MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021200	GCC	2	6	181694	181699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074546
5002	NC_021200	CAG	2	6	181717	181722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074546
5003	NC_021200	ACCAGG	2	12	181730	181741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074546
5004	NC_021200	GC	3	6	181773	181778	0 %	0 %	50 %	50 %	499074546
5005	NC_021200	CGG	2	6	181794	181799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074546
5006	NC_021200	CGG	2	6	181818	181823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074546
5007	NC_021200	CG	3	6	181865	181870	0 %	0 %	50 %	50 %	499074546
5008	NC_021200	TCA	2	6	181893	181898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074546
5009	NC_021200	CATC	2	8	181986	181993	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5010	NC_021200	GC	3	6	182034	182039	0 %	0 %	50 %	50 %	499074547
5011	NC_021200	GGC	2	6	182043	182048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074547
5012	NC_021200	CGT	2	6	182075	182080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074547
5013	NC_021200	CGC	3	9	182081	182089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074547
5014	NC_021200	TCG	2	6	182125	182130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074547
5015	NC_021200	AGCGC	2	10	182150	182159	20 %	0 %	40 %	40 %	499074547
5016	NC_021200	TGAG	2	8	182179	182186	25 %	25 %	50 %	0 %	499074547
5017	NC_021200	TCC	2	6	182206	182211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	499074547
5018	NC_021200	ATC	2	6	182215	182220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074547
5019	NC_021200	CTG	2	6	182280	182285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074547
5020	NC_021200	TCG	2	6	182309	182314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074547
5021	NC_021200	CGG	2	6	182343	182348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_021200	CCCCG	2	10	182373	182382	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
5023	NC_021200	CAC	2	6	182437	182442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074548
5024	NC_021200	GC	4	8	182450	182457	0 %	0 %	50 %	50 %	499074548
5025	NC_021200	AGC	2	6	182469	182474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074548
5026	NC_021200	GCC	3	9	182522	182530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074548
5027	NC_021200	TGC	2	6	182538	182543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074548
5028	NC_021200	CGA	2	6	182560	182565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074548
5029	NC_021200	CGT	2	6	182595	182600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074548
5030	NC_021200	AAGG	2	8	182657	182664	50 %	0 %	50 %	0 %	499074548
5031	NC_021200	CGC	2	6	182671	182676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074548
5032	NC_021200	GGC	2	6	182678	182683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074548
5033	NC_021200	TGC	2	6	182826	182831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074548
5034	NC_021200	AGCG	2	8	182951	182958	25 %	0 %	50 %	25 %	499074548
5035	NC_021200	ATC	2	6	182969	182974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074548
5036	NC_021200	GC	4	8	183000	183007	0 %	0 %	50 %	50 %	499074548
5037	NC_021200	CG	3	6	183018	183023	0 %	0 %	50 %	50 %	499074548
5038	NC_021200	GCG	2	6	183072	183077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074548
5039	NC_021200	GCC	2	6	183107	183112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074548
5040	NC_021200	CCG	2	6	183149	183154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074548
5041	NC_021200	ACCG	2	8	183158	183165	25 %	0 %	25 %	50 %	499074548
5042	NC_021200	CCG	3	9	183163	183171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074548
5043	NC_021200	CGT	2	6	183202	183207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074548
5044	NC_021200	GCT	2	6	183211	183216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074548
5045	NC_021200	CCGC	2	8	183231	183238	0 %	0 %	25 %	75 %	499074548
5046	NC_021200	AGG	2	6	183252	183257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074548
5047	NC_021200	GGT	2	6	183277	183282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074548
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5049	NC_021200	CCA	2	6	183300	183305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074548
5050	NC_021200	TGC	2	6	183312	183317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074548
5051	NC_021200	CTG	2	6	183320	183325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074548
5052	NC_021200	CGA	2	6	183361	183366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074548
5053	NC_021200	CGGC	2	8	183418	183425	0 %	0 %	50 %	50 %	499074548
5054	NC_021200	TGA	2	6	183429	183434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074548
5055	NC_021200	CGG	2	6	183451	183456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074548
5056	NC_021200	TGA	3	9	183465	183473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074548
5057	NC_021200	GCT	2	6	183478	183483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074548
5058	NC_021200	GCT	2	6	183493	183498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074548
5059	NC_021200	CGCCC	2	10	183556	183565	0 %	0 %	20 %	80 %	499074548
5060	NC_021200	TGC	2	6	183582	183587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074548
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5064	NC_021200	GGA	2	6	183748	183753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074548
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5070	NC_021200	TCG	2	6	184029	184034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074548
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5072	NC_021200	TCG	2	6	184122	184127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074548
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5074	NC_021200	CACG	2	8	184210	184217	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5075	NC_021200	GCCG	2	8	184239	184246	0 %	0 %	50 %	50 %	499074549
5076	NC_021200	CG	3	6	184248	184253	0 %	0 %	50 %	50 %	499074549
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5089	NC_021200	TGA	2	6	184650	184655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074549
5090	NC_021200	CATC	2	8	184718	184725	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5091	NC_021200	GCC	2	6	184753	184758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5092	NC_021200	GCG	2	6	184822	184827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_021200	GCG	2	6	184897	184902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074550
