MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 108642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
102501	NC_021192	GAT	2	6	4110957	4110962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494694103
102502	NC_021192	CGG	2	6	4110973	4110978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694103
102503	NC_021192	ACC	2	6	4111009	4111014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102504	NC_021192	ACGCC	2	10	4111035	4111044	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
102505	NC_021192	GCC	2	6	4111072	4111077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102506	NC_021192	CGG	2	6	4111115	4111120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694104
102507	NC_021192	AAC	2	6	4111123	4111128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494694104
102508	NC_021192	GAA	2	6	4111227	4111232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	494694104
102509	NC_021192	TCG	2	6	4111261	4111266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694104
102510	NC_021192	TGACC	2	10	4111280	4111289	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
102511	NC_021192	CCGTC	2	10	4111333	4111342	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
102512	NC_021192	CCT	2	6	4111359	4111364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	494694105
102513	NC_021192	CGC	2	6	4111368	4111373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494694105
102514	NC_021192	CCA	2	6	4111396	4111401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494694105
102515	NC_021192	CCG	2	6	4111483	4111488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494694105
102516	NC_021192	GTC	2	6	4111568	4111573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694105
102517	NC_021192	CAG	2	6	4111577	4111582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694105
102518	NC_021192	CGG	3	9	4111627	4111635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694105
102519	NC_021192	AGGTGA	2	12	4111654	4111665	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	494694105
102520	NC_021192	GCA	2	6	4111702	4111707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694105
102521	NC_021192	CGTCGG	2	12	4111723	4111734	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	494694105
102522	NC_021192	CGA	2	6	4111783	4111788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694105
102523	NC_021192	GATC	2	8	4111859	4111866	25 %	25 %	25 %	25 %	494694105
102524	NC_021192	ACG	2	6	4111872	4111877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694105
102525	NC_021192	ACG	2	6	4111897	4111902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694105
102526	NC_021192	GGC	2	6	4111927	4111932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694105
102527	NC_021192	CGCAG	2	10	4111945	4111954	20 %	0 %	40 %	40 %	494694105
102528	NC_021192	GCC	2	6	4111977	4111982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494694105
102529	NC_021192	GCG	2	6	4112103	4112108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694105
102530	NC_021192	CGG	2	6	4112119	4112124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694105
102531	NC_021192	GCC	2	6	4112135	4112140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494694105
102532	NC_021192	CGT	2	6	4112150	4112155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494694105
102533	NC_021192	CCA	2	6	4112194	4112199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494694105
102534	NC_021192	CTC	2	6	4112213	4112218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	494694105
102535	NC_021192	GCC	2	6	4112233	4112238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494694105
102536	NC_021192	GAT	2	6	4112252	4112257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494694105
102537	NC_021192	GGT	2	6	4112279	4112284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494694105
102538	NC_021192	GC	3	6	4112323	4112328	0 %	0 %	50 %	50 %	494694105
102539	NC_021192	ATGGCC	2	12	4112340	4112351	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	494694105
102540	NC_021192	CGG	2	6	4112377	4112382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694105
102541	NC_021192	AGC	2	6	4112385	4112390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102542	NC_021192	GGC	3	9	4112406	4112414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102543	NC_021192	CTG	2	6	4112426	4112431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102544	NC_021192	CAG	2	6	4112441	4112446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102545	NC_021192	GTC	2	6	4112447	4112452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102546	NC_021192	GGT	2	6	4112453	4112458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102547	NC_021192	GAC	5	15	4112474	4112488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102548	NC_021192	CTT	2	6	4112501	4112506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102549	NC_021192	CGA	2	6	4112512	4112517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102550	NC_021192	CCG	2	6	4112565	4112570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102551	NC_021192	ACG	2	6	4112580	4112585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102552	NC_021192	GC	3	6	4112639	4112644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102553	NC_021192	CCA	2	6	4112666	4112671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102554	NC_021192	CTC	3	9	4112742	4112750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102555	NC_021192	CGC	2	6	4112754	4112759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102556	NC_021192	CCG	2	6	4112912	4112917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102557	NC_021192	TCG	2	6	4112961	4112966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102558	NC_021192	GAG	2	6	4112997	4113002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102559	NC_021192	GCCCG	2	10	4113117	4113126	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
102560	NC_021192	CTG	2	6	4113146	4113151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102561	NC_021192	GCCA	2	8	4113194	4113201	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102562	NC_021192	CGACTT	2	12	4113205	4113216	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102563	NC_021192	AG	3	6	4113221	4113226	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102564	NC_021192	ATC	2	6	4113227	4113232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102565	NC_021192	CGA	2	6	4113250	4113255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102566	NC_021192	GC	3	6	4113431	4113436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102567	NC_021192	GCC	2	6	4113452	4113457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102568	NC_021192	ATC	2	6	4113582	4113587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102569	NC_021192	GAC	2	6	4113613	4113618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102570	NC_021192	TCGA	2	8	4113638	4113645	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102571	NC_021192	CCG	2	6	4113716	4113721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102572	NC_021192	CGC	2	6	4113723	4113728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102573	NC_021192	GATCG	2	10	4113757	4113766	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
102574	NC_021192	GGC	2	6	4113940	4113945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494694106
102575	NC_021192	CCA	2	6	4113975	4113980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494694106
102576	NC_021192	CAA	2	6	4113990	4113995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494694106
102577	NC_021192	GGATGC	2	12	4114017	4114028	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	494694106
102578	NC_021192	CGA	2	6	4114044	4114049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494694106
102579	NC_021192	CG	3	6	4114085	4114090	0 %	0 %	50 %	50 %	494694106
