MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 108642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
105001	NC_021192	CCGG	2	8	4214093	4214100	0 %	0 %	50 %	50 %	494694203
105002	NC_021192	GCGGGC	2	12	4214223	4214234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694203
105003	NC_021192	CTT	2	6	4214247	4214252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494694203
105004	NC_021192	GGC	3	9	4214262	4214270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694203
105005	NC_021192	CCG	2	6	4214278	4214283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494694203
105006	NC_021192	CGG	2	6	4214330	4214335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105007	NC_021192	G	6	6	4214334	4214339	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
105008	NC_021192	CG	3	6	4214407	4214412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105009	NC_021192	GAT	2	6	4214437	4214442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105010	NC_021192	TCG	2	6	4214447	4214452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105011	NC_021192	CAC	2	6	4214482	4214487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105012	NC_021192	CCG	2	6	4214516	4214521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105013	NC_021192	CGT	2	6	4214604	4214609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105014	NC_021192	ACG	2	6	4214652	4214657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105015	NC_021192	GAT	2	6	4214671	4214676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105016	NC_021192	CCGG	2	8	4214678	4214685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105017	NC_021192	TCG	3	9	4214738	4214746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105018	NC_021192	CTC	2	6	4214749	4214754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105019	NC_021192	GCT	2	6	4214757	4214762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105020	NC_021192	TCT	2	6	4214796	4214801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105021	NC_021192	GGC	2	6	4214809	4214814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105022	NC_021192	TCC	2	6	4214840	4214845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105023	NC_021192	GC	3	6	4214870	4214875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105024	NC_021192	CGA	2	6	4214892	4214897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105025	NC_021192	GCC	2	6	4214916	4214921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105026	NC_021192	CCA	2	6	4214970	4214975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105027	NC_021192	CTG	2	6	4215022	4215027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105028	NC_021192	TCGA	2	8	4215038	4215045	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105029	NC_021192	CCCG	2	8	4215048	4215055	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
105030	NC_021192	CCG	2	6	4215080	4215085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105031	NC_021192	CAG	2	6	4215094	4215099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105032	NC_021192	GCCG	2	8	4215121	4215128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105033	NC_021192	CGA	2	6	4215253	4215258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105034	NC_021192	CGG	2	6	4215273	4215278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105035	NC_021192	GC	3	6	4215293	4215298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105036	NC_021192	TCG	2	6	4215332	4215337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105037	NC_021192	GCC	2	6	4215364	4215369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105038	NC_021192	CGG	2	6	4215430	4215435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105039	NC_021192	GCT	2	6	4215471	4215476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105040	NC_021192	GCG	2	6	4215486	4215491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105041	NC_021192	CGGCT	2	10	4215523	4215532	0 %	20 %	40 %	40 %	494694204
105042	NC_021192	GCA	2	6	4215547	4215552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694204
105043	NC_021192	CG	3	6	4215567	4215572	0 %	0 %	50 %	50 %	494694204
105044	NC_021192	GCT	2	6	4215610	4215615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694204
105045	NC_021192	TCG	2	6	4215621	4215626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694204
105046	NC_021192	GGT	2	6	4215904	4215909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494694204
105047	NC_021192	CGG	2	6	4215945	4215950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694204
105048	NC_021192	TCGCCG	2	12	4215990	4216001	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	494694204
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105050	NC_021192	CGT	2	6	4216053	4216058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694204
105051	NC_021192	TCG	2	6	4216076	4216081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694204
105052	NC_021192	TGCACC	2	12	4216091	4216102	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	494694204
105053	NC_021192	GCC	2	6	4216108	4216113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494694204
105054	NC_021192	TCG	2	6	4216128	4216133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694204
105055	NC_021192	CG	3	6	4216162	4216167	0 %	0 %	50 %	50 %	494694204
105056	NC_021192	CGG	3	9	4216173	4216181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694204
105057	NC_021192	GCG	3	9	4216208	4216216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694204
105058	NC_021192	GCC	2	6	4216274	4216279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494694204
105059	NC_021192	CGG	2	6	4216371	4216376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694204
