MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 108642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
73001	NC_021192	CGT	2	6	2946439	2946444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73002	NC_021192	CGC	2	6	2946445	2946450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73003	NC_021192	CAC	2	6	2946467	2946472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73004	NC_021192	CCGGC	2	10	2946483	2946492	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
73005	NC_021192	GCG	2	6	2946494	2946499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73006	NC_021192	CCT	2	6	2946505	2946510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	494693100
73007	NC_021192	CGCGGC	2	12	2946517	2946528	0 %	0 %	50 %	50 %	494693100
73008	NC_021192	GCT	2	6	2946532	2946537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693100
73009	NC_021192	CCGC	2	8	2946538	2946545	0 %	0 %	25 %	75 %	494693100
73010	NC_021192	GGCGT	2	10	2946554	2946563	0 %	20 %	60 %	20 %	494693100
73011	NC_021192	GAG	2	6	2946620	2946625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	494693100
73012	NC_021192	TCG	2	6	2946648	2946653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693100
73013	NC_021192	TGT	2	6	2946690	2946695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	494693100
73014	NC_021192	GA	3	6	2946707	2946712	50 %	0 %	50 %	0 %	494693100
73015	NC_021192	CG	3	6	2946775	2946780	0 %	0 %	50 %	50 %	494693100
73016	NC_021192	GC	3	6	2946795	2946800	0 %	0 %	50 %	50 %	494693100
73017	NC_021192	GCC	2	6	2946842	2946847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494693100
73018	NC_021192	CGG	2	6	2946874	2946879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693100
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73020	NC_021192	TCG	2	6	2946946	2946951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693100
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73022	NC_021192	CGGCC	2	10	2947014	2947023	0 %	0 %	40 %	60 %	494693100
73023	NC_021192	CGT	2	6	2947044	2947049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693100
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73035	NC_021192	CG	4	8	2947496	2947503	0 %	0 %	50 %	50 %	494693101
73036	NC_021192	TCG	2	6	2947520	2947525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693101
73037	NC_021192	CGT	2	6	2947577	2947582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693101
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73050	NC_021192	ACCC	2	8	2948005	2948012	25 %	0 %	0 %	75 %	494693101
73051	NC_021192	C	7	7	2948010	2948016	0 %	0 %	0 %	100 %	494693101
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73054	NC_021192	GCT	2	6	2948107	2948112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693101
73055	NC_021192	TCG	2	6	2948115	2948120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693101
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73062	NC_021192	CGGC	2	8	2948260	2948267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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73065	NC_021192	TGGC	3	12	2948323	2948334	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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73072	NC_021192	GCG	2	6	2948593	2948598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73073	NC_021192	GCC	2	6	2948619	2948624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73074	NC_021192	CGG	2	6	2948639	2948644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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73089	NC_021192	CGC	2	6	2949111	2949116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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73094	NC_021192	GCCC	2	8	2949306	2949313	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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73097	NC_021192	CGGT	2	8	2949359	2949366	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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73108	NC_021192	A	6	6	2949872	2949877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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73112	NC_021192	TCGGG	2	10	2950056	2950065	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
73113	NC_021192	CCG	2	6	2950107	2950112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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73120	NC_021192	CGG	3	9	2950325	2950333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73121	NC_021192	ACC	2	6	2950364	2950369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73122	NC_021192	TCG	2	6	2950450	2950455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693103
73123	NC_021192	CGG	2	6	2950459	2950464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693103
73124	NC_021192	CGG	2	6	2950476	2950481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693103
73125	NC_021192	CAC	2	6	2950490	2950495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494693103
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73128	NC_021192	ATC	2	6	2950585	2950590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494693103
73129	NC_021192	CGGT	2	8	2950603	2950610	0 %	25 %	50 %	25 %	494693103
73130	NC_021192	CGG	2	6	2950625	2950630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693103
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73133	NC_021192	GC	3	6	2950743	2950748	0 %	0 %	50 %	50 %	494693103
73134	NC_021192	GGT	2	6	2950848	2950853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494693103
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73141	NC_021192	GCG	2	6	2951156	2951161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73142	NC_021192	GGC	2	6	2951182	2951187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73143	NC_021192	GCG	2	6	2951203	2951208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73144	NC_021192	GCTGT	2	10	2951212	2951221	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
