MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
120001	NC_021200	GCA	2	6	4235880	4235885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078178
120002	NC_021200	TGC	2	6	4235927	4235932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078178
120003	NC_021200	GC	3	6	4235945	4235950	0 %	0 %	50 %	50 %	499078178
120004	NC_021200	CGGG	2	8	4235952	4235959	0 %	0 %	75 %	25 %	499078178
120005	NC_021200	TGA	2	6	4235982	4235987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078178
120006	NC_021200	CCG	2	6	4235992	4235997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078178
120007	NC_021200	CCGG	2	8	4236012	4236019	0 %	0 %	50 %	50 %	499078178
120008	NC_021200	CGG	2	6	4236048	4236053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078178
120009	NC_021200	TTG	2	6	4236104	4236109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499078178
120010	NC_021200	TCG	2	6	4236122	4236127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078178
120011	NC_021200	GAC	2	6	4236145	4236150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078178
120012	NC_021200	CCA	2	6	4236195	4236200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078178
120013	NC_021200	GCC	2	6	4236214	4236219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078178
120014	NC_021200	CGAA	2	8	4236280	4236287	50 %	0 %	25 %	25 %	499078178
120015	NC_021200	CGT	2	6	4236414	4236419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078178
120016	NC_021200	GTA	2	6	4236430	4236435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078178
120017	NC_021200	ACG	2	6	4236471	4236476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078178
120018	NC_021200	CGT	3	9	4236519	4236527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078178
120019	NC_021200	TGC	2	6	4236536	4236541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078178
120020	NC_021200	GC	4	8	4236540	4236547	0 %	0 %	50 %	50 %	499078178
120021	NC_021200	GTT	2	6	4236553	4236558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499078178
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120023	NC_021200	GCT	2	6	4236610	4236615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078178
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120031	NC_021200	G	6	6	4236925	4236930	0 %	0 %	100 %	0 %	499078178
120032	NC_021200	CCG	2	6	4236935	4236940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078178
120033	NC_021200	CG	3	6	4237042	4237047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120034	NC_021200	TTCGC	2	10	4237070	4237079	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
120035	NC_021200	TAC	2	6	4237133	4237138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120036	NC_021200	CGGC	2	8	4237148	4237155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120037	NC_021200	AGG	2	6	4237175	4237180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120038	NC_021200	CTG	2	6	4237247	4237252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120039	NC_021200	GC	3	6	4237274	4237279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120040	NC_021200	CGT	2	6	4237282	4237287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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120042	NC_021200	AAACCC	2	12	4237439	4237450	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120043	NC_021200	GTG	2	6	4237460	4237465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120044	NC_021200	CGC	2	6	4237474	4237479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120045	NC_021200	CTG	3	9	4237508	4237516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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120051	NC_021200	GCC	2	6	4237674	4237679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120052	NC_021200	TGC	2	6	4237697	4237702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120053	NC_021200	ACC	2	6	4237735	4237740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120054	NC_021200	CGA	3	9	4237821	4237829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120055	NC_021200	GAG	2	6	4237849	4237854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120056	NC_021200	GCT	2	6	4237863	4237868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120057	NC_021200	GAC	2	6	4237899	4237904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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120059	NC_021200	TCG	2	6	4237931	4237936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120060	NC_021200	GCC	2	6	4237952	4237957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120061	NC_021200	GCC	2	6	4237960	4237965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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120064	NC_021200	CG	3	6	4238019	4238024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120065	NC_021200	AACG	2	8	4238050	4238057	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120066	NC_021200	GCG	2	6	4238095	4238100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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120072	NC_021200	GCA	3	9	4238300	4238308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078179
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120112	NC_021200	TCCAGC	2	12	4239697	4239708	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	499078180
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120116	NC_021200	GTC	2	6	4239939	4239944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078180
120117	NC_021200	CCA	2	6	4239953	4239958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078180
120118	NC_021200	AGC	2	6	4239961	4239966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078180
120119	NC_021200	GCG	3	9	4240030	4240038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078180
120120	NC_021200	CGA	2	6	4240058	4240063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078180
120121	NC_021200	GCG	2	6	4240087	4240092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078180
120122	NC_021200	GCG	2	6	4240141	4240146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078180
