MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycoplasma mycoides subsp. mycoides SC str. Gladysdale MU clone SC5

Total Repeats: 38315

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38002	NC_021025	TGT	2	6	1184153	1184158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479183980
38003	NC_021025	AATA	2	8	1184165	1184172	75 %	25 %	0 %	0 %	479183980
38004	NC_021025	ATA	2	6	1184223	1184228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479183980
38005	NC_021025	TAA	2	6	1184241	1184246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479183980
38006	NC_021025	AAG	2	6	1184251	1184256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479183980
38007	NC_021025	TGTTA	2	10	1184307	1184316	20 %	60 %	20 %	0 %	479183980
38008	NC_021025	TCT	2	6	1184320	1184325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479183980
38009	NC_021025	T	6	6	1184328	1184333	0 %	100 %	0 %	0 %	479183980
38010	NC_021025	GAAT	2	8	1184371	1184378	50 %	25 %	25 %	0 %	479183980
38011	NC_021025	CAA	2	6	1184379	1184384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479183980
38012	NC_021025	TGAAT	2	10	1184458	1184467	40 %	40 %	20 %	0 %	479183980
38013	NC_021025	TCA	2	6	1184479	1184484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479183980
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38015	NC_021025	GTTT	2	8	1184561	1184568	0 %	75 %	25 %	0 %	479183980
38016	NC_021025	T	6	6	1184650	1184655	0 %	100 %	0 %	0 %	479183980
38017	NC_021025	AT	3	6	1184722	1184727	50 %	50 %	0 %	0 %	479183980
38018	NC_021025	CAA	2	6	1184795	1184800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479183980
38019	NC_021025	TCTTTA	2	12	1184815	1184826	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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38021	NC_021025	ACT	2	6	1184941	1184946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479184621
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38023	NC_021025	TTG	2	6	1184959	1184964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479184621
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38025	NC_021025	T	6	6	1184994	1184999	0 %	100 %	0 %	0 %	479184621
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38028	NC_021025	T	6	6	1185101	1185106	0 %	100 %	0 %	0 %	479184621
38029	NC_021025	TAT	3	9	1185142	1185150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38030	NC_021025	T	6	6	1185179	1185184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38031	NC_021025	TGA	2	6	1185203	1185208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38032	NC_021025	ATAA	2	8	1185209	1185216	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38033	NC_021025	T	6	6	1185225	1185230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38034	NC_021025	TCA	2	6	1185237	1185242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38035	NC_021025	TA	3	6	1185265	1185270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38036	NC_021025	TTTTAG	2	12	1185278	1185289	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38037	NC_021025	TAA	2	6	1185300	1185305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38038	NC_021025	T	7	7	1185309	1185315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38039	NC_021025	TTA	2	6	1185318	1185323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38040	NC_021025	ATTT	2	8	1185392	1185399	25 %	75 %	0 %	0 %	479184121
38041	NC_021025	T	6	6	1185429	1185434	0 %	100 %	0 %	0 %	479184121
38042	NC_021025	CTT	2	6	1185437	1185442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479184121
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38044	NC_021025	ATTTA	2	10	1185468	1185477	40 %	60 %	0 %	0 %	479184121
38045	NC_021025	T	7	7	1185545	1185551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38046	NC_021025	T	6	6	1185563	1185568	0 %	100 %	0 %	0 %	479184751
38047	NC_021025	AATT	2	8	1185623	1185630	50 %	50 %	0 %	0 %	479184751
38048	NC_021025	TAA	2	6	1185665	1185670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479184751
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38053	NC_021025	T	7	7	1185745	1185751	0 %	100 %	0 %	0 %	479184751
38054	NC_021025	TC	3	6	1185756	1185761	0 %	50 %	0 %	50 %	479184751
38055	NC_021025	TTA	2	6	1185767	1185772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	479184751
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38059	NC_021025	T	6	6	1185876	1185881	0 %	100 %	0 %	0 %	479184751
38060	NC_021025	T	6	6	1185886	1185891	0 %	100 %	0 %	0 %	479184751
38061	NC_021025	ATC	2	6	1185921	1185926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479184751
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38093	NC_021025	AT	3	6	1187072	1187077	50 %	50 %	0 %	0 %	479184751
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38109	NC_021025	AATCA	2	10	1187673	1187682	60 %	20 %	0 %	20 %	479184751
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.