MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623 plasmid pMYCSM01

Total Repeats: 9483

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019957	ATG	2	6	24975	24980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_019957	GACT	2	8	25002	25009	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
503	NC_019957	GACA	2	8	25043	25050	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
504	NC_019957	TGA	2	6	25140	25145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_019957	CCGA	2	8	25192	25199	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
506	NC_019957	GAG	2	6	25240	25245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
507	NC_019957	GCG	2	6	25256	25261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_019957	TGC	2	6	25505	25510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_019957	CCG	2	6	25592	25597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_019957	CCG	2	6	25652	25657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_019957	TGC	2	6	25667	25672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_019957	GCG	2	6	25719	25724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_019957	CCG	2	6	25733	25738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_019957	CGA	2	6	25796	25801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644133
515	NC_019957	TCG	2	6	25826	25831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644133
516	NC_019957	CTC	2	6	25869	25874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433644133
517	NC_019957	CTG	2	6	25884	25889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644133
518	NC_019957	CGCC	2	8	25926	25933	0 %	0 %	25 %	75 %	433644133
519	NC_019957	CGAA	2	8	26033	26040	50 %	0 %	25 %	25 %	433644133
520	NC_019957	CTC	2	6	26078	26083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_019957	TCC	2	6	26090	26095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_019957	CCG	2	6	26109	26114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_019957	GCCG	2	8	26131	26138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
524	NC_019957	GCC	2	6	26142	26147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_019957	TCG	2	6	26330	26335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644134
526	NC_019957	TGG	2	6	26369	26374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644134
527	NC_019957	GCA	2	6	26381	26386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644134
528	NC_019957	CCTGG	2	10	26484	26493	0 %	20 %	40 %	40 %	433644134
529	NC_019957	CGC	2	6	26498	26503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644134
530	NC_019957	TGA	2	6	26510	26515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644134
531	NC_019957	CTGG	2	8	26529	26536	0 %	25 %	50 %	25 %	433644134
532	NC_019957	GCT	2	6	26538	26543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644134
533	NC_019957	CGT	2	6	26544	26549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644134
534	NC_019957	GCT	2	6	26559	26564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644134
535	NC_019957	TGC	2	6	26567	26572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644134
536	NC_019957	TCG	2	6	26617	26622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644134
537	NC_019957	GCA	2	6	26660	26665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644134
538	NC_019957	GGC	2	6	26682	26687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644134
539	NC_019957	TGATCG	2	12	26699	26710	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	433644134
540	NC_019957	GCC	2	6	26743	26748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644134
541	NC_019957	CTG	2	6	26776	26781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644134
542	NC_019957	GTT	2	6	26877	26882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433644134
543	NC_019957	GCC	2	6	26902	26907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644134
544	NC_019957	CAC	2	6	26925	26930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644134
545	NC_019957	CGC	2	6	26957	26962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644134
546	NC_019957	CGC	2	6	27006	27011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644134
547	NC_019957	CGA	2	6	27035	27040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644134
548	NC_019957	CCGAA	2	10	27041	27050	40 %	0 %	20 %	40 %	433644134
549	NC_019957	CGC	2	6	27054	27059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644134
550	NC_019957	GC	3	6	27058	27063	0 %	0 %	50 %	50 %	433644134
551	NC_019957	TCG	2	6	27083	27088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644134
552	NC_019957	CGA	2	6	27093	27098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644134
553	NC_019957	CG	3	6	27102	27107	0 %	0 %	50 %	50 %	433644134
554	NC_019957	TGA	2	6	27129	27134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644134
555	NC_019957	ACG	2	6	27167	27172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644134
556	NC_019957	CGGCGA	2	12	27182	27193	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	433644134
557	NC_019957	TGC	2	6	27194	27199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644134
558	NC_019957	GC	3	6	27261	27266	0 %	0 %	50 %	50 %	433644134
559	NC_019957	CTGGCG	2	12	27286	27297	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	433644134
560	NC_019957	CGC	2	6	27311	27316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644134
561	NC_019957	CGG	2	6	27337	27342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644134
562	NC_019957	TCGC	2	8	27386	27393	0 %	25 %	25 %	50 %	433644134
563	NC_019957	GTC	2	6	27422	27427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_019957	GCC	2	6	27453	27458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_019957	TGC	2	6	27484	27489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_019957	AGC	2	6	27497	27502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_019957	TCG	2	6	27517	27522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_019957	AGG	2	6	27612	27617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