73145	NC_021192	CGGC	2	8	2951317	2951324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73146	NC_021192	CAG	2	6	2951403	2951408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73147	NC_021192	CCGG	2	8	2951415	2951422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73148	NC_021192	GGT	2	6	2951441	2951446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73149	NC_021192	GTC	2	6	2951508	2951513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73150	NC_021192	C	6	6	2951528	2951533	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
73151	NC_021192	CGC	2	6	2951544	2951549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73152	NC_021192	GCG	2	6	2951585	2951590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73153	NC_021192	GCCA	2	8	2951619	2951626	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73154	NC_021192	GCC	2	6	2951628	2951633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73155	NC_021192	TCG	2	6	2951686	2951691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73156	NC_021192	CGG	2	6	2951719	2951724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693104
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73159	NC_021192	CGG	2	6	2951842	2951847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693104
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73162	NC_021192	CGG	2	6	2951869	2951874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693104
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73172	NC_021192	ACC	2	6	2952474	2952479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73173	NC_021192	C	6	6	2952523	2952528	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
73174	NC_021192	GCCTG	2	10	2952556	2952565	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
73175	NC_021192	TGC	2	6	2952567	2952572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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73177	NC_021192	CGC	2	6	2952632	2952637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73178	NC_021192	CAC	2	6	2952667	2952672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73179	NC_021192	CGG	2	6	2952719	2952724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693106
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73182	NC_021192	GATG	2	8	2952887	2952894	25 %	25 %	50 %	0 %	494693106
73183	NC_021192	CGACTC	2	12	2953045	2953056	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	494693106
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73188	NC_021192	GCC	2	6	2953193	2953198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73189	NC_021192	TGT	2	6	2953230	2953235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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73193	NC_021192	ACC	2	6	2953426	2953431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73194	NC_021192	TAC	2	6	2953452	2953457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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73197	NC_021192	GCG	2	6	2953577	2953582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73198	NC_021192	CAT	2	6	2953583	2953588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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73200	NC_021192	AAG	2	6	2953597	2953602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73201	NC_021192	TGC	2	6	2953643	2953648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73202	NC_021192	CGC	2	6	2953652	2953657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73203	NC_021192	CA	3	6	2953729	2953734	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73204	NC_021192	GC	3	6	2953756	2953761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73205	NC_021192	GAC	3	9	2953777	2953785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73206	NC_021192	AC	3	6	2953822	2953827	50 %	0 %	0 %	50 %	494693107
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73210	NC_021192	GT	3	6	2953941	2953946	0 %	50 %	50 %	0 %	494693107
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73213	NC_021192	CGT	2	6	2954102	2954107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693107
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73219	NC_021192	GCG	4	12	2954329	2954340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693107
73220	NC_021192	G	7	7	2954355	2954361	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
73221	NC_021192	AGT	2	6	2954400	2954405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73222	NC_021192	AGC	2	6	2954495	2954500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693108
73223	NC_021192	CTG	2	6	2954535	2954540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693108
73224	NC_021192	GCT	2	6	2954546	2954551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693108
73225	NC_021192	CGC	2	6	2954564	2954569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494693108
73226	NC_021192	GCGGG	2	10	2954599	2954608	0 %	0 %	80 %	20 %	494693108
73227	NC_021192	GCT	2	6	2954738	2954743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693108
73228	NC_021192	GTG	2	6	2954781	2954786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494693108
73229	NC_021192	CTG	2	6	2954799	2954804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693108
73230	NC_021192	CGA	2	6	2954897	2954902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693108
73231	NC_021192	CCCG	2	8	2954923	2954930	0 %	0 %	25 %	75 %	494693108
73232	NC_021192	CGC	2	6	2954957	2954962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494693108
73233	NC_021192	AGGC	2	8	2954989	2954996	25 %	0 %	50 %	25 %	494693108
73234	NC_021192	CGT	2	6	2954999	2955004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693108
