MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 chromosome

Total Repeats: 134128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019738	TA	3	6	4	9	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019738	ATT	2	6	104	109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019738	GCG	2	6	115	120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019738	GTAA	2	8	129	136	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019738	CA	3	6	143	148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_019738	AGA	2	6	282	287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019738	CCA	2	6	293	298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_019738	CAGC	2	8	409	416	25 %	0 %	25 %	50 %	428308378
9	NC_019738	TAC	2	6	489	494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308378
10	NC_019738	GAT	2	6	570	575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308378
11	NC_019738	GCA	2	6	622	627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308378
12	NC_019738	CCG	2	6	654	659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308378
13	NC_019738	T	6	6	688	693	0 %	100 %	0 %	0 %	428308378
14	NC_019738	TGT	2	6	701	706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308378
15	NC_019738	TAA	2	6	713	718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308378
16	NC_019738	GCTG	2	8	740	747	0 %	25 %	50 %	25 %	428308378
17	NC_019738	GCG	2	6	912	917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308378
18	NC_019738	GAT	2	6	981	986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308378
19	NC_019738	AAG	2	6	1018	1023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308378
20	NC_019738	T	7	7	1026	1032	0 %	100 %	0 %	0 %	428308378
21	NC_019738	TCC	2	6	1088	1093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308378
22	NC_019738	A	7	7	1198	1204	100 %	0 %	0 %	0 %	428308378
23	NC_019738	AT	3	6	1247	1252	50 %	50 %	0 %	0 %	428308378
24	NC_019738	CACT	2	8	1256	1263	25 %	25 %	0 %	50 %	428308378
25	NC_019738	C	6	6	1370	1375	0 %	0 %	0 %	100 %	428308378
26	NC_019738	TGG	2	6	1559	1564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308378
27	NC_019738	TAC	2	6	1574	1579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308378
28	NC_019738	TA	3	6	1585	1590	50 %	50 %	0 %	0 %	428308378
29	NC_019738	GA	3	6	1615	1620	50 %	0 %	50 %	0 %	428308378
30	NC_019738	CCAAA	2	10	1679	1688	60 %	0 %	0 %	40 %	428308378
31	NC_019738	A	6	6	1730	1735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019738	GA	3	6	1801	1806	50 %	0 %	50 %	0 %	428308379
33	NC_019738	AGTA	2	8	1825	1832	50 %	25 %	25 %	0 %	428308379
34	NC_019738	GATT	2	8	1899	1906	25 %	50 %	25 %	0 %	428308379
35	NC_019738	TG	3	6	1918	1923	0 %	50 %	50 %	0 %	428308379
36	NC_019738	TGAC	2	8	2049	2056	25 %	25 %	25 %	25 %	428308379
37	NC_019738	TGA	2	6	2058	2063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308379
38	NC_019738	ATT	2	6	2106	2111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308379
39	NC_019738	TTA	2	6	2245	2250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308380
40	NC_019738	GCG	2	6	2323	2328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308380
41	NC_019738	TC	4	8	2558	2565	0 %	50 %	0 %	50 %	428308380
42	NC_019738	CAAG	2	8	2628	2635	50 %	0 %	25 %	25 %	428308380
43	NC_019738	TTCAC	2	10	2648	2657	20 %	40 %	0 %	40 %	428308380
44	NC_019738	GCA	2	6	2661	2666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308380
45	NC_019738	AGA	2	6	2775	2780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308380
46	NC_019738	CGCAC	2	10	2880	2889	20 %	0 %	20 %	60 %	428308380
47	NC_019738	ATT	2	6	2932	2937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308380
48	NC_019738	ATC	2	6	2996	3001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308380
49	NC_019738	A	7	7	3092	3098	100 %	0 %	0 %	0 %	428308380
50	NC_019738	TGT	2	6	3102	3107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308380
51	NC_019738	CTTT	2	8	3139	3146	0 %	75 %	0 %	25 %	428308380
52	NC_019738	TGAT	2	8	3242	3249	25 %	50 %	25 %	0 %	428308380
53	NC_019738	AATG	2	8	3288	3295	50 %	25 %	25 %	0 %	428308380
54	NC_019738	GAT	2	6	3339	3344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308380
55	NC_019738	TAG	2	6	3461	3466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019738	CAAAG	2	10	3486	3495	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_019738	GAT	2	6	3584	3589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308381
58	NC_019738	GT	3	6	3649	3654	0 %	50 %	50 %	0 %	428308381
59	NC_019738	AAC	2	6	3756	3761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308381
60	NC_019738	CTG	2	6	3846	3851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308381
61	NC_019738	GAA	2	6	3887	3892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308381
62	NC_019738	TAA	2	6	3918	3923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308381
63	NC_019738	AAC	2	6	3960	3965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308381
64	NC_019738	CAA	2	6	3968	3973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308381
