MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 108642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_021192	AACG	2	8	575316	575323	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14002	NC_021192	GC	3	6	575332	575337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14003	NC_021192	GGC	2	6	575398	575403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14004	NC_021192	CGC	4	12	575416	575427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14005	NC_021192	CAGT	2	8	575440	575447	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14006	NC_021192	CGG	2	6	575482	575487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14007	NC_021192	GC	4	8	575608	575615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14008	NC_021192	GAC	2	6	575642	575647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14009	NC_021192	TCG	2	6	575652	575657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14010	NC_021192	GGT	2	6	575725	575730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_021192	GCC	2	6	575751	575756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14012	NC_021192	GCC	2	6	575760	575765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14013	NC_021192	GGCC	2	8	575771	575778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14014	NC_021192	CGG	2	6	575811	575816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14015	NC_021192	CGG	2	6	575820	575825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14016	NC_021192	GT	3	6	575892	575897	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14017	NC_021192	GGT	2	6	576022	576027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14018	NC_021192	GTC	2	6	576055	576060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14019	NC_021192	GGT	2	6	576153	576158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14020	NC_021192	AACG	2	8	576187	576194	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14021	NC_021192	GAT	2	6	576232	576237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14022	NC_021192	GCC	2	6	576250	576255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14023	NC_021192	GTG	2	6	576269	576274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14024	NC_021192	CGC	2	6	576296	576301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14025	NC_021192	CCG	2	6	576372	576377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14026	NC_021192	GTG	2	6	576385	576390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14027	NC_021192	GGC	2	6	576426	576431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14028	NC_021192	GTCA	2	8	576454	576461	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14029	NC_021192	GCT	2	6	576507	576512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14030	NC_021192	CGA	2	6	576522	576527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14031	NC_021192	CGG	2	6	576541	576546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14032	NC_021192	CGACGT	2	12	576651	576662	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	494691127
14033	NC_021192	GGC	2	6	576702	576707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691127
14034	NC_021192	CTG	2	6	576775	576780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691127
14035	NC_021192	CGC	2	6	576824	576829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691127
14036	NC_021192	GCCGTC	2	12	576851	576862	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	494691127
14037	NC_021192	ACCG	2	8	576889	576896	25 %	0 %	25 %	50 %	494691127
14038	NC_021192	GCATCG	2	12	576899	576910	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	494691127
14039	NC_021192	AGGA	2	8	576922	576929	50 %	0 %	50 %	0 %	494691127
14040	NC_021192	TTC	2	6	576943	576948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494691127
14041	NC_021192	G	6	6	576950	576955	0 %	0 %	100 %	0 %	494691127
14042	NC_021192	GC	3	6	576961	576966	0 %	0 %	50 %	50 %	494691127
14043	NC_021192	ACG	2	6	577028	577033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691127
14044	NC_021192	ACG	3	9	577112	577120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691127
14045	NC_021192	CGA	3	9	577202	577210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691127
14046	NC_021192	CAC	2	6	577237	577242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691127
14047	NC_021192	TGA	2	6	577266	577271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691127
14048	NC_021192	CGA	3	9	577279	577287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691127
14049	NC_021192	CAC	2	6	577314	577319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691127
14050	NC_021192	TGA	2	6	577343	577348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691127
14051	NC_021192	CGA	3	9	577356	577364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691127
14052	NC_021192	CAC	2	6	577392	577397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691127
14053	NC_021192	GAG	3	9	577407	577415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	494691127
14054	NC_021192	TGA	2	6	577422	577427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691127
14055	NC_021192	GT	3	6	577431	577436	0 %	50 %	50 %	0 %	494691127
14056	NC_021192	GGA	2	6	577444	577449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	494691127
14057	NC_021192	GAG	2	6	577451	577456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	494691127
14058	NC_021192	CTG	2	6	577481	577486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691127
14059	NC_021192	AGG	2	6	577491	577496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	494691127
14060	NC_021192	GGT	2	6	577510	577515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691127
14061	NC_021192	TGC	2	6	577584	577589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691127
14062	NC_021192	GC	3	6	577624	577629	0 %	0 %	50 %	50 %	494691127
14063	NC_021192	GGT	2	6	577684	577689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691127
14064	NC_021192	GAC	2	6	577709	577714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691127
14065	NC_021192	CGCA	2	8	577750	577757	25 %	0 %	25 %	50 %	494691127
14066	NC_021192	CG	3	6	577760	577765	0 %	0 %	50 %	50 %	494691127
14067	NC_021192	TGC	2	6	577767	577772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691127
14068	NC_021192	GGC	2	6	577778	577783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691127
14069	NC_021192	GAC	3	9	577784	577792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691127
14070	NC_021192	GTC	2	6	577853	577858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691127
14071	NC_021192	CTG	2	6	577904	577909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691127
14072	NC_021192	GCGG	2	8	577929	577936	0 %	0 %	75 %	25 %	494691127
14073	NC_021192	GGGCT	2	10	578081	578090	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
14074	NC_021192	ATG	2	6	578162	578167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14075	NC_021192	CGC	2	6	578235	578240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14076	NC_021192	CGTCG	2	10	578251	578260	0 %	20 %	40 %	40 %	494691128
14077	NC_021192	GCT	2	6	578271	578276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691128
14078	NC_021192	CGG	2	6	578286	578291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691128
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14080	NC_021192	GCA	2	6	578349	578354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691128
14081	NC_021192	CGG	2	6	578424	578429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691128
