MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 108642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_021192	GC	3	6	723692	723697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18002	NC_021192	GCCG	2	8	723709	723716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18003	NC_021192	GTC	2	6	723741	723746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18004	NC_021192	CAC	2	6	723780	723785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18005	NC_021192	TCG	2	6	723789	723794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18006	NC_021192	CAG	2	6	723815	723820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18007	NC_021192	GTC	3	9	723851	723859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18008	NC_021192	CGGCC	2	10	723933	723942	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18009	NC_021192	CAGC	2	8	723974	723981	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18010	NC_021192	CGC	2	6	723988	723993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18011	NC_021192	CAG	2	6	724043	724048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18012	NC_021192	CGGC	2	8	724123	724130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18013	NC_021192	CATG	2	8	724137	724144	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18014	NC_021192	CTT	2	6	724205	724210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18015	NC_021192	TCA	2	6	724253	724258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18016	NC_021192	GCC	2	6	724294	724299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18017	NC_021192	AC	3	6	724309	724314	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18018	NC_021192	GGA	2	6	724323	724328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18019	NC_021192	CACC	2	8	724369	724376	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
18020	NC_021192	GCT	2	6	724395	724400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18021	NC_021192	GTTG	2	8	724474	724481	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18022	NC_021192	ACC	3	9	724521	724529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18023	NC_021192	TCG	2	6	724543	724548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18024	NC_021192	CGG	2	6	724556	724561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18025	NC_021192	GAA	2	6	724578	724583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18026	NC_021192	CTG	2	6	724605	724610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18027	NC_021192	CGC	2	6	724650	724655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18028	NC_021192	TGT	2	6	724697	724702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18029	NC_021192	GCC	2	6	724711	724716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18030	NC_021192	GAT	2	6	724721	724726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18031	NC_021192	CGC	2	6	724727	724732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18032	NC_021192	ACA	2	6	724736	724741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18033	NC_021192	ATGGCG	2	12	724753	724764	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18034	NC_021192	CAC	2	6	724782	724787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18035	NC_021192	GCC	2	6	724827	724832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18036	NC_021192	CAT	2	6	724937	724942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18037	NC_021192	TTG	2	6	724977	724982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18038	NC_021192	CGT	2	6	725012	725017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18039	NC_021192	TGA	2	6	725024	725029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18040	NC_021192	ATCAG	2	10	725085	725094	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18041	NC_021192	GCTG	2	8	725165	725172	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18042	NC_021192	GC	3	6	725200	725205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18043	NC_021192	CGCGG	2	10	725226	725235	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
18044	NC_021192	GTGG	2	8	725355	725362	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
18045	NC_021192	TCA	2	6	725363	725368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18046	NC_021192	GC	3	6	725376	725381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18047	NC_021192	GGC	2	6	725386	725391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18048	NC_021192	CAC	2	6	725409	725414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18049	NC_021192	CGC	2	6	725440	725445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18050	NC_021192	GCT	2	6	725463	725468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18051	NC_021192	GTCGT	2	10	725472	725481	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18052	NC_021192	CCCG	2	8	725518	725525	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18053	NC_021192	GGC	2	6	725636	725641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18054	NC_021192	TGG	2	6	725663	725668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18055	NC_021192	CGT	2	6	725689	725694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18056	NC_021192	GGC	2	6	725696	725701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18057	NC_021192	CGA	2	6	725805	725810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18058	NC_021192	CAC	2	6	725834	725839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18059	NC_021192	GCC	2	6	725865	725870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18060	NC_021192	GCT	2	6	725924	725929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18061	NC_021192	ACCC	2	8	725934	725941	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
18062	NC_021192	CCA	2	6	725950	725955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18063	NC_021192	GCTG	2	8	726028	726035	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18064	NC_021192	TCG	2	6	726275	726280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18065	NC_021192	CCG	2	6	726287	726292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18066	NC_021192	GCCG	2	8	726345	726352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18067	NC_021192	ACTG	2	8	726366	726373	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18068	NC_021192	GT	3	6	726390	726395	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18069	NC_021192	GCA	2	6	726396	726401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18070	NC_021192	TCGATG	2	12	726404	726415	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18071	NC_021192	CAG	2	6	726538	726543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18072	NC_021192	CAT	2	6	726571	726576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18073	NC_021192	GCC	2	6	726580	726585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18074	NC_021192	GAT	2	6	726597	726602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18075	NC_021192	TCG	2	6	726635	726640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18076	NC_021192	ACC	2	6	726686	726691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18077	NC_021192	CGC	2	6	726843	726848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18078	NC_021192	TGA	2	6	726963	726968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18079	NC_021192	CGG	2	6	726991	726996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18080	NC_021192	GC	3	6	727012	727017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18081	NC_021192	ACG	2	6	727091	727096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18082	NC_021192	CGG	2	6	727126	