MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-USMARC-183

Total Repeats: 51791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_020833	CAC	2	6	78940	78945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332587
1503	NC_020833	TTTC	2	8	79074	79081	0 %	75 %	0 %	25 %	472332587
1504	NC_020833	GTT	2	6	79128	79133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332587
1505	NC_020833	AAT	2	6	79138	79143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332587
1506	NC_020833	ATC	2	6	79202	79207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332587
1507	NC_020833	GCCTT	2	10	79250	79259	0 %	40 %	20 %	40 %	472332587
1508	NC_020833	AGCC	2	8	79274	79281	25 %	0 %	25 %	50 %	472332587
1509	NC_020833	ATT	2	6	79318	79323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332587
1510	NC_020833	TCGG	2	8	79346	79353	0 %	25 %	50 %	25 %	472332587
1511	NC_020833	TGC	2	6	79396	79401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332587
1512	NC_020833	GGC	2	6	79405	79410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332587
1513	NC_020833	CAT	2	6	79453	79458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332587
1514	NC_020833	GTAA	2	8	79567	79574	50 %	25 %	25 %	0 %	472332587
1515	NC_020833	TGC	2	6	79613	79618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332587
1516	NC_020833	TG	3	6	79629	79634	0 %	50 %	50 %	0 %	472332587
1517	NC_020833	CAG	2	6	79636	79641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332587
1518	NC_020833	TTC	2	6	79642	79647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332587
1519	NC_020833	GGT	2	6	79671	79676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332587
1520	NC_020833	TCG	2	6	79704	79709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332587
1521	NC_020833	CTT	2	6	79737	79742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332587
1522	NC_020833	TCA	2	6	79769	79774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332587
1523	NC_020833	ACTTTC	2	12	79790	79801	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	472332587
1524	NC_020833	TAA	2	6	79804	79809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332587
1525	NC_020833	GTG	2	6	79862	79867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332587
1526	NC_020833	AAT	2	6	79918	79923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332587
1527	NC_020833	GTG	2	6	79936	79941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332587
1528	NC_020833	ATTGAA	2	12	80026	80037	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	472332587
1529	NC_020833	TGG	2	6	80136	80141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332587
1530	NC_020833	ATT	2	6	80230	80235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332587
1531	NC_020833	TAA	2	6	80308	80313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332587
1532	NC_020833	ATT	2	6	80324	80329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332587
1533	NC_020833	TAAA	2	8	80349	80356	75 %	25 %	0 %	0 %	472332588
1534	NC_020833	CAT	2	6	80439	80444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332588
1535	NC_020833	CAC	2	6	80503	80508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332588
1536	NC_020833	TTTG	2	8	80516	80523	0 %	75 %	25 %	0 %	472332588
1537	NC_020833	ATT	2	6	80539	80544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332588
1538	NC_020833	TCTTTG	2	12	80576	80587	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	472332588
1539	NC_020833	CATC	2	8	80688	80695	25 %	25 %	0 %	50 %	472332588
1540	NC_020833	TGTT	2	8	80814	80821	0 %	75 %	25 %	0 %	472332589
1541	NC_020833	CTG	2	6	80907	80912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332589
1542	NC_020833	TAA	2	6	80960	80965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332589
1543	NC_020833	GTA	2	6	81060	81065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_020833	TTA	2	6	81082	81087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_020833	GTA	2	6	81091	81096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_020833	AATT	2	8	81106	81113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_020833	A	6	6	81139	81144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_020833	T	6	6	81182	81187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_020833	AAT	2	6	81214	81219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332590
1550	NC_020833	TGA	2	6	81266	81271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332590
1551	NC_020833	CAA	2	6	81288	81293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332590
1552	NC_020833	CGC	2	6	81333	81338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332590
1553	NC_020833	TGCGTG	2	12	81398	81409	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	472332590
1554	NC_020833	TGA	2	6	81417	81422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332590
1555	NC_020833	TACGAT	2	12	81432	81443	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	472332590
1556	NC_020833	CGGTAT	2	12	81453	81464	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	472332590
1557	NC_020833	CAGC	2	8	81558	81565	25 %	0 %	25 %	50 %	472332590
1558	NC_020833	CTT	2	6	81596	81601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332590
1559	NC_020833	GCC	2	6	81637	81642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332590
1560	NC_020833	TGCC	2	8	81647	81654	0 %	25 %	25 %	50 %	472332590
1561	NC_020833	A	6	6	81715	81720	100 %	0 %	0 %	0 %	472332590
1562	NC_020833	TTC	2	6	81740	81745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332590
1563	NC_020833	AAGC	2	8	81869	81876	50 %	0 %	25 %	25 %	472332590
