MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 chromosome

Total Repeats: 134128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_019738	GAAACT	2	12	1009297	1009308	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428309212
18002	NC_019738	AT	3	6	1009378	1009383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18003	NC_019738	ATT	2	6	1009444	1009449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18004	NC_019738	CTGAG	2	10	1009479	1009488	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18005	NC_019738	AC	3	6	1009617	1009622	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18006	NC_019738	T	7	7	1009635	1009641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18007	NC_019738	AAT	2	6	1009671	1009676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18008	NC_019738	ATGAC	2	10	1009736	1009745	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18009	NC_019738	TC	3	6	1009754	1009759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18010	NC_019738	AGA	2	6	1009861	1009866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18011	NC_019738	TTG	2	6	1009921	1009926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428309213
18012	NC_019738	GTA	2	6	1009939	1009944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428309213
18013	NC_019738	GCC	2	6	1009984	1009989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428309213
18014	NC_019738	TAA	2	6	1010108	1010113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428309213
18015	NC_019738	GA	3	6	1010156	1010161	50 %	0 %	50 %	0 %	428309213
18016	NC_019738	GTT	2	6	1010172	1010177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428309213
18017	NC_019738	GCG	2	6	1010276	1010281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428309213
18018	NC_019738	CATTC	2	10	1010298	1010307	20 %	40 %	0 %	40 %	428309213
18019	NC_019738	CCCA	2	8	1010368	1010375	25 %	0 %	0 %	75 %	428309213
18020	NC_019738	TC	3	6	1010386	1010391	0 %	50 %	0 %	50 %	428309213
18021	NC_019738	GCC	2	6	1010480	1010485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428309213
18022	NC_019738	AAT	2	6	1010568	1010573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428309213
18023	NC_019738	CGG	2	6	1010591	1010596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428309213
18024	NC_019738	GATT	2	8	1010613	1010620	25 %	50 %	25 %	0 %	428309213
18025	NC_019738	CTG	2	6	1010715	1010720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428309213
18026	NC_019738	TCA	2	6	1010760	1010765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428309213
18027	NC_019738	GCA	2	6	1010766	1010771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428309213
18028	NC_019738	ATC	2	6	1010785	1010790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428309213
18029	NC_019738	CGC	2	6	1010793	1010798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428309213
18030	NC_019738	CAA	2	6	1010879	1010884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18031	NC_019738	TGC	2	6	1010986	1010991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428309214
18032	NC_019738	TAAC	2	8	1011002	1011009	50 %	25 %	0 %	25 %	428309214
18033	NC_019738	AACC	2	8	1011056	1011063	50 %	0 %	0 %	50 %	428309214
18034	NC_019738	TTA	2	6	1011122	1011127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428309214
18035	NC_019738	TAA	2	6	1011182	1011187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428309214
18036	NC_019738	AGA	2	6	1011283	1011288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428309214
18037	NC_019738	T	6	6	1011326	1011331	0 %	100 %	0 %	0 %	428309214
18038	NC_019738	TTGA	2	8	1011341	1011348	25 %	50 %	25 %	0 %	428309214
18039	NC_019738	TCA	2	6	1011421	1011426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428309214
18040	NC_019738	ATT	2	6	1011463	1011468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428309214
18041	NC_019738	ATT	2	6	1011474	1011479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428309214
18042	NC_019738	TGG	2	6	1011490	1011495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428309214
18043	NC_019738	CTT	2	6	1011497	1011502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428309214
18044	NC_019738	CTT	2	6	1011542	1011547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428309214
18045	NC_019738	GCC	2	6	1011589	1011594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428309214
18046	NC_019738	TAA	2	6	1011659	1011664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428309214
18047	NC_019738	TGG	2	6	1011700	1011705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428309214
18048	NC_019738	AG	4	8	1011719	1011726	50 %	0 %	50 %	0 %	428309214
18049	NC_019738	A	8	8	1011733	1011740	100 %	0 %	0 %	0 %	428309214
18050	NC_019738	AC	3	6	1011841	1011846	50 %	0 %	0 %	50 %	428309214
18051	NC_019738	TTG	2	6	1011888	1011893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428309214
18052	NC_019738	TCA	2	6	1011988	1011993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428309214
18053	NC_019738	TGA	2	6	1012039	1012044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428309214
18054	NC_019738	ATC	2	6	1012053	1012058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428309214
18055	NC_019738	T	6	6	1012067	1012072	0 %	100 %	0 %	0 %	428309214
18056	NC_019738	C	6	6	1012073	1012078	0 %	0 %	0 %	100 %	428309214
18057	NC_019738	A	6	6	1012157	1012162	100 %	0 %	0 %	0 %	428309214
18058	NC_019738	GGT	2	6	1012171	1012176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428309214
18059	NC_019738	AAG	2	6	1012179	1012184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428309214
18060	NC_019738	CTGCAA	2	12	1012197	1012208	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428309214
18061	NC_019738	CTTT	2	8	1012293	1012300	0 %	75 %	0 %	25 %	428309214
18062	NC_019738	GCA	2	6	1012310	1012315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428309214
18063	NC_019738	TCTT	2	8	1012324	1012331	0 %	75 %	0 %	25 %	428309214
18064	NC_019738	ACA	2	6	1012366	1012371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428309214
