MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis MAP4

Total Repeats: 137102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021200	ACC	2	6	166056	166061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074536
4502	NC_021200	CGA	2	6	166135	166140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_021200	CTGA	2	8	166166	166173	25 %	25 %	25 %	25 %	499074537
4504	NC_021200	CCG	2	6	166179	166184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074537
4505	NC_021200	CGC	2	6	166203	166208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074537
4506	NC_021200	CGG	2	6	166209	166214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074537
4507	NC_021200	GGC	2	6	166235	166240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074537
4508	NC_021200	GGGCT	2	10	166298	166307	0 %	20 %	60 %	20 %	499074537
4509	NC_021200	GCTG	2	8	166365	166372	0 %	25 %	50 %	25 %	499074537
4510	NC_021200	CCG	2	6	166383	166388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074537
4511	NC_021200	CGT	2	6	166411	166416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074537
4512	NC_021200	GTC	2	6	166469	166474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074537
4513	NC_021200	CGA	2	6	166534	166539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074537
4514	NC_021200	GCG	2	6	166582	166587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074537
4515	NC_021200	TGG	3	9	166608	166616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074537
4516	NC_021200	GGA	2	6	166651	166656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074537
4517	NC_021200	GGA	2	6	166750	166755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074537
4518	NC_021200	CG	3	6	166861	166866	0 %	0 %	50 %	50 %	499074537
4519	NC_021200	TG	3	6	166867	166872	0 %	50 %	50 %	0 %	499074537
4520	NC_021200	TGG	2	6	166941	166946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074538
4521	NC_021200	CGG	2	6	167009	167014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074538
4522	NC_021200	ACG	3	9	167062	167070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074538
4523	NC_021200	CCAG	2	8	167071	167078	25 %	0 %	25 %	50 %	499074538
4524	NC_021200	GTG	2	6	167136	167141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074538
4525	NC_021200	ACG	2	6	167151	167156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074538
4526	NC_021200	CGA	2	6	167174	167179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074538
4527	NC_021200	GTC	2	6	167199	167204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074538
4528	NC_021200	ACC	2	6	167230	167235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074538
4529	NC_021200	GTC	2	6	167244	167249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074538
4530	NC_021200	GGCT	2	8	167259	167266	0 %	25 %	50 %	25 %	499074538
4531	NC_021200	GGC	2	6	167267	167272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074538
4532	NC_021200	AAG	2	6	167319	167324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074538
4533	NC_021200	CGA	4	12	167354	167365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074538
4534	NC_021200	AAC	2	6	167376	167381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499074538
4535	NC_021200	CGG	2	6	167417	167422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074538
4536	NC_021200	GCTGG	2	10	167436	167445	0 %	20 %	60 %	20 %	499074538
4537	NC_021200	TGG	2	6	167518	167523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074538
4538	NC_021200	GGT	2	6	167525	167530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074538
4539	NC_021200	CGG	2	6	167546	167551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074538
4540	NC_021200	CGC	2	6	167558	167563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074538
4541	NC_021200	ACT	2	6	167647	167652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074538
4542	NC_021200	GGT	2	6	167663	167668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074538
4543	NC_021200	GTG	2	6	167712	167717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074538
4544	NC_021200	GAG	2	6	167730	167735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499074538
4545	NC_021200	GAA	2	6	167770	167775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074538
4546	NC_021200	TGA	2	6	167779	167784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074538
4547	NC_021200	ATC	2	6	167820	167825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499074538
4548	NC_021200	CTG	2	6	167841	167846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074538
4549	NC_021200	CACT	2	8	167868	167875	25 %	25 %	0 %	50 %	499074538
4550	NC_021200	CGC	2	6	167891	167896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074538
4551	NC_021200	GCT	2	6	167912	167917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074538
4552	NC_021200	GCCT	2	8	167937	167944	0 %	25 %	25 %	50 %	499074538
4553	NC_021200	GCC	2	6	167956	167961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074538
4554	NC_021200	CTGG	2	8	168041	168048	0 %	25 %	50 %	25 %	499074538
4555	NC_021200	AGA	2	6	168061	168066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074538
4556	NC_021200	CTG	2	6	168171	168176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074538
4557	NC_021200	CGG	2	6	168203	168208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074538
4558	NC_021200	C	6	6	168228	168233	0 %	0 %	0 %	100 %	499074538
4559	NC_021200	AGC	2	6	168295	168300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074538
4560	NC_021200	GTG	2	6	168306	168311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074538
4561	NC_021200	CAG	2	6	168345	168350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074538
4562	NC_021200	CGG	2	6	168383	168388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074538
4563	NC_021200	CAC	2	6	168464	168469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074538
4564	NC_021200	ATG	2	6	168523	168528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074538
4565	NC_021200	AAG	2	6	168534	168539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499074538
4566	NC_021200	GCGG	2	8	168551	168558	0 %	0 %	75 %	25 %	499074538
4567	NC_021200	CCG	2	6	168564	168569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074538
4568	NC_021200	CGG	2	6	168590	168595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074538
4569	NC_021200	TGC	3	9	168658	168666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074538