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5122	NC_021200	GCC	2	6	185614	185619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074550
5123	NC_021200	TGC	2	6	185656	185661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074550
5124	NC_021200	CGC	2	6	185671	185676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074550
5125	NC_021200	GCT	2	6	185726	185731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074550
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5130	NC_021200	GCG	2	6	186127	186132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074551
5131	NC_021200	CGA	2	6	186134	186139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074551
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5133	NC_021200	CAC	2	6	186222	186227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074551
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5135	NC_021200	CAG	2	6	186324	186329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074551
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5143	NC_021200	TA	3	6	186542	186547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5144	NC_021200	G	6	6	186553	186558	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5145	NC_021200	TA	3	6	186559	186564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5146	NC_021200	CGC	2	6	186585	186590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5148	NC_021200	CTG	2	6	186648	186653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074552
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5233	NC_021200	GGTCGG	2	12	189745	189756	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	499074555
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5241	NC_021200	GATG	2	8	190048	190055	25 %	25 %	50 %	0 %	499074555
5242	NC_021200	TGT	2	6	190107	190112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499074555
5243	NC_021200	GCA	2	6	190131	190136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074555
5244	NC_021200	GCG	2	6	190139	190144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074555
5245	NC_021200	GC	3	6	190147	190152	0 %	0 %	50 %	50 %	499074555
5246	NC_021200	GTC	2	6	190162	190167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074555
5247	NC_021200	CTC	3	9	190182	190190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5248	NC_021200	TCG	2	6	190207	190212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5249	NC_021200	CGG	2	6	190214	190219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5250	NC_021200	CGC	2	6	190230	190235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5251	NC_021200	TCC	2	6	190236	190241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5252	NC_021200	GGC	2	6	190293	190298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5253	NC_021200	TCG	2	6	190331	190336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074556
5254	NC_021200	GTC	2	6	190462	190467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074556
5255	NC_021200	CAG	2	6	190483	190488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074556
5256	NC_021200	CACC	2	8	190527	190534	25 %	0 %	0 %	75 %	499074556
5257	NC_021200	CAA	2	6	190537	190542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499074556
5258	NC_021200	CG	3	6	190543	190548	0 %	0 %	50 %	50 %	499074556
5259	NC_021200	GCCG	2	8	190555	190562	0 %	0 %	50 %	50 %	499074556
5260	NC_021200	GGC	2	6	190600	190605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074556
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5264	NC_021200	CAG	2	6	190699	190704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074556
5265	NC_021200	GCC	2	6	190724	190729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074556
5266	NC_021200	CGC	2	6	190800	190805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074556
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5268	NC_021200	GCC	2	6	190921	190926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074556
5269	NC_021200	GGCC	2	8	190968	190975	0 %	0 %	50 %	50 %	499074556
5270	NC_021200	GCG	2	6	191005	191010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074556
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5272	NC_021200	CG	4	8	191047	191054	0 %	0 %	50 %	50 %	499074556
5273	NC_021200	CCG	2	6	191096	191101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074556
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5276	NC_021200	GGT	2	6	191249	191254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074557
5277	NC_021200	CTG	2	6	191298	191303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074557
5278	NC_021200	GCT	2	6	191363	191368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074557
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5282	NC_021200	GCCG	2	8	191476	191483	0 %	0 %	50 %	50 %	499074557
5283	NC_021200	CCG	2	6	191521	191526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074557
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5290	NC_021200	GCTGG	2	10	191699	191708	0 %	20 %	60 %	20 %	499074557
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5322	NC_021200	GCG	2	6	192668	192673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074558
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5333	NC_021200	CTA	2	6	193030	193035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074558
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5486	NC_021200	GGC	2	6	198519	198524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074563
5487	NC_021200	CGC	2	6	198550	198555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074563
5488	NC_021200	ACA	2	6	198571	198576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499074563
5489	NC_021200	CGGCCG	2	12	198581	198592	0 %	0 %	50 %	50 %	499074563
5490	NC_021200	CGG	3	9	198647	198655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074563
5491	NC_021200	GC	3	6	198667	198672	0 %	0 %	50 %	50 %	499074563
5492	NC_021200	GAT	2	6	198680	198685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074563
5493	NC_021200	TCCG	2	8	198689	198696	0 %	25 %	25 %	50 %	499074563
5494	NC_021200	TGTGG	2	10	198710	198719	0 %	40 %	60 %	0 %	499074563
5495	NC_021200	ACG	2	6	198739	198744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074563
5496	NC_021200	CGT	2	6	198755	198760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074563
5497	NC_021200	CTG	2	6	198768	198773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074563
5498	NC_021200	TCG	2	6	198790	198795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074563
5499	NC_021200	CTG	2	6	198813	198818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074563
5500	NC_021200	ACG	2	6	198844	198849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074563

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