105060	NC_021192	GCGT	2	8	4216418	4216425	0 %	25 %	50 %	25 %	494694204
105061	NC_021192	CTTG	2	8	4216487	4216494	0 %	50 %	25 %	25 %	494694204
105062	NC_021192	CGG	2	6	4216538	4216543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105063	NC_021192	GGT	2	6	4216596	4216601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105064	NC_021192	CTT	2	6	4216662	4216667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105065	NC_021192	CGT	2	6	4216679	4216684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105066	NC_021192	CGC	2	6	4216694	4216699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105067	NC_021192	TCG	2	6	4216754	4216759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105068	NC_021192	CAG	2	6	4216794	4216799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105069	NC_021192	CTCGGC	2	12	4216861	4216872	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
105070	NC_021192	G	7	7	4216900	4216906	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
105071	NC_021192	CCG	2	6	4216907	4216912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105072	NC_021192	G	6	6	4216923	4216928	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
105073	NC_021192	AC	4	8	4216939	4216946	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105074	NC_021192	TCG	2	6	4216984	4216989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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105078	NC_021192	GCA	2	6	4217181	4217186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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105080	NC_021192	CGC	2	6	4217321	4217326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105081	NC_021192	GGT	2	6	4217408	4217413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105082	NC_021192	CG	3	6	4217465	4217470	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105083	NC_021192	TCG	2	6	4217487	4217492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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105085	NC_021192	CGAT	2	8	4217554	4217561	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105086	NC_021192	GAG	2	6	4217568	4217573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105087	NC_021192	CGG	2	6	4217611	4217616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105088	NC_021192	CCG	2	6	4217617	4217622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105089	NC_021192	CTT	2	6	4217624	4217629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105090	NC_021192	CCT	2	6	4217727	4217732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105091	NC_021192	CCG	2	6	4217772	4217777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105092	NC_021192	TGA	2	6	4217784	4217789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105093	NC_021192	TCG	2	6	4217801	4217806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105094	NC_021192	CGG	2	6	4217841	4217846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694205
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105106	NC_021192	CAG	2	6	4218175	4218180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694205
105107	NC_021192	GCCG	2	8	4218182	4218189	0 %	0 %	50 %	50 %	494694205
105108	NC_021192	ACC	2	6	4218212	4218217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494694205
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105119	NC_021192	TCG	2	6	4218554	4218559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694205
105120	NC_021192	CCG	2	6	4218598	4218603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494694205
105121	NC_021192	TGG	2	6	4218649	4218654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494694205
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105124	NC_021192	GCT	2	6	4218746	4218751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694205
105125	NC_021192	AC	3	6	4218831	4218836	50 %	0 %	0 %	50 %	494694205
105126	NC_021192	GCT	2	6	4218915	4218920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694205
105127	NC_021192	TGT	2	6	4218930	4218935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494694205
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105131	NC_021192	CAG	2	6	4219102	4219107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694205
105132	NC_021192	GGCCG	2	10	4219189	4219198	0 %	0 %	60 %	40 %	494694205
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105145	NC_021192	CAG	2	6	4219662	4219667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694205
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105148	NC_021192	CGA	2	6	4219721	4219726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694205
105149	NC_021192	TGG	2	6	4219732	4219737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494694205
105150	NC_021192	GCCG	2	8	4219752	4219759	0 %	0 %	50 %	50 %	494694205
105151	NC_021192	CGA	2	6	4219769	4219774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694205
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105188	NC_021192	GC	4	8	4221233	4221240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105189	NC_021192	CG	4	8	4221262	4221269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105190	NC_021192	CT	3	6	4221423	4221428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105191	NC_021192	CGGC	2	8	4221445	4221452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105192	NC_021192	CGG	2	6	4221458	4221463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105193	NC_021192	CAGC	2	8	4221542	4221549	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
105194	NC_021192	GCC	2	6	4221645	4221650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105195	NC_021192	CCG	2	6	4221697	4221702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105196	NC_021192	TGGGG	2	10	4221742	4221751	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
