MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 plasmid pMIC7113.02

Total Repeats: 1770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019760	A	7	7	18	24	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019760	TGT	2	6	27	32	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019760	GGT	2	6	77	82	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019760	CTTTT	2	10	168	177	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_019760	AAG	2	6	247	252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019760	CTT	2	6	272	277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019760	AGT	2	6	317	322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019760	TCT	2	6	379	384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_019760	AAATCT	2	12	385	396	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_019760	TGT	4	12	402	413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019760	T	6	6	424	429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019760	AATT	2	8	462	469	50 %	50 %	0 %	0 %	428314741
13	NC_019760	G	9	9	509	517	0 %	0 %	100 %	0 %	428314741
14	NC_019760	TTG	2	6	668	673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314741
15	NC_019760	TCG	2	6	716	721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314741
16	NC_019760	TGT	2	6	780	785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314741
17	NC_019760	C	7	7	879	885	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18	NC_019760	T	6	6	886	891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019760	G	6	6	894	899	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019760	G	6	6	903	908	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019760	CTT	2	6	955	960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019760	C	9	9	1042	1050	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23	NC_019760	GAGG	2	8	1065	1072	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019760	GTT	2	6	1269	1274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019760	T	6	6	1282	1287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019760	GTT	2	6	1314	1319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019760	GTC	2	6	1334	1339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_019760	GGT	2	6	1347	1352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019760	TTTGT	2	10	1378	1387	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019760	G	6	6	1409	1414	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019760	AATT	2	8	1497	1504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019760	CGGG	2	8	1605	1612	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_019760	TTTA	2	8	1642	1649	25 %	75 %	0 %	0 %	428314742
34	NC_019760	CGGGT	2	10	1658	1667	0 %	20 %	60 %	20 %	428314742
35	NC_019760	TAA	2	6	1699	1704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314742
36	NC_019760	TTC	2	6	1716	1721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314742
37	NC_019760	TAA	2	6	1742	1747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314742
38	NC_019760	CTTT	2	8	1790	1797	0 %	75 %	0 %	25 %	428314742
39	NC_019760	T	6	6	1808	1813	0 %	100 %	0 %	0 %	428314742
40	NC_019760	CTC	2	6	1952	1957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314742
41	NC_019760	TGGG	2	8	1963	1970	0 %	25 %	75 %	0 %	428314742
42	NC_019760	TAAT	2	8	1984	1991	50 %	50 %	0 %	0 %	428314742
43	NC_019760	CTT	2	6	1999	2004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314742
44	NC_019760	TGC	2	6	2081	2086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314742
45	NC_019760	CAT	2	6	2227	2232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314742
46	NC_019760	GAAG	2	8	2251	2258	50 %	0 %	50 %	0 %	428314742
47	NC_019760	GATA	2	8	2275	2282	50 %	25 %	25 %	0 %	428314742
48	NC_019760	TCA	2	6	2319	2324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314742
49	NC_019760	TGGTT	2	10	2327	2336	0 %	60 %	40 %	0 %	428314742
50	NC_019760	T	6	6	2335	2340	0 %	100 %	0 %	0 %	428314742
51	NC_019760	CGC	2	6	2402	2407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_019760	GGAA	2	8	2431	2438	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019760	GGAC	2	8	2517	2524	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_019760	TCA	2	6	2545	2550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314743
55	NC_019760	TTG	2	6	2607	2612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314743
56	NC_019760	AAT	2	6	2638	2643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314743
57	NC_019760	GCT	2	6	2654	2659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314743
58	NC_019760	AT	3	6	2764	2769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019760	AGAA	2	8	2911	2918	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019760	GTT	2	6	2982	2987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314744
61	NC_019760	AATG	2	8	3022	3029	50 %	25 %	25 %	0 %	428314744
62	NC_019760	CTC	2	6	3034	3039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314744
63	NC_019760	T	6	6	3107	3112	0 %	100 %	0 %	0 %	428314744
64	NC_019760	GAAC	2	8	3144	3151	50 %	0 %	25 %	25 %	428314744
65	NC_019760	CAG	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314744
66	NC_019760	TTC	2	6	3318	3323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314744
67	NC_019760	CAG	2	6	3377	3382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314744
68	NC_019760	GCA	2	6	3405	3410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314744
69	NC_019760	GCA	2	6	3421	3426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314744
70	NC_019760	GA	3	6	3438	3443	50 %	0 %	50 %	0 %	428314744
