MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 108642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021192	CG	3	6	534538	534543	0 %	0 %	50 %	50 %	494691094
13002	NC_021192	TCG	2	6	534560	534565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691094
13003	NC_021192	CAG	2	6	534571	534576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691094
13004	NC_021192	CGA	2	6	534597	534602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691094
13005	NC_021192	CGC	2	6	534617	534622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691094
13006	NC_021192	CCA	2	6	534642	534647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691094
13007	NC_021192	AGCTG	2	10	534707	534716	20 %	20 %	40 %	20 %	494691094
13008	NC_021192	GC	3	6	534839	534844	0 %	0 %	50 %	50 %	494691094
13009	NC_021192	CGC	2	6	534847	534852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691094
13010	NC_021192	CGG	2	6	534862	534867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691094
13011	NC_021192	TGA	2	6	534880	534885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691094
13012	NC_021192	CGA	2	6	534892	534897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13013	NC_021192	GTG	2	6	534911	534916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_021192	GCG	2	6	534978	534983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13015	NC_021192	CGCGG	2	10	534987	534996	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13016	NC_021192	CG	3	6	535067	535072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13017	NC_021192	GTC	2	6	535104	535109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13018	NC_021192	GC	3	6	535111	535116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13019	NC_021192	CGACAT	2	12	535119	535130	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13020	NC_021192	CGA	2	6	535226	535231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13021	NC_021192	GCC	2	6	535248	535253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13022	NC_021192	GCCG	2	8	535292	535299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13023	NC_021192	GGC	2	6	535344	535349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13024	NC_021192	ACA	2	6	535375	535380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13025	NC_021192	TCG	2	6	535389	535394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13026	NC_021192	TGC	2	6	535402	535407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13027	NC_021192	CGGC	2	8	535424	535431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13028	NC_021192	GACG	2	8	535434	535441	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13029	NC_021192	GCT	2	6	535463	535468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13030	NC_021192	GGCC	2	8	535479	535486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13031	NC_021192	CGG	2	6	535508	535513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13032	NC_021192	CGGG	2	8	535518	535525	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13033	NC_021192	CCA	2	6	535547	535552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13034	NC_021192	AGT	2	6	535566	535571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_021192	GCG	2	6	535572	535577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13036	NC_021192	ATGG	2	8	535578	535585	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_021192	TGG	2	6	535636	535641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691095
13038	NC_021192	GCC	2	6	535736	535741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691095
13039	NC_021192	GAT	2	6	535751	535756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691095
13040	NC_021192	TGC	2	6	535890	535895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691095
13041	NC_021192	AGC	2	6	535899	535904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691095
13042	NC_021192	CGG	3	9	535957	535965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691095
13043	NC_021192	TGA	2	6	535981	535986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691095
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13045	NC_021192	AAG	2	6	536033	536038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	494691095
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13048	NC_021192	C	6	6	536190	536195	0 %	0 %	0 %	100 %	494691095
13049	NC_021192	GAT	2	6	536203	536208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691095
13050	NC_021192	GTCC	2	8	536223	536230	0 %	25 %	25 %	50 %	494691095
13051	NC_021192	GC	3	6	536252	536257	0 %	0 %	50 %	50 %	494691095
13052	NC_021192	GTC	2	6	536302	536307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691095
13053	NC_021192	GGC	2	6	536314	536319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691095
13054	NC_021192	GC	3	6	536442	536447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13055	NC_021192	ATC	2	6	536636	536641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13056	NC_021192	TTC	2	6	536666	536671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13057	NC_021192	GTA	2	6	536715	536720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_021192	TCG	2	6	536767	536772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13059	NC_021192	TCG	2	6	536781	536786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13060	NC_021192	TCG	2	6	536890	536895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13061	NC_021192	TTGC	2	8	536914	536921	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13062	NC_021192	ATCGG	2	10	536999	537008	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13063	NC_021192	GA	3	6	537045	537050	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_021192	TTGG	2	8	537076	537083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13065	NC_021192	GGTA	2	8	537098	537105	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13066	NC_021192	CAGG	2	8	537135	537142	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13067	NC_021192	CGA	2	6	537176	537181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13068	NC_021192	ACCC	2	8	537212	537219	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
