MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
118001	NC_021200	GCA	2	6	4159076	4159081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118002	NC_021200	GC	3	6	4159114	4159119	0 %	0 %	50 %	50 %	499078113
118003	NC_021200	GCC	2	6	4159156	4159161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078113
118004	NC_021200	CCGAC	2	10	4159173	4159182	20 %	0 %	20 %	60 %	499078113
118005	NC_021200	CGG	2	6	4159185	4159190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078113
118006	NC_021200	CCA	2	6	4159207	4159212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078113
118007	NC_021200	CTG	2	6	4159223	4159228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078113
118008	NC_021200	GCC	2	6	4159298	4159303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078113
118009	NC_021200	CGGC	2	8	4159308	4159315	0 %	0 %	50 %	50 %	499078113
118010	NC_021200	TCG	2	6	4159317	4159322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078113
118011	NC_021200	CGG	2	6	4159356	4159361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078113
118012	NC_021200	GC	3	6	4159378	4159383	0 %	0 %	50 %	50 %	499078113
118013	NC_021200	GCT	2	6	4159408	4159413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078113
118014	NC_021200	GCCG	2	8	4159420	4159427	0 %	0 %	50 %	50 %	499078113
118015	NC_021200	CCG	2	6	4159451	4159456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078113
118016	NC_021200	CG	3	6	4159480	4159485	0 %	0 %	50 %	50 %	499078113
118017	NC_021200	CGGC	2	8	4159541	4159548	0 %	0 %	50 %	50 %	499078113
118018	NC_021200	GACC	2	8	4159549	4159556	25 %	0 %	25 %	50 %	499078113
118019	NC_021200	CGAT	2	8	4159562	4159569	25 %	25 %	25 %	25 %	499078113
118020	NC_021200	CAA	2	6	4159612	4159617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499078113
118021	NC_021200	CGC	2	6	4159623	4159628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078113
118022	NC_021200	CGG	2	6	4159663	4159668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078113
118023	NC_021200	GCC	2	6	4159687	4159692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078113
118024	NC_021200	GGC	2	6	4159696	4159701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078113
118025	NC_021200	GGA	2	6	4159723	4159728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499078113
118026	NC_021200	GCG	2	6	4159750	4159755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078113
118027	NC_021200	GC	3	6	4159764	4159769	0 %	0 %	50 %	50 %	499078113
118028	NC_021200	GCTG	2	8	4159803	4159810	0 %	25 %	50 %	25 %	499078113
118029	NC_021200	GCCC	2	8	4159833	4159840	0 %	0 %	25 %	75 %	499078113
118030	NC_021200	CG	3	6	4159866	4159871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118031	NC_021200	CCG	2	6	4159910	4159915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078114
118032	NC_021200	TCA	2	6	4160007	4160012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499078114
118033	NC_021200	CAG	2	6	4160035	4160040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078114
118034	NC_021200	CGGCCT	2	12	4160097	4160108	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	499078114
118035	NC_021200	CCA	2	6	4160112	4160117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499078114
118036	NC_021200	GCC	2	6	4160135	4160140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078114
118037	NC_021200	GAA	2	6	4160154	4160159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499078114
118038	NC_021200	CGA	2	6	4160166	4160171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078114
118039	NC_021200	CG	3	6	4160191	4160196	0 %	0 %	50 %	50 %	499078114
118040	NC_021200	ACG	2	6	4160255	4160260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118041	NC_021200	CCAGG	2	10	4160308	4160317	20 %	0 %	40 %	40 %	499078115
118042	NC_021200	CGC	2	6	4160340	4160345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078115
118043	NC_021200	GGC	2	6	4160362	4160367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078115
118044	NC_021200	AGC	3	9	4160384	4160392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078115
118045	NC_021200	CAG	2	6	4160419	4160424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078115
118046	NC_021200	CCT	2	6	4160466	4160471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499078115
118047	NC_021200	CGA	2	6	4160475	4160480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078115
118048	NC_021200	GCC	2	6	4160495	4160500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078115
118049	NC_021200	GC	3	6	4160537	4160542	0 %	0 %	50 %	50 %	499078115
118050	NC_021200	GTC	2	6	4160575	4160580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078115
118051	NC_021200	G	6	6	4160584	4160589	0 %	0 %	100 %	0 %	499078115
