MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021200	GCGCG	2	10	198859	198868	0 %	0 %	60 %	40 %	499074563
5502	NC_021200	GGC	2	6	198918	198923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074563
5503	NC_021200	ACA	2	6	198937	198942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499074563
5504	NC_021200	TGC	2	6	198982	198987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074563
5505	NC_021200	CGG	2	6	198992	198997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074563
5506	NC_021200	TCG	2	6	199002	199007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074563
5507	NC_021200	TGC	2	6	199015	199020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074563
5508	NC_021200	CGG	2	6	199031	199036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074563
5509	NC_021200	GCCGGC	2	12	199044	199055	0 %	0 %	50 %	50 %	499074563
5510	NC_021200	CGC	2	6	199057	199062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074563
5511	NC_021200	GCTG	2	8	199120	199127	0 %	25 %	50 %	25 %	499074563
5512	NC_021200	CGGG	2	8	199164	199171	0 %	0 %	75 %	25 %	499074564
5513	NC_021200	CAG	2	6	199186	199191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074564
5514	NC_021200	GGC	2	6	199195	199200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074564
5515	NC_021200	CCG	2	6	199206	199211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074564
5516	NC_021200	TCG	2	6	199251	199256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074564
5517	NC_021200	CGA	2	6	199287	199292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074564
5518	NC_021200	CCG	2	6	199325	199330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074564
5519	NC_021200	TCG	2	6	199362	199367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074564
5520	NC_021200	GTG	2	6	199379	199384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074564
5521	NC_021200	TGC	2	6	199421	199426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074564
5522	NC_021200	ATC	2	6	199454	199459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074564
5523	NC_021200	CCA	2	6	199518	199523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074564
5524	NC_021200	GCCG	2	8	199593	199600	0 %	0 %	50 %	50 %	499074564
5525	NC_021200	TGG	2	6	199608	199613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074564
5526	NC_021200	CCA	2	6	199635	199640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074564
5527	NC_021200	GCCA	2	8	199673	199680	25 %	0 %	25 %	50 %	499074564
5528	NC_021200	CGA	2	6	199716	199721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074564
5529	NC_021200	CAG	2	6	199783	199788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074564
5530	NC_021200	CGC	2	6	199789	199794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074564
5531	NC_021200	GTC	2	6	199896	199901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074565
5532	NC_021200	CCAG	2	8	199912	199919	25 %	0 %	25 %	50 %	499074565
5533	NC_021200	GC	3	6	199929	199934	0 %	0 %	50 %	50 %	499074565
5534	NC_021200	AAC	2	6	199941	199946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499074565
5535	NC_021200	TGG	2	6	199993	199998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074565
5536	NC_021200	TGGTGT	2	12	200002	200013	0 %	50 %	50 %	0 %	499074565
5537	NC_021200	ACC	2	6	200022	200027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074565
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5539	NC_021200	TGGT	2	8	200076	200083	0 %	50 %	50 %	0 %	499074565
5540	NC_021200	TGTT	2	8	200094	200101	0 %	75 %	25 %	0 %	499074565
5541	NC_021200	CGA	2	6	200107	200112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074565
5542	NC_021200	CGA	2	6	200119	200124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074565
5543	NC_021200	CGC	2	6	200149	200154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074565
5544	NC_021200	GTG	2	6	200217	200222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074565
5545	NC_021200	TCG	2	6	200257	200262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074565
5546	NC_021200	GCCGA	2	10	200316	200325	20 %	0 %	40 %	40 %	499074565
5547	NC_021200	AGC	2	6	200331	200336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074565
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5550	NC_021200	GCG	2	6	200387	200392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074565
5551	NC_021200	CGG	2	6	200395	200400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074565
5552	NC_021200	CGG	2	6	200413	200418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074565
5553	NC_021200	CGG	2	6	200431	200436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074565
5554	NC_021200	GCC	2	6	200484	200489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074565
5555	NC_021200	TCG	2	6	200523	200528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074565
5556	NC_021200	CGG	2	6	200560	200565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074565
5557	NC_021200	CCG	2	6	200566	200571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074565
5558	NC_021200	CGG	2	6	200581	200586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074565
5559	NC_021200	CTG	2	6	200596	200601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074565
5560	NC_021200	GCT	2	6	200605	200610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074565
5561	NC_021200	GCC	2	6	200645	200650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074566
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5564	NC_021200	CGT	3	9	200733	200741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074566
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5575	NC_021200	CGCCC	2	10	201144	201153	0 %	0 %	20 %	80 %	499074567
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5579	NC_021200	TCGA	2	8	201322	201329	25 %	25 %	25 %	25 %	499074567
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5589	NC_021200	GCA	3	9	201773	201781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074567
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5592	NC_021200	GC	3	6	201836	201841	0 %	0 %	50 %	50 %	499074567
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5601	NC_021200	TCGA	2	8	202239	202246	25 %	25 %	25 %	25 %	499074568
5602	NC_021200	GTT	2	6	202256	202261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499074568
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5615	NC_021200	CGG	2	6	202624	202629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074568
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5619	NC_021200	TCG	2	6	202752	202757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5620	NC_021200	CGT	2	6	202806	202811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074569
5621	NC_021200	CCA	2	6	202860	202865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074569
5622	NC_021200	GGC	2	6	202898	202903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074569
5623	NC_021200	AC	3	6	202919	202924	50 %	0 %	0 %	50 %	499074569
