MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 108642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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83002	NC_021192	GGCT	2	8	3354600	3354607	0 %	25 %	50 %	25 %	494693466
83003	NC_021192	TCG	2	6	3354610	3354615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693466
83004	NC_021192	GAT	2	6	3354616	3354621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494693466
83005	NC_021192	GC	3	6	3354630	3354635	0 %	0 %	50 %	50 %	494693466
83006	NC_021192	GTCC	2	8	3354649	3354656	0 %	25 %	25 %	50 %	494693466
83007	NC_021192	GC	4	8	3354670	3354677	0 %	0 %	50 %	50 %	494693466
83008	NC_021192	ACGA	2	8	3354679	3354686	50 %	0 %	25 %	25 %	494693466
83009	NC_021192	ACCGA	2	10	3354697	3354706	40 %	0 %	20 %	40 %	494693466
83010	NC_021192	AGA	2	6	3354710	3354715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	494693466
83011	NC_021192	ACC	2	6	3354742	3354747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494693466
83012	NC_021192	GCA	2	6	3354809	3354814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693466
83013	NC_021192	CAC	2	6	3354864	3354869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494693466
83014	NC_021192	GCA	2	6	3354923	3354928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693466
83015	NC_021192	CCA	2	6	3354929	3354934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494693466
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83017	NC_021192	CGC	2	6	3354980	3354985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83018	NC_021192	CG	3	6	3355036	3355041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83019	NC_021192	GCC	2	6	3355060	3355065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83020	NC_021192	ACCG	2	8	3355069	3355076	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83021	NC_021192	GAT	2	6	3355087	3355092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83022	NC_021192	GCAG	2	8	3355119	3355126	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83023	NC_021192	CG	3	6	3355175	3355180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83024	NC_021192	CTG	2	6	3355215	3355220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83025	NC_021192	GGAG	2	8	3355229	3355236	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
83026	NC_021192	GTC	2	6	3355240	3355245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83027	NC_021192	CCGG	2	8	3355269	3355276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83028	NC_021192	GCG	3	9	3355295	3355303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83029	NC_021192	AC	3	6	3355385	3355390	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83030	NC_021192	GCCC	2	8	3355437	3355444	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
83031	NC_021192	CAA	2	6	3355449	3355454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83032	NC_021192	CAC	2	6	3355455	3355460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83033	NC_021192	CAC	2	6	3355485	3355490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83034	NC_021192	CCA	2	6	3355505	3355510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83035	NC_021192	ACG	2	6	3355511	3355516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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83037	NC_021192	CCA	2	6	3355605	3355610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83038	NC_021192	GTC	3	9	3355621	3355629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83039	NC_021192	CAG	2	6	3355636	3355641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83040	NC_021192	GCC	2	6	3355689	3355694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83041	NC_021192	GCC	2	6	3355746	3355751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494693467
83042	NC_021192	C	6	6	3355968	3355973	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
83043	NC_021192	CAC	2	6	3356080	3356085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83044	NC_021192	TTG	2	6	3356126	3356131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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83046	NC_021192	GTA	2	6	3356257	3356262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83047	NC_021192	CCA	2	6	3356370	3356375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83048	NC_021192	CCGG	2	8	3356397	3356404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83049	NC_021192	CCG	2	6	3356415	3356420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83050	NC_021192	CG	4	8	3356424	3356431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83051	NC_021192	GGC	2	6	3356440	3356445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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83054	NC_021192	GC	3	6	3356522	3356527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83055	NC_021192	TC	3	6	3356612	3356617	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83056	NC_021192	CGGC	2	8	3356662	3356669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83057	NC_021192	GGC	2	6	3356691	3356696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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83059	NC_021192	GGC	2	6	3356805	3356810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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83062	NC_021192	GCG	2	6	3356837	3356842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83063	NC_021192	CGA	3	9	3356861	3356869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83064	NC_021192	CGG	2	6	3356870	3356875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83065	NC_021192	GCGG	2	8	3356891	3356898	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