120123	NC_021200	GCC	2	6	4240153	4240158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078180
120124	NC_021200	AGC	2	6	4240159	4240164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078180
120125	NC_021200	CCA	2	6	4240184	4240189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078180
120126	NC_021200	GCG	2	6	4240206	4240211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078180
120127	NC_021200	GCC	2	6	4240370	4240375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078181
120128	NC_021200	CAC	2	6	4240426	4240431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078181
120129	NC_021200	CCG	2	6	4240451	4240456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078181
120130	NC_021200	GCCG	2	8	4240495	4240502	0 %	0 %	50 %	50 %	499078181
120131	NC_021200	CCGG	2	8	4240509	4240516	0 %	0 %	50 %	50 %	499078181
120132	NC_021200	CTG	2	6	4240544	4240549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078181
120133	NC_021200	GCG	2	6	4240550	4240555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078181
120134	NC_021200	TGC	2	6	4240575	4240580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078181
120135	NC_021200	GCC	2	6	4240585	4240590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078181
120136	NC_021200	CG	3	6	4240632	4240637	0 %	0 %	50 %	50 %	499078182
120137	NC_021200	CGG	2	6	4240650	4240655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078182
120138	NC_021200	CGG	2	6	4240700	4240705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078182
120139	NC_021200	CGC	2	6	4240736	4240741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078182
120140	NC_021200	TCG	2	6	4240750	4240755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078182
120141	NC_021200	GACGTC	2	12	4240764	4240775	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	499078182
120142	NC_021200	GAG	2	6	4240792	4240797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499078182
120143	NC_021200	GCC	2	6	4240810	4240815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078182
120144	NC_021200	GCG	2	6	4240823	4240828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078182
120145	NC_021200	GGCC	2	8	4240853	4240860	0 %	0 %	50 %	50 %	499078182
120146	NC_021200	GCA	2	6	4240868	4240873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078182
120147	NC_021200	GTC	2	6	4241040	4241045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078182
120148	NC_021200	TGCCGA	2	12	4241054	4241065	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	499078182
120149	NC_021200	TGC	2	6	4241090	4241095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078182
120150	NC_021200	GC	5	10	4241107	4241116	0 %	0 %	50 %	50 %	499078183
120151	NC_021200	CG	3	6	4241120	4241125	0 %	0 %	50 %	50 %	499078183
120152	NC_021200	ATG	2	6	4241149	4241154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078183
120153	NC_021200	GCCCGC	2	12	4241163	4241174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078183
120154	NC_021200	CTG	2	6	4241188	4241193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078183
120155	NC_021200	CGG	2	6	4241198	4241203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078183
120156	NC_021200	GGCTGG	2	12	4241236	4241247	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	499078183
120157	NC_021200	GC	3	6	4241316	4241321	0 %	0 %	50 %	50 %	499078183
120158	NC_021200	GGT	2	6	4241328	4241333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078183
120159	NC_021200	GGT	2	6	4241337	4241342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078183
120160	NC_021200	GGT	2	6	4241394	4241399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078183
120161	NC_021200	GCTGGC	2	12	4241427	4241438	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	499078183
120162	NC_021200	GC	3	6	4241441	4241446	0 %	0 %	50 %	50 %	499078183
120163	NC_021200	CCG	2	6	4241465	4241470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078183
120164	NC_021200	CGGCCG	2	12	4241491	4241502	0 %	0 %	50 %	50 %	499078183
120165	NC_021200	CGT	2	6	4241531	4241536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078183
120166	NC_021200	TCCG	2	8	4241538	4241545	0 %	25 %	25 %	50 %	499078183
120167	NC_021200	GTT	2	6	4241586	4241591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499078183
120168	NC_021200	CCT	2	6	4241625	4241630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499078183
120169	NC_021200	CGC	2	6	4241634	4241639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078183
120170	NC_021200	CGG	2	6	4241657	4241662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078183
120171	NC_021200	TGT	2	6	4241744	4241749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499078183
120172	NC_021200	GCG	3	9	4241800	4241808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120173	NC_021200	CGA	2	6	4241878	4241883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120174	NC_021200	TGCA	2	8	4241889	4241896	25 %	25 %	25 %	25 %	499078184
120175	NC_021200	GCG	2	6	4241922	4241927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078184
120176	NC_021200	TCG	2	6	4241935	4241940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078184
120177	NC_021200	GGT	2	6	4241945	4241950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078184
120178	NC_021200	CGGC	2	8	4241971	4241978	0 %	0 %	50 %	50 %	499078184
120179	NC_021200	GGT	2	6	4242026	4242031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078184
120180	NC_021200	CGG	2	6	4242038	4242043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078184
120181	NC_021200	CCA	2	6	4242052	4242057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078184
120182	NC_021200	GCACCG	2	12	4242073	4242084	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	499078184
120183	NC_021200	CCCA	2	8	4242111	4242118	25 %	0 %	0 %	75 %	499078184
120184	NC_021200	TCGGC	2	10	4242121	4242130	0 %	20 %	40 %	40 %	499078184
120185	NC_021200	TCG	2	6	4242247	4242252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078184