13069	NC_021192	GCC	2	6	537220	537225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13070	NC_021192	CGC	2	6	537311	537316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13071	NC_021192	GTA	2	6	537458	537463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_021192	GGC	2	6	537464	537469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13073	NC_021192	GAT	2	6	537509	537514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13074	NC_021192	GGT	2	6	537575	537580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_021192	CG	3	6	537622	537627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13076	NC_021192	CAG	2	6	537656	537661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13084	NC_021192	CGT	2	6	537925	537930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691096
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13090	NC_021192	TAT	2	6	538070	538075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	494691096
13091	NC_021192	CCTT	2	8	538101	538108	0 %	50 %	0 %	50 %	494691096
13092	NC_021192	ACG	2	6	538141	538146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691096
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13094	NC_021192	GCCA	3	12	538233	538244	25 %	0 %	25 %	50 %	494691096
13095	NC_021192	GAT	2	6	538247	538252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691096
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13097	NC_021192	AGTA	2	8	538359	538366	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_021192	CCG	2	6	538472	538477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13099	NC_021192	CGT	2	6	538478	538483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13100	NC_021192	G	6	6	538578	538583	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13101	NC_021192	ACG	2	6	538652	538657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13102	NC_021192	GAA	2	6	538674	538679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13103	NC_021192	CGA	2	6	538709	538714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13104	NC_021192	ACC	3	9	538717	538725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13105	NC_021192	CGG	2	6	538801	538806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13106	NC_021192	AGCCT	2	10	538861	538870	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13107	NC_021192	GC	3	6	539030	539035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13108	NC_021192	GCG	3	9	539064	539072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13109	NC_021192	TGG	2	6	539074	539079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13110	NC_021192	CG	3	6	539084	539089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13111	NC_021192	CGCTGG	2	12	539092	539103	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13112	NC_021192	ACT	2	6	539158	539163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13113	NC_021192	TGC	3	9	539200	539208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13114	NC_021192	CGC	2	6	539213	539218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13115	NC_021192	GGT	2	6	539233	539238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_021192	AGC	2	6	539254	539259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13117	NC_021192	GCC	2	6	539319	539324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13118	NC_021192	ATCTGC	2	12	539353	539364	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13119	NC_021192	TCG	2	6	539435	539440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13120	NC_021192	CTG	2	6	539494	539499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13121	NC_021192	GGC	2	6	539514	539519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13122	NC_021192	CCG	2	6	539541	539546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13123	NC_021192	GAG	2	6	539571	539576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13124	NC_021192	TGC	2	6	539612	539617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13125	NC_021192	GGC	2	6	539741	539746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13126	NC_021192	CTT	2	6	539767	539772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13127	NC_021192	ATAGTC	2	12	539818	539829	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13128	NC_021192	TTG	2	6	539832	539837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13129	NC_021192	GC	4	8	539934	539941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13130	NC_021192	TG	3	6	539970	539975	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13131	NC_021192	ATGG	2	8	540037	540044	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13132	NC_021192	CCG	2	6	540050	540055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13133	NC_021192	TTG	2	6	540071	540076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13134	NC_021192	AGT	2	6	540077	540082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13135	NC_021192	GGGCCG	3	18	540083	540100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13137	NC_021192	GTC	2	6	540124	540129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13138	NC_021192	CGC	2	6	540145	540150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13139	NC_021192	GCTG	2	8	540175	540182	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13140	NC_021192	TGC	2	6	540226	540231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13141	NC_021192	TGCC	2	8	540236	540243	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13142	NC_021192	CGG	2	6	540285	540290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13143	NC_021192	CCG	2	6	540312	540317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13144	NC_021192	CGC	2	6	540322	540327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13145	NC_021192	TGG	2	6	540331	540336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13146	NC_021192	GGC	2	6	540359	540364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13147	NC_021192	TGG	2	6	540387	540392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13148	NC_021192	TTC	2	6	540401	540406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13151	NC_021192	CCG	2	6	540535	540540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13152	NC_021192	AAT	2	6	540583	540588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13155	NC_021192	CGG	2	6	540645	