83066	NC_021192	CTT	2	6	3356918	3356923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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83075	NC_021192	GCC	2	6	3357331	3357336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83076	NC_021192	TCGA	2	8	3357338	3357345	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83077	NC_021192	GGTG	2	8	3357357	3357364	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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83089	NC_021192	GGC	2	6	3357830	3357835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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83092	NC_021192	CGG	2	6	3357976	3357981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83093	NC_021192	GCCT	2	8	3358024	3358031	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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83100	NC_021192	TCGC	2	8	3358278	3358285	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83101	NC_021192	ACG	2	6	3358305	3358310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83102	NC_021192	GCAA	2	8	3358360	3358367	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83103	NC_021192	CGT	2	6	3358405	3358410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83104	NC_021192	TTCG	2	8	3358454	3358461	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83105	NC_021192	CGA	2	6	3358582	3358587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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83108	NC_021192	CGG	2	6	3358680	3358685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83109	NC_021192	CAT	2	6	3358689	3358694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83110	NC_021192	GCGG	2	8	3358710	3358717	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
83111	NC_021192	CGG	2	6	3358760	3358765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83112	NC_021192	CAC	2	6	3358767	3358772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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83114	NC_021192	CTGG	2	8	3358909	3358916	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83115	NC_021192	CAC	2	6	3358919	3358924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83116	NC_021192	GCG	2	6	3358966	3358971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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83120	NC_021192	CGA	2	6	3359068	3359073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83121	NC_021192	GC	3	6	3359122	3359127	0 %	0 %	50 %	50 %	494693468
83122	NC_021192	GCC	2	6	3359135	3359140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494693468
83123	NC_021192	CG	3	6	3359240	3359245	0 %	0 %	50 %	50 %	494693468
83124	NC_021192	GGC	2	6	3359267	3359272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693468
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83126	NC_021192	CTG	2	6	3359287	3359292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693468
83127	NC_021192	GCT	2	6	3359322	3359327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693468
83128	NC_021192	GCT	2	6	3359358	3359363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83129	NC_021192	GTCA	2	8	3359502	3359509	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83130	NC_021192	CGT	2	6	3359524	3359529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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83227	NC_021192	GCC	2	6	3363709	3363714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83228	NC_021192	CACAC	2	10	3363745	3363754	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
83229	NC_021192	ACACG	2	10	3363802	3363811	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
83230	NC_021192	CGCC	2	8	3363864	3363871	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
83231	NC_021192	GTG	2	6	3363886	3363891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83232	NC_021192	TCCC	2	8	3363952	3363959	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
83233	NC_021192	CGGC	2	8	3363969	3363976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83234	NC_021192	CCG	2	6	3363977	3363982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83235	NC_021192	GAAA	2	8	3364021	3364028	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83236	NC_021192	GCC	2	6	3364066	3364071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83237	NC_021192	CGC	2	6	3364160	3364165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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83239	NC_021192	CCA	2	6	3364194	3364199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83240	NC_021192	CCGG	2	8	3364294	3364301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83241	NC_021192	ACA	2	6	3364328	3364333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83242	NC_021192	CGGC	2	8	3364335	3364342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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83244	NC_021192	GCG	2	6	3364370	3364375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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83482	NC_021192	AAC	2	6	3373477	3373482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494693481
83483	NC_021192	CAA	2	6	3373542	3373547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494693481
83484	NC_021192	CAG	2	6	3373551	3373556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693481
83485	NC_021192	GAA	2	6	3373566	3373571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	494693481
83486	NC_021192	ATG	2	6	3373597	3373602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494693481
83487	NC_021192	ATC	2	6	3373606	3373611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494693481
83488	NC_021192	GGT	3	9	3373620	3373628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494693481
83489	NC_021192	CTC	2	6	3373729	3373734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	494693481
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83491	NC_021192	CGG	2	6	3373846	3373851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693481
83492	NC_021192	CG	4	8	3373873	3373880	0 %	0 %	50 %	50 %	494693481
83493	NC_021192	CGG	2	6	3373929	3373934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693481
83494	NC_021192	GAT	2	6	3374031	3374036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494693481
83495	NC_021192	CAC	2	6	3374043	3374048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494693481
83496	NC_021192	CGCCGG	2	12	3374055	3374066	0 %	0 %	50 %	50 %	494693481
83497	NC_021192	GC	3	6	3374102	3374107	0 %	0 %	50 %	50 %	494693481
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83499	NC_021192	CCGAC	2	10	3374137	3374146	20 %	0 %	20 %	60 %	494693481
83500	NC_021192	GCG	2	6	3374158	3374163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693481

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