MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 108642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021192	ACG	2	6	166253	166258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_021192	CGG	2	6	166286	166291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_021192	GCG	2	6	166294	166299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_021192	GAT	2	6	166418	166423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_021192	TCT	2	6	166600	166605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_021192	AGC	2	6	166656	166661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_021192	TCG	2	6	166672	166677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_021192	GTC	2	6	166734	166739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_021192	GTC	2	6	166798	166803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_021192	GGT	2	6	166809	166814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_021192	CGGC	2	8	166829	166836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4012	NC_021192	CAG	2	6	166870	166875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_021192	TGC	2	6	166925	166930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_021192	CG	3	6	166947	166952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4015	NC_021192	CGC	2	6	166974	166979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4016	NC_021192	GCGTG	2	10	166985	166994	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4017	NC_021192	GAG	2	6	167008	167013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_021192	GCC	2	6	167044	167049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4019	NC_021192	GAC	2	6	167050	167055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_021192	GCC	2	6	167089	167094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4021	NC_021192	CCG	2	6	167100	167105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4022	NC_021192	CGG	2	6	167159	167164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_021192	AGC	2	6	167171	167176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_021192	GGC	2	6	167207	167212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_021192	GCC	2	6	167271	167276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4026	NC_021192	CG	3	6	167347	167352	0 %	0 %	50 %	50 %	494690801
4027	NC_021192	GTG	2	6	167353	167358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690801
4028	NC_021192	GC	3	6	167363	167368	0 %	0 %	50 %	50 %	494690801
4029	NC_021192	GCGG	2	8	167370	167377	0 %	0 %	75 %	25 %	494690801
4030	NC_021192	GCG	2	6	167416	167421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690801
4031	NC_021192	CA	3	6	167472	167477	50 %	0 %	0 %	50 %	494690801
4032	NC_021192	GACGCC	2	12	167491	167502	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	494690801
4033	NC_021192	GTCG	2	8	167505	167512	0 %	25 %	50 %	25 %	494690801
4034	NC_021192	GAT	2	6	167532	167537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494690801
4035	NC_021192	GCCG	2	8	167555	167562	0 %	0 %	50 %	50 %	494690801
4036	NC_021192	CGA	2	6	167565	167570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690801
4037	NC_021192	GCT	2	6	167586	167591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690801
4038	NC_021192	GGT	2	6	167619	167624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690801
4039	NC_021192	GCCGC	2	10	167658	167667	0 %	0 %	40 %	60 %	494690801
4040	NC_021192	CGG	2	6	167814	167819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690802
4041	NC_021192	ACA	3	9	167868	167876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494690802
4042	NC_021192	GAT	2	6	167896	167901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494690802
4043	NC_021192	CAC	2	6	167911	167916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690802
4044	NC_021192	CGG	2	6	167923	167928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690802
4045	NC_021192	GCG	2	6	167959	167964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_021192	CG	3	6	167963	167968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4047	NC_021192	CAT	2	6	167990	167995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_021192	ACG	2	6	168003	168008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_021192	GCC	2	6	168058	168063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4050	NC_021192	CGC	2	6	168068	168073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4051	NC_021192	CGA	2	6	168076	168081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_021192	CCG	2	6	168123	168128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690803
4053	NC_021192	GACGAT	2	12	168173	168184	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	494690803
4054	NC_021192	CAG	2	6	168200	168205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690803
4055	NC_021192	CGG	2	6	168217	168222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690803
4056	NC_021192	GCT	2	6	168245	168250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690803
4057	NC_021192	CAG	2	6	168285	168290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690803
4058	NC_021192	CCG	2	6	168292	168297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690803
4059	NC_021192	CGG	2	6	168383	168388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690803
4060	NC_021192	CAC	2	6	168400	168405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690803
4061	NC_021192	AGT	2	6	168413	168418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494690803
4062	NC_021192	AAG	2	6	168479	168484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	494690803
4063	NC_021192	GCA	2	6	168527	168532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690803
4064	NC_021192	GTC	2	6	168549	168554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690803
4065	NC_021192	CGC	2	6	168579	168584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690803
4066	NC_021192	CGG	2	6	168676	168681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690803
4067	NC_021192	CAG	2	6	168684	168689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690803
4068	NC_021192	GCCG	2	8	168699	168706	0 %	0 %	50 %	50 %	494690803
4069	NC_021192	GCC	2	6	168732	168737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690803
4070	NC_021192	CCA	2	6	168770	168775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690803
4071	NC_021192	GC	3	6	168805	168810	0 %	0 %	50 %	50 %	494690803
4072	NC_021192	TCG	2	6	168838	168843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690803
4073	NC_021192	CCGCC	2	10	168899	168908	0 %	0 %	20 %	80 %	494690803
4074	NC_021192	CGT	2	6	168909	168914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690803
4075	NC_021192	CG	3	6	168937	168942	0 %	0 %	50 %	50 %	494690803
4076	NC_021192	GCC	2	6	168963	168968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690803
4077	NC_021192	AGA	2	6	169044	169049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_021192	CCG	2	6	169145	169150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690804
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4080	NC_021192	CGA	2	6	169262	169267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690804
4081	NC_021192	CAG	2	6	169269	169274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690804
4082	NC_021192	CGC	2	6	169310	169315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690804
4083	NC_021192	GCG	2	6	169319	169324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690804
4084	NC_021192	GCC	2	6	169374	169379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690804
4085	NC_021192	TCG	2	6	169382	169387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690804
