MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 108642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_021192	GCC	2	6	450595	450600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691022
11002	NC_021192	CAT	2	6	450658	450663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691022
11003	NC_021192	TCCG	2	8	450670	450677	0 %	25 %	25 %	50 %	494691022
11004	NC_021192	GAT	2	6	450722	450727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691022
11005	NC_021192	CGC	2	6	450827	450832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691023
11006	NC_021192	ATCC	2	8	450842	450849	25 %	25 %	0 %	50 %	494691023
11007	NC_021192	GTC	2	6	450851	450856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691023
11008	NC_021192	TCG	2	6	450973	450978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691023
11009	NC_021192	CCGCCT	2	12	450985	450996	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	494691023
11010	NC_021192	CGA	3	9	451024	451032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691023
11011	NC_021192	GC	3	6	451052	451057	0 %	0 %	50 %	50 %	494691023
11012	NC_021192	TGGCG	2	10	451058	451067	0 %	20 %	60 %	20 %	494691023
11013	NC_021192	CG	3	6	451073	451078	0 %	0 %	50 %	50 %	494691023
11014	NC_021192	GAAC	2	8	451109	451116	50 %	0 %	25 %	25 %	494691023
11015	NC_021192	GCG	3	9	451131	451139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691023
11016	NC_021192	GCGCG	2	10	451172	451181	0 %	0 %	60 %	40 %	494691023
11017	NC_021192	CGC	2	6	451215	451220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691023
11018	NC_021192	CCG	2	6	451286	451291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691023
11019	NC_021192	CG	3	6	451290	451295	0 %	0 %	50 %	50 %	494691023
11020	NC_021192	ACCC	2	8	451356	451363	25 %	0 %	0 %	75 %	494691023
11021	NC_021192	GC	3	6	451412	451417	0 %	0 %	50 %	50 %	494691023
11022	NC_021192	GTC	2	6	451422	451427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691023
11023	NC_021192	GAT	2	6	451484	451489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691023
11024	NC_021192	GCC	2	6	451490	451495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691023
11025	NC_021192	TCG	2	6	451524	451529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691023
11026	NC_021192	CGG	2	6	451576	451581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691023
11027	NC_021192	GCC	2	6	451610	451615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691023
11028	NC_021192	ACC	2	6	451649	451654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691023
11029	NC_021192	CAC	2	6	451696	451701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691023
11030	NC_021192	CGG	2	6	451725	451730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691023
11031	NC_021192	CACG	2	8	451761	451768	25 %	0 %	25 %	50 %	494691023
11032	NC_021192	CGG	2	6	451820	451825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691023
11033	NC_021192	GCC	2	6	451852	451857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691023
11034	NC_021192	CGA	2	6	451920	451925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691023
11035	NC_021192	CGG	2	6	451968	451973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691023
11036	NC_021192	CG	3	6	451990	451995	0 %	0 %	50 %	50 %	494691023
11037	NC_021192	CAA	3	9	452014	452022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494691023
11038	NC_021192	GCC	2	6	452044	452049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691023
11039	NC_021192	TGC	2	6	452063	452068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691023
11040	NC_021192	CGC	2	6	452073	452078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691023
11041	NC_021192	CGC	2	6	452100	452105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691023
11042	NC_021192	TCTCG	2	10	452126	452135	0 %	40 %	20 %	40 %	494691023
11043	NC_021192	CGA	2	6	452139	452144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691023
11044	NC_021192	CCA	2	6	452171	452176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691023
11045	NC_021192	CG	3	6	452201	452206	0 %	0 %	50 %	50 %	494691023
11046	NC_021192	CGGCC	2	10	452223	452232	0 %	0 %	40 %	60 %	494691023
11047	NC_021192	ATC	2	6	452293	452298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691023
11048	NC_021192	CGT	2	6	452301	452306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691023
11049	NC_021192	GTCC	2	8	452373	452380	0 %	25 %	25 %	50 %	494691023
11050	NC_021192	GCC	2	6	452465	452470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691024
11051	NC_021192	GGA	2	6	452476	452481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	494691024
11052	NC_021192	GCC	2	6	452540	452545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691024
11053	NC_021192	GTG	2	6	452593	452598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691024
11054	NC_021192	TG	3	6	452597	452602	0 %	50 %	50 %	0 %	494691024
11055	NC_021192	CCG	2	6	452630	452635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691024
11056	NC_021192	TTG	2	6	452645	452650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494691024
11057	NC_021192	TCA	2	6	452654	452659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691024
11058	NC_021192	GAT	2	6	452682	452687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691024
11059	NC_021192	CGGGGT	2	12	452697	452708	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	494691024
11060	NC_021192	AGCT	2	8	452746	452753	25 %	25 %	25 %	25 %	494691025
11061	NC_021192	GC	3	6	452774	452779	0 %	0 %	50 %	50 %	494691025
11062	NC_021192	TGCG	2	8	452867	452874	0 %	25 %	50 %	25 %	494691025
11063	NC_021192	GTG	3	9	452996	453004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691025
11064	NC_021192	GCG	2	6	453066	453071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691025
11065	NC_021192	CGG	2	6	453076	453081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691025
11066	NC_021192	CGG	2	6	453085	453090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691025
11067	NC_021192	GCG	2	6	453093	453098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691025
11068	NC_021192	GCTC	2	8	453247	453254	0 %	25 %	25 %	50 %	494691026
11069	NC_021192	CGG	2	6	453278	453283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691026
11070	NC_021192	ACGA	2	8	453288	453295	50 %	0 %	25 %	25 %	494691026
11071	NC_021192	GAA	2	6	453316	453321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	494691026
11072	NC_021192	GT	3	6	453344	453349	0 %	50 %	50 %	0 %	494691026
11073	NC_021192	CAT	2	6	453363	453368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691026
11074	NC_021192	GGC	3	9	453396	453404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691026
