MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 108642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_021192	AGG	2	6	650072	650077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	494691200
16003	NC_021192	TGA	2	6	650086	650091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691200
16004	NC_021192	CTG	2	6	650127	650132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691200
16005	NC_021192	GTT	2	6	650171	650176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494691200
16006	NC_021192	GGC	2	6	650198	650203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691200
16007	NC_021192	ACGTCT	2	12	650224	650235	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	494691200
16008	NC_021192	ATGC	2	8	650268	650275	25 %	25 %	25 %	25 %	494691200
16009	NC_021192	GCG	2	6	650327	650332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691200
16010	NC_021192	C	7	7	650333	650339	0 %	0 %	0 %	100 %	494691200
16011	NC_021192	CCG	2	6	650370	650375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691200
16012	NC_021192	GT	3	6	650420	650425	0 %	50 %	50 %	0 %	494691200
16013	NC_021192	CGTGC	2	10	650468	650477	0 %	20 %	40 %	40 %	494691200
16014	NC_021192	TG	3	6	650525	650530	0 %	50 %	50 %	0 %	494691200
16015	NC_021192	CGG	2	6	650590	650595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691200
16016	NC_021192	GCT	2	6	650638	650643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691200
16017	NC_021192	CGA	2	6	650704	650709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691200
16018	NC_021192	TGGCGT	2	12	650738	650749	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	494691200
16019	NC_021192	CGG	2	6	650769	650774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691200
16020	NC_021192	GGC	2	6	650781	650786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691200
16021	NC_021192	GCC	2	6	650793	650798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691200
16022	NC_021192	GCCA	2	8	650812	650819	25 %	0 %	25 %	50 %	494691200
16023	NC_021192	TGA	2	6	650828	650833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691200
16024	NC_021192	CGGG	2	8	650848	650855	0 %	0 %	75 %	25 %	494691200
16025	NC_021192	CGGAT	2	10	650860	650869	20 %	20 %	40 %	20 %	494691200
16026	NC_021192	CACC	2	8	650884	650891	25 %	0 %	0 %	75 %	494691200
16027	NC_021192	GC	3	6	650926	650931	0 %	0 %	50 %	50 %	494691200
16028	NC_021192	TGA	2	6	650964	650969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691200
16029	NC_021192	GAG	2	6	650986	650991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	494691200
16030	NC_021192	TGGC	2	8	651008	651015	0 %	25 %	50 %	25 %	494691200
16031	NC_021192	GCG	2	6	651026	651031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691200
16032	NC_021192	TGA	2	6	651204	651209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16033	NC_021192	CAC	2	6	651268	651273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16034	NC_021192	CGATG	2	10	651310	651319	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16035	NC_021192	TCG	2	6	651323	651328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16036	NC_021192	GTT	2	6	651347	651352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16037	NC_021192	CCCA	2	8	651440	651447	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
16038	NC_021192	GC	3	6	651478	651483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16039	NC_021192	CCG	2	6	651575	651580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16040	NC_021192	CGA	2	6	651590	651595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16041	NC_021192	CGT	2	6	651596	651601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16042	NC_021192	CCG	2	6	651679	651684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16043	NC_021192	TGCC	2	8	651738	651745	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16044	NC_021192	CCT	2	6	651762	651767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16045	NC_021192	GAT	2	6	651769	651774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16046	NC_021192	GAC	3	9	651902	651910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691201
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16052	NC_021192	GGT	2	6	652075	652080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691201
16053	NC_021192	CCG	3	9	652091	652099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691201
16054	NC_021192	TTG	2	6	652124	652129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494691201
16055	NC_021192	CGA	2	6	652179	652184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691201
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16061	NC_021192	AGT	2	6	652431	652436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691202
16062	NC_021192	GC	3	6	652464	652469	0 %	0 %	50 %	50 %	494691202
16063	NC_021192	CA	3	6	652496	652501	50 %	0 %	0 %	50 %	494691202
16064	NC_021192	ACC	2	6	652710	652715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691202
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16070	NC_021192	CGGT	2	8	653055	653062	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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16072	NC_021192	TCT	2	6	653113	653118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16073	NC_021192	CGC	2	6	653167	653172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16074	NC_021192	GAA	2	6	653234	653239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16075	NC_021192	CGAT	2	8	653355	653362	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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16086	NC_021192	CTT	2	6	653814	653819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16087	NC_021192	TCG	2	6	653836	653841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16102	NC_021192	CGGT	2	8	654449	654456	0 %	25 %	50 %	25 %	494691204
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16122	NC_021192	CGA	2	6	655334	655339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16123	NC_021192	CG	3	6	655340	655345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16124	NC_021192	TGA	2	6	655366	655371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16125	NC_021192	ACT	2	6	655411	655416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691205
16126	NC_021192	CCG	3	9	655417	655425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691205
