MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 108642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_021192	CGC	2	6	514048	514053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12502	NC_021192	GGC	2	6	514090	514095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12503	NC_021192	TCG	2	6	514119	514124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12504	NC_021192	ACCC	2	8	514145	514152	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
12505	NC_021192	TGG	2	6	514269	514274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12506	NC_021192	GTC	2	6	514292	514297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12507	NC_021192	GGT	2	6	514300	514305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12508	NC_021192	GACC	2	8	514316	514323	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12509	NC_021192	GCCA	2	8	514416	514423	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12510	NC_021192	TGG	2	6	514424	514429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12511	NC_021192	GT	3	6	514472	514477	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_021192	CTG	2	6	514497	514502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12513	NC_021192	AGCC	2	8	514541	514548	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12514	NC_021192	CCAG	2	8	514551	514558	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12515	NC_021192	GTTC	2	8	514559	514566	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12516	NC_021192	GCC	2	6	514580	514585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12517	NC_021192	GCG	3	9	514586	514594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12518	NC_021192	CGG	2	6	514614	514619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12519	NC_021192	CCA	2	6	514653	514658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12520	NC_021192	CGA	2	6	514677	514682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12521	NC_021192	AGC	2	6	514724	514729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12522	NC_021192	CGG	2	6	514764	514769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12523	NC_021192	CGG	2	6	514772	514777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12524	NC_021192	CGC	2	6	514846	514851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12525	NC_021192	TGC	2	6	514970	514975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12526	NC_021192	CG	3	6	514982	514987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12527	NC_021192	CG	3	6	515056	515061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12528	NC_021192	GACA	2	8	515090	515097	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12529	NC_021192	TCG	3	9	515102	515110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12530	NC_021192	TGA	2	6	515163	515168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12531	NC_021192	CGG	2	6	515180	515185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12532	NC_021192	GGC	2	6	515272	515277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12533	NC_021192	TGG	2	6	515295	515300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12534	NC_021192	CCG	2	6	515319	515324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12535	NC_021192	CGG	2	6	515337	515342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12536	NC_021192	GT	3	6	515366	515371	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12537	NC_021192	TGG	2	6	515412	515417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12538	NC_021192	GC	3	6	515428	515433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12539	NC_021192	CGA	2	6	515434	515439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12540	NC_021192	CGC	2	6	515444	515449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12541	NC_021192	GGC	3	9	515452	515460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12542	NC_021192	GAG	2	6	515462	515467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12543	NC_021192	GC	3	6	515485	515490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12544	NC_021192	GCG	2	6	515497	515502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12545	NC_021192	CAT	2	6	515505	515510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12546	NC_021192	ACG	2	6	515528	515533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12547	NC_021192	GTCGC	2	10	515546	515555	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12548	NC_021192	GC	3	6	515582	515587	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12549	NC_021192	GCAA	2	8	515606	515613	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12550	NC_021192	GAA	2	6	515675	515680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12551	NC_021192	GAC	2	6	515784	515789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12552	NC_021192	GTG	2	6	515849	515854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12553	NC_021192	GAA	2	6	515874	515879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_021192	GTT	2	6	515891	515896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12555	NC_021192	CTA	2	6	515914	515919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691073
12556	NC_021192	TGG	2	6	515937	515942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691073
12557	NC_021192	GCC	2	6	515960	515965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691073
12558	NC_021192	GCG	2	6	515989	515994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691073
12559	NC_021192	GC	3	6	515998	516003	0 %	0 %	50 %	50 %	494691073
12560	NC_021192	CG	3	6	516025	516030	0 %	0 %	50 %	50 %	494691073
12561	NC_021192	ATGA	2	8	516108	516115	50 %	25 %	25 %	0 %	494691073
12562	NC_021192	ATGGTG	2	12	516153	516164	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	494691073
12563	NC_021192	TGT	2	6	516166	516171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494691073