727131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18083	NC_021192	GAC	2	6	727165	727170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18084	NC_021192	GGT	2	6	727198	727203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18085	NC_021192	TGG	2	6	727205	727210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18086	NC_021192	GC	3	6	727215	727220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18087	NC_021192	CGG	2	6	727352	727357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18088	NC_021192	GGCG	2	8	727372	727379	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18089	NC_021192	ACA	2	6	727460	727465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18090	NC_021192	AG	3	6	727483	727488	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18091	NC_021192	CCG	2	6	727577	727582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18092	NC_021192	GAA	2	6	727607	727612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18093	NC_021192	CCG	2	6	727662	727667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18094	NC_021192	GACT	2	8	727687	727694	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18095	NC_021192	AGGT	2	8	727695	727702	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18096	NC_021192	CGCCGT	2	12	727795	727806	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18097	NC_021192	ACG	3	9	727812	727820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18098	NC_021192	GAG	2	6	727832	727837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18099	NC_021192	GCC	2	6	727844	727849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18100	NC_021192	TG	3	6	727892	727897	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18101	NC_021192	GGC	2	6	727915	727920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18102	NC_021192	TTC	2	6	727922	727927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18103	NC_021192	GGCG	2	8	728005	728012	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18104	NC_021192	ATC	2	6	728069	728074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18105	NC_021192	GAC	2	6	728301	728306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18106	NC_021192	GTC	2	6	728319	728324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18107	NC_021192	CGG	2	6	728369	728374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18108	NC_021192	GGT	2	6	728440	728445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18109	NC_021192	CTA	2	6	728544	728549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18110	NC_021192	CGG	2	6	728551	728556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18111	NC_021192	AAG	2	6	728558	728563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18112	NC_021192	CGGG	2	8	728569	728576	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18113	NC_021192	GAT	2	6	728632	728637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18114	NC_021192	ACT	2	6	728652	728657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18115	NC_021192	ACC	2	6	728709	728714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18116	NC_021192	GCC	2	6	728738	728743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18117	NC_021192	ACG	2	6	728754	728759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18118	NC_021192	CTT	2	6	728815	728820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18119	NC_021192	TCG	2	6	728964	728969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18120	NC_021192	ACG	3	9	728991	728999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18121	NC_021192	CAG	2	6	729038	729043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18122	NC_021192	TCA	2	6	729090	729095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18123	NC_021192	GC	3	6	729164	729169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18124	NC_021192	GTC	2	6	729195	729200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691271
18125	NC_021192	GC	3	6	729233	729238	0 %	0 %	50 %	50 %	494691271
18126	NC_021192	CTGGT	2	10	729277	729286	0 %	40 %	40 %	20 %	494691271
18127	NC_021192	TGCC	2	8	729289	729296	0 %	25 %	25 %	50 %	494691271
18128	NC_021192	AGC	2	6	729327	729332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691271
18129	NC_021192	CTG	2	6	729375	729380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691271
18130	NC_021192	CGA	3	9	729393	729401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691271
18131	NC_021192	TGG	2	6	729446	729451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691271
18132	NC_021192	CCA	2	6	729467	729472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691271
18133	NC_021192	CGA	2	6	729522	729527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691271
18134	NC_021192	CGA	2	6	729540	729545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691271
18135	NC_021192	GGT	2	6	729617	729622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691271
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18137	NC_021192	GACGTC	2	12	729681	729692	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	494691271
18138	NC_021192	ACC	2	6	729747	729752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691271
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18141	NC_021192	CAAA	2	8	729887	729894	75 %	0 %	0 %	25 %	494691271
18142	NC_021192	GGT	2	6	729911	729916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691271
18143	NC_021192	TGG	2	6	729937	729942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691271
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18145	NC_021192	GCC	2	6	730135	730140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18146	NC_021192	GCA	2	6	730160	730165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18148	NC_021192	TGC	2	6	730343	730348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691272
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18150	NC_021192	CGA	2	6	730464	730469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691272
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18154	NC_021192	GGCG	2	8	730550	730557	0 %	0 %	75 %	25 %	494691272
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18159	NC_021192	AAGG	2	8	730782	730789	50 %	0 %	50 %	0 %	494691272
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18167	NC_021192	GCT	3	9	731031	731039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18169	NC_021192	AAG	2	6	731134	731139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18174	NC_021192	TCG	2	6	731389	731394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18179	NC_021192	CG	3	6	731687	731692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18180	NC_021192	CCG	2	6	731726	731731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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18185	NC_021192	CGGCG	2	10	731856	731865	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
18186	NC_021192	CGA	2	6	731868	731873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18243	NC_021192	CG	3	6	734579	734584	0 %	0 %	50 %	50 %	494691278
18244	NC_021192	TCG	2	6	734596	734601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691278
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18249	NC_021192	AGC	2	6	734713	734718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691278
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18252	NC_021192	GTC	2	6	734856	734861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691278
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18284	NC_021192	CGG	2	6	736412	736417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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