16127	NC_021192	GTG	2	6	655436	655441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691205
16128	NC_021192	CGTT	2	8	655458	655465	0 %	50 %	25 %	25 %	494691205
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16151	NC_021192	CCGATC	2	12	656284	656295	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16152	NC_021192	CGCA	2	8	656300	656307	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16153	NC_021192	GCC	2	6	656334	656339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16154	NC_021192	GACG	3	12	656346	656357	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16155	NC_021192	ACC	2	6	656415	656420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16156	NC_021192	CGGC	2	8	656506	656513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16157	NC_021192	CGA	2	6	656525	656530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16158	NC_021192	GGT	2	6	656573	656578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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16161	NC_021192	TGG	2	6	656647	656652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16162	NC_021192	GC	3	6	656680	656685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16163	NC_021192	ATCCGG	2	12	656692	656703	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16165	NC_021192	CGG	3	9	656765	656773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16166	NC_021192	CCG	2	6	656777	656782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16172	NC_021192	CCG	2	6	657123	657128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16181	NC_021192	CGA	2	6	657370	657375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16186	NC_021192	CG	3	6	657524	657529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16231	NC_021192	ACC	2	6	659807	659812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16232	NC_021192	CCAC	2	8	659822	659829	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
16233	NC_021192	CAG	2	6	659833	659838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691207
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16237	NC_021192	CG	3	6	659917	659922	0 %	0 %	50 %	50 %	494691207
16238	NC_021192	CGG	2	6	659926	659931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691207
16239	NC_021192	CCAA	2	8	660010	660017	50 %	0 %	0 %	50 %	494691207
16240	NC_021192	CGT	2	6	660025	660030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691207
16241	NC_021192	AGC	2	6	660044	660049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691207
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16243	NC_021192	CCT	2	6	660268	660273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	494691207
16244	NC_021192	GCG	2	6	660294	660299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691207
16245	NC_021192	ATCG	2	8	660302	660309	25 %	25 %	25 %	25 %	494691207
16246	NC_021192	CCA	2	6	660352	660357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691207
16247	NC_021192	TCG	3	9	660360	660368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691207
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16249	NC_021192	AC	3	6	660430	660435	50 %	0 %	0 %	50 %	494691207
16250	NC_021192	GTC	2	6	660472	660477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691207
16251	NC_021192	CAC	2	6	660499	660504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691207
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16253	NC_021192	CGA	2	6	660576	660581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691207
16254	NC_021192	CGG	2	6	660623	660628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691207
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16262	NC_021192	GAC	3	9	660880	660888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16303	NC_021192	TTGACG	2	12	662651	662662	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	494691209
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16309	NC_021192	CG	3	6	662897	662902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16310	NC_021192	CCA	2	6	662910	662915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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16313	NC_021192	GCG	3	9	662930	662938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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16315	NC_021192	CG	3	6	662945	662950	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16318	NC_021192	TTCC	2	8	663069	663076	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16319	NC_021192	GC	3	6	663078	663083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16320	NC_021192	GCCA	2	8	663115	663122	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16321	NC_021192	TCG	2	6	663133	663138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16322	NC_021192	TCG	2	6	663179	663184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16342	NC_021192	GCG	2	6	664046	664051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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16371	NC_021192	TGG	2	6	665488	665493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691210
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16373	NC_021192	TCG	2	6	665533	665538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691210
16374	NC_021192	CGG	2	6	665548	665553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691210
16375	NC_021192	CGC	2	6	665560	665565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691210
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16392	NC_021192	GGT	2	6	666465	666470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16393	NC_021192	GGA	2	6	666485	666490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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16400	NC_021192	GTC	2	6	666642	666647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691211
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16410	NC_021192	GTAC	2	8	667104	667111	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16411	NC_021192	CG	3	6	667160	667165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16412	NC_021192	CGG	3	9	667167	667175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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16421	NC_021192	GCC	2	6	667488	667493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16424	NC_021192	GGT	2	6	667545	667550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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