MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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119502	NC_021200	CCG	2	6	4218216	4218221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078165
119503	NC_021200	GCC	2	6	4218235	4218240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078165
119504	NC_021200	GTCG	2	8	4218251	4218258	0 %	25 %	50 %	25 %	499078165
119505	NC_021200	CTG	2	6	4218293	4218298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078165
119506	NC_021200	GCCG	2	8	4218328	4218335	0 %	0 %	50 %	50 %	499078165
119507	NC_021200	AGC	2	6	4218345	4218350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078165
119508	NC_021200	CGG	2	6	4218358	4218363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078165
119509	NC_021200	TCGCC	2	10	4218370	4218379	0 %	20 %	20 %	60 %	499078165
119510	NC_021200	TGC	2	6	4218396	4218401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078165
119511	NC_021200	TGT	2	6	4218415	4218420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499078165
119512	NC_021200	GCC	2	6	4218545	4218550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078165
119513	NC_021200	CCG	2	6	4218591	4218596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078165
119514	NC_021200	GGAG	2	8	4218629	4218636	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
119515	NC_021200	GCG	2	6	4218639	4218644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119516	NC_021200	ACG	2	6	4218710	4218715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078166
119517	NC_021200	GAC	2	6	4218747	4218752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078166
119518	NC_021200	GCCG	2	8	4218839	4218846	0 %	0 %	50 %	50 %	499078166
119519	NC_021200	CCG	2	6	4218909	4218914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078166
119520	NC_021200	TTG	2	6	4218931	4218936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499078166
119521	NC_021200	CGC	2	6	4218945	4218950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078166
119522	NC_021200	CGC	2	6	4218999	4219004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078166
119523	NC_021200	GCTG	2	8	4219070	4219077	0 %	25 %	50 %	25 %	499078166
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119534	NC_021200	GC	3	6	4219765	4219770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119535	NC_021200	CGG	2	6	4219793	4219798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119536	NC_021200	GCGAA	2	10	4219816	4219825	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
119537	NC_021200	GTT	2	6	4219867	4219872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119538	NC_021200	CG	3	6	4219882	4219887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119539	NC_021200	CGG	2	6	4219957	4219962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119540	NC_021200	CCG	3	9	4219965	4219973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119541	NC_021200	ACC	2	6	4220012	4220017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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119544	NC_021200	GGT	2	6	4220109	4220114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119545	NC_021200	GGC	2	6	4220121	4220126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119546	NC_021200	CG	3	6	4220138	4220143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119547	NC_021200	GGCC	2	8	4220159	4220166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119548	NC_021200	CG	3	6	4220246	4220251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119549	NC_021200	ATCT	2	8	4220362	4220369	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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119552	NC_021200	CCG	2	6	4220480	4220485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119553	NC_021200	GAA	2	6	4220491	4220496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119554	NC_021200	GCC	2	6	4220500	4220505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119555	NC_021200	TTC	2	6	4220530	4220535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119556	NC_021200	GC	3	6	4220558	4220563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119557	NC_021200	GCC	2	6	4220639	4220644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119558	NC_021200	GCCCG	2	10	4220649	4220658	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
119559	NC_021200	GAT	2	6	4220676	4220681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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119561	NC_021200	GTC	2	6	4220834	4220839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119562	NC_021200	GCAGT	2	10	4220980	4220989	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
119563	NC_021200	TACA	2	8	4221068	4221075	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119564	NC_021200	CG	3	6	4221137	4221142	0 %	0 %	50 %	50 %	499078167
119565	NC_021200	CG	3	6	4221149	4221154	0 %	0 %	50 %	50 %	499078167
119566	NC_021200	CGT	2	6	4221165	4221170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078167
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119618	NC_021200	CGA	3	9	4222878	4222886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078167
119619	NC_021200	GCT	2	6	4222908	4222913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078167
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119845	NC_021200	AACGC	2	10	4231175	4231184	40 %	0 %	20 %	40 %	499078174
119846	NC_021200	GC	3	6	4231200	4231205	0 %	0 %	50 %	50 %	499078174
119847	NC_021200	GGT	2	6	4231275	4231280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499078174
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