MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 108642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_021192	CGG	2	6	407713	407718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_021192	GGT	2	6	407756	407761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_021192	CGG	2	6	407767	407772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_021192	CAG	2	6	407799	407804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10005	NC_021192	GCT	2	6	407878	407883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10006	NC_021192	CGGTGT	2	12	407910	407921	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10007	NC_021192	GGT	2	6	407923	407928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_021192	GGC	2	6	407944	407949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10009	NC_021192	CTC	2	6	407984	407989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10010	NC_021192	CGG	2	6	407993	407998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10011	NC_021192	GTG	2	6	408016	408021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_021192	GGC	2	6	408033	408038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10013	NC_021192	CGG	2	6	408060	408065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10014	NC_021192	CGG	2	6	408084	408089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10015	NC_021192	CGG	2	6	408207	408212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10016	NC_021192	CGG	2	6	408216	408221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10017	NC_021192	GGC	2	6	408226	408231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10018	NC_021192	CGG	2	6	408296	408301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10019	NC_021192	CGG	2	6	408314	408319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10020	NC_021192	GCA	2	6	408330	408335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10021	NC_021192	GCC	2	6	408348	408353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10022	NC_021192	GCC	2	6	408366	408371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10023	NC_021192	GCC	2	6	408402	408407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10024	NC_021192	CGC	2	6	408419	408424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10025	NC_021192	CGT	2	6	408443	408448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10026	NC_021192	CCG	2	6	408520	408525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10027	NC_021192	CGAG	2	8	408558	408565	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10028	NC_021192	GTCGG	2	10	408604	408613	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10029	NC_021192	TCG	2	6	408619	408624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10030	NC_021192	GATC	2	8	408629	408636	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10031	NC_021192	ATCGCC	2	12	408642	408653	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10032	NC_021192	GTG	2	6	408667	408672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_021192	GTG	2	6	408729	408734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_021192	GCT	2	6	408743	408748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10035	NC_021192	GTG	2	6	408825	408830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_021192	CGT	2	6	408836	408841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10037	NC_021192	GCC	2	6	408879	408884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10038	NC_021192	GC	3	6	408992	408997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10039	NC_021192	GCT	2	6	409005	409010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10040	NC_021192	GCGGG	2	10	409011	409020	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
10041	NC_021192	GGC	2	6	409048	409053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10042	NC_021192	GCT	2	6	409086	409091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10043	NC_021192	TGG	2	6	409112	409117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_021192	CCAG	2	8	409127	409134	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10045	NC_021192	CGG	2	6	409185	409190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10046	NC_021192	G	7	7	409189	409195	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_021192	GACC	2	8	409205	409212	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10048	NC_021192	CAATGC	2	12	409237	409248	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10049	NC_021192	ATC	2	6	409283	409288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10050	NC_021192	TCA	2	6	409295	409300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10051	NC_021192	CG	3	6	409400	409405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10052	NC_021192	GTGC	2	8	409415	409422	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10053	NC_021192	GGT	2	6	409489	409494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_021192	GCG	2	6	409537	409542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690991
10055	NC_021192	CAG	2	6	409556	409561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690991
10056	NC_021192	ACAG	2	8	409570	409577	50 %	0 %	25 %	25 %	494690991
10057	NC_021192	GCA	2	6	409585	409590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690991
10058	NC_021192	CTG	2	6	409618	409623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690991
10059	NC_021192	ACG	2	6	409726	409731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690991
10060	NC_021192	CGA	2	6	409802	409807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690991
10061	NC_021192	TCGC	2	8	409810	409817	0 %	25 %	25 %	50 %	494690991
10062	NC_021192	CAG	2	6	409852	409857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690991
10063	NC_021192	CGGC	2	8	409889	409896	0 %	0 %	50 %	50 %	494690991
10064	NC_021192	GGC	2	6	409974	409979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690991
10065	NC_021192	GTC	2	6	410000	410005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690991
10066	NC_021192	GGT	2	6	410006	410011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690991
10067	NC_021192	GTT	2	6	410020	410025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494690991
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10069	NC_021192	TGC	2	6	410097	410102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10070	NC_021192	AGGCCA	2	12	410115	410126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10071	NC_021192	GCG	2	6	410131	410136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10072	NC_021192	TCG	2	6	410139	410144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10073	NC_021192	TCGT	2	8	410153	410160	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10074	NC_021192	GAT	2	6	410191	410196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_021192	CTG	2	6	410204	410209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10076	NC_021192	CGG	2	6	410280	410285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10077	NC_021192	CG	3	6	410439	410444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10078	NC_021192	GC	3	6	410529	410534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10079	NC_021192	TGGC	2	8	410560	410567	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10080	NC_021192	CGA	2	6	410612	410617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10081	NC_021192	CGA	2	6	410626	410631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10082	NC_021192	CGG	2	6	410704	410709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10083	NC_021192	GGGC	2	8	410740	410747	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10084	NC_021192	CGA	2	6	410783	410788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10085	NC_021192	CCA	2	6	410826	410831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10086	NC_021192	TTG	2	6	410832	410837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_021192	CGT	3	9	410850	410858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10088	NC_021192	GCT	2	6	410890	410895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10089	NC_021192	CCG	2	6	410901	410906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10090	NC_021192	GGT	2	6	410929	410934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_021192	GCT	2	6	410969	410974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10092	NC_021192	CGG	2	6	410996	411001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10093	NC_021192	CAT	2	6	411020	411025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10094	NC_021192	CG	3	6	411039	411044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10095	NC_021192	ACG	2	6	411088	411093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690992
10096	NC_021192	GGT	2	6	411143	411148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690992
