MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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125002	NC_021200	GCT	2	6	4410508	4410513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078343
125003	NC_021200	GACCG	2	10	4410539	4410548	20 %	0 %	40 %	40 %	499078343
125004	NC_021200	GTG	2	6	4410552	4410557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078343
125005	NC_021200	CAG	2	6	4410560	4410565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078343
125006	NC_021200	GTG	2	6	4410663	4410668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078344
125007	NC_021200	CCA	2	6	4410685	4410690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078344
125008	NC_021200	CGC	3	9	4410704	4410712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078344
125009	NC_021200	GCCG	2	8	4410733	4410740	0 %	0 %	50 %	50 %	499078344
125010	NC_021200	GCCG	2	8	4410793	4410800	0 %	0 %	50 %	50 %	499078344
125011	NC_021200	CCG	2	6	4410803	4410808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078344
125012	NC_021200	TGA	2	6	4410814	4410819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078344
125013	NC_021200	GC	3	6	4410827	4410832	0 %	0 %	50 %	50 %	499078344
125014	NC_021200	GCC	2	6	4410837	4410842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078344
125015	NC_021200	CAG	2	6	4410872	4410877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078344
125016	NC_021200	CGA	2	6	4410907	4410912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125017	NC_021200	GCCG	2	8	4410920	4410927	0 %	0 %	50 %	50 %	499078345
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125019	NC_021200	GTA	3	9	4411020	4411028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078345
125020	NC_021200	CGG	2	6	4411040	4411045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078345
125021	NC_021200	GCC	2	6	4411057	4411062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078345
125022	NC_021200	GTC	2	6	4411092	4411097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078345
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125024	NC_021200	CGG	2	6	4411122	4411127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078345
125025	NC_021200	GTC	2	6	4411185	4411190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078345
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125027	NC_021200	CAG	3	9	4411236	4411244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078345
125028	NC_021200	CAG	2	6	4411263	4411268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078345
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125030	NC_021200	ATG	2	6	4411318	4411323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078345
125031	NC_021200	CAG	2	6	4411329	4411334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078345
125032	NC_021200	CCG	2	6	4411336	4411341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078345
125033	NC_021200	TGC	2	6	4411343	4411348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078345
125034	NC_021200	CGT	2	6	4411374	4411379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078345
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125041	NC_021200	GCCGG	2	10	4411624	4411633	0 %	0 %	60 %	40 %	499078345
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125048	NC_021200	TCG	2	6	4411816	4411821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078345
125049	NC_021200	GTC	2	6	4411827	4411832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078345
125050	NC_021200	GAC	3	9	4411839	4411847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078345
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125052	NC_021200	CAG	2	6	4411947	4411952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078345
125053	NC_021200	TCG	2	6	4411993	4411998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078345
125054	NC_021200	GAC	2	6	4412007	4412012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078345
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125099	NC_021200	GCCA	2	8	4413777	4413784	25 %	0 %	25 %	50 %	499078346
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125102	NC_021200	CGA	2	6	4413860	4413865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078346
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125118	NC_021200	GAT	2	6	4414469	4414474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078346
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125339	NC_021200	ACC	2	6	4422127	4422132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078355
125340	NC_021200	GAC	2	6	4422170	4422175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078355
125341	NC_021200	GCG	2	6	4422178	4422183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125342	NC_021200	GAG	2	6	4422192	4422197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125343	NC_021200	GCG	2	6	4422233	4422238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125344	NC_021200	GAG	2	6	4422247	4422252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125345	NC_021200	TGC	2	6	4422343	4422348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125346	NC_021200	GGTGC	2	10	4422417	4422426	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
125347	NC_021200	AGTG	2	8	4422452	4422459	25 %	25 %	50 %	0 %	499078356
125348	NC_021200	GGCC	2	8	4422491	4422498	0 %	0 %	50 %	50 %	499078356
125349	NC_021200	CGACGT	2	12	4422536	4422547	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	499078356
125350	NC_021200	ACC	2	6	4422561	4422566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078356
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125378	NC_021200	CG	3	6	4423343	4423348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125379	NC_021200	ACG	2	6	4423447	4423452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078357
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125445	NC_021200	GTC	2	6	4426091	4426096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078360
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125449	NC_021200	CA	3	6	4426135	4426140	50 %	0 %	0 %	50 %	499078360
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125451	NC_021200	GGC	2	6	4426334	4426339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078360
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125453	NC_021200	GC	3	6	4426360	4426365	0 %	0 %	50 %	50 %	499078360
125454	NC_021200	ATCCCG	2	12	4426413	4426424	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	499078360
125455	NC_021200	CAT	2	6	4426433	4426438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078360
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125458	NC_021200	CCGG	2	8	4426543	4426550	0 %	0 %	50 %	50 %	499078360
125459	NC_021200	TGC	2	6	4426612	4426617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078360
125460	NC_021200	TGG	2	6	4426624	4426629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078360
125461	NC_021200	GCT	2	6	4426631	4426636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078360
125462	NC_021200	CGA	2	6	4426640	4426645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078360
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125480	NC_021200	GC	3	6	4427155	4427160	0 %	0 %	50 %	50 %	499078360
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125482	NC_021200	CGA	2	6	4427210	4427215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078360
125483	NC_021200	CTGG	2	8	4427243	4427250	0 %	25 %	50 %	25 %	499078360
125484	NC_021200	GCC	2	6	4427256	4427261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078360
125485	NC_021200	ATC	2	6	4427301	4427306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078360
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125489	NC_021200	GTA	2	6	4427494	4427499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125490	NC_021200	GACC	2	8	4427516	4427523	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
125491	NC_021200	GAG	2	6	4427552	4427557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499078361
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125499	NC_021200	CG	3	6	4428070	4428075	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125500	NC_021200	AC	3	6	4428131	4428136	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

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