MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 108642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_021192	ACT	2	6	555332	555337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691106
13502	NC_021192	CGC	2	6	555411	555416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691106
13503	NC_021192	GAA	2	6	555418	555423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	494691106
13504	NC_021192	CCA	2	6	555485	555490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691106
13505	NC_021192	TCG	2	6	555505	555510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691106
13506	NC_021192	ACC	2	6	555511	555516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691106
13507	NC_021192	GCG	2	6	555586	555591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691107
13508	NC_021192	GCGTCT	2	12	555600	555611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691107
13509	NC_021192	GAG	2	6	555624	555629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	494691107
13510	NC_021192	GCGAT	2	10	555639	555648	20 %	20 %	40 %	20 %	494691107
13511	NC_021192	GCCG	2	8	555738	555745	0 %	0 %	50 %	50 %	494691107
13512	NC_021192	CGAGCG	2	12	555819	555830	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	494691107
13513	NC_021192	CAC	2	6	555858	555863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691107
13514	NC_021192	GTC	2	6	555958	555963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691107
13515	NC_021192	TCC	2	6	555993	555998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	494691107
13516	NC_021192	CGC	2	6	556018	556023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691107
13517	NC_021192	CCA	2	6	556025	556030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691107
13518	NC_021192	TTC	2	6	556059	556064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494691107
13519	NC_021192	TGC	2	6	556078	556083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691107
13520	NC_021192	CGA	2	6	556115	556120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13521	NC_021192	GCC	3	9	556122	556130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13522	NC_021192	GC	3	6	556131	556136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13523	NC_021192	GGA	2	6	556139	556144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13524	NC_021192	GTT	2	6	556292	556297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13525	NC_021192	GAA	2	6	556385	556390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13526	NC_021192	TGC	2	6	556425	556430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13528	NC_021192	GTA	2	6	556580	556585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13529	NC_021192	CGGC	2	8	556612	556619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13530	NC_021192	ACG	2	6	556662	556667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13531	NC_021192	CGA	2	6	556672	556677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13533	NC_021192	GCT	2	6	556816	556821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13534	NC_021192	G	9	9	556839	556847	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13535	NC_021192	GA	3	6	556875	556880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13536	NC_021192	TGC	3	9	557104	557112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13538	NC_021192	GGC	2	6	557261	557266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13539	NC_021192	TGC	2	6	557293	557298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13540	NC_021192	AGC	2	6	557299	557304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13542	NC_021192	GAG	2	6	557379	557384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13543	NC_021192	ACA	2	6	557389	557394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13544	NC_021192	CTT	2	6	557426	557431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13545	NC_021192	CGC	2	6	557482	557487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13546	NC_021192	CCGG	2	8	557541	557548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13547	NC_021192	GC	3	6	557557	557562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13554	NC_021192	GAA	2	6	557982	557987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	494691108
13555	NC_021192	TGG	2	6	557989	557994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691108
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13558	NC_021192	CGT	2	6	558173	558178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691108
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13560	NC_021192	CAGCCG	2	12	558211	558222	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	494691108
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13564	NC_021192	GTC	2	6	558372	558377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691108
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13568	NC_021192	GC	3	6	558592	558597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13569	NC_021192	CAG	2	6	558627	558632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13571	NC_021192	GCC	2	6	558716	558721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13572	NC_021192	CAGC	2	8	558795	558802	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13573	NC_021192	GTAG	2	8	558822	558829	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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13589	NC_021192	TGG	2	6	559369	559374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13592	NC_021192	CCG	2	6	559503	559508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13595	NC_021192	CGC	2	6	559618	559623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13596	NC_021192	CCG	2	6	559653	559658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13597	NC_021192	CTT	2	6	559672	559677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13598	NC_021192	GCG	3	9	559681	559689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13599	NC_021192	TTTGCT	2	12	559741	559752	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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13603	NC_021192	CAGCG	2	10	559864	559873	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13604	NC_021192	GGT	2	6	559891	559896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13605	NC_021192	CAT	2	6	559909	559914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13606	NC_021192	CGG	2	6	559917	559922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13607	NC_021192	CGA	2	6	559941	559946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13608	NC_021192	CCA	2	6	560046	560051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13609	NC_021192	GCG	2	6	560059	560064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13610	NC_021192	TCACGG	2	12	560107	560118	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	494691109
13611	NC_021192	TAC	2	6	560171	560176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691109
13612	NC_021192	CTG	2	6	560192	560197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691109
13613	NC_021192	CG	5	10	560208	560217	0 %	0 %	50 %	50 %	494691109
13614	NC_021192	GTC	2	6	560234	560239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691109
13615	NC_021192	GAT	2	6	560265	560270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691109
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13621	NC_021192	GCC	2	6	560406	560411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691109
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13623	NC_021192	GTG	2	6	560439	560444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691109
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13625	NC_021192	ATC	2	6	560640	560645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691109
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13874	NC_021192	ACC	2	6	570989	570994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691121
13875	NC_021192	GACCCC	2	12	571042	571053	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	494691121
13876	NC_021192	GGCGCC	2	12	571118	571129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13877	NC_021192	TGG	2	6	571155	571160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13878	NC_021192	GCG	2	6	571314	571319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691122
13879	NC_021192	TCG	2	6	571333	571338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691122
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13882	NC_021192	CGA	2	6	571494	571499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691122
13883	NC_021192	GCT	2	6	571510	571515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691122
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13886	NC_021192	TGC	2	6	571592	571597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691122
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13889	NC_021192	CGA	2	6	571698	571703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691122
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13892	NC_021192	G	8	8	571777	571784	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13893	NC_021192	CGC	2	6	571785	571790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13894	NC_021192	AGG	2	6	571827	571832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	494691123
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13897	NC_021192	GC	3	6	571899	571904	0 %	0 %	50 %	50 %	494691123
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13899	NC_021192	GTCCG	2	10	572044	572053	0 %	20 %	40 %	40 %	494691123
13900	NC_021192	CG	3	6	572074	572079	0 %	0 %	50 %	50 %	494691123
13901	NC_021192	GCA	2	6	572112	572117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691123
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13910	NC_021192	GCC	2	6	572385	572390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691123
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13933	NC_021192	CGA	2	6	572934	572939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13944	NC_021192	GCACG	2	10	573250	573259	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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13975	NC_021192	GGC	2	6	574484	574489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691126
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13985	NC_021192	CGT	2	6	574835	574840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691126
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13993	NC_021192	GA	3	6	575037	575042	50 %	0 %	50 %	0 %	494691126
13994	NC_021192	TGC	2	6	575077	575082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13995	NC_021192	GCG	2	6	575176	575181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13996	NC_021192	TGC	2	6	575230	575235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13997	NC_021192	GC	3	6	575237	575242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13998	NC_021192	CAC	2	6	575246	575251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13999	NC_021192	GCG	2	6	575297	575302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14000	NC_021192	GGC	2	6	575308	575313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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