MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_021200	CGC	2	6	269211	269216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074636
7502	NC_021200	CGG	2	6	269274	269279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074636
7503	NC_021200	CGGC	2	8	269398	269405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7504	NC_021200	CACG	2	8	269441	269448	25 %	0 %	25 %	50 %	499074637
7505	NC_021200	GGT	2	6	269477	269482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074637
7506	NC_021200	GTC	2	6	269516	269521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074637
7507	NC_021200	GC	4	8	269542	269549	0 %	0 %	50 %	50 %	499074637
7508	NC_021200	CGGGG	2	10	269570	269579	0 %	0 %	80 %	20 %	499074637
7509	NC_021200	TTG	2	6	269589	269594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499074637
7510	NC_021200	TGC	2	6	269643	269648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074637
7511	NC_021200	GCA	2	6	269656	269661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074637
7512	NC_021200	TGG	2	6	269689	269694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074637
7513	NC_021200	CGC	2	6	269711	269716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074637
7514	NC_021200	CGG	2	6	269830	269835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074637
7515	NC_021200	CAA	2	6	269892	269897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7516	NC_021200	GTA	2	6	269934	269939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7517	NC_021200	CCG	2	6	269962	269967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7518	NC_021200	CCA	2	6	269999	270004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074638
7519	NC_021200	CGA	2	6	270035	270040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074638
7520	NC_021200	CGG	2	6	270044	270049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074638
7521	NC_021200	TGC	2	6	270064	270069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074638
7522	NC_021200	TGC	2	6	270121	270126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074638
7523	NC_021200	CGC	2	6	270128	270133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074638
7524	NC_021200	GGT	2	6	270143	270148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074638
7525	NC_021200	TGG	2	6	270268	270273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074638
7526	NC_021200	CTC	2	6	270275	270280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499074638
7527	NC_021200	GCG	3	9	270286	270294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074638
7528	NC_021200	GTG	2	6	270342	270347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074638
7529	NC_021200	CCT	2	6	270352	270357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499074638
7530	NC_021200	ACC	2	6	270381	270386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074638
7531	NC_021200	CGCGG	2	10	270419	270428	0 %	0 %	60 %	40 %	499074638
7532	NC_021200	CGT	2	6	270436	270441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074638
7533	NC_021200	TTC	2	6	270486	270491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499074638
7534	NC_021200	AGG	2	6	270565	270570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074638
7535	NC_021200	GCC	2	6	270588	270593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074638
7536	NC_021200	ATC	2	6	270648	270653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074638
7537	NC_021200	CGA	2	6	270665	270670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074638
7538	NC_021200	CGGCG	2	10	270691	270700	0 %	0 %	60 %	40 %	499074638
7539	NC_021200	CACC	2	8	270701	270708	25 %	0 %	0 %	75 %	499074638
7540	NC_021200	CTG	2	6	270795	270800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074638
7541	NC_021200	GGC	2	6	270809	270814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074638
7542	NC_021200	GCG	2	6	270831	270836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7543	NC_021200	AGGAA	2	10	270885	270894	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7544	NC_021200	GCTC	2	8	270957	270964	0 %	25 %	25 %	50 %	499074639
7545	NC_021200	CG	3	6	270966	270971	0 %	0 %	50 %	50 %	499074639
7546	NC_021200	GAC	2	6	270984	270989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074639
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7548	NC_021200	GAC	2	6	271017	271022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074639
7549	NC_021200	GC	3	6	271085	271090	0 %	0 %	50 %	50 %	499074640
7550	NC_021200	CGC	2	6	271095	271100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074640
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7552	NC_021200	CGG	2	6	271211	271216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074640
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7554	NC_021200	GCA	2	6	271244	271249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074640
7555	NC_021200	CGAT	2	8	271264	271271	25 %	25 %	25 %	25 %	499074640
7556	NC_021200	GC	3	6	271277	271282	0 %	0 %	50 %	50 %	499074640
7557	NC_021200	TCC	2	6	271324	271329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499074640
7558	NC_021200	TGG	2	6	271373	271378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074640
7559	NC_021200	GTG	2	6	271453	271458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074640
7560	NC_021200	TCC	2	6	271483	271488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7561	NC_021200	TCG	2	6	271502	271507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7562	NC_021200	CAGGC	2	10	271523	271532	20 %	0 %	40 %	40 %	499074641
7563	NC_021200	ATCG	2	8	271555	271562	25 %	25 %	25 %	25 %	499074641
7564	NC_021200	TGC	2	6	271574	271579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074641
7565	NC_021200	GAT	2	6	271615	271620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074641
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7567	NC_021200	ATC	2	6	271700	271705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074641