5624	NC_021200	GCT	2	6	202932	202937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074569
5625	NC_021200	TGCAC	2	10	202944	202953	20 %	20 %	20 %	40 %	499074569
5626	NC_021200	CGG	2	6	202990	202995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074569
5627	NC_021200	GC	3	6	203092	203097	0 %	0 %	50 %	50 %	499074569
5628	NC_021200	GCCG	2	8	203152	203159	0 %	0 %	50 %	50 %	499074569
5629	NC_021200	GGC	2	6	203197	203202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074569
5630	NC_021200	CCG	2	6	203319	203324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074569
5631	NC_021200	CGG	3	9	203365	203373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074569
5632	NC_021200	CGAT	2	8	203439	203446	25 %	25 %	25 %	25 %	499074569
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5634	NC_021200	CGT	2	6	203556	203561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074569
5635	NC_021200	CGT	2	6	203568	203573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074569
5636	NC_021200	GCC	2	6	203594	203599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074569
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5640	NC_021200	GAT	2	6	203731	203736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074569
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5643	NC_021200	TCG	2	6	203843	203848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074569
5644	NC_021200	TCT	2	6	203862	203867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499074569
5645	NC_021200	GCA	2	6	203874	203879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074569
5646	NC_021200	GGCC	2	8	203908	203915	0 %	0 %	50 %	50 %	499074569
5647	NC_021200	CGGC	2	8	203922	203929	0 %	0 %	50 %	50 %	499074569
5648	NC_021200	GAC	2	6	203957	203962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074569
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5650	NC_021200	ACCG	2	8	204010	204017	25 %	0 %	25 %	50 %	499074569
5651	NC_021200	GCC	2	6	204172	204177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074569
5652	NC_021200	CCA	2	6	204219	204224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074569
5653	NC_021200	GTA	2	6	204241	204246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074569
5654	NC_021200	CGAGCA	2	12	204252	204263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074569
5655	NC_021200	C	6	6	204332	204337	0 %	0 %	0 %	100 %	499074570
5656	NC_021200	CCA	2	6	204341	204346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074570
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5664	NC_021200	CGG	2	6	204695	204700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074570
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5670	NC_021200	CCAC	2	8	204817	204824	25 %	0 %	0 %	75 %	499074570
5671	NC_021200	AGC	2	6	204832	204837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074570
5672	NC_021200	TGG	2	6	204842	204847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074570
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5674	NC_021200	GCT	2	6	204875	204880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074570
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5676	NC_021200	CAG	2	6	204915	204920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074570
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5687	NC_021200	CAGCGT	2	12	205209	205220	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	499074570
5688	NC_021200	TTC	2	6	205231	205236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499074570
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5690	NC_021200	TGT	2	6	205331	205336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499074570
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5693	NC_021200	TCG	2	6	205484	205489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5694	NC_021200	CTC	2	6	205519	205524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5695	NC_021200	TCG	2	6	205538	205543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5696	NC_021200	CG	3	6	205542	205547	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5699	NC_021200	CCGGCG	2	12	205615	205626	0 %	0 %	50 %	50 %	499074571
5700	NC_021200	GCCCG	2	10	205652	205661	0 %	0 %	40 %	60 %	499074571
5701	NC_021200	GGC	2	6	205668	205673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074571
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5703	NC_021200	TCG	2	6	205722	205727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074571
5704	NC_021200	CGG	2	6	205736	205741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074571
5705	NC_021200	CGG	2	6	205745	205750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074571
5706	NC_021200	TCC	2	6	205787	205792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499074571
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5742	NC_021200	C	6	6	207176	207181	0 %	0 %	0 %	100 %	499074572
5743	NC_021200	CCG	2	6	207203	207208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074572
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5751	NC_021200	CG	3	6	207333	207338	0 %	0 %	50 %	50 %	499074572
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5859	NC_021200	GGCGCC	2	12	211526	211537	0 %	0 %	50 %	50 %	499074575
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5862	NC_021200	GCG	2	6	211575	211580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074575
5863	NC_021200	GCG	2	6	211599	211604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074575
5864	NC_021200	AAG	2	6	211605	211610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074575
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5986	NC_021200	GCG	2	6	216007	216012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074579
5987	NC_021200	CGG	2	6	216020	216025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074579
5988	NC_021200	CGCC	2	8	216026	216033	0 %	0 %	25 %	75 %	499074579
5989	NC_021200	TCGGG	2	10	216047	216056	0 %	20 %	60 %	20 %	499074579
5990	NC_021200	GCT	2	6	216177	216182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074579
5991	NC_021200	CGA	2	6	216266	216271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074579
5992	NC_021200	GTG	2	6	216286	216291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074579
5993	NC_021200	GTA	2	6	216351	216356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074579
5994	NC_021200	GTT	2	6	216363	216368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499074579
5995	NC_021200	CGGGG	2	10	216450	216459	0 %	0 %	80 %	20 %	499074579
5996	NC_021200	G	6	6	216456	216461	0 %	0 %	100 %	0 %	499074579
5997	NC_021200	G	6	6	216510	216515	0 %	0 %	100 %	0 %	499074580
5998	NC_021200	TGC	2	6	216519	216524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074580
5999	NC_021200	GC	3	6	216551	216556	0 %	0 %	50 %	50 %	499074580
6000	NC_021200	ATCACC	2	12	216566	216577	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	499074580

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