569	NC_019957	CGG	2	6	27728	27733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_019957	CCAC	2	8	27739	27746	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
571	NC_019957	TGA	2	6	27784	27789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_019957	CAG	2	6	27813	27818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_019957	CGC	2	6	27835	27840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644135
574	NC_019957	CCT	2	6	27858	27863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433644135
575	NC_019957	ACAG	2	8	27866	27873	50 %	0 %	25 %	25 %	433644135
576	NC_019957	CGG	2	6	27875	27880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644135
577	NC_019957	TGG	2	6	27916	27921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644135
578	NC_019957	TGG	3	9	27946	27954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644135
579	NC_019957	ATC	2	6	27957	27962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644135
580	NC_019957	AAC	2	6	28110	28115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433644135
581	NC_019957	CGA	2	6	28271	28276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644135
582	NC_019957	TGA	2	6	28325	28330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644135
583	NC_019957	TCTG	2	8	28374	28381	0 %	50 %	25 %	25 %	433644135
584	NC_019957	GCG	2	6	28406	28411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644135
585	NC_019957	GAT	2	6	28450	28455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644136
586	NC_019957	CTGA	2	8	28475	28482	25 %	25 %	25 %	25 %	433644136
587	NC_019957	CGC	2	6	28498	28503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644136
588	NC_019957	CGC	2	6	28636	28641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644136
589	NC_019957	GCT	2	6	28705	28710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644136
590	NC_019957	AGC	2	6	28776	28781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644136
591	NC_019957	CCT	2	6	28804	28809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433644136
592	NC_019957	GCC	2	6	28946	28951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644136
593	NC_019957	CAG	2	6	28967	28972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644136
594	NC_019957	TCA	2	6	28984	28989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644136
595	NC_019957	ACG	2	6	29019	29024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644136
596	NC_019957	GCG	2	6	29037	29042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644136
597	NC_019957	TGG	2	6	29053	29058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644136
598	NC_019957	CCG	3	9	29072	29080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644136
599	NC_019957	CAG	2	6	29123	29128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644136
600	NC_019957	CGGCAA	2	12	29188	29199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644136
601	NC_019957	CTG	2	6	29205	29210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644136
602	NC_019957	ACCA	2	8	29276	29283	50 %	0 %	0 %	50 %	433644136
603	NC_019957	CCAC	2	8	29309	29316	25 %	0 %	0 %	75 %	433644136
604	NC_019957	CAG	2	6	29371	29376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644136
605	NC_019957	GGC	2	6	29387	29392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644136
606	NC_019957	GCG	2	6	29424	29429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644136
607	NC_019957	CGC	2	6	29482	29487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644136
608	NC_019957	CGG	2	6	29488	29493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644136
609	NC_019957	GCC	2	6	29500	29505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644136
610	NC_019957	GCG	2	6	29516	29521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644136
611	NC_019957	CGG	2	6	29568	29573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644136
612	NC_019957	GTG	2	6	29631	29636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644136
613	NC_019957	GCC	2	6	29695	29700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644136
614	NC_019957	CCGGT	2	10	29757	29766	0 %	20 %	40 %	40 %	433644136
615	NC_019957	CCG	2	6	29777	29782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644136
616	NC_019957	GC	3	6	29802	29807	0 %	0 %	50 %	50 %	433644136
617	NC_019957	TCAGC	2	10	29826	29835	20 %	20 %	20 %	40 %	433644136
618	NC_019957	CGG	2	6	29839	29844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644136
619	NC_019957	CGC	2	6	29860	29865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644136
620	NC_019957	TCG	4	12	29876	29887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644136
621	NC_019957	C	6	6	29898	29903	0 %	0 %	0 %	100 %	433644136
622	NC_019957	CTC	2	6	29968	29973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433644136
623	NC_019957	GCT	2	6	29986	29991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644136
624	NC_019957	GCT	2	6	30019	30024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644136
625	NC_019957	ATC	2	6	30098	30103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644136
626	NC_019957	AGC	2	6	30107	30112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644136
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628	NC_019957	TGT	2	6	30165	30170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433644136
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752	NC_019957	CGA	2	6	35813	35818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644140
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760	NC_019957	CGC	2	6	36346	36351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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