MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium smegmatis JS623 plasmid pMYCSM01

Total Repeats: 9483

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_019957	GC	3	6	214027	214032	0 %	0 %	50 %	50 %	433644278
5002	NC_019957	AGC	2	6	214096	214101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644278
5003	NC_019957	GGT	2	6	214128	214133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644278
5004	NC_019957	GCC	2	6	214193	214198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644278
5005	NC_019957	CCG	2	6	214264	214269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644278
5006	NC_019957	CTC	2	6	214273	214278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433644278
5007	NC_019957	GCACG	2	10	214397	214406	20 %	0 %	40 %	40 %	433644278
5008	NC_019957	CGC	2	6	214486	214491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644278
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5010	NC_019957	TCG	2	6	214518	214523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644278
5011	NC_019957	CCG	2	6	214527	214532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644278
5012	NC_019957	TGC	2	6	214581	214586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644278
5013	NC_019957	CAT	2	6	214609	214614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644278
5014	NC_019957	CGC	2	6	214660	214665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644278
5015	NC_019957	GAA	2	6	214715	214720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433644278
5016	NC_019957	CTC	2	6	214909	214914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433644278
5017	NC_019957	GAT	2	6	214952	214957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644278
5018	NC_019957	TGG	2	6	214959	214964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644278
5019	NC_019957	ACC	2	6	214990	214995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644278
5020	NC_019957	CG	3	6	215072	215077	0 %	0 %	50 %	50 %	433644279
5021	NC_019957	CG	3	6	215084	215089	0 %	0 %	50 %	50 %	433644279
5022	NC_019957	ACG	2	6	215098	215103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644279
5023	NC_019957	ATC	2	6	215215	215220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644279
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5025	NC_019957	CTG	2	6	215314	215319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644279
5026	NC_019957	GCAA	2	8	215368	215375	50 %	0 %	25 %	25 %	433644279
5027	NC_019957	GTG	2	6	215397	215402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433644279
5028	NC_019957	CAAG	2	8	215511	215518	50 %	0 %	25 %	25 %	433644279
5029	NC_019957	GAC	2	6	215538	215543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644279
5030	NC_019957	CACG	2	8	215544	215551	25 %	0 %	25 %	50 %	433644279
5031	NC_019957	CGC	2	6	215580	215585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644279
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5033	NC_019957	A	6	6	215611	215616	100 %	0 %	0 %	0 %	433644279
5034	NC_019957	CCTCA	2	10	215712	215721	20 %	20 %	0 %	60 %	433644279
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5037	NC_019957	GAC	2	6	215797	215802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644279
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5040	NC_019957	GCG	2	6	215880	215885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644279
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5043	NC_019957	CGGTG	2	10	216105	216114	0 %	20 %	60 %	20 %	433644279
5044	NC_019957	CGC	2	6	216159	216164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644279
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5053	NC_019957	TGT	2	6	216441	216446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433644279
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5061	NC_019957	CTTGG	2	10	216874	216883	0 %	40 %	40 %	20 %	433644279
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5089	NC_019957	GTC	2	6	218270	218275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644280
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5097	NC_019957	CATC	2	8	218669	218676	25 %	25 %	0 %	50 %	433644281
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5101	NC_019957	ACT	2	6	218942	218947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433644281
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5105	NC_019957	G	6	6	219149	219154	0 %	0 %	100 %	0 %	433644281
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5109	NC_019957	GCT	2	6	219318	219323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644281
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5119	NC_019957	G	6	6	219976	219981	0 %	0 %	100 %	0 %	433644282
5120	NC_019957	AAG	2	6	220057	220062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433644282
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5122	NC_019957	TAG	2	6	220090	220095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433644282
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5124	NC_019957	GT	3	6	220233	220238	0 %	50 %	50 %	0 %	433644282
5125	NC_019957	CAC	2	6	220256	220261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644282
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5127	NC_019957	CGAT	2	8	220286	220293	25 %	25 %	25 %	25 %	433644282
5128	NC_019957	CAGA	2	8	220328	220335	50 %	0 %	25 %	25 %	433644282
5129	NC_019957	GTC	2	6	220343	220348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644282
5130	NC_019957	TCG	2	6	220371	220376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644282
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5134	NC_019957	GAC	2	6	220607	220612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644283
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5136	NC_019957	GCG	2	6	220708	220713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644283
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5142	NC_019957	AGA	2	6	220983	220988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433644283
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5151	NC_019957	TCC	2	6	221456	221461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433644283
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5161	NC_019957	ACG	2	6	221923	221928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644283