1564	NC_020833	A	6	6	81890	81895	100 %	0 %	0 %	0 %	472332590
1565	NC_020833	A	6	6	81927	81932	100 %	0 %	0 %	0 %	472332590
1566	NC_020833	GAG	2	6	81946	81951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	472332590
1567	NC_020833	TATT	2	8	82127	82134	25 %	75 %	0 %	0 %	472332590
1568	NC_020833	ACT	2	6	82163	82168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332590
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1570	NC_020833	CTG	2	6	82291	82296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332590
1571	NC_020833	GTG	2	6	82354	82359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332590
1572	NC_020833	CAA	2	6	82389	82394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332590
1573	NC_020833	ACA	2	6	82395	82400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332590
1574	NC_020833	TGA	2	6	82437	82442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332590
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1577	NC_020833	TGA	2	6	82608	82613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332590
1578	NC_020833	TGGT	2	8	82615	82622	0 %	50 %	50 %	0 %	472332590
1579	NC_020833	GACTTA	2	12	82675	82686	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	472332590
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1581	NC_020833	GTTC	2	8	82745	82752	0 %	50 %	25 %	25 %	472332590
1582	NC_020833	GTG	2	6	82795	82800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332590
1583	NC_020833	AC	3	6	82820	82825	50 %	0 %	0 %	50 %	472332590
1584	NC_020833	ACC	2	6	82858	82863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332590
1585	NC_020833	GCA	2	6	82882	82887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332590
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1588	NC_020833	GATTG	2	10	82990	82999	20 %	40 %	40 %	0 %	472332590
1589	NC_020833	CTG	2	6	83002	83007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332590
1590	NC_020833	TGCT	2	8	83021	83028	0 %	50 %	25 %	25 %	472332590
1591	NC_020833	TTA	2	6	83060	83065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332590
1592	NC_020833	TAAA	2	8	83072	83079	75 %	25 %	0 %	0 %	472332590
1593	NC_020833	TTG	2	6	83080	83085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332590
1594	NC_020833	AT	3	6	83137	83142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_020833	AAT	2	6	83176	83181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332591
1596	NC_020833	ATG	2	6	83199	83204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332591
1597	NC_020833	A	7	7	83224	83230	100 %	0 %	0 %	0 %	472332591
1598	NC_020833	ATT	2	6	83276	83281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332591
1599	NC_020833	T	7	7	83366	83372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_020833	T	6	6	83429	83434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_020833	GAATAG	2	12	83455	83466	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_020833	ATTT	2	8	83485	83492	25 %	75 %	0 %	0 %	472332592
1603	NC_020833	ATG	2	6	83515	83520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332592
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1605	NC_020833	A	6	6	83619	83624	100 %	0 %	0 %	0 %	472332592
1606	NC_020833	ATT	2	6	83634	83639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332592
1607	NC_020833	GGT	2	6	83684	83689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332592
1608	NC_020833	CGG	2	6	83695	83700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332592
1609	NC_020833	ATT	2	6	83744	83749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332592
1610	NC_020833	GAA	2	6	83799	83804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	472332592
1611	NC_020833	ACAA	2	8	83842	83849	75 %	0 %	0 %	25 %	472332592
1612	NC_020833	TGA	2	6	83888	83893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332592
1613	NC_020833	TGA	2	6	83935	83940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332592
1614	NC_020833	CCACA	2	10	83957	83966	40 %	0 %	0 %	60 %	472332592
1615	NC_020833	AG	3	6	83969	83974	50 %	0 %	50 %	0 %	472332592
1616	NC_020833	ATG	2	6	83989	83994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332592
1617	NC_020833	GCAG	2	8	84053	84060	25 %	0 %	50 %	25 %	472332592
1618	NC_020833	CGG	2	6	84074	84079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332592
1619	NC_020833	GAT	2	6	84123	84128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332592
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1621	NC_020833	GGTG	2	8	84188	84195	0 %	25 %	75 %	0 %	472332592
1622	NC_020833	TAG	2	6	84262	84267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332592
1623	NC_020833	A	6	6	84289	84294	100 %	0 %	0 %	0 %	472332592
1624	NC_020833	GTG	2	6	84309	84314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332592
1625	NC_020833	TGG	2	6	84403	84408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332592
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1987	NC_020833	TTGGG	2	10	101835	101844	0 %	40 %	60 %	0 %	472332604
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1993	NC_020833	TTTCG	2	10	102107	102116	0 %	60 %	20 %	20 %	472332604
1994	NC_020833	ATC	2	6	102131	102136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332604
1995	NC_020833	TATT	2	8	102195	102202	25 %	75 %	0 %	0 %	472332604
1996	NC_020833	GCAC	2	8	102215	102222	25 %	0 %	25 %	50 %	472332604
1997	NC_020833	TCA	2	6	102247	102252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332604
1998	NC_020833	AATT	2	8	102316	102323	50 %	50 %	0 %	0 %	472332605
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