10097	NC_021192	CTT	2	6	411162	411167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494690992
10098	NC_021192	CG	3	6	411176	411181	0 %	0 %	50 %	50 %	494690992
10099	NC_021192	CTG	2	6	411249	411254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690992
10100	NC_021192	GGC	2	6	411368	411373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690992
10101	NC_021192	GCC	2	6	411399	411404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690992
10102	NC_021192	CTG	2	6	411408	411413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690992
10103	NC_021192	TGG	2	6	411427	411432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690992
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10105	NC_021192	GAA	2	6	411597	411602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	494690992
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10107	NC_021192	CAT	2	6	411674	411679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494690992
10108	NC_021192	CGG	2	6	411680	411685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690992
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10110	NC_021192	CG	3	6	411747	411752	0 %	0 %	50 %	50 %	494690993
10111	NC_021192	GCG	2	6	411788	411793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690993
10112	NC_021192	CG	3	6	411830	411835	0 %	0 %	50 %	50 %	494690993
10113	NC_021192	TGG	2	6	411857	411862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690993
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10116	NC_021192	TGG	2	6	411924	411929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690993
10117	NC_021192	CAACG	2	10	411933	411942	40 %	0 %	20 %	40 %	494690993
10118	NC_021192	GTT	2	6	412079	412084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494690993
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10120	NC_021192	GGTGG	2	10	412160	412169	0 %	20 %	80 %	0 %	494690993
10121	NC_021192	GCC	2	6	412201	412206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690993
10122	NC_021192	GCCG	2	8	412365	412372	0 %	0 %	50 %	50 %	494690993
10123	NC_021192	GTC	2	6	412393	412398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690993
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10125	NC_021192	CGG	2	6	412423	412428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690993
10126	NC_021192	CGT	2	6	412499	412504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494690993
10127	NC_021192	GGT	2	6	412505	412510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690993
10128	NC_021192	GCC	2	6	412536	412541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690993
10129	NC_021192	GCC	2	6	412548	412553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494690993
10130	NC_021192	CG	3	6	412623	412628	0 %	0 %	50 %	50 %	494690993
10131	NC_021192	GTT	2	6	412690	412695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494690993
10132	NC_021192	GGT	2	6	412740	412745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690993
10133	NC_021192	GGT	2	6	412808	412813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494690993
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10147	NC_021192	ATG	2	6	413520	413525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494690993
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10150	NC_021192	TCCG	2	8	413637	413644	0 %	25 %	25 %	50 %	494690994
10151	NC_021192	GCG	2	6	413678	413683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494690994
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10159	NC_021192	CCA	2	6	413902	413907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690994
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10191	NC_021192	ATTG	2	8	415152	415159	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10192	NC_021192	GCC	2	6	415180	415185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10193	NC_021192	AGG	2	6	415212	415217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10200	NC_021192	GC	3	6	415660	415665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10201	NC_021192	TTC	2	6	415728	415733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10202	NC_021192	TGG	2	6	415798	415803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10203	NC_021192	CA	3	6	415824	415829	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10204	NC_021192	TGC	2	6	415882	415887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10206	NC_021192	TGACCA	2	12	415904	415915	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10207	NC_021192	GAC	2	6	415942	415947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690996
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10210	NC_021192	CATG	2	8	416137	416144	25 %	25 %	25 %	25 %	494690996
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10214	NC_021192	ACGGT	2	10	416437	416446	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10215	NC_021192	GA	3	6	416482	416487	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10216	NC_021192	CGA	2	6	416581	416586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10217	NC_021192	TGA	2	6	416682	416687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10218	NC_021192	TCC	2	6	416688	416693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10219	NC_021192	GC	3	6	416703	416708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10220	NC_021192	CTG	2	6	416738	416743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10221	NC_021192	CGG	2	6	416841	416846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10222	NC_021192	TCA	2	6	416850	416855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10223	NC_021192	GGTG	2	8	416943	416950	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10224	NC_021192	GAG	2	6	417032	417037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10225	NC_021192	CGA	2	6	417055	417060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10226	NC_021192	GGC	2	6	417076	417081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10227	NC_021192	CCT	2	6	417096	417101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10228	NC_021192	GCT	2	6	417139	417144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10229	NC_021192	CCG	2	6	417366	417371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10230	NC_021192	TCA	2	6	417398	417403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10231	NC_021192	AAG	2	6	417414	417419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10232	NC_021192	AGG	2	6	417432	417437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10233	NC_021192	ACC	2	6	417475	417480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10234	NC_021192	CGT	2	6	417486	417491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10235	NC_021192	GTC	3	9	417517	417525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10236	NC_021192	ACC	2	6	417547	417552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10237	NC_021192	TGA	2	6	417726	417731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494690997
10238	NC_021192	ACG	2	6	417788	417793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690997
10239	NC_021192	CCA	2	6	417825	417830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494690997
10240	NC_021192	TGC	2	6	417861	417866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10241	NC_021192	AGC	2	6	417927	417932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10242	NC_021192	GTG	2	6	417954	417959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10243	NC_021192	CTG	2	6	417977	417982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10244	NC_021192	ACC	2	6	418029	418034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10245	NC_021192	CGG	2	6	418036	418041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10246	NC_021192	CGA	2	6	418042	418047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10247	NC_021192	GTC	2	6	418061	418066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10248	NC_021192	GCC	2	6	418146	418151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10249	NC_021192	AGTC	2	8	418179	418186	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10250	NC_021192	GTT	2	6	418235	418240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10251	NC_021192	AGC	2	6	418249	418254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494690998
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10253	NC_021192	GATC	2	8	418351	418358	25 %	25 %	25 %	25 %	494690998
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10499	NC_021192	TGCCGA	2	12	431224	431235	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10500	NC_021192	GCC	2	6	431287	431292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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