	2	6	4446602	4446607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078382
125991	NC_021200	TCGCGG	2	12	4446639	4446650	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	499078382
125992	NC_021200	GACA	2	8	4446711	4446718	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
125993	NC_021200	CGGCT	2	10	4446800	4446809	0 %	20 %	40 %	40 %	499078383
125994	NC_021200	ACG	2	6	4446810	4446815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078383
125995	NC_021200	AAG	2	6	4446869	4446874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499078383
125996	NC_021200	CTG	2	6	4446923	4446928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078383
125997	NC_021200	GC	3	6	4446982	4446987	0 %	0 %	50 %	50 %	499078383
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125999	NC_021200	GC	3	6	4447002	4447007	0 %	0 %	50 %	50 %	499078383
126000	NC_021200	CGT	3	9	4447012	4447020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078383

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