MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 108642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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82002	NC_021192	GCC	2	6	3315057	3315062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494693428
82003	NC_021192	GCA	2	6	3315082	3315087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693428
82004	NC_021192	GTC	2	6	3315185	3315190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693429
82005	NC_021192	TCT	2	6	3315196	3315201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494693429
82006	NC_021192	ATTC	2	8	3315250	3315257	25 %	50 %	0 %	25 %	494693429
82007	NC_021192	TGC	2	6	3315353	3315358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693429
82008	NC_021192	GGC	2	6	3315438	3315443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693429
82009	NC_021192	CTG	2	6	3315463	3315468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693429
82010	NC_021192	GGC	2	6	3315491	3315496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693429
82011	NC_021192	CGA	2	6	3315531	3315536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693429
82012	NC_021192	CTG	2	6	3315541	3315546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693429
82013	NC_021192	GCG	2	6	3315556	3315561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693429
82014	NC_021192	CGC	2	6	3315609	3315614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494693429
82015	NC_021192	CGC	2	6	3315743	3315748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82016	NC_021192	TGGCG	2	10	3315848	3315857	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
82017	NC_021192	CGT	2	6	3315890	3315895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82018	NC_021192	GCC	3	9	3315937	3315945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82019	NC_021192	GCC	2	6	3315960	3315965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82020	NC_021192	CTG	2	6	3315969	3315974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82021	NC_021192	CGG	2	6	3315979	3315984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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82024	NC_021192	GGA	2	6	3316139	3316144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82025	NC_021192	GCG	2	6	3316217	3316222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82026	NC_021192	TCCAG	2	10	3316267	3316276	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
82027	NC_021192	GCAA	2	8	3316305	3316312	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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82038	NC_021192	GGCG	2	8	3316797	3316804	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
82039	NC_021192	CA	4	8	3316861	3316868	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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82043	NC_021192	AC	3	6	3317118	3317123	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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82052	NC_021192	GGTG	2	8	3317597	3317604	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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82057	NC_021192	CA	3	6	3317942	3317947	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82058	NC_021192	GCG	2	6	3317967	3317972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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82123	NC_021192	ACC	2	6	3321125	3321130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82124	NC_021192	GGTC	2	8	3321137	3321144	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82125	NC_021192	GCT	2	6	3321177	3321182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82126	NC_021192	CGTCC	2	10	3321239	3321248	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
82127	NC_021192	CGC	2	6	3321256	3321261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82128	NC_021192	GCC	2	6	3321263	3321268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82129	NC_021192	GCG	2	6	3321269	3321274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82130	NC_021192	GTT	2	6	3321277	3321282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82131	NC_021192	CGG	2	6	3321291	3321296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82132	NC_021192	TGC	2	6	3321321	3321326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82133	NC_021192	GGC	2	6	3321454	3321459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82134	NC_021192	CAC	2	6	3321490	3321495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82135	NC_021192	GGC	2	6	3321496	3321501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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82137	NC_021192	GCT	2	6	3321568	3321573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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82139	NC_021192	TGG	2	6	3321626	3321631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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82142	NC_021192	GTCGG	2	10	3321748	3321757	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
82143	NC_021192	GC	3	6	3321782	3321787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82144	NC_021192	GCC	2	6	3321845	3321850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82145	NC_021192	CCG	2	6	3321870	3321875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82146	NC_021192	TGA	2	6	3321888	3321893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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82150	NC_021192	CCG	2	6	3322198	3322203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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82152	NC_021192	GCCGG	2	10	3322295	3322304	0 %	0 %	60 %	40 %	494693432
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82182	NC_021192	GCCC	2	8	3323315	3323322	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
82183	NC_021192	ACC	3	9	3323364	3323372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494693434
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82225	NC_021192	CG	3	6	3324732	3324737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82226	NC_021192	GCC	2	6	3324753	3324758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82227	NC_021192	CGGC	2	8	3324790	3324797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82228	NC_021192	TCGG	2	8	3324828	3324835	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82229	NC_021192	GGC	2	6	3324852	3324857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82230	NC_021192	CG	3	6	3324900	3324905	0 %	0 %	50 %	50 %	494693436
82231	NC_021192	TGG	2	6	3324908	3324913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494693436
82232	NC_021192	GTC	2	6	3324956	3324961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693436
82233	NC_021192	CACC	2	8	3324972	3324979	25 %	0 %	0 %	75 %	494693436
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82238	NC_021192	GC	4	8	3325159	3325166	0 %	0 %	50 %	50 %	494693436
82239	NC_021192	CGG	2	6	3325181	3325186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693436
82240	NC_021192	ACGCC	2	10	3325188	3325197	20 %	0 %	20 %	60 %	494693436
82241	NC_021192	CGA	2	6	3325251	3325256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693436
82242	NC_021192	GCC	2	6	3325262	3325267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494693436
82243	NC_021192	GTG	2	6	3325372	3325377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494693436
82244	NC_021192	CGC	2	6	3325395	3325400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494693436
82245	NC_021192	CGG	2	6	3325431	3325436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693436
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82249	NC_021192	ATC	2	6	3325673	3325678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494693436
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82251	NC_021192	GGC	2	6	3325699	3325704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693436
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82258	NC_021192	CGA	2	6	3326209	3326214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693436
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82278	NC_021192	CGG	2	6	3326838	3326843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693437
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82281	NC_021192	ACA	2	6	3327027	3327032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	494693437