4570	NC_021200	GCT	3	9	168677	168685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074538
4571	NC_021200	GGT	2	6	168707	168712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074538
4572	NC_021200	TGA	2	6	168733	168738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074538
4573	NC_021200	GC	3	6	168739	168744	0 %	0 %	50 %	50 %	499074538
4574	NC_021200	TCG	2	6	168784	168789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074538
4575	NC_021200	CGC	2	6	168826	168831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074538
4576	NC_021200	TGG	3	9	168835	168843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074538
4577	NC_021200	GTC	2	6	168855	168860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074538
4578	NC_021200	GC	3	6	168921	168926	0 %	0 %	50 %	50 %	499074538
4579	NC_021200	ACC	2	6	168972	168977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074538
4580	NC_021200	GGC	2	6	168979	168984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074538
4581	NC_021200	GCC	3	9	168993	169001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074538
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4583	NC_021200	TGA	2	6	169051	169056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074538
4584	NC_021200	GGC	2	6	169079	169084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074538
4585	NC_021200	GCT	3	9	169085	169093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074538
4586	NC_021200	GGT	2	6	169103	169108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074538
4587	NC_021200	TGA	2	6	169132	169137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074538
4588	NC_021200	GCT	2	6	169139	169144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074538
4589	NC_021200	CGA	2	6	169148	169153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074538
4590	NC_021200	CTG	2	6	169154	169159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074538
4591	NC_021200	CCG	2	6	169178	169183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074538
4592	NC_021200	CGA	2	6	169223	169228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074538
4593	NC_021200	CGGC	2	8	169250	169257	0 %	0 %	50 %	50 %	499074538
4594	NC_021200	CCG	2	6	169266	169271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074538
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4599	NC_021200	CACC	2	8	169319	169326	25 %	0 %	0 %	75 %	499074538
4600	NC_021200	CGGC	2	8	169347	169354	0 %	0 %	50 %	50 %	499074538
4601	NC_021200	GC	3	6	169353	169358	0 %	0 %	50 %	50 %	499074538
4602	NC_021200	CAC	2	6	169403	169408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074538
4603	NC_021200	CCCGG	2	10	169415	169424	0 %	0 %	40 %	60 %	499074538
4604	NC_021200	CCGA	2	8	169434	169441	25 %	0 %	25 %	50 %	499074538
4605	NC_021200	GAC	2	6	169448	169453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074538
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4607	NC_021200	GCC	2	6	169480	169485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074538
4608	NC_021200	GCC	2	6	169490	169495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074538
4609	NC_021200	GCCC	3	12	169522	169533	0 %	0 %	25 %	75 %	499074538
4610	NC_021200	GGC	2	6	169535	169540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074538
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4612	NC_021200	CGA	2	6	169592	169597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074538
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4616	NC_021200	GGC	2	6	169665	169670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074538
4617	NC_021200	CGGC	2	8	169684	169691	0 %	0 %	50 %	50 %	499074538
4618	NC_021200	CG	4	8	169703	169710	0 %	0 %	50 %	50 %	499074538
4619	NC_021200	GCC	2	6	169744	169749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074538
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4621	NC_021200	CTG	2	6	169779	169784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074538
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4730	NC_021200	GCC	2	6	172976	172981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4732	NC_021200	CCCG	2	8	173141	173148	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4733	NC_021200	CAA	2	6	173183	173188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4734	NC_021200	CGC	2	6	173195	173200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4739	NC_021200	ATG	2	6	173300	173305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499074542
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4741	NC_021200	GTT	2	6	173356	173361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499074542
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4743	NC_021200	GTC	2	6	173494	173499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499074542
4744	NC_021200	CGC	2	6	173512	173517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074542
4745	NC_021200	C	6	6	173517	173522	0 %	0 %	0 %	100 %	499074542
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4752	NC_021200	AGGGC	2	10	173776	173785	20 %	0 %	60 %	20 %	499074542
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4986	NC_021200	CAG	2	6	181222	181227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074546
4987	NC_021200	GCCG	2	8	181242	181249	0 %	0 %	50 %	50 %	499074546
4988	NC_021200	GGT	2	6	181254	181259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499074546
4989	NC_021200	GCA	2	6	181314	181319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074546
4990	NC_021200	GAC	2	6	181339	181344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074546
4991	NC_021200	GGC	2	6	181345	181350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074546
4992	NC_021200	ACG	2	6	181367	181372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	499074546
4993	NC_021200	GCC	2	6	181377	181382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499074546
4994	NC_021200	CAC	2	6	181423	181428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074546
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4996	NC_021200	GGC	2	6	181484	181489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074546
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4998	NC_021200	CAGG	2	8	181615	181622	25 %	0 %	50 %	25 %	499074546
4999	NC_021200	CCA	2	6	181632	181637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499074546
5000	NC_021200	CGG	2	6	181643	181648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	499074546

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