71	NC_019760	TGT	2	6	3460	3465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314744
72	NC_019760	AGC	2	6	3534	3539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314744
73	NC_019760	TGC	2	6	3588	3593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314744
74	NC_019760	TCT	2	6	3651	3656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314744
75	NC_019760	TTC	2	6	3671	3676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314744
76	NC_019760	CGG	2	6	3684	3689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314744
77	NC_019760	CAA	2	6	3839	3844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_019760	ACT	2	6	3854	3859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019760	ATCG	2	8	3871	3878	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_019760	TGT	2	6	3981	3986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019760	CAT	2	6	4285	4290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314745
82	NC_019760	ACT	2	6	4318	4323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314745
83	NC_019760	TTGA	2	8	4349	4356	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019760	GGA	2	6	4362	4367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019760	GTT	2	6	4425	4430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019760	CCG	2	6	4504	4509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314746
87	NC_019760	TCA	2	6	4591	4596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314746
88	NC_019760	CTG	2	6	4652	4657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314746
89	NC_019760	CCG	2	6	4661	4666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428314746
90	NC_019760	CCA	2	6	4772	4777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314746
91	NC_019760	ACC	3	9	4827	4835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314746
92	NC_019760	GTTT	2	8	4852	4859	0 %	75 %	25 %	0 %	428314746
93	NC_019760	TCGG	2	8	4874	4881	0 %	25 %	50 %	25 %	428314746
94	NC_019760	CTG	2	6	4899	4904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314746
95	NC_019760	TAGA	2	8	4926	4933	50 %	25 %	25 %	0 %	428314746
96	NC_019760	GTG	2	6	5118	5123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019760	CAC	2	6	5163	5168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_019760	TC	3	6	5231	5236	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_019760	TCC	2	6	5308	5313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_019760	TTA	2	6	5315	5320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019760	TGT	2	6	5350	5355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019760	CAT	2	6	5399	5404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019760	CAA	2	6	5515	5520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314747
104	NC_019760	TGA	2	6	5550	5555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314747
105	NC_019760	CCA	2	6	5574	5579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314747
106	NC_019760	TCA	2	6	5586	5591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314747
107	NC_019760	GCT	2	6	5603	5608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314747
108	NC_019760	CCT	2	6	5609	5614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314747
109	NC_019760	CT	3	6	5650	5655	0 %	50 %	0 %	50 %	428314747
110	NC_019760	AAC	2	6	5666	5671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314747
111	NC_019760	ATC	2	6	5672	5677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314747
112	NC_019760	GTT	2	6	5687	5692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314747
113	NC_019760	CTT	2	6	5694	5699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314747
114	NC_019760	TCT	2	6	5811	5816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314747
115	NC_019760	GGC	2	6	5896	5901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314747
116	NC_019760	TTCT	2	8	5941	5948	0 %	75 %	0 %	25 %	428314747
117	NC_019760	CCA	2	6	6034	6039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314747
118	NC_019760	GT	3	6	6054	6059	0 %	50 %	50 %	0 %	428314747
119	NC_019760	CGG	2	6	6061	6066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314747
120	NC_019760	ACC	2	6	6122	6127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314747
121	NC_019760	AAG	3	9	6165	6173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428314747
122	NC_019760	ACA	2	6	6180	6185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314747
123	NC_019760	CCT	2	6	6231	6236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314747
124	NC_019760	CAA	2	6	6238	6243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314747
125	NC_019760	CTT	2	6	6259	6264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314747
126	NC_019760	GCT	2	6	6269	6274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314747
127	NC_019760	CTTCAA	2	12	6340	6351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314747
128	NC_019760	CAT	2	6	6358	6363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314747
129	NC_019760	AGC	2	6	6484	6489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314747
130	NC_019760	CTA	2	6	6541	6546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_019760	TAG	2	6	6595	6600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019760	C	7	7	6610	6616	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
133	NC_019760	C	6	6	6619	6624	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
134	NC_019760	G	6	6	6632	6637	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019760	G	7	7	6683	6689	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019760	AAT	2	6	6690	6695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019760	CTCCC	2	10	6700	6709	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
