MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 108642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
105501	NC_021192	TCGT	2	8	4234835	4234842	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105502	NC_021192	GGC	2	6	4234864	4234869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105503	NC_021192	GCG	2	6	4234871	4234876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105504	NC_021192	GCG	3	9	4234923	4234931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105505	NC_021192	GC	3	6	4234955	4234960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105506	NC_021192	ACG	2	6	4234962	4234967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105507	NC_021192	CAAC	2	8	4235024	4235031	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105508	NC_021192	CGCGG	2	10	4235070	4235079	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
105509	NC_021192	CGG	2	6	4235108	4235113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105510	NC_021192	GC	3	6	4235141	4235146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105511	NC_021192	CCGCGG	2	12	4235152	4235163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105512	NC_021192	CCG	2	6	4235164	4235169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105513	NC_021192	GCG	2	6	4235176	4235181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105514	NC_021192	CCA	2	6	4235209	4235214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105515	NC_021192	TCC	2	6	4235260	4235265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105516	NC_021192	ATC	2	6	4235271	4235276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105517	NC_021192	CAG	2	6	4235283	4235288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105518	NC_021192	GCA	2	6	4235297	4235302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105519	NC_021192	CGC	2	6	4235306	4235311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105520	NC_021192	TGG	2	6	4235347	4235352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105521	NC_021192	TAC	2	6	4235412	4235417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105522	NC_021192	ATT	2	6	4235427	4235432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105523	NC_021192	ACG	2	6	4235466	4235471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105524	NC_021192	GCG	2	6	4235517	4235522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105525	NC_021192	TGG	2	6	4235551	4235556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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105529	NC_021192	CAT	2	6	4235714	4235719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105530	NC_021192	C	6	6	4235763	4235768	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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105534	NC_021192	CTT	2	6	4235885	4235890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105535	NC_021192	CGA	2	6	4235956	4235961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105536	NC_021192	GGTG	2	8	4236011	4236018	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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105538	NC_021192	CGA	2	6	4236190	4236195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694218
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105540	NC_021192	GCT	2	6	4236281	4236286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694218
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105544	NC_021192	TGCCA	2	10	4236371	4236380	20 %	20 %	20 %	40 %	494694218
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105551	NC_021192	TCG	2	6	4236706	4236711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694218
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105553	NC_021192	CGT	2	6	4236780	4236785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694218
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105555	NC_021192	TCG	2	6	4236845	4236850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694218
105556	NC_021192	CCA	2	6	4236888	4236893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494694218
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105558	NC_021192	GCA	2	6	4236971	4236976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694218
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105563	NC_021192	CGTGT	2	10	4237102	4237111	0 %	40 %	40 %	20 %	494694218
105564	NC_021192	GC	3	6	4237112	4237117	0 %	0 %	50 %	50 %	494694218
105565	NC_021192	CGA	2	6	4237293	4237298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694218
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105617	NC_021192	GTTCA	2	10	4239242	4239251	20 %	40 %	20 %	20 %	494694218
105618	NC_021192	CGA	2	6	4239282	4239287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694218
105619	NC_021192	CGA	2	6	4239464	4239469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694218
105620	NC_021192	CGG	2	6	4239494	4239499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694218
105621	NC_021192	CGT	2	6	4239500	4239505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694218
105622	NC_021192	CCT	2	6	4239586	4239591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	494694218
105623	NC_021192	CGA	2	6	4239685	4239690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694218
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105625	NC_021192	CAG	2	6	4239802	4239807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694218
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105627	NC_021192	GC	3	6	4239946	4239951	0 %	0 %	50 %	50 %	494694218
105628	NC_021192	GCG	2	6	4239972	4239977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694218
105629	NC_021192	TCA	2	6	4240020	4240025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494694218
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105632	NC_021192	GCG	2	6	4240066	4240071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694218
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105635	NC_021192	CCG	2	6	4240346	4240351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494694218
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105639	NC_021192	ACT	2	6	4240587	4240592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494694218
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105641	NC_021192	GCA	2	6	4240727	4240732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694218
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105644	NC_021192	CGT	2	6	4240905	4240910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694218
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105722	NC_021192	TGG	2	6	4244239	4244244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105723	NC_021192	GCC	2	6	4244263	4244268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105724	NC_021192	GCT	2	6	4244270	4244275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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105727	NC_021192	GAC	2	6	4244490	4244495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105728	NC_021192	GTG	2	6	4244530	4244535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105729	NC_021192	GCTG	2	8	4244543	4244550	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105730	NC_021192	GTT	2	6	4244560	4244565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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105732	NC_021192	GTG	2	6	4244712	4244717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105733	NC_021192	GCA	2	6	4244757	4244762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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105735	NC_021192	GCTGC	2	10	4244787	4244796	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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105848	NC_021192	AGG	2	6	4250301	4250306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	494694224
