MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 108642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_021192	CGC	2	6	838298	838303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21002	NC_021192	CACG	2	8	838324	838331	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21003	NC_021192	ACCA	2	8	838342	838349	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21004	NC_021192	GTC	2	6	838400	838405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21005	NC_021192	CT	3	6	838414	838419	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21006	NC_021192	CG	3	6	838437	838442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21007	NC_021192	GTA	2	6	838466	838471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21008	NC_021192	GATGC	2	10	838504	838513	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21009	NC_021192	TCT	2	6	838533	838538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21010	NC_021192	ATAGCC	2	12	838558	838569	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21011	NC_021192	CA	3	6	838638	838643	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21012	NC_021192	CGT	3	9	838659	838667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21013	NC_021192	CAA	2	6	838690	838695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21014	NC_021192	TCG	2	6	838754	838759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21015	NC_021192	AGC	2	6	838760	838765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21016	NC_021192	CCG	2	6	838769	838774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21017	NC_021192	GTCG	2	8	838782	838789	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21018	NC_021192	GGC	2	6	838816	838821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21019	NC_021192	GC	3	6	838824	838829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21020	NC_021192	TGC	2	6	838843	838848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21021	NC_021192	GCCG	2	8	838857	838864	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21022	NC_021192	GCC	2	6	838915	838920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21023	NC_021192	CGG	2	6	838932	838937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21024	NC_021192	CAC	2	6	838957	838962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21025	NC_021192	CTTCG	2	10	838993	839002	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
21026	NC_021192	GC	3	6	839004	839009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21027	NC_021192	CGA	2	6	839037	839042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21028	NC_021192	CGC	2	6	839055	839060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21029	NC_021192	GC	3	6	839080	839085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21030	NC_021192	CAC	2	6	839089	839094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21031	NC_021192	TGC	2	6	839107	839112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21032	NC_021192	CGC	2	6	839154	839159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21033	NC_021192	TGG	2	6	839256	839261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21034	NC_021192	TCG	2	6	839291	839296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21035	NC_021192	ATC	2	6	839312	839317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21036	NC_021192	TGT	2	6	839328	839333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21037	NC_021192	CGG	2	6	839349	839354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21038	NC_021192	GCC	2	6	839418	839423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21039	NC_021192	CGT	2	6	839426	839431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21040	NC_021192	GGC	2	6	839499	839504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21041	NC_021192	GGC	2	6	839547	839552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21042	NC_021192	CGA	2	6	839561	839566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21043	NC_021192	TCG	3	9	839575	839583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21044	NC_021192	GCC	2	6	839699	839704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21045	NC_021192	GCC	2	6	839746	839751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21046	NC_021192	CACCGG	2	12	839767	839778	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
21047	NC_021192	TCG	2	6	839952	839957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21048	NC_021192	GTGC	2	8	840003	840010	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21049	NC_021192	GAA	2	6	840015	840020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21050	NC_021192	GCC	2	6	840021	840026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21051	NC_021192	AGGTC	2	10	840059	840068	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21052	NC_021192	CGG	2	6	840110	840115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21053	NC_021192	GCC	2	6	840154	840159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21054	NC_021192	GC	3	6	840241	840246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21055	NC_021192	CCG	2	6	840394	840399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691374
21056	NC_021192	GGC	3	9	840423	840431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691374
21057	NC_021192	CGA	2	6	840467	840472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691374
21058	NC_021192	GTG	2	6	840495	840500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691374
21059	NC_021192	CCT	2	6	840518	840523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	494691374
21060	NC_021192	CGCC	2	8	840547	840554	0 %	0 %	25 %	75 %	494691374
21061	NC_021192	GGGCC	2	10	840649	840658	0 %	0 %	60 %	40 %	494691374
21062	NC_021192	ATC	2	6	840675	840680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691374
21063	NC_021192	ACC	2	6	840711	840716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691374