12564	NC_021192	CGT	2	6	516179	516184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691073
12565	NC_021192	CTG	2	6	516189	516194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691073
12566	NC_021192	GGCA	2	8	516202	516209	25 %	0 %	50 %	25 %	494691073
12567	NC_021192	GAC	2	6	516234	516239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691073
12568	NC_021192	CCA	2	6	516253	516258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691073
12569	NC_021192	ACC	3	9	516261	516269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691073
12570	NC_021192	GCG	2	6	516273	516278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691073
12571	NC_021192	ACA	2	6	516330	516335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494691073
12572	NC_021192	GCC	2	6	516353	516358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691073
12573	NC_021192	GGC	2	6	516382	516387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691073
12574	NC_021192	TAC	2	6	516449	516454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691073
12575	NC_021192	CCG	2	6	516480	516485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12576	NC_021192	AGC	2	6	516508	516513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12577	NC_021192	GCC	2	6	516547	516552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691074
12578	NC_021192	TCG	2	6	516561	516566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691074
12579	NC_021192	CCG	2	6	516623	516628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691074
12580	NC_021192	GTT	2	6	516672	516677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494691074
12581	NC_021192	GCT	2	6	516696	516701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691074
12582	NC_021192	TCG	2	6	516712	516717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691074
12583	NC_021192	GCA	2	6	516720	516725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691074
12584	NC_021192	ACG	2	6	516797	516802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691074
12585	NC_021192	AGTTCG	2	12	516875	516886	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	494691074
12586	NC_021192	CGA	2	6	516914	516919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691074
12587	NC_021192	CGT	2	6	516924	516929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691074
12588	NC_021192	CCA	2	6	516962	516967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691074
12589	NC_021192	CGG	2	6	517004	517009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691074
12590	NC_021192	CCG	2	6	517030	517035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691074
12591	NC_021192	C	6	6	517067	517072	0 %	0 %	0 %	100 %	494691074
12592	NC_021192	GCG	2	6	517077	517082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691074
12593	NC_021192	ACC	3	9	517129	517137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12594	NC_021192	GAC	2	6	517153	517158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12595	NC_021192	CTG	2	6	517159	517164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691075
12596	NC_021192	GCG	2	6	517166	517171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691075
12597	NC_021192	ATC	2	6	517183	517188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691075
12598	NC_021192	CGA	2	6	517263	517268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691075
12599	NC_021192	GAC	2	6	517269	517274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691075
12600	NC_021192	TGCC	2	8	517334	517341	0 %	25 %	25 %	50 %	494691075
12601	NC_021192	GCC	2	6	517351	517356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691075
12602	NC_021192	TGC	2	6	517502	517507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691075
12603	NC_021192	CCG	2	6	517547	517552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691075
12604	NC_021192	CCCG	2	8	517585	517592	0 %	0 %	25 %	75 %	494691075
12605	NC_021192	ACCC	2	8	517636	517643	25 %	0 %	0 %	75 %	494691075
12606	NC_021192	CG	3	6	517647	517652	0 %	0 %	50 %	50 %	494691075
12607	NC_021192	CGC	2	6	517679	517684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691075
12608	NC_021192	GTG	2	6	517713	517718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691075
12609	NC_021192	GCT	2	6	517800	517805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691075
12610	NC_021192	ACT	2	6	517808	517813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691075
12611	NC_021192	TCA	2	6	517840	517845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691075
12612	NC_021192	TGG	2	6	517849	517854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691075
12613	NC_021192	GAT	2	6	517890	517895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691075
12614	NC_021192	CAG	2	6	517900	517905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691075
12615	NC_021192	CCG	2	6	517913	517918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691075
12616	NC_021192	AGA	3	9	517971	517979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12617	NC_021192	CAT	2	6	517984	517989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12618	NC_021192	GC	3	6	518091	518096	0 %	0 %	50 %	50 %	494691076
12619	NC_021192	TCG	2	6	518121	518126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691076
12620	NC_021192	CCG	2	6	518134	518139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691076
12621	NC_021192	GCC	2	6	518204	518209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691076
12622	NC_021192	ATC	2	6	518231	518236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691076
12623	NC_021192	AACG	2	8	518252	518259	50 %	0 %	25 %	25 %	494691076
12624	NC_021192	CGA	2	6	518328	518333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691076