102580	NC_021192	GCG	2	6	4114145	4114150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102581	NC_021192	CAT	2	6	4114158	4114163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102582	NC_021192	GACC	2	8	4114167	4114174	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102583	NC_021192	CGG	2	6	4114191	4114196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102584	NC_021192	AGA	2	6	4114225	4114230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102585	NC_021192	CAG	2	6	4114243	4114248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102586	NC_021192	GAG	2	6	4114296	4114301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102587	NC_021192	CGA	3	9	4114355	4114363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102588	NC_021192	CGG	2	6	4114364	4114369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102589	NC_021192	CGA	2	6	4114526	4114531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102590	NC_021192	GCC	2	6	4114539	4114544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102591	NC_021192	CAC	2	6	4114720	4114725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102592	NC_021192	GC	3	6	4114735	4114740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102593	NC_021192	GTG	2	6	4114742	4114747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102594	NC_021192	CGG	2	6	4114749	4114754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102595	NC_021192	GGC	2	6	4114762	4114767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102596	NC_021192	AAC	2	6	4114842	4114847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102597	NC_021192	TCC	2	6	4114884	4114889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102598	NC_021192	CGA	2	6	4114903	4114908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102599	NC_021192	ACC	2	6	4115010	4115015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102600	NC_021192	ACG	2	6	4115034	4115039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102601	NC_021192	CGA	2	6	4115074	4115079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102602	NC_021192	GCC	2	6	4115106	4115111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102603	NC_021192	GCGG	2	8	4115137	4115144	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
102604	NC_021192	TCG	2	6	4115217	4115222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102605	NC_021192	CG	3	6	4115290	4115295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102606	NC_021192	CT	3	6	4115298	4115303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102607	NC_021192	CGT	2	6	4115338	4115343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102608	NC_021192	CGG	2	6	4115430	4115435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102609	NC_021192	TGGC	2	8	4115590	4115597	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102610	NC_021192	GGC	2	6	4115608	4115613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102611	NC_021192	GTGG	2	8	4115629	4115636	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
102612	NC_021192	CGGC	2	8	4115687	4115694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102613	NC_021192	TGA	2	6	4115721	4115726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102614	NC_021192	TGG	2	6	4115785	4115790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102615	NC_021192	CTGG	2	8	4115791	4115798	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102616	NC_021192	CGG	2	6	4115886	4115891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102617	NC_021192	CCG	2	6	4115895	4115900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102618	NC_021192	CGC	2	6	4115954	4115959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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102620	NC_021192	ACC	2	6	4116071	4116076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102621	NC_021192	GCC	2	6	4116095	4116100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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102623	NC_021192	CGG	2	6	4116157	4116162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102624	NC_021192	CGT	3	9	4116223	4116231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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102725	NC_021192	CCGCG	2	10	4120045	4120054	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
102726	NC_021192	TCG	2	6	4120120	4120125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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102728	NC_021192	ATC	2	6	4120140	4120145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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102730	NC_021192	ACG	2	6	4120219	4120224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102731	NC_021192	ATCG	2	8	4120226	4120233	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102732	NC_021192	GCC	2	6	4120234	4120239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102733	NC_021192	CGG	2	6	4120256	4120261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102734	NC_021192	CAAC	2	8	4120289	4120296	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102735	NC_021192	GCTGCG	2	12	4120333	4120344	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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102746	NC_021192	CA	3	6	4120829	4120834	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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102960	NC_021192	CGT	2	6	4129432	4129437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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102963	NC_021192	GC	3	6	4129677	4129682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102964	NC_021192	G	6	6	4129743	4129748	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
102965	NC_021192	GTCCG	2	10	4129777	4129786	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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102967	NC_021192	TCG	2	6	4129832	4129837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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102970	NC_021192	GCCGC	2	10	4129890	4129899	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
102971	NC_021192	TAC	2	6	4130081	4130086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102972	NC_021192	AC	3	6	4130085	4130090	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102973	NC_021192	CGA	2	6	4130104	4130109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102974	NC_021192	CG	3	6	4130151	4130156	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102975	NC_021192	CCG	2	6	4130220	4130225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102976	NC_021192	TTC	2	6	4130246	4130251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102977	NC_021192	GAC	2	6	4130281	4130286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102978	NC_021192	AGG	2	6	4130300	4130305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102979	NC_021192	CAC	2	6	4130317	4130322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102980	NC_021192	TGC	2	6	4130498	4130503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102981	NC_021192	TGA	2	6	4130547	4130552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102982	NC_021192	CAG	2	6	4130605	4130610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102983	NC_021192	GTG	2	6	4130611	4130616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102984	NC_021192	GGT	2	6	4130640	4130645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102985	NC_021192	GTC	2	6	4130692	4130697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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102989	NC_021192	TCG	3	9	4130783	4130791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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103000	NC_021192	CCGG	2	8	4131345	4131352	0 %	0 %	50 %	50 %	494694123

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