105849	NC_021192	ACC	2	6	4250379	4250384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494694224
105850	NC_021192	CCA	2	6	4250488	4250493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494694224
105851	NC_021192	CGC	2	6	4250508	4250513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494694224
105852	NC_021192	TGC	2	6	4250542	4250547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694224
105853	NC_021192	CAT	2	6	4250559	4250564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494694224
105854	NC_021192	CGC	3	9	4250576	4250584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494694224
105855	NC_021192	CG	3	6	4250661	4250666	0 %	0 %	50 %	50 %	494694224
105856	NC_021192	TGC	2	6	4250707	4250712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694224
105857	NC_021192	GAT	2	6	4250840	4250845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494694224
105858	NC_021192	TG	3	6	4250971	4250976	0 %	50 %	50 %	0 %	494694224
105859	NC_021192	CCG	2	6	4250996	4251001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494694224
105860	NC_021192	GTAT	2	8	4251060	4251067	25 %	50 %	25 %	0 %	494694224
105861	NC_021192	CGA	2	6	4251073	4251078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694224
105862	NC_021192	TGA	2	6	4251089	4251094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494694224
105863	NC_021192	GC	3	6	4251106	4251111	0 %	0 %	50 %	50 %	494694224
105864	NC_021192	AGC	2	6	4251148	4251153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694224
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105866	NC_021192	GAC	2	6	4251411	4251416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694224
105867	NC_021192	GCA	2	6	4251423	4251428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694224
105868	NC_021192	CGT	2	6	4251433	4251438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694224
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105870	NC_021192	GCGG	2	8	4251583	4251590	0 %	0 %	75 %	25 %	494694224
105871	NC_021192	CTGC	2	8	4251621	4251628	0 %	25 %	25 %	50 %	494694224
105872	NC_021192	TCG	2	6	4251662	4251667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694224
105873	NC_021192	TCGT	2	8	4251677	4251684	0 %	50 %	25 %	25 %	494694224
105874	NC_021192	TGC	2	6	4251715	4251720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694224
105875	NC_021192	TCG	2	6	4251846	4251851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694224
105876	NC_021192	TCC	2	6	4251876	4251881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	494694224
105877	NC_021192	CG	3	6	4251894	4251899	0 %	0 %	50 %	50 %	494694224
105878	NC_021192	ACC	3	9	4251910	4251918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494694224
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105881	NC_021192	GCC	2	6	4252058	4252063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494694224
105882	NC_021192	CG	3	6	4252150	4252155	0 %	0 %	50 %	50 %	494694224
105883	NC_021192	TCG	2	6	4252164	4252169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694224
105884	NC_021192	ACC	2	6	4252196	4252201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494694224
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105887	NC_021192	CG	3	6	4252321	4252326	0 %	0 %	50 %	50 %	494694224
105888	NC_021192	TCT	2	6	4252409	4252414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494694224
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105894	NC_021192	GT	3	6	4252689	4252694	0 %	50 %	50 %	0 %	494694224
105895	NC_021192	CGA	2	6	4252796	4252801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694224
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105908	NC_021192	CTG	2	6	4253500	4253505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694224
105909	NC_021192	CGA	2	6	4253514	4253519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694224
105910	NC_021192	GC	3	6	4253560	4253565	0 %	0 %	50 %	50 %	494694224
105911	NC_021192	TCT	2	6	4253600	4253605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494694224
105912	NC_021192	GCT	2	6	4253634	4253639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694224
105913	NC_021192	GCCC	2	8	4253724	4253731	0 %	0 %	25 %	75 %	494694224
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105915	NC_021192	ACG	2	6	4253783	4253788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694224
105916	NC_021192	CCA	2	6	4253838	4253843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494694224
105917	NC_021192	GCG	2	6	4253886	4253891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694224
105918	NC_021192	CGC	2	6	4253922	4253927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494694224
105919	NC_021192	TCG	2	6	4253933	4253938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694224
105920	NC_021192	CGG	3	9	4253964	4253972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694224
105921	NC_021192	GTC	2	6	4253980	4253985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694224
105922	NC_021192	TCG	2	6	4254003	4254008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105923	NC_021192	CGC	2	6	4254013	4254018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105924	NC_021192	CAG	2	6	4254085	4254090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694225
105925	NC_021192	CCGTG	2	10	4254237	4254246	0 %	20 %	40 %	40 %	494694225
105926	NC_021192	AGCG	2	8	4254315	4254322	25 %	0 %	50 %	25 %	494694225
105927	NC_021192	CTAC	2	8	4254380	4254387	25 %	25 %	0 %	50 %	494694225
105928	NC_021192	GC	3	6	4254405	4254410	0 %	0 %	50 %	50 %	494694225
105929	NC_021192	CGAC	2	8	4254411	4254418	25 %	0 %	25 %	50 %	494694225
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105931	NC_021192	CTG	2	6	4254463	4254468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694225
105932	NC_021192	CGAA	2	8	4254469	4254476	50 %	0 %	25 %	25 %	494694225
105933	NC_021192	GGC	2	6	4254511	4254516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694225
105934	NC_021192	TCC	2	6	4254520	4254525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	494694225
105935	NC_021192	AGG	2	6	4254636	4254641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	494694225
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105941	NC_021192	CAG	3	9	4254804	4254812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694225
105942	NC_021192	GGC	2	6	4254894	4254899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694225
105943	NC_021192	AGC	2	6	4254909	4254914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694225
105944	NC_021192	GGCGT	2	10	4254978	4254987	0 %	20 %	60 %	20 %	494694225
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105946	NC_021192	CAG	2	6	4255189	4255194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694225
105947	NC_021192	GCT	2	6	4255218	4255223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694225
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105949	NC_021192	CAG	2	6	4255294	4255299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694225
105950	NC_021192	GCG	2	6	4255305	4255310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694225
105951	NC_021192	CGT	2	6	4255335	4255340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694225
105952	NC_021192	CG	3	6	4255403	4255408	0 %	0 %	50 %	50 %	494694225
105953	NC_021192	CG	3	6	4255425	4255430	0 %	0 %	50 %	50 %	494694225
105954	NC_021192	TAG	2	6	4255451	4255456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494694225
105955	NC_021192	TCG	2	6	4255505	4255510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694225
105956	NC_021192	GGATC	2	10	4255512	4255521	20 %	20 %	40 %	20 %	494694225
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105959	NC_021192	CGC	2	6	4255576	4255581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494694225
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