12625	NC_021192	CCT	2	6	518369	518374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	494691076
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12628	NC_021192	GGTGA	2	10	518472	518481	20 %	20 %	60 %	0 %	494691076
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12640	NC_021192	CGAT	2	8	519095	519102	25 %	25 %	25 %	25 %	494691077
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12645	NC_021192	CG	3	6	519428	519433	0 %	0 %	50 %	50 %	494691077
12646	NC_021192	CGG	3	9	519444	519452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691077
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12652	NC_021192	GCC	2	6	519653	519658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12653	NC_021192	GCA	2	6	519665	519670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12655	NC_021192	GAC	2	6	519711	519716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12657	NC_021192	CCA	2	6	519760	519765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12658	NC_021192	TCG	2	6	519825	519830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12663	NC_021192	CG	3	6	520021	520026	0 %	0 %	50 %	50 %	494691078
12664	NC_021192	TGC	2	6	520062	520067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691078
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12669	NC_021192	GTC	2	6	520208	520213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12683	NC_021192	CCGAC	2	10	520753	520762	20 %	0 %	20 %	60 %	494691080
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12692	NC_021192	ACG	2	6	521434	521439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691080
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12697	NC_021192	CG	3	6	521594	521599	0 %	0 %	50 %	50 %	494691081
12698	NC_021192	GTC	2	6	521615	521620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691081
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12729	NC_021192	GCC	2	6	522893	522898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12730	NC_021192	ACC	2	6	522918	522923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691083
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12732	NC_021192	GCC	2	6	522972	522977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691083
12733	NC_021192	CGG	2	6	522999	523004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691083
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12735	NC_021192	CGGGG	2	10	523038	523047	0 %	0 %	80 %	20 %	494691083
12736	NC_021192	ACG	2	6	523166	523171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691083
12737	NC_021192	CCAA	2	8	523205	523212	50 %	0 %	0 %	50 %	494691083
12738	NC_021192	TGA	2	6	523244	523249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691083
12739	NC_021192	TGCC	2	8	523253	523260	0 %	25 %	25 %	50 %	494691083
12740	NC_021192	CG	3	6	523298	523303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12741	NC_021192	GC	3	6	523412	523417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12742	NC_021192	CCCG	2	8	523460	523467	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12743	NC_021192	ACC	2	6	523561	523566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691084
12744	NC_021192	CCG	2	6	523585	523590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691084
12745	NC_021192	TGA	2	6	523595	523600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691084
12746	NC_021192	CGT	2	6	523652	523657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691084
12747	NC_021192	CGG	2	6	523661	523666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691084
12748	NC_021192	GCG	2	6	523684	523689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691084
12749	NC_021192	GCG	2	6	523843	523848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691085
12750	NC_021192	CCG	2	6	523862	523867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691085
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12755	NC_021192	CGG	2	6	524093	524098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691085
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12762	NC_021192	ACC	2	6	524433	524438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691085
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12779	NC_021192	TGC	2	6	525042	525047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691085
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12986	NC_021192	GTC	2	6	533927	533932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691093
12987	NC_021192	CCA	2	6	533960	533965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691093
12988	NC_021192	GTG	2	6	534026	534031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691093
12989	NC_021192	GTG	2	6	534060	534065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691093
12990	NC_021192	CCT	2	6	534111	534116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12991	NC_021192	GGC	2	6	534172	534177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12992	NC_021192	ACC	2	6	534221	534226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12993	NC_021192	GT	3	6	534276	534281	0 %	50 %	50 %	0 %	494691094
12994	NC_021192	GCC	2	6	534340	534345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691094
12995	NC_021192	GGC	2	6	534363	534368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691094
12996	NC_021192	CTG	2	6	534389	534394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691094
12997	NC_021192	TGC	2	6	534419	534424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691094
12998	NC_021192	TGG	2	6	534464	534469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691094
12999	NC_021192	TCG	2	6	534485	534490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691094
13000	NC_021192	TGG	2	6	534510	534515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691094

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