120186	NC_021200	ACT	2	6	4242259	4242264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078184
120187	NC_021200	GCG	2	6	4242271	4242276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078184
120188	NC_021200	CCG	2	6	4242340	4242345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078184
120189	NC_021200	GGT	2	6	4242383	4242388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078184
120190	NC_021200	CAA	2	6	4242398	4242403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499078184
120191	NC_021200	CGG	3	9	4242416	4242424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078184
120192	NC_021200	CGC	2	6	4242425	4242430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078184
120193	NC_021200	TTC	2	6	4242432	4242437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499078184
120194	NC_021200	CAC	2	6	4242443	4242448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078184
120195	NC_021200	CGA	2	6	4242482	4242487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078184
120196	NC_021200	GGCCC	2	10	4242573	4242582	0 %	0 %	40 %	60 %	499078185
120197	NC_021200	TGG	2	6	4242617	4242622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078185
120198	NC_021200	CGA	3	9	4242782	4242790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078185
120199	NC_021200	TGA	2	6	4242818	4242823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078185
120200	NC_021200	GC	4	8	4242968	4242975	0 %	0 %	50 %	50 %	499078185
120201	NC_021200	CTTG	2	8	4242992	4242999	0 %	50 %	25 %	25 %	499078185
120202	NC_021200	GTC	2	6	4243020	4243025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078185
120203	NC_021200	GCA	2	6	4243044	4243049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078185
120204	NC_021200	GTC	2	6	4243100	4243105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078186
120205	NC_021200	GTG	2	6	4243184	4243189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078186
120206	NC_021200	GCCG	2	8	4243194	4243201	0 %	0 %	50 %	50 %	499078186
120207	NC_021200	GCG	2	6	4243214	4243219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078186
120208	NC_021200	CAG	2	6	4243228	4243233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078186
120209	NC_021200	GGC	2	6	4243236	4243241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078186
120210	NC_021200	CGA	2	6	4243243	4243248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078186
120211	NC_021200	GC	3	6	4243257	4243262	0 %	0 %	50 %	50 %	499078186
120212	NC_021200	CGC	2	6	4243288	4243293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078186
120213	NC_021200	GCT	2	6	4243306	4243311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078186
120214	NC_021200	AGC	2	6	4243314	4243319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078186
120215	NC_021200	GAC	2	6	4243336	4243341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078186
120216	NC_021200	CGA	2	6	4243381	4243386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078186
120217	NC_021200	CCA	2	6	4243395	4243400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078186
120218	NC_021200	CGT	2	6	4243413	4243418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078186
120219	NC_021200	CAG	2	6	4243432	4243437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078186
120220	NC_021200	CGCC	2	8	4243482	4243489	0 %	0 %	25 %	75 %	499078186
120221	NC_021200	TGGCGG	2	12	4243506	4243517	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	499078186
120222	NC_021200	CTC	2	6	4243528	4243533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499078186
120223	NC_021200	GAT	2	6	4243534	4243539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078186
120224	NC_021200	TCG	2	6	4243553	4243558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078186
120225	NC_021200	GTC	2	6	4243576	4243581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078186
120226	NC_021200	GCGCG	2	10	4243591	4243600	0 %	0 %	60 %	40 %	499078186
120227	NC_021200	TGG	2	6	4243611	4243616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078186
120228	NC_021200	GCT	2	6	4243635	4243640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078186
120229	NC_021200	TTG	2	6	4243659	4243664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499078186
120230	NC_021200	CTG	3	9	4243758	4243766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078187
120231	NC_021200	GAT	2	6	4243775	4243780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078187
120232	NC_021200	CGA	2	6	4243823	4243828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078187
120233	NC_021200	GAG	2	6	4243848	4243853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499078187
120234	NC_021200	CGA	2	6	4243913	4243918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078187
120235	NC_021200	TCA	2	6	4243921	4243926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078187
120236	NC_021200	GC	3	6	4243957	4243962	0 %	0 %	50 %	50 %	499078187
120237	NC_021200	CGC	3	9	4243960	4243968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078187
120238	NC_021200	GCT	2	6	4244039	4244044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078187
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120242	NC_021200	ATC	2	6	4244214	4244219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078187
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120271	NC_021200	CGA	2	6	4245668	4245673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078188
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120331	NC_021200	GC	3	6	4247070	4247075	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120332	NC_021200	CG	4	8	4247081	4247088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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120335	NC_021200	CG	3	6	4247156	4247161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120336	NC_021200	CGG	2	6	4247323	4247328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078189
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