540650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13156	NC_021192	TGG	2	6	540729	540734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13157	NC_021192	ACTT	2	8	540752	540759	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13158	NC_021192	GCT	2	6	540783	540788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13160	NC_021192	TGC	2	6	540858	540863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13161	NC_021192	CTGG	2	8	540874	540881	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13162	NC_021192	TGG	2	6	540900	540905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13163	NC_021192	C	6	6	540979	540984	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13164	NC_021192	GCC	2	6	541078	541083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13165	NC_021192	GCG	2	6	541087	541092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13166	NC_021192	CCGG	2	8	541102	541109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13167	NC_021192	CGG	2	6	541149	541154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13168	NC_021192	CGCC	2	8	541208	541215	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13169	NC_021192	CGC	2	6	541236	541241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13170	NC_021192	GGC	2	6	541260	541265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13174	NC_021192	CGA	2	6	541332	541337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13177	NC_021192	CCG	2	6	541369	541374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13178	NC_021192	GGGC	2	8	541413	541420	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13179	NC_021192	GCAA	2	8	541438	541445	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13180	NC_021192	GCCG	2	8	541461	541468	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13181	NC_021192	CGA	2	6	541485	541490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13186	NC_021192	GCC	2	6	541855	541860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13188	NC_021192	GGT	2	6	541981	541986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13222	NC_021192	CGCC	2	8	543294	543301	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13223	NC_021192	CGGTC	2	10	543324	543333	0 %	20 %	40 %	40 %	494691098
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13242	NC_021192	GCC	2	6	544108	544113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13243	NC_021192	GCA	2	6	544171	544176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13245	NC_021192	CT	3	6	544221	544226	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13246	NC_021192	TGC	2	6	544241	544246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13247	NC_021192	GTA	2	6	544300	544305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13248	NC_021192	GTA	2	6	544320	544325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13249	NC_021192	GTA	2	6	544330	544335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13250	NC_021192	GCC	2	6	544542	544547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13251	NC_021192	TCG	2	6	544581	544586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13252	NC_021192	GTC	2	6	544596	544601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13254	NC_021192	CAG	2	6	544746	544751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13382	NC_021192	AGA	2	6	549696	549701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13383	NC_021192	GTT	2	6	549751	549756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13384	NC_021192	ACG	2	6	549768	549773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13386	NC_021192	ATT	2	6	549914	549919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13387	NC_021192	GAA	2	6	549961	549966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13388	NC_021192	TTCC	2	8	549995	550002	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13389	NC_021192	AGGC	2	8	550230	550237	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13390	NC_021192	GACC	2	8	550246	550253	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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13393	NC_021192	CG	4	8	550427	550434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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13398	NC_021192	GCT	2	6	550640	550645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13400	NC_021192	GC	3	6	550797	550802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13401	NC_021192	C	6	6	550814	550819	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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13403	NC_021192	GGT	2	6	550840	550845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13407	NC_021192	TGG	2	6	550946	550951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13422	NC_021192	CCAG	2	8	551576	551583	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13423	NC_021192	CG	3	6	551623	551628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13424	NC_021192	GTT	2	6	551653	551658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13455	NC_021192	TGCCCG	2	12	553240	553251	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	494691103
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13457	NC_021192	CGGCTG	2	12	553316	553327	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	494691103
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13484	NC_021192	CTGG	2	8	554708	554715	0 %	25 %	50 %	25 %	494691104
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13491	NC_021192	GCTCG	2	10	554903	554912	0 %	20 %	40 %	40 %	494691104
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13493	NC_021192	GGC	2	6	554965	554970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691104
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13496	NC_021192	TGGA	2	8	555115	555122	25 %	25 %	50 %	0 %	494691104
13497	NC_021192	GCC	2	6	555145	555150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691105
13498	NC_021192	CGA	2	6	555240	555245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691106
13499	NC_021192	CCA	2	6	555248	555253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691106
13500	NC_021192	TCA	2	6	555302	555307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691106

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