MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium tuberculosis str. Haarlem/NITR202

Total Repeats: 108642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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65002	NC_021192	CAG	2	6	2626049	2626054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494692843
65003	NC_021192	GC	3	6	2626198	2626203	0 %	0 %	50 %	50 %	494692843
65004	NC_021192	CTGT	2	8	2626226	2626233	0 %	50 %	25 %	25 %	494692843
65005	NC_021192	CGA	2	6	2626245	2626250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494692843
65006	NC_021192	TGCC	2	8	2626280	2626287	0 %	25 %	25 %	50 %	494692843
65007	NC_021192	CGA	2	6	2626331	2626336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494692844
65008	NC_021192	GAT	2	6	2626481	2626486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494692844
65009	NC_021192	GGTG	2	8	2626552	2626559	0 %	25 %	75 %	0 %	494692844
65010	NC_021192	GTA	2	6	2626561	2626566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494692844
65011	NC_021192	GCGCG	2	10	2626570	2626579	0 %	0 %	60 %	40 %	494692844
65012	NC_021192	GGT	2	6	2626616	2626621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494692844
65013	NC_021192	TGA	2	6	2626666	2626671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	494692844
65014	NC_021192	GAA	2	6	2626727	2626732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	494692844
65015	NC_021192	GGT	2	6	2626826	2626831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494692844
65016	NC_021192	TGG	2	6	2626872	2626877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494692844
65017	NC_021192	TCGG	2	8	2626880	2626887	0 %	25 %	50 %	25 %	494692844
65018	NC_021192	CG	3	6	2626980	2626985	0 %	0 %	50 %	50 %	494692844
65019	NC_021192	GGT	2	6	2627000	2627005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494692844
65020	NC_021192	GTC	2	6	2627013	2627018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494692844
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65025	NC_021192	CGA	2	6	2627124	2627129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494692844
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65028	NC_021192	GGCC	2	8	2627196	2627203	0 %	0 %	50 %	50 %	494692844
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65030	NC_021192	CGG	2	6	2627509	2627514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65031	NC_021192	GGGCG	2	10	2627523	2627532	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
65032	NC_021192	GCG	2	6	2627540	2627545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65033	NC_021192	TGC	2	6	2627585	2627590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65034	NC_021192	CG	3	6	2627611	2627616	0 %	0 %	50 %	50 %	494692845
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65043	NC_021192	GC	3	6	2627883	2627888	0 %	0 %	50 %	50 %	494692845
65044	NC_021192	GTC	2	6	2627894	2627899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494692845
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65051	NC_021192	CGG	2	6	2628052	2628057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494692846
65052	NC_021192	CGG	2	6	2628061	2628066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494692846
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65055	NC_021192	CCGCGG	2	12	2628199	2628210	0 %	0 %	50 %	50 %	494692846
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65058	NC_021192	CCG	2	6	2628388	2628393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65059	NC_021192	CGG	2	6	2628397	2628402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65060	NC_021192	ACA	2	6	2628442	2628447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65061	NC_021192	CGG	2	6	2628458	2628463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65062	NC_021192	GC	3	6	2628467	2628472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65063	NC_021192	CGA	2	6	2628474	2628479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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65065	NC_021192	ACC	2	6	2628501	2628506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65066	NC_021192	GC	3	6	2628563	2628568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65067	NC_021192	TGCCA	2	10	2628573	2628582	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
65068	NC_021192	CAC	2	6	2628656	2628661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65069	NC_021192	CGGG	2	8	2628679	2628686	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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65071	NC_021192	CA	3	6	2628743	2628748	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65072	NC_021192	CGAC	2	8	2628759	2628766	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65073	NC_021192	CCG	2	6	2628803	2628808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65074	NC_021192	GGC	2	6	2628815	2628820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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65076	NC_021192	CACCG	2	10	2628851	2628860	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
65077	NC_021192	GT	3	6	2628871	2628876	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65078	NC_021192	CCA	2	6	2628895	2628900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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65092	NC_021192	CCGG	2	8	2629708	2629715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65093	NC_021192	GCC	2	6	2629793	2629798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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65105	NC_021192	ACC	2	6	2630396	2630401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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65108	NC_021192	GCC	2	6	2630527	2630532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65109	NC_021192	GCTG	2	8	2630535	2630542	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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65112	NC_021192	CGA	2	6	2630655	2630660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65113	NC_021192	CCGG	2	8	2630674	2630681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65114	NC_021192	TGA	2	6	2630688	2630693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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65118	NC_021192	GCACG	2	10	2630810	2630819	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