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5163	NC_019957	GCA	2	6	222165	222170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644283
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5165	NC_019957	TCG	2	6	222233	222238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644283
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5188	NC_019957	GCT	2	6	223629	223634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644283
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5199	NC_019957	CGT	2	6	224158	224163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644284
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5213	NC_019957	CGC	2	6	224731	224736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5228	NC_019957	GTG	2	6	225184	225189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5229	NC_019957	CA	3	6	225203	225208	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5230	NC_019957	CGG	2	6	225219	225224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5231	NC_019957	AGC	2	6	225274	225279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5232	NC_019957	GCT	2	6	225310	225315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5233	NC_019957	GAA	2	6	225348	225353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5234	NC_019957	GCG	2	6	225363	225368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5235	NC_019957	CGC	2	6	225516	225521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5236	NC_019957	CGG	2	6	225542	225547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5237	NC_019957	GTC	2	6	225549	225554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5238	NC_019957	GTC	2	6	225580	225585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5239	NC_019957	GCCGG	2	10	225587	225596	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5240	NC_019957	TCC	2	6	225642	225647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5241	NC_019957	GAA	2	6	225660	225665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5242	NC_019957	GT	3	6	225834	225839	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5243	NC_019957	CCG	3	9	225849	225857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644286
5244	NC_019957	TCG	2	6	225860	225865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644286
5245	NC_019957	GCG	2	6	225872	225877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644286
5246	NC_019957	CG	3	6	225975	225980	0 %	0 %	50 %	50 %	433644286
5247	NC_019957	CGG	2	6	225988	225993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644286
5248	NC_019957	GTT	2	6	226012	226017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433644286
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5267	NC_019957	GACCA	2	10	226779	226788	40 %	0 %	20 %	40 %	433644287
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5272	NC_019957	ACC	2	6	226951	226956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433644287
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5280	NC_019957	CGG	2	6	227267	227272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644287
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5287	NC_019957	GCG	2	6	227759	227764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5317	NC_019957	CGG	2	6	228723	228728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5318	NC_019957	GCC	2	6	228745	228750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5329	NC_019957	GCG	2	6	229422	229427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5332	NC_019957	CGGCCG	2	12	229599	229610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5333	NC_019957	GCG	2	6	229628	229633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5338	NC_019957	GCG	2	6	229838	229843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5342	NC_019957	GCC	2	6	230005	230010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5347	NC_019957	CTG	2	6	230285	230290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5353	NC_019957	CGT	2	6	230529	230534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644290
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5355	NC_019957	CAG	2	6	230560	230565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433644290
5356	NC_019957	GGGCCG	2	12	230623	230634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644290
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5361	NC_019957	GCG	2	6	230813	230818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644290
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5365	NC_019957	CCG	2	6	230948	230953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5366	NC_019957	TCG	2	6	231078	231083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5367	NC_019957	GTC	2	6	231131	231136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5369	NC_019957	ACG	2	6	231289	231294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5371	NC_019957	CAT	2	6	231373	231378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5372	NC_019957	ATC	2	6	231422	231427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5373	NC_019957	TGA	2	6	231436	231441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5374	NC_019957	ATC	2	6	231462	231467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5375	NC_019957	TGA	2	6	231559	231564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5491	NC_019957	TCG	2	6	236206	236211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433644296
5492	NC_019957	GCC	2	6	236302	236307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433644296
5493	NC_019957	GGC	2	6	236334	236339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433644296
5494	NC_019957	CG	3	6	236377	236382	0 %	0 %	50 %	50 %	433644296
5495	NC_019957	GCG	2	6	236471	236476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5496	NC_019957	TGTC	2	8	236558	236565	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5497	NC_019957	TCG	2	6	236573	236578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5498	NC_019957	GAC	2	6	236594	236599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5499	NC_019957	T	8	8	236633	236640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5500	NC_019957	CCG	2	6	236666	236671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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