MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6502	NC_021200	CT	3	6	233379	233384	0 %	50 %	0 %	50 %	499074598
6503	NC_021200	CGA	2	6	233398	233403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074598
6504	NC_021200	GCG	2	6	233430	233435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074598
6505	NC_021200	CGC	2	6	233523	233528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074598
6506	NC_021200	GCG	2	6	233532	233537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074598
6507	NC_021200	CGT	2	6	233538	233543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074598
6508	NC_021200	CAG	2	6	233545	233550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074598
6509	NC_021200	TGGTCG	2	12	233570	233581	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	499074598
6510	NC_021200	CCA	2	6	233592	233597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074598
6511	NC_021200	GCA	2	6	233598	233603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074598
6512	NC_021200	CGC	2	6	233631	233636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074598
6513	NC_021200	CGG	2	6	233718	233723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074598
6514	NC_021200	CCA	2	6	233724	233729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074598
6515	NC_021200	GGGGT	2	10	233777	233786	0 %	20 %	80 %	0 %	499074598
6516	NC_021200	CGA	2	6	233835	233840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074598
6517	NC_021200	GCA	2	6	233895	233900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074598
6518	NC_021200	GC	3	6	233901	233906	0 %	0 %	50 %	50 %	499074598
6519	NC_021200	GCC	2	6	233998	234003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074598
6520	NC_021200	GGC	2	6	234052	234057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074598
6521	NC_021200	CTG	2	6	234067	234072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074598
6522	NC_021200	CGT	3	9	234168	234176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074598
6523	NC_021200	CCA	2	6	234195	234200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074598
6524	NC_021200	GCA	2	6	234255	234260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074598
6525	NC_021200	GC	3	6	234297	234302	0 %	0 %	50 %	50 %	499074598
6526	NC_021200	GCCC	2	8	234305	234312	0 %	0 %	25 %	75 %	499074598
6527	NC_021200	GC	3	6	234340	234345	0 %	0 %	50 %	50 %	499074598
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6530	NC_021200	CCG	2	6	234467	234472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074599
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6533	NC_021200	GTC	2	6	234586	234591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074599
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6543	NC_021200	TCG	2	6	235028	235033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074599
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6555	NC_021200	GCA	2	6	235529	235534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074600
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6557	NC_021200	TCG	2	6	235618	235623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074600
6558	NC_021200	CGG	2	6	235640	235645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074600
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6572	NC_021200	TCCG	2	8	236299	236306	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6575	NC_021200	CGTC	2	8	236385	236392	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6599	NC_021200	TCG	2	6	237057	237062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6601	NC_021200	ACG	2	6	237223	237228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074602
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6609	NC_021200	GCGG	2	8	237551	237558	0 %	0 %	75 %	25 %	499074603
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6615	NC_021200	CAG	2	6	237671	237676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074603
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6621	NC_021200	CGC	2	6	237886	237891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074603
6622	NC_021200	CCG	2	6	237897	237902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074603
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6624	NC_021200	GCC	2	6	237929	237934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074603
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6698	NC_021200	TCG	2	6	239936	239941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074605
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6721	NC_021200	G	6	6	240842	240847	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6722	NC_021200	GCG	2	6	240870	240875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6723	NC_021200	GGCCGA	2	12	240976	240987	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	499074607
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6725	NC_021200	GGT	2	6	241039	241044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074607
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6729	NC_021200	CGC	2	6	241131	241136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074607
6730	NC_021200	GCG	2	6	241190	241195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074607
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6732	NC_021200	CCG	2	6	241311	241316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074607
6733	NC_021200	CGG	2	6	241363	241368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074607
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6736	NC_021200	GCCA	2	8	241466	241473	25 %	0 %	25 %	50 %	499074607
6737	NC_021200	CAA	2	6	241475	241480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499074607
6738	NC_021200	TGGTGC	2	12	241488	241499	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	499074607
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6986	NC_021200	ATTC	2	8	249462	249469	25 %	50 %	0 %	25 %	499074613
6987	NC_021200	AGT	2	6	249513	249518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074613
6988	NC_021200	GCCG	2	8	249527	249534	0 %	0 %	50 %	50 %	499074613
6989	NC_021200	GC	4	8	249545	249552	0 %	0 %	50 %	50 %	499074613
6990	NC_021200	ATG	2	6	249617	249622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074613
6991	NC_021200	CGG	2	6	249709	249714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074614
6992	NC_021200	TGC	2	6	249740	249745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074614
6993	NC_021200	TCA	2	6	249800	249805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074614
6994	NC_021200	GCC	2	6	249842	249847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074614
6995	NC_021200	AGC	3	9	249853	249861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074614
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6997	NC_021200	CGC	2	6	250027	250032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074614
6998	NC_021200	CG	3	6	250048	250053	0 %	0 %	50 %	50 %	499074614
6999	NC_021200	TCG	2	6	250064	250069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074614
7000	NC_021200	GTG	2	6	250110	250115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074614

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