73235	NC_021192	GA	3	6	2955052	2955057	50 %	0 %	50 %	0 %	494693108
73236	NC_021192	CCG	2	6	2955079	2955084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494693108
73237	NC_021192	GGCT	2	8	2955096	2955103	0 %	25 %	50 %	25 %	494693108
73238	NC_021192	TTC	2	6	2955108	2955113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	494693108
73239	NC_021192	TGG	2	6	2955178	2955183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494693108
73240	NC_021192	CACC	2	8	2955304	2955311	25 %	0 %	0 %	75 %	494693108
73241	NC_021192	CGA	2	6	2955329	2955334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693108
73242	NC_021192	TCA	2	6	2955337	2955342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494693108
73243	NC_021192	GCC	2	6	2955399	2955404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494693108
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73280	NC_021192	CCA	2	6	2956736	2956741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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73344	NC_021192	TCG	2	6	2959485	2959490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693112
73345	NC_021192	CTGG	2	8	2959505	2959512	0 %	25 %	50 %	25 %	494693112
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73347	NC_021192	GGCATG	2	12	2959569	2959580	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	494693112
73348	NC_021192	CGA	2	6	2959616	2959621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693112
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73350	NC_021192	CCA	2	6	2959692	2959697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73351	NC_021192	ACA	2	6	2959740	2959745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73352	NC_021192	CGC	2	6	2959750	2959755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73353	NC_021192	TCG	2	6	2959806	2959811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693113
73354	NC_021192	GCA	2	6	2959847	2959852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693113
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73357	NC_021192	GC	3	6	2959991	2959996	0 %	0 %	50 %	50 %	494693113
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73359	NC_021192	GCC	2	6	2960038	2960043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494693113
73360	NC_021192	CGG	2	6	2960061	2960066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693113
73361	NC_021192	GGC	2	6	2960076	2960081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494693113
73362	NC_021192	CAC	2	6	2960139	2960144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	494693113
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73365	NC_021192	TCA	2	6	2960246	2960251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494693113
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73369	NC_021192	CGC	3	9	2960390	2960398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73370	NC_021192	CGC	2	6	2960475	2960480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73371	NC_021192	CCG	2	6	2960483	2960488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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73374	NC_021192	GACACC	2	12	2960618	2960629	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73375	NC_021192	GCGG	2	8	2960653	2960660	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
73376	NC_021192	TTG	2	6	2960723	2960728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73377	NC_021192	TCCG	2	8	2960736	2960743	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73378	NC_021192	CGA	2	6	2960766	2960771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73379	NC_021192	GGCC	2	8	2960790	2960797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73380	NC_021192	TGC	2	6	2960811	2960816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73381	NC_021192	GCA	2	6	2960820	2960825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73382	NC_021192	GAC	2	6	2960833	2960838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73383	NC_021192	CGA	2	6	2960854	2960859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73384	NC_021192	CG	3	6	2960876	2960881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73385	NC_021192	C	6	6	2960954	2960959	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
73386	NC_021192	CTG	2	6	2960969	2960974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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73388	NC_021192	CTG	3	9	2961062	2961070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73389	NC_021192	CTG	2	6	2961185	2961190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73390	NC_021192	GTC	2	6	2961230	2961235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73391	NC_021192	GTG	2	6	2961237	2961242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73392	NC_021192	CGG	2	6	2961243	2961248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73393	NC_021192	GCT	2	6	2961305	2961310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73394	NC_021192	TGG	2	6	2961330	2961335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73395	NC_021192	CCG	2	6	2961336	2961341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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73397	NC_021192	CGT	3	9	2961352	2961360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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73472	NC_021192	GC	3	6	2964521	2964526	0 %	0 %	50 %	50 %	494693119
73473	NC_021192	GCC	2	6	2964575	2964580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494693119
73474	NC_021192	TCG	2	6	2964585	2964590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494693119
73475	NC_021192	GCA	2	6	2964592	2964597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494693119
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