21064	NC_021192	CCG	2	6	840837	840842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691374
21065	NC_021192	ACA	2	6	840875	840880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494691374
21066	NC_021192	TCG	2	6	840892	840897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691374
21067	NC_021192	CGG	2	6	841094	841099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691374
21068	NC_021192	TG	3	6	841129	841134	0 %	50 %	50 %	0 %	494691374
21069	NC_021192	GGC	2	6	841161	841166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691374
21070	NC_021192	GCGCT	2	10	841296	841305	0 %	20 %	40 %	40 %	494691374
21071	NC_021192	CAT	2	6	841307	841312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691374
21072	NC_021192	ACA	2	6	841325	841330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494691374
21073	NC_021192	GGC	3	9	841377	841385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691374
21074	NC_021192	CGG	2	6	841388	841393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691374
21075	NC_021192	CGA	2	6	841448	841453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691374
21076	NC_021192	GGC	4	12	841461	841472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691374
21077	NC_021192	CGA	2	6	841476	841481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691374
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21079	NC_021192	GC	3	6	841511	841516	0 %	0 %	50 %	50 %	494691374
21080	NC_021192	GGC	4	12	841533	841544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691374
21081	NC_021192	GCAG	2	8	841545	841552	25 %	0 %	50 %	25 %	494691374
21082	NC_021192	G	6	6	841640	841645	0 %	0 %	100 %	0 %	494691374
21083	NC_021192	TGC	2	6	841784	841789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691374
21084	NC_021192	CGG	2	6	841826	841831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691374
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21088	NC_021192	CGG	2	6	841951	841956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691374
21089	NC_021192	GGC	2	6	841961	841966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691374
21090	NC_021192	CGG	2	6	841978	841983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691374
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21092	NC_021192	GCGG	2	8	842015	842022	0 %	0 %	75 %	25 %	494691374
21093	NC_021192	CGG	2	6	842026	842031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691374
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21100	NC_021192	G	7	7	842140	842146	0 %	0 %	100 %	0 %	494691374
21101	NC_021192	GGT	2	6	842155	842160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691374
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21105	NC_021192	CCCGGA	2	12	842248	842259	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	494691374
21106	NC_021192	GCA	2	6	842357	842362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691374
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21108	NC_021192	CG	3	6	842369	842374	0 %	0 %	50 %	50 %	494691374
21109	NC_021192	CTG	2	6	842472	842477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691374
21110	NC_021192	TCG	2	6	842482	842487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691374
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21112	NC_021192	GTCG	2	8	842652	842659	0 %	25 %	50 %	25 %	494691374
21113	NC_021192	GAT	2	6	842694	842699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691374
21114	NC_021192	CTG	2	6	842725	842730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691374
21115	NC_021192	CACC	2	8	842733	842740	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
21116	NC_021192	CGT	2	6	842760	842765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21117	NC_021192	GGC	2	6	842785	842790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21118	NC_021192	TCG	2	6	842852	842857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21119	NC_021192	CGG	3	9	842930	842938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21120	NC_021192	TCA	2	6	842939	842944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21121	NC_021192	GAC	2	6	843009	843014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21122	NC_021192	CGA	2	6	843139	843144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691375
21123	NC_021192	TAGC	2	8	843267	843274	25 %	25 %	25 %	25 %	494691375
21124	NC_021192	ATCG	2	8	843297	843304	25 %	25 %	25 %	25 %	494691375
21125	NC_021192	AGC	2	6	843308	843313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691375
21126	NC_021192	TGT	3	9	843352	843360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494691375
21127	NC_021192	TTG	2	6	843483	843488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494691375
21128	NC_021192	ATT	2	6	843575	843580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21129	NC_021192	GCCCA	2	10	843626	843635	20 %	0 %	20 %	60 %	494691376
21130	NC_021192	GTA	2	6	843639	843644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691376
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21134	NC_021192	CCTGA	2	10	843872	843881	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
21135	NC_021192	TGC	2	6	844116	844121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691377
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21162	NC_021192	AGG	2	6	845844	845849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	494691379