65119	NC_021192	GCA	2	6	2630822	2630827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65120	NC_021192	CGT	2	6	2630828	2630833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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65122	NC_021192	CGA	2	6	2630913	2630918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65123	NC_021192	GT	3	6	2630960	2630965	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65124	NC_021192	CGA	2	6	2631021	2631026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65125	NC_021192	CCA	2	6	2631047	2631052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65126	NC_021192	CGA	2	6	2631095	2631100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65127	NC_021192	GCA	2	6	2631107	2631112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65128	NC_021192	TCG	2	6	2631127	2631132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65129	NC_021192	CTCAC	2	10	2631150	2631159	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
65130	NC_021192	CGG	2	6	2631196	2631201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65131	NC_021192	TCG	2	6	2631276	2631281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65132	NC_021192	GAAG	2	8	2631333	2631340	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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65135	NC_021192	CAC	2	6	2631418	2631423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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65144	NC_021192	CGG	2	6	2631779	2631784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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65147	NC_021192	CGG	2	6	2631851	2631856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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65161	NC_021192	CAGG	2	8	2632327	2632334	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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65164	NC_021192	GCCG	2	8	2632369	2632376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65165	NC_021192	TCG	2	6	2632414	2632419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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65178	NC_021192	CGG	2	6	2633166	2633171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65179	NC_021192	CG	3	6	2633202	2633207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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65212	NC_021192	CTGGG	2	10	2634524	2634533	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
65213	NC_021192	CG	3	6	2634534	2634539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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65225	NC_021192	GCG	2	6	2635236	2635241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65226	NC_021192	ATTG	2	8	2635263	2635270	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65227	NC_021192	TCG	2	6	2635285	2635290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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65229	NC_021192	GAC	2	6	2635326	2635331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65230	NC_021192	AGC	2	6	2635369	2635374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65231	NC_021192	G	6	6	2635394	2635399	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
65232	NC_021192	TGG	2	6	2635481	2635486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65233	NC_021192	GGC	2	6	2635582	2635587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65234	NC_021192	CAC	2	6	2635589	2635594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65235	NC_021192	GC	3	6	2635646	2635651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65236	NC_021192	GGC	2	6	2635666	2635671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65237	NC_021192	GTG	2	6	2635770	2635775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65238	NC_021192	CGG	2	6	2635816	2635821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494692851
65239	NC_021192	GC	4	8	2635883	2635890	0 %	0 %	50 %	50 %	494692851
65240	NC_021192	CTG	2	6	2635895	2635900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494692851
65241	NC_021192	ATC	2	6	2635902	2635907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	494692851
65242	NC_021192	CGC	2	6	2635933	2635938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494692851
65243	NC_021192	GTG	2	6	2636010	2636015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65244	NC_021192	GTC	2	6	2636081	2636086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65245	NC_021192	CGC	2	6	2636135	2636140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65246	NC_021192	GCC	2	6	2636196	2636201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65247	NC_021192	GTC	2	6	2636225	2636230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65248	NC_021192	GGT	2	6	2636282	2636287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65249	NC_021192	GCC	2	6	2636310	2636315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65250	NC_021192	TCC	2	6	2636343	2636348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65251	NC_021192	GCG	2	6	2636373	2636378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65252	NC_021192	ACC	2	6	2636395	2636400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65253	NC_021192	GGC	2	6	2636499	2636504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65254	NC_021192	CG	3	6	2636562	2636567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65255	NC_021192	CGT	2	6	2636705	2636710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494692852
