MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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122002	NC_021200	GCT	2	6	4307978	4307983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078241
122003	NC_021200	TGCG	2	8	4307992	4307999	0 %	25 %	50 %	25 %	499078241
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122005	NC_021200	ACG	2	6	4308040	4308045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078242
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122009	NC_021200	GCCG	2	8	4308172	4308179	0 %	0 %	50 %	50 %	499078242
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122114	NC_021200	GC	3	6	4311703	4311708	0 %	0 %	50 %	50 %	499078243
122115	NC_021200	CCG	2	6	4311737	4311742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078243
122116	NC_021200	CGG	2	6	4311749	4311754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078243
122117	NC_021200	GCC	2	6	4311765	4311770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078243
122118	NC_021200	CAG	2	6	4311855	4311860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078243
122119	NC_021200	GCCC	2	8	4311897	4311904	0 %	0 %	25 %	75 %	499078243
122120	NC_021200	CGA	2	6	4311920	4311925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078243
122121	NC_021200	CGA	2	6	4311927	4311932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078243
122122	NC_021200	CGA	2	6	4311950	4311955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078243
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122145	NC_021200	GCA	2	6	4312863	4312868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078244
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122153	NC_021200	CCG	2	6	4313176	4313181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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122227	NC_021200	GCT	2	6	4315483	4315488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078246
122228	NC_021200	GGA	2	6	4315495	4315500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499078246
122229	NC_021200	CGT	2	6	4315516	4315521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078246
122230	NC_021200	GCG	2	6	4315561	4315566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078246
122231	NC_021200	CGA	2	6	4315678	4315683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078246
122232	NC_021200	GC	3	6	4315752	4315757	0 %	0 %	50 %	50 %	499078246
122233	NC_021200	CGA	2	6	4315837	4315842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078246
122234	NC_021200	TGC	3	9	4315875	4315883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078246
122235	NC_021200	CGA	2	6	4315891	4315896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078246
122236	NC_021200	ATCCTG	2	12	4315946	4315957	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	499078246
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122239	NC_021200	CGA	2	6	4316044	4316049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078246
122240	NC_021200	TCA	2	6	4316052	4316057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078246
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122246	NC_021200	CG	4	8	4316356	4316363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122247	NC_021200	TTG	2	6	4316373	4316378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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122341	NC_021200	CGG	2	6	4319689	4319694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078250
122342	NC_021200	CAT	2	6	4319728	4319733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078250
122343	NC_021200	GCC	2	6	4319745	4319750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078250
122344	NC_021200	TGG	2	6	4319841	4319846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078250
122345	NC_021200	CAC	2	6	4319860	4319865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078250
122346	NC_021200	GC	3	6	4319890	4319895	0 %	0 %	50 %	50 %	499078250
122347	NC_021200	CAG	2	6	4319900	4319905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078250
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122349	NC_021200	GTG	2	6	4319936	4319941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078250
122350	NC_021200	GCC	2	6	4319957	4319962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078250
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122353	NC_021200	GC	3	6	4320113	4320118	0 %	0 %	50 %	50 %	499078251
122354	NC_021200	GCT	2	6	4320160	4320165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078251
122355	NC_021200	GTCGAC	2	12	4320218	4320229	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	499078251
122356	NC_021200	CAC	2	6	4320343	4320348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078251
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122360	NC_021200	CGC	2	6	4320465	4320470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078251
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122362	NC_021200	CTG	2	6	4320524	4320529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078251
122363	NC_021200	CGA	2	6	4320531	4320536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078251
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122370	NC_021200	GAT	2	6	4320730	4320735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078251
122371	NC_021200	GCT	2	6	4320736	4320741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078251
122372	NC_021200	CCGG	2	8	4320759	4320766	0 %	0 %	50 %	50 %	499078251
122373	NC_021200	GCG	2	6	4320785	4320790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078251
122374	NC_021200	GTC	2	6	4320796	4320801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078251
122375	NC_021200	ACG	2	6	4320876	4320881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078251
122376	NC_021200	GCT	2	6	4320883	4320888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078251
122377	NC_021200	CCG	2	6	4320980	4320985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078252
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122380	NC_021200	CGT	2	6	4321065	4321070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078252