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21187	NC_021192	GC	3	6	846619	846624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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21194	NC_021192	TGA	2	6	846955	846960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21207	NC_021192	ATCGG	2	10	847496	847505	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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21218	NC_021192	ATCG	2	8	847883	847890	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21219	NC_021192	GC	3	6	847910	847915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21220	NC_021192	GC	3	6	847925	847930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21221	NC_021192	ACC	2	6	847947	847952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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21224	NC_021192	GCGG	2	8	848215	848222	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21225	NC_021192	CCG	2	6	848241	848246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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21228	NC_021192	GCC	2	6	848360	848365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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21231	NC_021192	GCT	2	6	848419	848424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21232	NC_021192	TGC	3	9	848436	848444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21233	NC_021192	CTG	2	6	848491	848496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21234	NC_021192	ACG	2	6	848519	848524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21236	NC_021192	CGA	2	6	848598	848603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21237	NC_021192	TGC	2	6	848621	848626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21238	NC_021192	CGA	2	6	848700	848705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21239	NC_021192	AGG	2	6	848747	848752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21240	NC_021192	TCG	2	6	848791	848796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21241	NC_021192	GC	4	8	848800	848807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21242	NC_021192	GCG	2	6	848810	848815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21243	NC_021192	TCG	2	6	848837	848842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21244	NC_021192	TGG	2	6	848849	848854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21245	NC_021192	GAC	2	6	848880	848885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21246	NC_021192	TGC	2	6	848902	848907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21247	NC_021192	CG	3	6	848924	848929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21248	NC_021192	GCC	2	6	848974	848979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21249	NC_021192	ATC	2	6	849113	849118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21250	NC_021192	CAC	2	6	849238	849243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21251	NC_021192	ACG	2	6	849287	849292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21252	NC_021192	TCG	2	6	849293	849298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21253	NC_021192	TGA	2	6	849333	849338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21254	NC_021192	C	9	9	849382	849390	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21255	NC_021192	TCA	2	6	849416	849421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21256	NC_021192	CGC	2	6	849488	849493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21257	NC_021192	GCC	2	6	849510	849515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21258	NC_021192	TG	4	8	849614	849621	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21259	NC_021192	GAA	2	6	849624	849629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21260	NC_021192	CCT	2	6	849641	849646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21261	NC_021192	GAC	2	6	849705	849710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21262	NC_021192	GTC	2	6	849711	849716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21263	NC_021192	GCCA	2	8	849727	849734	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21264	NC_021192	ACG	2	6	849767	849772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691380
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21266	NC_021192	CGC	2	6	849855	849860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691380
21267	NC_021192	CGT	2	6	849894	849899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691380
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21313	NC_021192	GCCG	2	8	851990	851997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21314	NC_021192	GCT	2	6	852047	852052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21316	NC_021192	GAT	2	6	852195	852200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21317	NC_021192	GCGCA	2	10	852257	852266	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21318	NC_021192	TCG	2	6	852300	852305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691383
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21323	NC_021192	ATG	2	6	852536	852541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21325	NC_021192	TCG	2	6	852575	852580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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21350	NC_021192	CGA	2	6	853556	853561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691386
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21362	NC_021192	GC	3	6	854096	854101	0 %	0 %	50 %	50 %	494691386
21363	NC_021192	CAGA	2	8	854142	854149	50 %	0 %	25 %	25 %	494691386
21364	NC_021192	GTC	2	6	854208	854213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691386
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21366	NC_021192	GTC	2	6	854232	854237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691386
21367	NC_021192	AGC	3	9	854257	854265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691386
21368	NC_021192	GTG	2	6	854287	854292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21369	NC_021192	CTGG	2	8	854334	854341	0 %	25 %	50 %	25 %	494691387
21370	NC_021192	TCC	2	6	854362	854367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	494691387
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21495	NC_021192	GT	3	6	859935	859940	0 %	50 %	50 %	0 %	494691392
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