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65266	NC_021192	CCG	2	6	2637141	2637146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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65270	NC_021192	GGT	2	6	2637475	2637480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65271	NC_021192	CGGC	2	8	2637513	2637520	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65272	NC_021192	CAGC	2	8	2637521	2637528	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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65276	NC_021192	GCG	2	6	2637727	2637732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65277	NC_021192	GC	3	6	2637776	2637781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65278	NC_021192	GCCG	2	8	2637925	2637932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65279	NC_021192	GCC	2	6	2637938	2637943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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65282	NC_021192	GTC	2	6	2638167	2638172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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65285	NC_021192	CG	3	6	2638249	2638254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65286	NC_021192	CGC	2	6	2638313	2638318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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65290	NC_021192	GC	4	8	2638388	2638395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65291	NC_021192	CGG	2	6	2638409	2638414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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65293	NC_021192	GCC	2	6	2638432	2638437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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65297	NC_021192	TAA	2	6	2638621	2638626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65298	NC_021192	CACC	2	8	2638631	2638638	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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65302	NC_021192	TCG	2	6	2638879	2638884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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65322	NC_021192	ACA	2	6	2639678	2639683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65323	NC_021192	CAG	2	6	2639702	2639707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494692855
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65336	NC_021192	CAG	2	6	2640203	2640208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65337	NC_021192	CCG	2	6	2640216	2640221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494692856
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65343	NC_021192	GCGCG	2	10	2640355	2640364	0 %	0 %	60 %	40 %	494692856
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65350	NC_021192	GCT	2	6	2640604	2640609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494692856
65351	NC_021192	TCG	2	6	2640652	2640657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494692856
65352	NC_021192	GCG	2	6	2640693	2640698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494692856
65353	NC_021192	CGGCG	2	10	2640773	2640782	0 %	0 %	60 %	40 %	494692856
65354	NC_021192	TCG	2	6	2640859	2640864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494692856
65355	NC_021192	TGG	2	6	2640875	2640880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494692856
65356	NC_021192	GCCG	2	8	2640893	2640900	0 %	0 %	50 %	50 %	494692856
65357	NC_021192	CAC	2	6	2640930	2640935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65358	NC_021192	GCA	2	6	2640986	2640991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65359	NC_021192	C	7	7	2641040	2641046	0 %	0 %	0 %	100 %	494692857
65360	NC_021192	TCG	2	6	2641142	2641147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494692857
65361	NC_021192	CG	3	6	2641208	2641213	0 %	0 %	50 %	50 %	494692857
65362	NC_021192	CGGT	2	8	2641282	2641289	0 %	25 %	50 %	25 %	494692857
65363	NC_021192	GTC	2	6	2641290	2641295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494692857
65364	NC_021192	CGT	2	6	2641298	2641303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494692857
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65486	NC_021192	ACG	2	6	2646780	2646785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494692862
65487	NC_021192	AGG	2	6	2646817	2646822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	494692862
65488	NC_021192	GGC	2	6	2646828	2646833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	494692862
65489	NC_021192	GC	3	6	2646863	2646868	0 %	0 %	50 %	50 %	494692862
65490	NC_021192	CGT	2	6	2646887	2646892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494692862
65491	NC_021192	TGC	2	6	2646904	2646909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494692862
65492	NC_021192	CGA	2	6	2646920	2646925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494692862
65493	NC_021192	CGC	2	6	2646953	2646958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	494692862
65494	NC_021192	CAGC	2	8	2647016	2647023	25 %	0 %	25 %	50 %	494692862
65495	NC_021192	CGA	2	6	2647026	2647031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	494692862
65496	NC_021192	CCGGC	2	10	2647055	2647064	0 %	0 %	40 %	60 %	494692862
65497	NC_021192	TGG	2	6	2647135	2647140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	494692862
65498	NC_021192	GCT	2	6	2647273	2647278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	494692862
65499	NC_021192	CG	3	6	2647300	2647305	0 %	0 %	50 %	50 %	494692862
65500	NC_021192	GAA	2	6	2647316	2647321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	494692862

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