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122391	NC_021200	GCC	2	6	4321327	4321332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078252
122392	NC_021200	CGT	2	6	4321344	4321349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078252
122393	NC_021200	GCGCG	2	10	4321370	4321379	0 %	0 %	60 %	40 %	499078252
122394	NC_021200	CTG	2	6	4321411	4321416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078252
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122397	NC_021200	GCA	2	6	4321505	4321510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078252
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122399	NC_021200	CAG	2	6	4321555	4321560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078252
122400	NC_021200	GT	3	6	4321606	4321611	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122401	NC_021200	CGG	2	6	4321617	4321622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122402	NC_021200	CGGC	2	8	4321626	4321633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122403	NC_021200	GTC	2	6	4321636	4321641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122404	NC_021200	CGC	2	6	4321661	4321666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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122452	NC_021200	CCT	2	6	4323062	4323067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499078254
122453	NC_021200	GC	3	6	4323159	4323164	0 %	0 %	50 %	50 %	499078254
122454	NC_021200	CGG	2	6	4323165	4323170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078254
122455	NC_021200	CAC	2	6	4323210	4323215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078254
122456	NC_021200	GAA	2	6	4323268	4323273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499078254
122457	NC_021200	CG	3	6	4323348	4323353	0 %	0 %	50 %	50 %	499078254
122458	NC_021200	GAT	2	6	4323366	4323371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078254
122459	NC_021200	GAG	2	6	4323406	4323411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499078254
122460	NC_021200	CAT	2	6	4323474	4323479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078254
122461	NC_021200	CAC	2	6	4323516	4323521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078254
122462	NC_021200	GCG	3	9	4323524	4323532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078254
122463	NC_021200	GAA	2	6	4323540	4323545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499078254
122464	NC_021200	GC	3	6	4323576	4323581	0 %	0 %	50 %	50 %	499078254
122465	NC_021200	CTA	2	6	4323603	4323608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078254
122466	NC_021200	GGCATC	2	12	4323619	4323630	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	499078254
122467	NC_021200	TGG	2	6	4323638	4323643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078254
122468	NC_021200	CTG	2	6	4323694	4323699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078254
122469	NC_021200	TCA	2	6	4323743	4323748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078254
122470	NC_021200	CTT	2	6	4323789	4323794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499078254
122471	NC_021200	GAT	2	6	4323816	4323821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078254
122472	NC_021200	CGG	2	6	4323825	4323830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078254
122473	NC_021200	GGC	2	6	4323925	4323930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078254
122474	NC_021200	ATC	2	6	4324057	4324062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078254
122475	NC_021200	ACC	2	6	4324063	4324068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078254
122476	NC_021200	GCCGG	2	10	4324089	4324098	0 %	0 %	60 %	40 %	499078254
122477	NC_021200	GCT	3	9	4324101	4324109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078254
122478	NC_021200	GAG	2	6	4324138	4324143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499078254
122479	NC_021200	GC	3	6	4324146	4324151	0 %	0 %	50 %	50 %	499078254
122480	NC_021200	CGC	2	6	4324248	4324253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078255
122481	NC_021200	GGC	2	6	4324271	4324276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078255
122482	NC_021200	GAC	2	6	4324298	4324303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078255
122483	NC_021200	GAT	2	6	4324316	4324321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078255
122484	NC_021200	CGC	2	6	4324381	4324386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078255
122485	NC_021200	GCC	2	6	4324400	4324405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078255
122486	NC_021200	GAA	2	6	4324529	4324534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499078255
122487	NC_021200	CTT	2	6	4324559	4324564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499078255
122488	NC_021200	GAA	2	6	4324565	4324570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499078255
122489	NC_021200	CTTC	2	8	4324579	4324586	0 %	50 %	0 %	50 %	499078255
122490	NC_021200	CGA	2	6	4324648	4324653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078255
122491	NC_021200	CGG	2	6	4324688	4324693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078255
122492	NC_021200	CAG	2	6	4324709	4324714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078255
122493	NC_021200	CCG	2	6	4324716	4324721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078255
122494	NC_021200	CAG	2	6	4324727	4324732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078255
122495	NC_021200	GCA	2	6	4324744	4324749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078255
122496	NC_021200	CAG	2	6	4324757	4324762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078255
122497	NC_021200	GCA	2	6	4324798	4324803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078255
122498	NC_021200	CCAA	2	8	4324831	4324838	50 %	0 %	0 %	50 %	499078255
122499	NC_021200	CGG	2	6	4324873	4324878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078255
122500	NC_021200	ATG	2	6	4324884	4324889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078255

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