105197	NC_021192	CATA	2	8	4221835	4221842	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105198	NC_021192	GCC	2	6	4221863	4221868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105199	NC_021192	ACA	2	6	4222024	4222029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494694208
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105202	NC_021192	CTG	2	6	4222098	4222103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694208
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105208	NC_021192	AGC	2	6	4222426	4222431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694208
105209	NC_021192	CTG	2	6	4222467	4222472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694208
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105213	NC_021192	GCG	2	6	4222610	4222615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694208
105214	NC_021192	GCA	2	6	4222627	4222632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694208
105215	NC_021192	CAC	2	6	4222637	4222642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494694208
105216	NC_021192	ACG	2	6	4222662	4222667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694208
105217	NC_021192	CGCC	2	8	4222678	4222685	0 %	0 %	25 %	75 %	494694208
105218	NC_021192	CGCGC	2	10	4222782	4222791	0 %	0 %	40 %	60 %	494694208
105219	NC_021192	CCCG	2	8	4222806	4222813	0 %	0 %	25 %	75 %	494694208
105220	NC_021192	ATC	2	6	4222891	4222896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494694208
105221	NC_021192	CTC	2	6	4222913	4222918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	494694208
105222	NC_021192	GCTG	2	8	4222999	4223006	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105223	NC_021192	CGG	2	6	4223082	4223087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105224	NC_021192	GGC	2	6	4223101	4223106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694209
105225	NC_021192	CCACAC	2	12	4223137	4223148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494694209
105226	NC_021192	GTT	2	6	4223155	4223160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494694209
105227	NC_021192	CAG	2	6	4223167	4223172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694209
105228	NC_021192	CCG	2	6	4223248	4223253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494694209
105229	NC_021192	TGC	2	6	4223257	4223262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694209
105230	NC_021192	CGC	2	6	4223268	4223273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494694209
105231	NC_021192	GTG	2	6	4223289	4223294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494694209
105232	NC_021192	A	6	6	4223305	4223310	100 %	0 %	0 %	0 %	494694209
105233	NC_021192	CGAAGC	2	12	4223327	4223338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694209
105234	NC_021192	GCC	2	6	4223353	4223358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494694209
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105246	NC_021192	CGT	2	6	4223828	4223833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694209
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105295	NC_021192	CGA	2	6	4226227	4226232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694211
105296	NC_021192	CCA	2	6	4226239	4226244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494694211
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105310	NC_021192	CCA	2	6	4226714	4226719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494694212
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105312	NC_021192	CCGG	2	8	4226811	4226818	0 %	0 %	50 %	50 %	494694212
105313	NC_021192	CCGG	2	8	4226861	4226868	0 %	0 %	50 %	50 %	494694212
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105329	NC_021192	CGCCAG	2	12	4227292	4227303	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	494694213
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105468	NC_021192	CCA	2	6	4233534	4233539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105469	NC_021192	CGC	2	6	4233585	4233590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105470	NC_021192	GCC	2	6	4233595	4233600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105471	NC_021192	CCA	2	6	4233616	4233621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105472	NC_021192	GCC	3	9	4233646	4233654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105473	NC_021192	ATC	2	6	4233655	4233660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105474	NC_021192	TGCGA	2	10	4233692	4233701	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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105476	NC_021192	GGT	2	6	4233735	4233740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105477	NC_021192	CCA	2	6	4233741	4233746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105478	NC_021192	ACT	2	6	4233764	4233769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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105480	NC_021192	TCG	2	6	4233857	4233862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105481	NC_021192	CGG	2	6	4233894	4233899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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105493	NC_021192	CGC	2	6	4234347	4234352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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105499	NC_021192	CGC	2	6	4234805	4234810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105500	NC_021192	AAC	2	6	4234826	4234831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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