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82289	NC_021192	CGGCA	2	10	3327259	3327268	20 %	0 %	40 %	40 %	494693437
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82301	NC_021192	CGA	2	6	3327761	3327766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693437
82302	NC_021192	TGC	2	6	3327775	3327780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693437
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82305	NC_021192	GTGCG	2	10	3327816	3327825	0 %	20 %	60 %	20 %	494693437
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82308	NC_021192	GTG	2	6	3327981	3327986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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82311	NC_021192	GTG	2	6	3328244	3328249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494693438
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82331	NC_021192	CGT	2	6	3329145	3329150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693440
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82344	NC_021192	GCA	2	6	3329802	3329807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693440
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82346	NC_021192	TGA	2	6	3329939	3329944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494693440
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82350	NC_021192	TTG	2	6	3330009	3330014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494693440
82351	NC_021192	GCT	2	6	3330016	3330021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693440
82352	NC_021192	CGG	2	6	3330049	3330054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693440
82353	NC_021192	GCC	2	6	3330143	3330148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82354	NC_021192	TCA	2	6	3330210	3330215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82355	NC_021192	GTC	2	6	3330234	3330239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82356	NC_021192	GGC	2	6	3330261	3330266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82357	NC_021192	CCA	2	6	3330296	3330301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82358	NC_021192	CGA	2	6	3330328	3330333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82359	NC_021192	CAC	2	6	3330344	3330349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82360	NC_021192	TGA	2	6	3330379	3330384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82361	NC_021192	CGA	2	6	3330388	3330393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82362	NC_021192	CA	3	6	3330422	3330427	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82363	NC_021192	GGTC	2	8	3330484	3330491	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82364	NC_021192	GTT	2	6	3330551	3330556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82365	NC_021192	TGGT	2	8	3330609	3330616	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82366	NC_021192	CCGTCG	2	12	3330630	3330641	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
82367	NC_021192	GCC	2	6	3330687	3330692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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82369	NC_021192	CAGC	2	8	3330731	3330738	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82370	NC_021192	TGA	2	6	3330757	3330762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82371	NC_021192	CGA	2	6	3330799	3330804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82372	NC_021192	CCGGC	2	10	3330814	3330823	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
82373	NC_021192	CCA	2	6	3330926	3330931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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82378	NC_021192	GTC	2	6	3331122	3331127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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82381	NC_021192	GCC	2	6	3331171	3331176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82382	NC_021192	CGG	2	6	3331178	3331183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82383	NC_021192	CCGTG	2	10	3331187	3331196	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
82384	NC_021192	CGC	2	6	3331241	3331246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82385	NC_021192	GTG	2	6	3331258	3331263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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82388	NC_021192	CGC	3	9	3331328	3331336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82389	NC_021192	GC	3	6	3331356	3331361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82390	NC_021192	GGC	2	6	3331377	3331382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82391	NC_021192	CGG	2	6	3331443	3331448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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82424	NC_021192	GCC	2	6	3333050	3333055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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82462	NC_021192	CATGCG	2	12	3334739	3334750	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	494693444
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82468	NC_021192	CGA	2	6	3334882	3334887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693444
82469	NC_021192	ACG	2	6	3334928	3334933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693444
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82471	NC_021192	GTC	2	6	3335005	3335010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693444
82472	NC_021192	GGC	2	6	3335142	3335147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693444
82473	NC_021192	CGT	2	6	3335150	3335155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693444
82474	NC_021192	GC	3	6	3335182	3335187	0 %	0 %	50 %	50 %	494693444
82475	NC_021192	TTG	2	6	3335206	3335211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494693444
82476	NC_021192	CCT	2	6	3335213	3335218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	494693444
82477	NC_021192	TGC	2	6	3335253	3335258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693444
82478	NC_021192	C	6	6	3335299	3335304	0 %	0 %	0 %	100 %	494693444
82479	NC_021192	CTC	2	6	3335313	3335318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	494693444
82480	NC_021192	CAC	2	6	3335410	3335415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494693445
82481	NC_021192	GGT	2	6	3335424	3335429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494693445
82482	NC_021192	TCG	2	6	3335447	3335452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693445
82483	NC_021192	ATCAC	2	10	3335465	3335474	40 %	20 %	0 %	40 %	494693445
82484	NC_021192	CAT	2	6	3335475	3335480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494693445
82485	NC_021192	TCT	2	6	3335495	3335500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494693445
82486	NC_021192	CGC	2	6	3335531	3335536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494693445
82487	NC_021192	GCC	2	6	3335561	3335566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494693445
82488	NC_021192	CGA	2	6	3335585	3335590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693445
82489	NC_021192	CAC	2	6	3335649	3335654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494693446
82490	NC_021192	CGC	2	6	3335660	3335665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494693446
82491	NC_021192	GTC	2	6	3335706	3335711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693446
82492	NC_021192	CGA	2	6	3336110	3336115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82493	NC_021192	CGACG	2	10	3336123	3336132	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
82494	NC_021192	ACT	2	6	3336163	3336168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82495	NC_021192	CAC	2	6	3336173	3336178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82496	NC_021192	CGC	2	6	3336194	3336199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82497	NC_021192	CG	3	6	3336237	3336242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82498	NC_021192	CCA	2	6	3336244	3336249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82499	NC_021192	TCG	2	6	3336269	3336274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82500	NC_021192	TGA	2	6	3336290	3336295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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