11075	NC_021192	AG	3	6	453530	453535	50 %	0 %	50 %	0 %	494691027
11076	NC_021192	TGC	2	6	453652	453657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691027
11077	NC_021192	CGG	2	6	453683	453688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691027
11078	NC_021192	CCG	2	6	453743	453748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691027
11079	NC_021192	CGT	2	6	453761	453766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691027
11080	NC_021192	CAG	2	6	453798	453803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691027
11081	NC_021192	GC	3	6	453834	453839	0 %	0 %	50 %	50 %	494691027
11082	NC_021192	CCA	2	6	453863	453868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691027
11083	NC_021192	CGC	2	6	453885	453890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691027
11084	NC_021192	CAG	2	6	453897	453902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691027
11085	NC_021192	GGT	2	6	453906	453911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691027
11086	NC_021192	GTG	2	6	453918	453923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691027
11087	NC_021192	CGGT	2	8	453940	453947	0 %	25 %	50 %	25 %	494691027
11088	NC_021192	GCGCC	2	10	453955	453964	0 %	0 %	40 %	60 %	494691027
11089	NC_021192	CCG	2	6	453972	453977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691027
11090	NC_021192	CGA	2	6	453983	453988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691027
11091	NC_021192	CAC	2	6	454026	454031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691027
11092	NC_021192	GAT	2	6	454107	454112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691027
11093	NC_021192	CGA	2	6	454142	454147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11094	NC_021192	CAA	2	6	454170	454175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494691028
11095	NC_021192	GTC	2	6	454194	454199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691028
11096	NC_021192	CGC	2	6	454226	454231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691028
11097	NC_021192	GCC	2	6	454240	454245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691028
11098	NC_021192	AGGA	2	8	454400	454407	50 %	0 %	50 %	0 %	494691028
11099	NC_021192	CAT	2	6	454480	454485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691028
11100	NC_021192	CCG	2	6	454490	454495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691028
11101	NC_021192	GTC	2	6	454507	454512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691028
11102	NC_021192	CAG	2	6	454549	454554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691028
11103	NC_021192	GC	3	6	454622	454627	0 %	0 %	50 %	50 %	494691028
11104	NC_021192	TGG	2	6	454641	454646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691028
11105	NC_021192	ACC	2	6	454652	454657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691028
11106	NC_021192	CGT	2	6	454666	454671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691028
11107	NC_021192	GCA	2	6	454683	454688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691028
11108	NC_021192	CGC	2	6	454757	454762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691028
11109	NC_021192	GCCG	2	8	454811	454818	0 %	0 %	50 %	50 %	494691028
11110	NC_021192	GCG	2	6	454832	454837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691028
11111	NC_021192	ACG	2	6	454840	454845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691028
11112	NC_021192	CGC	2	6	454868	454873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691028
11113	NC_021192	GCG	2	6	454952	454957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691028
11114	NC_021192	AGC	2	6	455008	455013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691028
11115	NC_021192	CGACA	2	10	455017	455026	40 %	0 %	20 %	40 %	494691028
11116	NC_021192	CCAGC	2	10	455031	455040	20 %	0 %	20 %	60 %	494691028
11117	NC_021192	AGC	2	6	455108	455113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691028
11118	NC_021192	GAC	2	6	455130	455135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691028
11119	NC_021192	GCC	2	6	455178	455183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691028
11120	NC_021192	CCA	2	6	455278	455283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691028
11121	NC_021192	CAC	2	6	455305	455310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691028
11122	NC_021192	CCG	2	6	455332	455337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11123	NC_021192	GGT	2	6	455354	455359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691029
11124	NC_021192	ACC	2	6	455373	455378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494691029
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11131	NC_021192	CGC	2	6	455745	455750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691029
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11152	NC_021192	CGC	2	6	456487	456492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11153	NC_021192	GCG	2	6	456563	456568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691030
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11159	NC_021192	GGCC	2	8	456873	456880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11160	NC_021192	CTG	2	6	456913	456918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11161	NC_021192	CTGCAG	2	12	457000	457011	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	494691031
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11167	NC_021192	TCG	2	6	457257	457262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691031
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11172	NC_021192	CGGG	2	8	457390	457397	0 %	0 %	75 %	25 %	494691032
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11188	NC_021192	GTG	2	6	457969	457974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11220	NC_021192	CAG	2	6	459236	459241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11221	NC_021192	CGG	2	6	459270	459275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691035
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11223	NC_021192	GTC	2	6	459320	459325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691035
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11226	NC_021192	CGC	2	6	459450	459455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691035
11227	NC_021192	CGA	2	6	459528	459533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691035