65	NC_019738	AAG	2	6	4014	4019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308381
66	NC_019738	AAC	2	6	4086	4091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308381
67	NC_019738	TGT	2	6	4119	4124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308381
68	NC_019738	CCT	2	6	4143	4148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308381
69	NC_019738	CT	3	6	4230	4235	0 %	50 %	0 %	50 %	428308381
70	NC_019738	GAG	2	6	4239	4244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308381
71	NC_019738	CAA	2	6	4367	4372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308381
72	NC_019738	ATTTA	2	10	4435	4444	40 %	60 %	0 %	0 %	428308381
73	NC_019738	TGG	2	6	4451	4456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308381
74	NC_019738	ATC	2	6	4489	4494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308381
75	NC_019738	GCC	2	6	4500	4505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308381
76	NC_019738	TGA	2	6	4567	4572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308381
77	NC_019738	T	7	7	4612	4618	0 %	100 %	0 %	0 %	428308381
78	NC_019738	ACA	2	6	4638	4643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308381
79	NC_019738	TGA	2	6	4780	4785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308381
80	NC_019738	ACC	2	6	4824	4829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308381
81	NC_019738	TTC	2	6	4839	4844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308381
82	NC_019738	A	6	6	4845	4850	100 %	0 %	0 %	0 %	428308381
83	NC_019738	TATTG	2	10	4851	4860	20 %	60 %	20 %	0 %	428308381
84	NC_019738	AGG	2	6	4864	4869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308381
85	NC_019738	AAC	2	6	4931	4936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308381
86	NC_019738	TCG	2	6	4964	4969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308381
87	NC_019738	TCCC	2	8	4970	4977	0 %	25 %	0 %	75 %	428308381
88	NC_019738	TCT	2	6	4988	4993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308381
89	NC_019738	ATC	2	6	5042	5047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308381
90	NC_019738	CAAT	2	8	5122	5129	50 %	25 %	0 %	25 %	428308381
91	NC_019738	A	6	6	5134	5139	100 %	0 %	0 %	0 %	428308381
92	NC_019738	A	6	6	5175	5180	100 %	0 %	0 %	0 %	428308381
93	NC_019738	GTA	2	6	5198	5203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308381
94	NC_019738	TTG	2	6	5246	5251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308381
95	NC_019738	GGCT	2	8	5746	5753	0 %	25 %	50 %	25 %	428308382
96	NC_019738	TC	3	6	5825	5830	0 %	50 %	0 %	50 %	428308382
97	NC_019738	AG	3	6	5989	5994	50 %	0 %	50 %	0 %	428308382
98	NC_019738	TGC	2	6	6049	6054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308383
99	NC_019738	A	6	6	6100	6105	100 %	0 %	0 %	0 %	428308383
100	NC_019738	TAT	3	9	6109	6117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308383
101	NC_019738	C	6	6	6126	6131	0 %	0 %	0 %	100 %	428308383
102	NC_019738	CT	3	6	6218	6223	0 %	50 %	0 %	50 %	428308383
103	NC_019738	TCT	2	6	6344	6349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308383
104	NC_019738	TTTA	2	8	6362	6369	25 %	75 %	0 %	0 %	428308383
105	NC_019738	TGG	2	6	6400	6405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308383
106	NC_019738	TAC	2	6	6477	6482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308383
107	NC_019738	TTC	2	6	6501	6506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308383
108	NC_019738	GTTG	2	8	6514	6521	0 %	50 %	50 %	0 %	428308383
109	NC_019738	TTA	2	6	6576	6581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308383
110	NC_019738	TGG	2	6	6652	6657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308383
111	NC_019738	ATG	2	6	6669	6674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308383
112	NC_019738	CTT	2	6	6781	6786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308383
113	NC_019738	CTG	2	6	6813	6818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308383
114	NC_019738	GGA	2	6	6891	6896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019738	ATCT	2	8	7010	7017	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_019738	ATT	2	6	7050	7055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019738	TA	3	6	7079	7084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019738	TAG	2	6	7115	7120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019738	TGA	2	6	7123	7128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019738	TC	3	6	7184	7189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_019738	T	6	6	7226	7231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019738	TGA	2	6	7234	7239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019738	TC	3	6	7272	7277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_019738	CAC	2	6	7354	7359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308384
125	NC_019738	ACAA	2	8	7372	7379	75 %	0 %	0 %	25 %	428308384
126	NC_019738	CTG	3	9	7395	7403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308384
127	NC_019738	TCG	2	6	7446	7451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308384