4086	NC_021192	GGTA	2	8	169494	169501	25 %	25 %	50 %	0 %	494690804
4087	NC_021192	GTG	2	6	169512	169517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690804
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4089	NC_021192	CAA	2	6	169714	169719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494690804
4090	NC_021192	GGT	2	6	169738	169743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690804
4091	NC_021192	CGC	2	6	169790	169795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690804
4092	NC_021192	GGC	2	6	169812	169817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690804
4093	NC_021192	GTC	2	6	169823	169828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690804
4094	NC_021192	CCA	2	6	169885	169890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690804
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4098	NC_021192	CAG	2	6	170127	170132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690804
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4101	NC_021192	CA	3	6	170208	170213	50 %	0 %	0 %	50 %	494690804
4102	NC_021192	ACTT	2	8	170232	170239	25 %	50 %	0 %	25 %	494690804
4103	NC_021192	GCATG	2	10	170245	170254	20 %	20 %	40 %	20 %	494690804
4104	NC_021192	CGA	2	6	170268	170273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690804
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4107	NC_021192	CTT	2	6	170551	170556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494690804
4108	NC_021192	CGA	2	6	170557	170562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690804
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4110	NC_021192	GGT	2	6	170599	170604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_021192	CGG	2	6	170652	170657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_021192	TTC	2	6	170712	170717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_021192	CGA	2	6	170773	170778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_021192	GGCC	2	8	170780	170787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4115	NC_021192	CTACC	2	10	170848	170857	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4116	NC_021192	CGC	2	6	170868	170873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4117	NC_021192	GCGA	2	8	170983	170990	25 %	0 %	50 %	25 %	494690805
4118	NC_021192	TGGC	2	8	171057	171064	0 %	25 %	50 %	25 %	494690805
4119	NC_021192	TGGC	2	8	171071	171078	0 %	25 %	50 %	25 %	494690805
4120	NC_021192	GAG	2	6	171100	171105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	494690805
4121	NC_021192	CGA	2	6	171144	171149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690805
4122	NC_021192	CAC	2	6	171159	171164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690805
4123	NC_021192	TGC	2	6	171167	171172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690805
4124	NC_021192	GAC	2	6	171259	171264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690805
4125	NC_021192	TGG	2	6	171305	171310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690805
4126	NC_021192	GGC	2	6	171439	171444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_021192	TCG	2	6	171471	171476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_021192	CTT	2	6	171511	171516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_021192	CGC	2	6	171541	171546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4130	NC_021192	CCG	2	6	171612	171617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4131	NC_021192	GATC	2	8	171634	171641	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4132	NC_021192	ACG	2	6	171668	171673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_021192	CCG	2	6	171719	171724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4134	NC_021192	CGC	2	6	171744	171749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4135	NC_021192	GCAC	2	8	171778	171785	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4136	NC_021192	TACC	2	8	171814	171821	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4137	NC_021192	GCG	2	6	171916	171921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690806
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4142	NC_021192	AT	3	6	172206	172211	50 %	50 %	0 %	0 %	494690806
4143	NC_021192	CGC	2	6	172296	172301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690806
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4145	NC_021192	GAT	2	6	172315	172320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494690806
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4152	NC_021192	CCG	2	6	172604	172609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4153	NC_021192	GCG	2	6	172647	172652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4154	NC_021192	CTG	2	6	172660	172665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4155	NC_021192	ATC	2	6	172729	172734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4156	NC_021192	CGG	2	6	172772	172777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4157	NC_021192	CGT	2	6	172803	172808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690807
4158	NC_021192	CGC	2	6	172827	172832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690807
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4211	NC_021192	CGG	2	6	174904	174909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4247	NC_021192	TGG	2	6	176634	176639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690809
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4249	NC_021192	GAA	3	9	176753	176761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	494690809
4250	NC_021192	TGA	2	6	176807	176812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494690809
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4252	NC_021192	GGC	2	6	176836	176841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690809
4253	NC_021192	CGG	2	6	176862	176867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690809
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4262	NC_021192	GGACA	2	10	177293	177302	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4263	NC_021192	GCG	2	6	177321	177326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4266	NC_021192	GTG	2	6	177405	177410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4268	NC_021192	GCTG	2	8	177484	177491	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4269	NC_021192	TGC	2	6	177525	177530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4272	NC_021192	GCC	2	6	177797	177802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4274	NC_021192	CCT	2	6	177880	177885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4276	NC_021192	TGG	2	6	177904	177909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4277	NC_021192	GCC	3	9	177936	177944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4282	NC_021192	GCCGA	2	10	178113	178122	20 %	0 %	40 %	40 %	494690810
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4372	NC_021192	CGC	2	6	181223	181228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690811
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4377	NC_021192	TGG	2	6	181466	181471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4405	NC_021192	GCC	2	6	182794	182799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4410	NC_021192	GTC	2	6	182991	182996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4499	NC_021192	CGA	2	6	185726	185731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690817
4500	NC_021192	GCC	2	6	185775	185780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690817

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