138	NC_019760	C	7	7	6755	6761	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
139	NC_019760	AAT	2	6	6799	6804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428314748
140	NC_019760	ATC	3	9	6814	6822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314748
141	NC_019760	ATC	2	6	6847	6852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314748
142	NC_019760	ACG	2	6	6856	6861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314748
143	NC_019760	TTTC	2	8	6882	6889	0 %	75 %	0 %	25 %	428314748
144	NC_019760	TGA	2	6	6939	6944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314748
145	NC_019760	TTA	2	6	6947	6952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428314748
146	NC_019760	TCA	2	6	7010	7015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314748
147	NC_019760	TTGT	2	8	7070	7077	0 %	75 %	25 %	0 %	428314749
148	NC_019760	ACG	2	6	7173	7178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314749
149	NC_019760	TCA	2	6	7182	7187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314749
150	NC_019760	CAT	2	6	7219	7224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314749
151	NC_019760	ACC	2	6	7227	7232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428314749
152	NC_019760	ACT	2	6	7278	7283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314749
153	NC_019760	CTGT	2	8	7298	7305	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
154	NC_019760	CAG	2	6	7339	7344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_019760	TTG	2	6	7364	7369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314750
156	NC_019760	GTA	2	6	7499	7504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314750
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158	NC_019760	CAG	2	6	7657	7662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314750
159	NC_019760	TGA	2	6	7707	7712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314750
160	NC_019760	GCGG	2	8	7832	7839	0 %	0 %	75 %	25 %	428314750
161	NC_019760	TC	3	6	7881	7886	0 %	50 %	0 %	50 %	428314750
162	NC_019760	TTC	2	6	7889	7894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314750
163	NC_019760	GCA	2	6	7914	7919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314750
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166	NC_019760	TCT	5	15	8019	8033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428314750
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168	NC_019760	CAG	3	9	8053	8061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314750
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171	NC_019760	TGT	2	6	8081	8086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428314750
172	NC_019760	T	6	6	8088	8093	0 %	100 %	0 %	0 %	428314750
173	NC_019760	T	6	6	8167	8172	0 %	100 %	0 %	0 %	428314750
174	NC_019760	T	6	6	8187	8192	0 %	100 %	0 %	0 %	428314750
175	NC_019760	ACA	2	6	8235	8240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428314750
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179	NC_019760	AACG	2	8	8506	8513	50 %	0 %	25 %	25 %	428314750
180	NC_019760	GTG	2	6	8517	8522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428314750
181	NC_019760	CCT	2	6	8678	8683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
182	NC_019760	TGGG	2	8	8820	8827	0 %	25 %	75 %	0 %	428314751
183	NC_019760	TACTG	2	10	8858	8867	20 %	40 %	20 %	20 %	428314751
184	NC_019760	TCC	2	6	8887	8892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428314751
185	NC_019760	TCG	2	6	8929	8934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314751
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189	NC_019760	CTG	2	6	9070	9075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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203	NC_019760	TA	3	6	9986	9991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
204	NC_019760	CAG	2	6	10008	10013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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208	NC_019760	C	6	6	10108	10113	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
209	NC_019760	G	6	6	10121	10126	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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212	NC_019760	C	6	6	10219	10224	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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215	NC_019760	G	7	7	10255	10261	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_019760	CA	3	6	12574	12579	50 %	0 %	0 %	50 %	428314754
254	NC_019760	TGA	2	6	12580	12585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314754
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267	NC_019760	AGGG	2	8	13610	13617	25 %	0 %	75 %	0 %	428314755
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269	NC_019760	GGC	2	6	13666	13671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428314755
270	NC_019760	GGA	2	6	13678	13683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314755
271	NC_019760	CAG	2	6	13705	13710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314755
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273	NC_019760	G	6	6	13814	13819	0 %	0 %	100 %	0 %	428314755
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407	NC_019760	AACC	2	8	21062	21069	50 %	0 %	0 %	50 %	428314758
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411	NC_019760	GACC	2	8	21388	21395	25 %	0 %	25 %	50 %	428314758
412	NC_019760	GCA	2	6	21481	21486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314758
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