118052	NC_021200	CGA	3	9	4160605	4160613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078115
118053	NC_021200	GGC	2	6	4160620	4160625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078115
118054	NC_021200	CCG	2	6	4160631	4160636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078115
118055	NC_021200	GCG	2	6	4160638	4160643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078115
118056	NC_021200	GT	3	6	4160658	4160663	0 %	50 %	50 %	0 %	499078115
118057	NC_021200	CGC	2	6	4160706	4160711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078115
118058	NC_021200	CGCC	2	8	4160739	4160746	0 %	0 %	25 %	75 %	499078115
118059	NC_021200	ATCC	2	8	4160768	4160775	25 %	25 %	0 %	50 %	499078115
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118064	NC_021200	CGG	2	6	4160952	4160957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078115
118065	NC_021200	TCG	2	6	4160978	4160983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078115
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118070	NC_021200	GAC	2	6	4161082	4161087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078115
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118082	NC_021200	GC	3	6	4161415	4161420	0 %	0 %	50 %	50 %	499078115
118083	NC_021200	CTG	2	6	4161430	4161435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078115
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118088	NC_021200	CGCAC	2	10	4161596	4161605	20 %	0 %	20 %	60 %	499078115
118089	NC_021200	CG	3	6	4161667	4161672	0 %	0 %	50 %	50 %	499078115
118090	NC_021200	CCGA	2	8	4161889	4161896	25 %	0 %	25 %	50 %	499078115
118091	NC_021200	GCC	2	6	4161925	4161930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118092	NC_021200	CAGT	2	8	4161943	4161950	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118093	NC_021200	GCA	3	9	4162006	4162014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078116
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118101	NC_021200	CCG	2	6	4162249	4162254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499078117
118102	NC_021200	GT	3	6	4162258	4162263	0 %	50 %	50 %	0 %	499078117
118103	NC_021200	CGG	2	6	4162267	4162272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078117
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118106	NC_021200	CGG	2	6	4162321	4162326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078117
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118230	NC_021200	GTA	2	6	4166717	4166722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078123
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118344	NC_021200	GAG	2	6	4171084	4171089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499078127
118345	NC_021200	GAT	2	6	4171140	4171145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078127
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118347	NC_021200	CGA	2	6	4171176	4171181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078127
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118350	NC_021200	GAGGTG	2	12	4171309	4171320	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	499078128
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118453	NC_021200	TC	3	6	4176360	4176365	0 %	50 %	0 %	50 %	499078130
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118461	NC_021200	GTC	2	6	4176661	4176666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499078130
118462	NC_021200	CCGGG	2	10	4176702	4176711	0 %	0 %	60 %	40 %	499078130
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118471	NC_021200	CGCA	2	8	4176949	4176956	25 %	0 %	25 %	50 %	499078130
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118488	NC_021200	GCG	2	6	4177883	4177888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078130
118489	NC_021200	GAT	2	6	4177986	4177991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078130
118490	NC_021200	CG	3	6	4178074	4178079	0 %	0 %	50 %	50 %	499078130
118491	NC_021200	AAC	2	6	4178328	4178333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118492	NC_021200	CAG	2	6	4178366	4178371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078131
118493	NC_021200	GGC	2	6	4178374	4178379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078131
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118495	NC_021200	CGG	2	6	4178429	4178434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499078131
118496	NC_021200	ACG	2	6	4178442	4178447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499078131
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118498	NC_021200	TGA	2	6	4178485	4178490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499078131
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