18065	NC_019738	ATA	2	6	1012384	1012389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428309214
18066	NC_019738	CCA	2	6	1012404	1012409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428309214
18067	NC_019738	AGG	2	6	1012419	1012424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428309214
18068	NC_019738	GTT	2	6	1012476	1012481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428309214
18069	NC_019738	CTTTAA	2	12	1012487	1012498	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428309214
18070	NC_019738	ATGT	2	8	1012501	1012508	25 %	50 %	25 %	0 %	428309214
18071	NC_019738	CCA	2	6	1012510	1012515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428309214
18072	NC_019738	GCA	2	6	1012627	1012632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428309214
18073	NC_019738	A	6	6	1012644	1012649	100 %	0 %	0 %	0 %	428309214
18074	NC_019738	TCC	2	6	1012806	1012811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428309214
18075	NC_019738	A	6	6	1012812	1012817	100 %	0 %	0 %	0 %	428309214
18076	NC_019738	CAT	2	6	1012889	1012894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428309214
18077	NC_019738	CTA	2	6	1012985	1012990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428309214
18078	NC_019738	T	7	7	1013011	1013017	0 %	100 %	0 %	0 %	428309214
18079	NC_019738	CGGA	2	8	1013096	1013103	25 %	0 %	50 %	25 %	428309214
18080	NC_019738	ATAG	2	8	1013109	1013116	50 %	25 %	25 %	0 %	428309214
18081	NC_019738	CCA	2	6	1013209	1013214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428309214
18082	NC_019738	A	6	6	1013260	1013265	100 %	0 %	0 %	0 %	428309214
18083	NC_019738	TTG	2	6	1013344	1013349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428309214
18084	NC_019738	TAT	2	6	1013414	1013419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428309214
18085	NC_019738	TTA	2	6	1013437	1013442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428309214
18086	NC_019738	T	6	6	1013465	1013470	0 %	100 %	0 %	0 %	428309214
18087	NC_019738	TAC	2	6	1013561	1013566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428309214
18088	NC_019738	TG	4	8	1013591	1013598	0 %	50 %	50 %	0 %	428309214
18089	NC_019738	CTC	2	6	1013639	1013644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428309214
18090	NC_019738	TCA	2	6	1013683	1013688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428309214
18091	NC_019738	TTA	2	6	1013776	1013781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428309214
18092	NC_019738	AG	4	8	1013831	1013838	50 %	0 %	50 %	0 %	428309214
18093	NC_019738	TAGC	2	8	1013963	1013970	25 %	25 %	25 %	25 %	428309214
18094	NC_019738	ATTGA	2	10	1013998	1014007	40 %	40 %	20 %	0 %	428309214
18095	NC_019738	TAT	2	6	1014011	1014016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428309214
18096	NC_019738	TCC	2	6	1014093	1014098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428309214
18097	NC_019738	ATC	2	6	1014156	1014161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428309214
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18099	NC_019738	TTG	2	6	1014229	1014234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428309214
18100	NC_019738	CGC	2	6	1014242	1014247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428309214
18101	NC_019738	ATA	2	6	1014295	1014300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428309214
18102	NC_019738	TCC	3	9	1014381	1014389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428309214
18103	NC_019738	CAT	2	6	1014473	1014478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428309214
18104	NC_019738	TA	3	6	1014480	1014485	50 %	50 %	0 %	0 %	428309214
18105	NC_019738	TC	3	6	1014503	1014508	0 %	50 %	0 %	50 %	428309214
18106	NC_019738	TTG	2	6	1014517	1014522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428309214
18107	NC_019738	C	8	8	1014526	1014533	0 %	0 %	0 %	100 %	428309214
18108	NC_019738	ATT	2	6	1014550	1014555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428309214
18109	NC_019738	TTA	2	6	1014655	1014660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428309214
18110	NC_019738	CAG	2	6	1014743	1014748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428309214
18111	NC_019738	GCA	2	6	1014778	1014783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428309214
18112	NC_019738	AGG	2	6	1014805	1014810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428309214
18113	NC_019738	CTA	2	6	1014926	1014931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18114	NC_019738	CTC	2	6	1014941	1014946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18115	NC_019738	ATA	2	6	1014963	1014968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18116	NC_019738	TAA	3	9	1015010	1015018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18117	NC_019738	CAA	2	6	1015022	1015027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18118	NC_019738	TCA	2	6	1015075	1015080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428309215
18119	NC_019738	GCT	2	6	1015200	1015205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428309215
18120	NC_019738	AGTC	2	8	1015239	1015246	25 %	25 %	25 %	25 %	428309215
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18124	NC_019738	CTTT	2	8	1015424	1015431	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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18154	NC_019738	T	6	6	1016980	1016985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18157	NC_019738	CTTC	2	8	1017064	1017071	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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18235	NC_019738	GAC	2	6	1022097	1022102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428309220
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18237	NC_019738	CAC	2	6	1022338	1022343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428309220
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18239	NC_019738	G	6	6	1022498	1022503	0 %	0 %	100 %	0 %	428309220
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18256	NC_019738	CCT	2	6	1023603	1023608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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