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11229	NC_021192	C	6	6	459598	459603	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11230	NC_021192	TGG	2	6	459661	459666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11231	NC_021192	GC	3	6	459671	459676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11232	NC_021192	ACC	2	6	459715	459720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11233	NC_021192	TGC	2	6	459733	459738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11234	NC_021192	CG	3	6	459762	459767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11235	NC_021192	GGAC	2	8	459816	459823	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11236	NC_021192	CGA	2	6	459829	459834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494691036
11237	NC_021192	GCC	2	6	459836	459841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691036
11238	NC_021192	ATC	2	6	459860	459865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691036
11239	NC_021192	TGA	2	6	459870	459875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494691036
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11241	NC_021192	TGG	2	6	459908	459913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494691036
11242	NC_021192	GTC	2	6	459923	459928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494691036
11243	NC_021192	CCGC	2	8	459979	459986	0 %	0 %	25 %	75 %	494691036
11244	NC_021192	CCG	2	6	460036	460041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691036
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11248	NC_021192	GTCCG	2	10	460171	460180	0 %	20 %	40 %	40 %	494691036
11249	NC_021192	CGG	2	6	460207	460212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691036
11250	NC_021192	ATC	2	6	460265	460270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494691036
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11252	NC_021192	TTC	2	6	460310	460315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11253	NC_021192	GCC	2	6	460430	460435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11254	NC_021192	CG	3	6	460458	460463	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11255	NC_021192	CGG	2	6	460513	460518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11256	NC_021192	CCA	2	6	460569	460574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11257	NC_021192	GCC	2	6	460577	460582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11259	NC_021192	TGC	2	6	460753	460758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11261	NC_021192	TGC	2	6	460838	460843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11262	NC_021192	GC	3	6	460848	460853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11263	NC_021192	GCC	2	6	460881	460886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11264	NC_021192	AGGGTG	2	12	460912	460923	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11267	NC_021192	CGA	2	6	461048	461053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11269	NC_021192	ATCG	2	8	461154	461161	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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11271	NC_021192	CGC	2	6	461273	461278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11273	NC_021192	CCGGCG	2	12	461402	461413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11274	NC_021192	GGC	2	6	461433	461438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11275	NC_021192	CG	3	6	461473	461478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11276	NC_021192	GGCG	2	8	461532	461539	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11277	NC_021192	ACG	2	6	461572	461577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11282	NC_021192	G	6	6	461683	461688	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11283	NC_021192	GTGAG	2	10	461731	461740	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
11284	NC_021192	CCGG	2	8	461810	461817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11285	NC_021192	CGA	2	6	461831	461836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11293	NC_021192	CGA	2	6	462104	462109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11311	NC_021192	GCT	2	6	462695	462700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11367	NC_021192	GCG	2	6	464684	464689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11368	NC_021192	AGGA	2	8	464692	464699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11369	NC_021192	GTCG	2	8	464723	464730	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11370	NC_021192	TAC	2	6	464743	464748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11372	NC_021192	TGG	2	6	464796	464801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11373	NC_021192	GCG	2	6	464972	464977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11374	NC_021192	CGC	2	6	465008	465013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11375	NC_021192	CGC	2	6	465035	465040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11376	NC_021192	GGC	2	6	465074	465079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11407	NC_021192	GGT	2	6	466176	466181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11432	NC_021192	CGG	2	6	467556	467561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11471	NC_021192	GCG	2	6	469256	469261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11472	NC_021192	CACT	2	8	469280	469287	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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11485	NC_021192	TCC	2	6	469904	469909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11486	NC_021192	GCC	2	6	470018	470023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11487	NC_021192	TCGGA	2	10	470025	470034	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11488	NC_021192	GGC	2	6	470106	470111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11489	NC_021192	CCCGG	2	10	470139	470148	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11490	NC_021192	TGC	2	6	470209	470214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11491	NC_021192	TGCGGG	2	12	470312	470323	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
11492	NC_021192	GCC	2	6	470352	470357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11493	NC_021192	GATCG	2	10	470364	470373	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11494	NC_021192	TGG	2	6	470527	470532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11495	NC_021192	GT	3	6	470538	470543	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11496	NC_021192	GCA	2	6	470557	470562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11497	NC_021192	GCGCC	2	10	470570	470579	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11498	NC_021192	GGC	2	6	470597	470602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494691039
11499	NC_021192	GCC	2	6	470646	470651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494691039
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