128	NC_019738	TCAA	2	8	7469	7476	50 %	25 %	0 %	25 %	428308384
129	NC_019738	GGC	2	6	7503	7508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308384
130	NC_019738	ATC	2	6	7542	7547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308384
131	NC_019738	GAA	2	6	7548	7553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308384
132	NC_019738	GACA	2	8	7584	7591	50 %	0 %	25 %	25 %	428308384
133	NC_019738	CCT	2	6	7622	7627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308384
134	NC_019738	A	6	6	7659	7664	100 %	0 %	0 %	0 %	428308384
135	NC_019738	GCTC	2	8	7673	7680	0 %	25 %	25 %	50 %	428308384
136	NC_019738	GAT	2	6	7686	7691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308384
137	NC_019738	GGC	2	6	7733	7738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308384
138	NC_019738	ACA	2	6	7880	7885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308384
139	NC_019738	CAGA	2	8	7899	7906	50 %	0 %	25 %	25 %	428308384
140	NC_019738	CAA	2	6	7920	7925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308384
141	NC_019738	AAC	2	6	7960	7965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308384
142	NC_019738	AGC	2	6	7973	7978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308384
143	NC_019738	A	6	6	8080	8085	100 %	0 %	0 %	0 %	428308384
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149	NC_019738	GTC	2	6	8505	8510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308384
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156	NC_019738	TTG	2	6	9096	9101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308385
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168	NC_019738	GCAG	2	8	9658	9665	25 %	0 %	50 %	25 %	428308385
169	NC_019738	GTC	2	6	9683	9688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308385
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175	NC_019738	ATT	2	6	9884	9889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308385
176	NC_019738	ATT	2	6	9923	9928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308385
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250	NC_019738	TAT	2	6	13564	13569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308387
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256	NC_019738	ATC	2	6	13955	13960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308388
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262	NC_019738	GTA	2	6	14315	14320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308388
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265	NC_019738	AT	3	6	14443	14448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_019738	TCTT	2	8	14456	14463	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
267	NC_019738	GCA	2	6	14498	14503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_019738	TGA	2	6	14549	14554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
269	NC_019738	T	6	6	14556	14561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_019738	ACA	2	6	14581	14586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_019738	ATT	2	6	14659	14664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_019738	CTC	2	6	14775	14780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
273	NC_019738	CGG	2	6	14823	14828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_019738	A	9	9	14836	14844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_019738	TAGT	2	8	14921	14928	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
276	NC_019738	TAA	2	6	14938	14943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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365	NC_019738	CATT	2	8	20648	20655	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
366	NC_019738	TTAGG	2	10	20666	20675	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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368	NC_019738	CTTG	2	8	20702	20709	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
369	NC_019738	GTCAAC	2	12	20723	20734	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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386	NC_019738	ACC	2	6	21712	21717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308394
387	NC_019738	GCA	2	6	21722	21727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308394
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389	NC_019738	CCG	2	6	21845	21850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308394
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393	NC_019738	GGT	2	6	22021	22026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308394
394	NC_019738	CTC	2	6	22140	22145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
395	NC_019738	TGCT	2	8	22260	22267	0 %	50 %	25 %	25 %	428308395
396	NC_019738	T	7	7	22274	22280	0 %	100 %	0 %	0 %	428308395
397	NC_019738	GCA	2	6	22326	22331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308395
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401	NC_019738	AGA	2	6	22486	22491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308395
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