14082	NC_021192	AGC	2	6	578435	578440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691128
14083	NC_021192	CAC	2	6	578503	578508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691128
14084	NC_021192	CGC	2	6	578514	578519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691128
14085	NC_021192	ACCG	2	8	578522	578529	25 %	0 %	25 %	50 %	494691128
14086	NC_021192	CCA	2	6	578553	578558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691128
14087	NC_021192	GCG	2	6	578580	578585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691128
14088	NC_021192	AGC	2	6	578603	578608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691128
14089	NC_021192	CGG	2	6	578647	578652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14090	NC_021192	CCG	2	6	578703	578708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14091	NC_021192	GCA	2	6	578715	578720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14092	NC_021192	CGT	3	9	578739	578747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14093	NC_021192	CCA	2	6	578810	578815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14094	NC_021192	CGG	2	6	578856	578861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691129
14095	NC_021192	CGA	3	9	578862	578870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691129
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14098	NC_021192	GCCC	2	8	578930	578937	0 %	0 %	25 %	75 %	494691129
14099	NC_021192	GAT	2	6	578974	578979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691129
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14101	NC_021192	GCC	2	6	579104	579109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691129
14102	NC_021192	CCAGC	2	10	579112	579121	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
14103	NC_021192	GGC	2	6	579127	579132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14104	NC_021192	GCA	2	6	579135	579140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14105	NC_021192	GAC	2	6	579212	579217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14106	NC_021192	GC	3	6	579228	579233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14107	NC_021192	GAC	2	6	579304	579309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691130
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14112	NC_021192	GGGT	2	8	579413	579420	0 %	25 %	75 %	0 %	494691130
14113	NC_021192	CTC	2	6	579430	579435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	494691130
14114	NC_021192	GGCC	2	8	579477	579484	0 %	0 %	50 %	50 %	494691130
14115	NC_021192	GC	3	6	579496	579501	0 %	0 %	50 %	50 %	494691130
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14119	NC_021192	GC	3	6	579601	579606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14120	NC_021192	GCG	2	6	579722	579727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691131
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14123	NC_021192	GCC	3	9	579800	579808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691131
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14226	NC_021192	CGG	2	6	584070	584075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14227	NC_021192	GAC	2	6	584139	584144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14230	NC_021192	CGG	2	6	584233	584238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14231	NC_021192	C	7	7	584317	584323	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14232	NC_021192	GCC	2	6	584408	584413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14233	NC_021192	GCG	2	6	584539	584544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14235	NC_021192	GCG	3	9	584559	584567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14236	NC_021192	GGCGC	2	10	584651	584660	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14237	NC_021192	TGC	2	6	584669	584674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691135
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14239	NC_021192	TTG	2	6	584883	584888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494691135
14240	NC_021192	GCC	2	6	584900	584905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691135
14241	NC_021192	CA	4	8	584908	584915	50 %	0 %	0 %	50 %	494691135
14242	NC_021192	ACG	2	6	585007	585012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691136
14243	NC_021192	GTCA	2	8	585039	585046	25 %	25 %	25 %	25 %	494691136
14244	NC_021192	CGC	2	6	585075	585080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691136
14245	NC_021192	GCC	2	6	585180	585185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691136
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14248	NC_021192	GTC	2	6	585207	585212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691136
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14272	NC_021192	TGT	2	6	586303	586308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14279	NC_021192	CGG	3	9	586689	586697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14340	NC_021192	AGCGC	2	10	589278	589287	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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14353	NC_021192	GTG	2	6	589730	589735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14355	NC_021192	GCG	2	6	589759	589764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14356	NC_021192	TGG	3	9	589766	589774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14357	NC_021192	GT	3	6	589787	589792	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14358	NC_021192	TGT	2	6	589811	589816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14359	NC_021192	ACG	2	6	589829	589834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14363	NC_021192	ACG	2	6	589939	589944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14364	NC_021192	TTGC	2	8	589957	589964	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14365	NC_021192	CGG	2	6	590055	590060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14366	NC_021192	ATC	2	6	590109	590114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14367	NC_021192	GCT	2	6	590153	590158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14368	NC_021192	GTT	2	6	590196	590201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14369	NC_021192	CCG	2	6	590276	590281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14370	NC_021192	CCGACG	2	12	590294	590305	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14371	NC_021192	CAG	2	6	590353	590358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14372	NC_021192	GCCG	2	8	590377	590384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14373	NC_021192	AGC	2	6	590466	590471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14492	NC_021192	TTC	2	6	595415	595420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14493	NC_021192	CTG	2	6	595474	595479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14494	NC_021192	GGATAT	2	12	595552	595563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14495	NC_021192	GC	4	8	595588	595595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14496	NC_021192	GCC	2	6	595600	595605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14497	NC_021192	GAT	2	6	595606	595611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14498	NC_021192	GAC	2	6	595621	595626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14499	NC_021192	ATG	2	6	595637	595642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14500	NC_021192	TGGCA	2	10	595649	595658	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding

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