7568	NC_021200	GAC	2	6	271753	271758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074641
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7570	NC_021200	TACCC	2	10	271834	271843	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
7571	NC_021200	GCAC	2	8	271887	271894	25 %	0 %	25 %	50 %	499074642
7572	NC_021200	GCT	3	9	271909	271917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074642
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7574	NC_021200	CGT	2	6	271993	271998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074642
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7577	NC_021200	TGG	2	6	272064	272069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074642
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7581	NC_021200	CGT	2	6	272155	272160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074642
7582	NC_021200	GCC	2	6	272174	272179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074642
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7585	NC_021200	GCT	2	6	272284	272289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074642
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7588	NC_021200	GCC	2	6	272351	272356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074642
7589	NC_021200	GTG	2	6	272375	272380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074642
7590	NC_021200	TGG	2	6	272411	272416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7591	NC_021200	TAT	2	6	272456	272461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499074643
7592	NC_021200	GCAC	2	8	272475	272482	25 %	0 %	25 %	50 %	499074643
7593	NC_021200	CGC	2	6	272523	272528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074643
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7595	NC_021200	GCG	2	6	272609	272614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074643
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7618	NC_021200	GC	3	6	273262	273267	0 %	0 %	50 %	50 %	499074644
7619	NC_021200	CGG	2	6	273340	273345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074644
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7622	NC_021200	CG	4	8	273436	273443	0 %	0 %	50 %	50 %	499074644
7623	NC_021200	AGA	2	6	273465	273470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074644
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7744	NC_021200	CGG	2	6	277979	277984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074648
7745	NC_021200	CGGC	2	8	277988	277995	0 %	0 %	50 %	50 %	499074648
7746	NC_021200	TGC	2	6	278006	278011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074648
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7793	NC_021200	CGA	2	6	279935	279940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7825	NC_021200	CCG	2	6	281220	281225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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7839	NC_021200	GC	3	6	281602	281607	0 %	0 %	50 %	50 %	499074651
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7843	NC_021200	GCGG	2	8	281707	281714	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7844	NC_021200	GCCGG	2	10	281794	281803	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7845	NC_021200	GGA	2	6	281827	281832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7846	NC_021200	GACAA	2	10	281844	281853	60 %	0 %	20 %	20 %	499074652
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7849	NC_021200	GCG	2	6	281935	281940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074652
7850	NC_021200	GCT	2	6	281963	281968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074652
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7853	NC_021200	ACG	2	6	282031	282036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074652
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7855	NC_021200	ACG	2	6	282091	282096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074652
7856	NC_021200	AC	3	6	282118	282123	50 %	0 %	0 %	50 %	499074652
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7859	NC_021200	GCC	2	6	282168	282173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074652
7860	NC_021200	GC	3	6	282178	282183	0 %	0 %	50 %	50 %	499074652
7861	NC_021200	CGA	2	6	282212	282217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074652
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7865	NC_021200	GTG	2	6	282270	282275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074652
7866	NC_021200	GCC	2	6	282321	282326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074652
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7986	NC_021200	GCC	2	6	286343	286348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074654
7987	NC_021200	CGG	2	6	286350	286355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074654
7988	NC_021200	GGCCA	2	10	286387	286396	20 %	0 %	40 %	40 %	499074654
7989	NC_021200	GCC	3	9	286408	286416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074654
7990	NC_021200	GTC	2	6	286432	286437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074654
7991	NC_021200	C	6	6	286445	286450	0 %	0 %	0 %	100 %	499074654
7992	NC_021200	CG	3	6	286480	286485	0 %	0 %	50 %	50 %	499074654
7993	NC_021200	CGG	2	6	286507	286512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074654
7994	NC_021200	TCG	2	6	286574	286579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074654
7995	NC_021200	GCT	2	6	286623	286628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074654
7996	NC_021200	CG	3	6	286659	286664	0 %	0 %	50 %	50 %	499074654
7997	NC_021200	GC	3	6	286680	286685	0 %	0 %	50 %	50 %	499074654
7998	NC_021200	CGC	2	6	286742	286747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074654
7999	NC_021200	CGGC	2	8	286754	286761	0 %	0 %	50 %	50 %	499074654
8000	NC_021200	CAG	2	6	286810	286815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074654

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